ID Q6Z8E0_ORYSJ Unreviewed; 166 AA.
AC Q6Z8E0; A0A0N7KFX7;
DT 05-JUL-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 05-JUL-2004, sequence version 1.
DT 24-JAN-2024, entry version 135.
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DE SubName: Full=cDNA clone:J033076B01, full insert sequence {ECO:0000313|EMBL:BAH00618.1};
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GN ORFNames=OSNPB_020699600 {ECO:0000313|EMBL:BAS80449.1};
OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAS80449.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RN [1] {ECO:0000313|EMBL:BAH00618.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K., Namiki T.,
RA Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K., Shishiki T., Otomo Y.,
RA Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T., Suzuki Y., Tsunoda Y.,
RA Kurosaki T., Kodama T., Masuda H., Kobayashi M., Xie Q., Lu M.,
RA Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K., Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R.,
RA Ishibiki J., Kawamata M., Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M.,
RA Ryu R., Ueda M., Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K.,
RA Arakawa T., Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K.,
RA Ishii Y., Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N.,
RA Ota Y., Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT japonica Rice.";
RL Science 301:376-379(2003).
RN [2] {ECO:0000313|EMBL:BAH00618.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Adachi J., Aizawa K., Akimura T., Arakawa T., Carninci P., Doi K.,
RA Fujimura T., Fukuda S., Hanagaki T., Hara A., Hashizume W., Hayashida K.,
RA Hayashizaki Y., Hayatsu N., Hiramoto K., Hiraoka T., Hori F., Hotta I.,
RA Iida J., Iida Y., Ikeda R., Imamura K., Imotani K., Ishibiki J., Ishii Y.,
RA Ishikawa M., Itoh M., Kagawa I., Kanagawa S., Katoh H., Kawagashira N.,
RA Kawai J., Kawamata M., Kikuchi S., Kishikawa-Hirozane T., Kishimoto N.,
RA Kobayashi M., Kodama T., Kojima K., Kojima Y., Kondo S., Konno H.,
RA Kouda M., Koya S., Kurihara C., Kurosaki T., Kusumegi T., Li C., Lu M.,
RA Masuda H., Matsubara K., Matsuyama T., Miura J., Miyazaki A., Mizuno K.,
RA Murakami K., Murata M., Nagata T., Nakahama Y., Nakamura M., Namiki T.,
RA Narikawa R., Niikura J., Nishi K., Nomura K., Numasaki R., Ohneda E.,
RA Ohno M., Ohtsuki K., Oka M., Ooka H., Osato N., Ota Y., Otomo Y., Ryu R.,
RA Saitoh H., Sakai C., Sakai K., Sakazume N., Sano H., Sasaki D., Sato K.,
RA Satoh K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T., Shishiki T., Sogabe Y.,
RA Sugano S., Sugiyama A., Suzuki K., Suzuki Y., Tagami M., Tagami-Takeda Y.,
RA Tagawa A., Takahashi F., Takaku-Akahira S., Tanaka T., Tomaru A., Toya T.,
RA Tsunoda Y., Ueda M., Waki K., Xie Q., Yahagi W., Yamada H., Yamamoto M.,
RA Yasunishi A., Yazaki J., Yokomizo S., Yoshimura A.;
RT "Collection, mapping, and annotation of 28K full-length cDNA clones from
RT japonica rice.";
RL Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [3] {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
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RA Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
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RA Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
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RA Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
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RA Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
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RA Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
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RT "The map-based sequence of the rice genome.";
RL Nature 436:793-800(2005).
RN [4] {ECO:0000313|EMBL:BAS80449.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=23299411; DOI=10.1093/pcp/pcs183;
RA Sakai H., Lee S.S., Tanaka T., Numa H., Kim J., Kawahara Y., Wakimoto H.,
RA Yang C.C., Iwamoto M., Abe T., Yamada Y., Muto A., Inokuchi H., Ikemura T.,
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RN [5] {ECO:0000313|EMBL:BAS80449.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=24280374; DOI=10.1186/1939-8433-6-4;
RA Kawahara Y., de la Bastide M., Hamilton J.P., Kanamori H., McCombie W.R.,
RA Ouyang S., Schwartz D.C., Tanaka T., Wu J., Zhou S., Childs K.L.,
RA Davidson R.M., Lin H., Quesada-Ocampo L., Vaillancourt B., Sakai H.,
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RL Rice 6:4-4(2013).
RN [6] {ECO:0000313|EMBL:BAS80449.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Sakai H., Kawahara Y., Matsumoto T., Buell C.R., Itoh T.;
RL Submitted (OCT-2015) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC -!- SIMILARITY: Belongs to the universal ribosomal protein uL11 family.
CC {ECO:0000256|ARBA:ARBA00010537, ECO:0000256|RuleBase:RU003978}.
CC ---------------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC ---------------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AK121709; BAH00618.1; -; mRNA.
DR EMBL; AP014958; BAS80449.1; -; Genomic_DNA.
DR RefSeq; XP_015627232.1; XM_015771746.1.
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DR KEGG; osa:4330425; -.
DR eggNOG; KOG0886; Eukaryota.
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DR OMA; KIVNLRC; -.
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DR GO; GO:0070180; F:large ribosomal subunit rRNA binding; IBA:GO_Central.
DR GO; GO:0003735; F:structural constituent of ribosome; IBA:GO_Central.
DR GO; GO:0006412; P:translation; IBA:GO_Central.
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DR Gene3D; 1.10.10.250; Ribosomal protein L11, C-terminal domain; 1.
DR Gene3D; 3.30.1550.10; Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain; 1.
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DR InterPro; IPR000911; Ribosomal_uL11.
DR InterPro; IPR020783; Ribosomal_uL11_C.
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DR InterPro; IPR020785; Ribosomal_uL11_CS.
DR InterPro; IPR020784; Ribosomal_uL11_N.
DR InterPro; IPR036796; Ribosomal_uL11_N_sf.
DR PANTHER; PTHR11661; 60S RIBOSOMAL PROTEIN L12; 1.
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PE 2: Evidence at transcript level;
KW Reference proteome {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
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FT DOMAIN 15..70
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MPPKLDPTQV VDVFVRVTGG EVGAASSLAP KIGPLGLSPK KIGEDIAKET AKDWKGLRVT
VKLTVQNRQA KVSVVPSAAA LVIKALKEPE RDRKKVKNIK HSGNISLDDV IEIARVMRPR
SMAKEMAGTV KEILGTCVSV GCTVDGKDPK DLQQEISDGE VEIPSA
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