GenomeNet

Database: UniProt
Entry: Q6EN61_ORYSJ
LinkDB: Q6EN61_ORYSJ
Original site: Q6EN61_ORYSJ 
ID   Q6EN61_ORYSJ            Unreviewed;       196 AA.
AC   Q6EN61; Q6EQ96;
DT   16-AUG-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT   16-AUG-2004, sequence version 1.
DT   27-MAR-2024, entry version 114.
DE   SubName: Full=Os09g0287500 protein {ECO:0000313|EMBL:BAT07275.1};
DE   SubName: Full=cDNA clone:006-210-G07, full insert sequence {ECO:0000313|EMBL:BAG87228.1};
GN   OrderedLocusNames=Os09g0287500 {ECO:0000313|EMBL:BAT07275.1};
GN   ORFNames=OSNPB_090287500 {ECO:0000313|EMBL:BAT07275.1};
OS   Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC   Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX   NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAT07275.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RN   [1] {ECO:0000313|EMBL:BAG87228.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA   Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K., Namiki T.,
RA   Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K., Shishiki T., Otomo Y.,
RA   Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T., Suzuki Y., Tsunoda Y.,
RA   Kurosaki T., Kodama T., Masuda H., Kobayashi M., Xie Q., Lu M.,
RA   Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K., Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R.,
RA   Ishibiki J., Kawamata M., Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M.,
RA   Ryu R., Ueda M., Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K.,
RA   Arakawa T., Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K.,
RA   Ishii Y., Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N.,
RA   Ota Y., Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA   Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT   "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT   japonica Rice.";
RL   Science 301:376-379(2003).
RN   [2] {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX   PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG   International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA   Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA   Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA   Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA   Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA   Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA   Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA   Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA   Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA   Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA   Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA   Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA   Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA   Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA   Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA   Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA   Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA   Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA   Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA   Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA   Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA   Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA   Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA   Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA   Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA   Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA   Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA   Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA   Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA   Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA   Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA   Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA   Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA   Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA   Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA   Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA   Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA   Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA   Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA   Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
RA   Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S.,
RA   Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T.,
RA   Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.;
RT   "The map-based sequence of the rice genome.";
RL   Nature 436:793-800(2005).
RN   [3] {ECO:0000313|EMBL:BAT07275.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX   PubMed=23299411; DOI=10.1093/pcp/pcs183;
RA   Sakai H., Lee S.S., Tanaka T., Numa H., Kim J., Kawahara Y., Wakimoto H.,
RA   Yang C.C., Iwamoto M., Abe T., Yamada Y., Muto A., Inokuchi H., Ikemura T.,
RA   Matsumoto T., Sasaki T., Itoh T.;
RT   "Rice Annotation Project Database (RAP-DB): an integrative and interactive
RT   database for rice genomics.";
RL   Plant Cell Physiol. 54:E6-E6(2013).
RN   [4] {ECO:0000313|EMBL:BAT07275.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC   STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX   PubMed=24280374; DOI=10.1186/1939-8433-6-4;
RA   Kawahara Y., de la Bastide M., Hamilton J.P., Kanamori H., McCombie W.R.,
RA   Ouyang S., Schwartz D.C., Tanaka T., Wu J., Zhou S., Childs K.L.,
RA   Davidson R.M., Lin H., Quesada-Ocampo L., Vaillancourt B., Sakai H.,
RA   Lee S.S., Kim J., Numa H., Itoh T., Buell C.R., Matsumoto T.;
RT   "Improvement of the Oryza sativa Nipponbare reference genome using next
RT   generation sequence and optical map data.";
RL   Rice 6:4-4(2013).
RN   [5] {ECO:0000313|EMBL:BAT07275.1}
RP   NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA   Sakai H., Kawahara Y., Matsumoto T., Buell C.R., Itoh T.;
RL   Submitted (OCT-2015) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC   -!- SIMILARITY: Belongs to the ycf20 family.
CC       {ECO:0000256|ARBA:ARBA00009846}.
CC   ---------------------------------------------------------------------------
CC   Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC   Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC   ---------------------------------------------------------------------------
DR   EMBL; AK059944; BAG87228.1; -; mRNA.
DR   EMBL; AP014965; BAT07275.1; -; Genomic_DNA.
DR   RefSeq; XP_015610842.1; XM_015755356.1.
DR   AlphaFoldDB; Q6EN61; -.
DR   PaxDb; 39947-Q6EN61; -.
DR   EnsemblPlants; Os09t0287500-01; Os09t0287500-01; Os09g0287500.
DR   GeneID; 4346632; -.
DR   Gramene; Os09t0287500-01; Os09t0287500-01; Os09g0287500.
DR   KEGG; osa:4346632; -.
DR   eggNOG; ENOG502RZMD; Eukaryota.
DR   HOGENOM; CLU_090160_1_0_1; -.
DR   OMA; RRTCFLW; -.
DR   OrthoDB; 1208488at2759; -.
DR   Proteomes; UP000059680; Chromosome 9.
DR   GO; GO:0016020; C:membrane; IEA:UniProtKB-KW.
DR   InterPro; IPR007572; Uncharacterised_Ycf20.
DR   PANTHER; PTHR33787; -; 1.
DR   PANTHER; PTHR33787:SF4; YCF20-LIKE PROTEIN; 1.
DR   Pfam; PF04483; DUF565; 1.
PE   2: Evidence at transcript level;
KW   Membrane {ECO:0000256|SAM:Phobius};
KW   Reference proteome {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
KW   Transmembrane {ECO:0000256|SAM:Phobius};
KW   Transmembrane helix {ECO:0000256|SAM:Phobius}.
FT   TRANSMEM        115..134
FT                   /note="Helical"
FT                   /evidence="ECO:0000256|SAM:Phobius"
FT   TRANSMEM        140..158
FT                   /note="Helical"
FT                   /evidence="ECO:0000256|SAM:Phobius"
FT   TRANSMEM        170..189
FT                   /note="Helical"
FT                   /evidence="ECO:0000256|SAM:Phobius"
SQ   SEQUENCE   196 AA;  20840 MW;  E015C8E605CC2943 CRC64;
     MPLRRGGALP LSAPRAAAGG LRGGGGRGAA LLHPTCLSPP GTTGRALGLS CQMKRTRWKP
     VFALETGGPS NADNQDFEDD GGFLGRTRLG RLIQAAAREL LEKLNSARNK SPTKIFLVLL
     GFYTANALAT VLGQTGDWDV FVAAIVVATI EGIGMLMYRK PASRPPGRFW SMITMVNYWK
     AGVCLGFFVD AFKVGS
//
DBGET integrated database retrieval system