Entry
Name
[histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase;
KDM5A (gene name);
KDM5B (gene name);
KDM5C (gene name);
KDM5D (gene name);
JARID1A (gene name)
Class
Oxidoreductases;
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
With 2-oxoglutarate as one donor, and incorporation of one atom of oxygen into each donor
BRITE hierarchy
Sysname
[histone H3]-N6,N6,N6-trimethyl-L-lysine4,2-oxoglutarate:oxygen oxidoreductase
Reaction(IUBMB)
a [histone H3]-N6,N6,N6-trimethyl-L-lysine4 + 3 2-oxoglutarate + 3 O2 = a [histone H3]-L-lysine4 + 3 succinate + 3 formaldehyde + 3 CO2 (overall reaction) [RN:
R12461 ];
(1a) a [histone H3]-N6,N6,N6-trimethyl-L-lysine4 + 2-oxoglutarate + O2 = a [histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4 + succinate + formaldehyde + CO2 [RN:
R12460 ];
(1b) a [histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4 + 2-oxoglutarate + O2 = a [histone H3]-N6-methyl-L-lysine4 + succinate + formaldehyde + CO2 [RN:
R09510 ];
(1c) a [histone H3]-N6-methyl-L-lysine4 + 2-oxoglutarate + O2 = a [histone H3]-L-lysine4 + succinate + formaldehyde + CO2 [RN:
R09511 ]
Reaction(KEGG)
Substrate
[histone H3]-N6,N6,N6-trimethyl-L-lysine4;
2-oxoglutarate [CPD:
C00026 ];
O2 [CPD:
C00007 ];
[histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4;
[histone H3]-N6-methyl-L-lysine4
Product
[histone H3]-L-lysine4;
succinate [CPD:
C00042 ];
formaldehyde [CPD:
C00067 ];
CO2 [CPD:
C00011 ];
[histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4;
[histone H3]-N6-methyl-L-lysine4
Comment
Requires iron(II). This entry describes a group of enzymes that demethylate N-methylated L-lysine residues at position 4 of histone H3 (H3K4). The enzymes are dioxygenases and act by hydroxylating the methyl group, forming an unstable hemiaminal that leaves as formaldehyde. They can act on tri-, di-, and mono-methylated forms.
History
EC 1.14.11.67 created 2019
Orthology
K11446 [histone H3]-trimethyl-L-lysine4 demethylase
K16914 protein-L-histidine (3S)-3-hydroxylase / [histone H3]-trimethyl-L-lysine4/36 demethylase
Genes
HSA : 10765(KDM5B) 5927(KDM5A) 79697(RIOX1) 8242(KDM5C) 8284(KDM5D)
PTR : 104002100(RIOX1) 449032(KDM5D) 451737(KDM5A) 457630(KDM5B) 744380(KDM5C)
PPS : 100969555(KDM5B) 100970129(KDM5C) 100980071(KDM5A) 103787047(RIOX1)
GGO : 101127412(KDM5C) 101149215(KDM5A) 101153769(KDM5B)
PON : 100172643(KDM5C) 100434572(KDM5A) 100450767(KDM5B) 103892384(RIOX1)
NLE : 100590577(KDM5C) 100591974(KDM5B) 100593603(KDM5A) 105739243(RIOX1)
HMH : 116457628(KDM5B) 116472503(KDM5A) 116484625(RIOX1) 116811456(KDM5D) 116811709(KDM5C)
MCC : 100270697(KDM5D) 106992262(KDM5C) 696773(RIOX1) 706437(KDM5B) 721599(KDM5A)
MCF : 102118086(KDM5C) 102126562(KDM5B) 102135352(RIOX1) 102140751(KDM5A)
MTHB : 126930226 126938099 126946598 126947157 126959510
MNI : 105463806(KDM5A) 105484747(KDM5B) 105493792(KDM5C) 105494285(RIOX1)
CSAB : 103218353(KDM5A) 103229309(RIOX1) 103230303(KDM5B) 103232010(KDM5C) 103246987(KDM5D)
CATY : 105576364(KDM5C) 105577027(KDM5B) 105582941(KDM5A) 105599557
PANU : 101006817(KDM5B) 101008965(KDM5C) 101017644(KDM5A) 103886364(RIOX1) 116272372(KDM5D)
TGE : 112615445(KDM5C) 112622855(KDM5B) 112629404(RIOX1) 112634022(KDM5A)
MLEU : 105529906(KDM5A) 105532259(KDM5C) 105541877 105547098(KDM5B)
RRO : 104656344(RIOX1) 104658712(KDM5D) 104663374(KDM5C) 104672250(KDM5A) 104674506(KDM5B)
RBB : 108523797 108523849(KDM5A) 108536225(CUNH14orf169) 108545038(KDM5B)
TFN : 117069369(RIOX1) 117076567(KDM5B) 117077894(KDM5C) 117090613 117090733(KDM5A)
PTEH : 111520308(KDM5A) 111520542(RIOX1) 111522705(KDM5B) 111535695(KDM5D) 111536175(KDM5C)
CANG : 105504344(KDM5B) 105514903(KDM5C) 105517321 105522581(KDM5A)
CJC : 100399585 100401370(KDM5C) 100404196(RIOX1) 100405218(KDM5B)
SBQ : 101040986(KDM5C) 101053880(KDM5A) 101054224(KDM5B) 104650789
CIMI : 108295439(KDM5C) 108298169(KDM5D) 108301949(KDM5B) 108304494(RIOX1) 108315773(KDM5A)
CSYR : 103249493(KDM5B) 103253624(KDM5C) 103262573(KDM5A) 103273243(RIOX1)
MMUR : 105858343(RIOX1) 105860036(KDM5B) 105861236(KDM5C) 105862177(KDM5A)
LCAT : 123626963(KDM5B) 123628040(KDM5C) 123629089 123640209(KDM5A) 123647004(RIOX1)
PCOQ : 105812900(KDM5A) 105819645(KDM5B) 105819790 105823439(KDM5C)
OGA : 100942327(KDM5A) 100942672(KDM5C) 100960790(KDM5B) 105886713(RIOX1)
MMU : 20591(Kdm5c) 20592(Kdm5d) 214899(Kdm5a) 71952(Riox1) 75605(Kdm5b)
MCAL : 110286928(Kdm5c) 110295764(Kdm5a) 110304747(Kdm5b) 110307186(Riox1)
MPAH : 110313472(Kdm5c) 110316599(Kdm5a) 110322297(Kdm5b) 110324497(Riox1)
RNO : 100312983(Kdm5d) 304809(Kdm5b) 312678(Kdm5a) 314300(Riox1) 317432(Kdm5c)
MCOC : 116080287(Riox1) 116089874 116096519 116099508(Kdm5a) 116099545(Kdm5b)
ANU : 117694415(Kdm5c) 117697455(Riox1) 117701335 117714701(Kdm5a) 117715964(Kdm5b)
MUN : 110546054(Kdm5a) 110546738(Kdm5b) 110558535(Riox1) 110566279(Kdm5c)
CGE : 100757111(Kdm5a) 100758549(Kdm5c) 100761435(Kdm5b)
MAUA : 101823347(Kdm5a) 101826098(Kdm5b) 101837244(Riox1) 101842205(Kdm5c)
PROB : 127214695 127217695(Kdm5c) 127236217(Kdm5a) 127236473(Kdm5b)
PLEU : 114683381 114698112(Kdm5b) 114698396(Riox1) 114700746(Kdm5a) 114702841
MORG : 121443060 121443864 121445556(Kdm5c) 121445873(Kdm5b) 121452248(Riox1) 121466032(Kdm5a)
MFOT : 126494024 126505018 126505444 126515167
AAMP : 119804613(Kdm5c) 119806604(Kdm5a) 119818543(Riox1) 119827298(Kdm5b)
NGI : 103731840(Kdm5b) 103739366(Kdm5a) 103747323(Kdm5c) 103747411(Riox1)
HGL : 101697034(Kdm5a) 101709640(Kdm5c) 101711865(Kdm5b) 101712659(Riox1)
CPOC : 100716870(Kdm5c) 100723111(Kdm5b) 100729659(Riox1) 100730959(Kdm5a)
CCAN : 109684662 109686312(Kdm5b) 109691362(Riox1) 109694623(Kdm5a) 109702638
DORD : 105982898 105986419(Kdm5b) 105991114(Kdm5a) 106000642(Kdm5c)
DSP : 122101699(Kdm5a) 122109409(Kdm5b) 122112011(Kdm5c) 122118818(Riox1)
NCAR : 124961691 124971332 124973562 124977643 124982081
OCU : 100341721 100351408 100356218
OPI : 101516236(KDM5A) 101531399(KDM5C) 101533952(KDM5B) 105941772(RIOX1)
TUP : 102477639(KDM5B) 102483934(KDM5C) 102484507(RIOX1) 102494185(KDM5A)
GVR : 103592130(KDM5C) 103594525(KDM5A) 103599622(KDM5B) 103599802 103606856
CFA : 106559177(RIOX1) 477727(KDM5A) 479999(KDM5B) 491894(KDM5C)
CLUD : 112657830(RIOX1) 112667046(KDM5B) 112669010(KDM5A) 112673074(KDM5C)
VVP : 112911956(KDM5C) 112911964 112917407(KDM5A) 112927248(RIOX1) 112934568(KDM5B)
VLG : 121479758(KDM5A) 121482909(KDM5C) 121493398(KDM5B) 121493577(RIOX1)
AML : 100468557(RIOX1) 100476032(KDM5A) 100483283(KDM5B) 100484551(KDM5C)
UMR : 103657783(KDM5B) 103673481(RIOX1) 103675225 103675721(KDM5A)
UAH : 113242535(KDM5B) 113247519(KDM5C) 113258031(KDM5A) 113270360(RIOX1)
UAR : 123777696(KDM5A) 123785737(KDM5B) 123789861 123793531(KDM5C) 123799008(RIOX1)
ELK : 111139800 111148493 111150998 111159667
LLV : 125085806 125091638 125092604 125103705 125106230
MPUF : 101671203(KDM5A) 101671929 101678160(KDM5B) 101691151(KDM5C)
NVS : 122891381(KDM5A) 122893635(RIOX1) 122897461(KDM5C) 122918799(KDM5B)
ORO : 101370942(KDM5B) 101371710(KDM5C) 101372331(KDM5A) 101375635 101379219
EJU : 114199294(RIOX1) 114200632(KDM5C) 114221914(KDM5B) 114222472(KDM5A)
ZCA : 113909018(RIOX1) 113921672(KDM5A) 113930629(KDM5C) 113932218(KDM5B) 118356625
MLX : 117997497(KDM5C) 118002325(RIOX1) 118006907 118014191(KDM5B) 118025790(KDM5A)
NSU : 110571430(RIOX1) 110574077(KDM5B) 110581088(KDM5A) 110591787 110591996(KDM5C)
LWW : 102739562(RIOX1) 102743015(KDM5A) 102744231(KDM5B) 115936488
FCA : 101087846(KDM5A) 101091600(KDM5C) 101101609(KDM5B) 102900260(RIOX1)
PYU : 121021637(KDM5B) 121021978(KDM5A) 121024589 121024802(KDM5C) 121032016(RIOX1)
PCOO : 112856086(RIOX1) 112857709(KDM5B) 112867367(KDM5A) 112870988(KDM5C)
PBG : 122469294(RIOX1) 122473228(KDM5A) 122475994(KDM5B) 122477397(KDM5C)
LRUF : 124502209 124510017 124512053 124522269 124527590
PTG : 102953605(KDM5B) 102957240(KDM5C) 102960977(RIOX1) 102962286(KDM5A) 102965571
PPAD : 109253798(CUNH14orf169) 109256462(KDM5B) 109260277(KDM5C) 109276231(KDM5A)
PUC : 125908683 125918710 125925411 125931697
AJU : 106965399(KDM5A) 106974127(KDM5B) 106974332(RIOX1) 106985380(KDM5C) 106989091
HHV : 120222959(KDM5C) 120228852(KDM5B) 120231954(RIOX1) 120234454(KDM5A)
BTA : 281490(KDM5C) 507962(KDM5A) 511031(RIOX1) 540633(KDM5B)
BOM : 102271619(KDM5A) 102276246(KDM5B) 102285244(RIOX1) 102285874(KDM5C)
BIU : 109555159(KDM5C) 109559764(KDM5A) 109565323(RIOX1) 109570476(KDM5B)
BBUB : 102393119(KDM5A) 102405105(KDM5C) 102408415(KDM5B)
BBIS : 104981871(KDM5B) 104992237(KDM5A) 104997801(KDM5C) 105000131
CHX : 102173094(C10H14orf169) 102178381(KDM5B) 102183856(KDM5A) 102185641(KDM5C)
OAS : 101110351(KDM5B) 101115023(KDM5A) 101121317(KDM5C) 105606501(RIOX1)
ODA : 120853602(RIOX1) 120857856(KDM5A) 120880089(KDM5B) 120882154(KDM5C)
CCAD : 122423036(KDM5A) 122434579(KDM5C) 122451861(KDM5B)
SSC : 100037295(KDM5C) 100294704(KDM5A) 100523074(RIOX1) 102163404(KDM5B) 110257883
CFR : 102504875(KDM5B) 102505373(RIOX1) 102505415(KDM5C) 102520574(KDM5A) 102523369
CBAI : 105069985(KDM5B) 105075429 105076333(KDM5A) 105081455(KDM5C)
CDK : 105086126(RIOX1) 105096692(KDM5C) 105102938(KDM5A) 105105928(KDM5B)
VPC : 102527902(KDM5C) 102530924(KDM5B) 102540504(KDM5A) 102544596(RIOX1)
BACU : 103009652(KDM5D) 103009914(KDM5B) 103010727(KDM5A) 103011953(KDM5C) 103014019(RIOX1)
LVE : 103069841 103072576(KDM5B) 103083652(KDM5A) 103088289(KDM5C)
OOR : 101270071(KDM5A) 101271172(KDM5C) 101275960 101288712(KDM5B)
DLE : 111168309(KDM5B) 111170781(KDM5C) 111176276(RIOX1) 111176614(KDM5A)
PCAD : 102980914(RIOX1) 102983382(KDM5B) 102988928(KDM5A) 102992593(KDM5C)
PSIU : 116747354(KDM5C) 116749506(RIOX1) 116753763(KDM5B) 116760676(KDM5A)
NASI : 112391742(KDM5A) 112394900(RIOX1) 112396013(KDM5C) 112402613(KDM5B) 112415963
ECB : 100034190(KDM5C) 100056935(KDM5A) 100064707(KDM5B) 100146448(RIOX1)
EPZ : 103543421 103555110(KDM5B) 103567990(RIOX1)
EAI : 106827705(RIOX1) 106827754 106831523(KDM5A) 106836255 106840227(KDM5B)
MYB : 102239080(KDM5B) 102245023(KDM5C) 102255481(KDM5A) 102256784(RIOX1)
MYD : 102752699(KDM5A) 102757410(RIOX1) 102762785(KDM5B) 102775396(KDM5C)
MMYO : 118651885(KDM5A) 118653696(KDM5C) 118657792(RIOX1) 118678752(KDM5B)
MLF : 102430956(KDM5A) 102440102(RIOX1) 102440974(KDM5B) 102441756(KDM5C)
MNA : 107533472 107536012(KDM5B) 107542357(KDM5C) 107542684 107546447(KDM5A)
PKL : 118710517(KDM5B) 118715502(RIOX1) 118717925(KDM5C) 118728408(KDM5A)
HAI : 109380463(KDM5B) 109381570(RIOX1) 109388945(KDM5A) 109396384(KDM5C)
DRO : 112311208(KDM5A) 112311546(RIOX1) 112318809(KDM5B) 112322361(KDM5C)
SHON : 118976654(RIOX1) 118997784(KDM5C) 119000006(KDM5A) 119003944(KDM5B)
AJM : 119036137(RIOX1) 119045227(KDM5A) 119055492(KDM5C) 119060683(KDM5B)
PDIC : 114492357(RIOX1) 114504994(KDM5C) 114512244(KDM5B) 114512840(KDM5A)
PHAS : 123808581(RIOX1) 123813412(KDM5A) 123814653(KDM5C) 123832498(KDM5B)
MMF : 118616455(RIOX1) 118624543(KDM5A) 118635575(KDM5C) 118640502(KDM5B) 118643098 118643102
RFQ : 117018656(KDM5B) 117021821(KDM5C) 117022753(RIOX1) 117028360(KDM5A)
PALE : 102878118(KDM5A) 102882705(KDM5B) 102883012(KDM5C) 102887644(RIOX1) 102887656
PGIG : 120593576(KDM5C) 120607339(KDM5A) 120612197 120619291(KDM5B) 120619476(RIOX1)
PVP : 105296914(KDM5B) 105297265(KDM5A) 105299251(RIOX1) 105307811(KDM5C)
RAY : 107502986(KDM5B) 107503761(KDM5C) 107505016 107509747(KDM5A)
MJV : 108384283(KDM5C) 108396319(KDM5B) 108397196(CUNH14orf169) 108399069(KDM5A)
TOD : 119234368(KDM5B) 119239267(RIOX1) 119246144(KDM5C) 119247840(KDM5A) 119250668
SARA : 101538783(KDM5A) 101554028(KDM5C) 101558160(KDM5B) 105943148
LAV : 100660048(KDM5C) 100665887(KDM5A) 100668526(RIOX1) 100675094(KDM5B)
TMU : 101348575 101357057 101358805 101361602
ETF : 101655692(KDM5C) 101664095(KDM5B) 101664579(KDM5A) 105979987(RIOX1)
DNM : 101437091(RIOX1) 101439060(KDM5B) 101440209(KDM5C) 101446057(KDM5A)
MDO : 100011885(KDM5B) 100020718(KDM5A) 100024523(RIOX1) 100379644(KDM5C)
GAS : 123235838(RIOX1) 123247455(KDM5B) 123250373(KDM5A) 123253580 123254153
SHR : 100921713(KDM5A) 100925521(KDM5B) 105750349(RIOX1) 116420405
AFZ : 127538033 127542695 127543056 127549524 127562710
PCW : 110201022 110208359(RIOX1) 110218651(KDM5A) 110219561(KDM5B)
OAA : 100075501(KDM5C) 100077577(KDM5B) 100080164(KDM5A) 100086314(RIOX1)
GGA : 418148(KDM5A) 421168(KDM5B) 423249(C5H14ORF169)
PCOC : 116226856(KDM5A) 116229243(RIOX1) 116238788(KDM5B)
MGP : 100545882(RIOX1) 100548982(KDM5B)
CJO : 107314864(RIOX1) 107315373(KDM5A) 107324646(KDM5B)
NMEL : 110388134(KDM5B) 110398370(KDM5A) 110401899(RIOX1)
APLA : 101794048(KDM5A) 101796505(RIOX1) 101802603(KDM5B)
ACYG : 106030948(KDM5A) 106040700(RIOX1) 106045876(KDM5B)
AFUL : 116489571(RIOX1) 116490126(KDM5A) 116498733(KDM5B)
TGU : 100219109(RIOX1) 100220128(KDM5B) 100226987(KDM5A)
LSR : 110469157(KDM5B) 110472176(RIOX1) 110472936(KDM5A)
SCAN : 103820453(KDM5A) 103822358(KDM5B) 103826967(RIOX1)
PMOA : 120497275(KDM5B) 120500278(RIOX1) 120501644(KDM5A) 120507211
OTC : 121332768(KDM5A) 121334309(RIOX1) 121339173 121345536(KDM5B)
PRUF : 121349550(RIOX1) 121362673(KDM5A) 121363516 121365432(KDM5B)
GFR : 102035608(RIOX1) 102036946(KDM5B) 102042789(KDM5A)
FAB : 101810162(KDM5A) 101819482(RIOX1) 101819778(KDM5B)
PHI : 102102154(KDM5B) 102104485(KDM5A) 102111304(KDM5C) 102111633
PMAJ : 107204784(KDM5A) 107205486(RIOX1) 107214918(KDM5B)
CCAE : 111927901(KDM5A) 111930251(RIOX1) 111939719(KDM5B)
CCW : 104688287(RIOX1) 104692233(KDM5A) 104692454(KDM5B) 120412199
CBRC : 103619143 103619499(KDM5B) 103620966(CUNH14orf169) 103624685(KDM5A)
ETL : 114055505(RIOX1) 114064760(KDM5B) 114069392(KDM5A)
ZAB : 102060487(RIOX1) 102071491(KDM5B) 102072583(KDM5A)
ACHL : 103801643(KDM5B) 103807375 103809203(KDM5A)
SVG : 106848947 106849412(KDM5A) 106851108(KDM5B)
FPG : 101914016(KDM5B) 101916107(KDM5A) 101921902(KDM5C) 101922675(RIOX1)
FCH : 102046513(KDM5C) 102048054(KDM5B) 102049474(KDM5A) 102052952(RIOX1)
CLV : 102085791(RIOX1) 102091315(KDM5B) 102097139(KDM5A)
EGZ : 104122023(KDM5B) 104129750(KDM5A) 104132280
NNI : 104011099(KDM5B) 104020219(KDM5A) 104020430
PLET : 104619961 104620911(KDM5A) 104624890(KDM5B)
PCRI : 104036312(KDM5B) 104037210 104038157(KDM5A)
PCAO : 104041401(KDM5A) 104048181 104053667
ACUN : 113480503(RIOX1) 113488968(KDM5B) 113491464(KDM5A)
TALA : 104357502(RIOX1) 104362239(KDM5B) 104363111(KDM5A)
PADL : 103912835 103913826(KDM5B) 103924376(KDM5A)
AFOR : 103898887(CUNH14orf169) 103901085(KDM5B) 103906415(KDM5A)
ACHC : 115335011(KDM5B) 115338395(RIOX1) 115352435(KDM5A)
HALD : 104310767(KDM5B) 104314949 104316305(KDM5A)
HLE : 104830942(KDM5A) 104835805(KDM5C) 104842420(KDM5B)
AGEN : 126035180 126048105 126049446 126052137
GCL : 127016865 127023637 127026186
CCRI : 104158036 104161816(KDM5B) 104162014(KDM5A)
CSTI : 104549376(KDM5A) 104553649(KDM5B) 104562289
EHS : 104507040(KDM5B) 104515933
CMAC : 104474476 104483476
MUI : 104537340 104538615(KDM5B) 104541058(KDM5A)
FGA : 104069708(KDM5A) 104075934(KDM5B) 104080124
GSTE : 104251195 104260162(KDM5A) 104263192(KDM5B)
LDI : 104340698 104342791(KDM5B) 104351922(KDM5A)
MNB : 103774562 103775688(KDM5B) 103778034
OHA : 104327346(KDM5B) 104328193 104330260(KDM5A)
NNT : 104399702 104405443(KDM5A) 104410348(KDM5B)
SHAB : 115602306(KDM5B) 115604836(KDM5A) 115606848(RIOX1)
DPUB : 104300163(KDM5B) 104300359 104300682 104310214(KDM5A)
PGUU : 104458157(KDM5A) 104461822 104464730
ACAR : 104518307(RIOX1) 104528078
CPEA : 104385887(KDM5B) 104386577(KDM5A) 104390585
AVIT : 104267065 104274253(KDM5B) 104281348
CVF : 104281598(KDM5A) 104283191(KDM5B) 104284091
CUCA : 104055909(KDM5A) 104059013(KDM5B) 104061865
TEO : 104373599 104381477(KDM5A)
BRHI : 104491683(KDM5A) 104500050 104500512(KDM5B)
AAM : 106488690(KDM5A) 106498095(RIOX1) 106500239(KDM5B)
AROW : 112964060(RIOX1) 112965069(KDM5B) 112968311(KDM5A) 112972703(KDM5C)
NPD : 112958315(KDM5A) 112959167(KDM5B)
TGT : 104575138(KDM5B) 104579083
DNE : 112980748(RIOX1) 112983853(KDM5B) 112993350(KDM5A)
SCAM : 104139280(KDM5B) 104141222 104147280(KDM5A)
ASN : 102369320(KDM5C) 102376489(RIOX1) 102381778 102383432
AMJ : 102560036(RIOX1) 102562466(KDM5C) 102563181(KDM5B) 106736739(KDM5A)
CPOO : 109316471(KDM5A) 109317567(KDM5B) 109321529(CUNH14orf169)
GGN : 109295154(KDM5B) 109296217(KDM5A) 109298811(CUNH14orf169)
PSS : 102450180(RIOX1) 102450369(KDM5A) 102451841
CMY : 102933242(RIOX1) 102934613(KDM5B) 102937604(KDM5C) 102937991(KDM5A)
CPIC : 101942004(KDM5B) 101944414(RIOX1) 101948551(KDM5A) 101952359(KDM5C)
TST : 117876040(KDM5B) 117876967(RIOX1) 117882381(KDM5A)
CABI : 116818908(KDM5C) 116825381(RIOX1) 116833500(KDM5B) 116833549 116834559(KDM5A)
MRV : 120388507(KDM5C) 120393460(KDM5B) 120404335(RIOX1) 120409291(KDM5A)
ACS : 100557464(riox1) 100562154(kdm5a) 100562356(kdm5b) 100565551(kdm5c)
PVT : 110073373(KDM5B) 110076663(KDM5A) 110078625(KDM5C) 110088098(RIOX1)
SUND : 121919007(RIOX1) 121920875(KDM5C) 121927791(KDM5B) 121931103(KDM5A)
PBI : 103057421(KDM5C) 103064072(RIOX1) 103064844(KDM5A) 103067839(KDM5B)
PMUR : 107285905(KDM5A) 107287109(KDM5B) 107289352(KDM5C) 107290099(RIOX1)
CTIG : 120296986(KDM5B) 120302776(RIOX1) 120317491(KDM5A) 120318460(KDM5C)
TSR : 106540035 106543320(KDM5B) 106544479 106550471(KDM5A)
PGUT : 117655652(KDM5A) 117663729(KDM5B) 117665617(RIOX1) 117675469(KDM5C)
VKO : 123016537(KDM5A) 123026708(RIOX1) 123029940(KDM5C) 123032033(KDM5B)
PMUA : 114587654(KDM5C) 114594532(RIOX1) 114599455(KDM5B) 114605015(KDM5A)
ZVI : 118088211(KDM5B) 118090810(KDM5A) 118097496(KDM5C) 118097647(RIOX1)
HCG : 128323413(KDM5B) 128327108(KDM5A) 128334145(RIOX1) 128343344(KDM5C)
GJA : 107105528 107107867(KDM5B) 107111814(RIOX1) 107120238(KDM5A)
STOW : 125429880(KDM5C) 125433908(KDM5B) 125434728(KDM5A) 125435934(RIOX1)
XLA : 108699964(kdm5c.S) 108704489(kdm5c.L) 108704575 108708118 108709501(kdm5b.S) 108712258 108716657(riox1.L)
XTR : 100488170(kdm5b) 100488246(riox1) 100492348(kdm5a) 780176(kdm5c)
NPR : 108787373(KDM5B) 108788900(KDM5C) 108788943(CUNH14orf169) 108804616(KDM5A)
RTEM : 120913029(KDM5C) 120927275(KDM5B) 120932695(KDM5A) 120937491(RIOX1)
BBUF : 120995175(KDM5B) 120998764(RIOX1) 121004252(KDM5A) 121009164(KDM5C)
BGAR : 122928498(KDM5A) 122932711(KDM5B) 122934417(RIOX1) 122946072(KDM5C)
DRE : 100333310(kdm5a) 327168(kdm5ba) 415256(kdm5bb) 553406(kdm5c) 560815(riox1)
SRX : 107710764 107711851 107719421 107727821 107747206 107749493
SANH : 107655070 107669424 107669637 107685701 107693604 107702826 107704066
SGH : 107548410 107550909 107556320 107559126 107574477(kdm5a) 107600688
CCAR : 109064318 109068503 109081363 109098572 109099991(kdm5c)
CAUA : 113055186 113065725(kdm5a) 113068568 113068613 113070734 113072091 113107377 113107752 113111176 113120605
CGIB : 127938534 127956151 127963006 127964095 127968412 127984595 128018372 128018564 128022313
PPRM : 120477433 120477434 120479417(kdm5c) 120480668(kdm5ba) 120484176(kdm5bb) 120491947(riox1)
MAMB : 125244679(kdm5a) 125257169(kdm5ba) 125278713(riox1) 125279736(kdm5bb) 125280213(kdm5c)
CIDE : 127502362 127511051 127517271 127517301 127517986 127522138
MASI : 127414595 127414630 127415547 127424242 127424523 127426361 127428205 127435307 127436990
IPU : 108254769(kdm5ba) 108257725(riox1) 108265475(kdm5c) 108265643(kdm5bb) 108279764(kdm5a)
PHYP : 113527523 113532105(riox1) 113532401(kdm5a) 113533207 113539724
SMEO : 124377246(riox1) 124399507(kdm5c) 124399872(kdm5bb) 124400782(kdm5a) 124402132(kdm5ba)
TFD : 113642757(kdm5ba) 113645616(kdm5a) 113655601(riox1) 113655729(kdm5bb) 113656094(kdm5c)
AMEX : 103025998 103026437 103035157(kdm5c) 103035470(riox1) 103038308
EEE : 113571701(riox1) 113572091 113573556(kdm5a) 113578751 113578913(kdm5b)
TRU : 101062233 101069081(riox1) 101069859 101076258 101077353(kdm5a)
TNG : GSTEN00013024G001 GSTEN00013608G001 GSTEN00023017G001 GSTEN00023473G001 GSTEN00023524G001
LCO : 104919933 104930843(riox1) 104932136 104933725(kdm5a) 104937247
NCC : 104950067 104953602(kdm5b)
CGOB : 115008327(kdm5b) 115028237(kdm5a)
ELY : 117249514(kdm5a) 117257016(kdm5ba) 117258130(kdm5c) 117258216(kdm5bb) 117270465(riox1)
EFO : 125883156(kdm5a) 125888646(kdm5ba) 125891331(kdm5c) 125891905(kdm5bb) 125896950(riox1)
PLEP : 121946434(kdm5c) 121946569(kdm5bb) 121953399(kdm5ba) 121955439(riox1) 121961263(kdm5a)
SLUC : 116039762(kdm5a) 116043572(kdm5c) 116043576(kdm5bb) 116066116(riox1) 116066445(kdm5ba)
ECRA : 117938688(kdm5a) 117942866(kdm5ba) 117947004(kdm5bb) 117947272(kdm5c) 117961991(riox1)
ESP : 116673038(kdm5a) 116679806 116687211 116692050 116692797(kdm5c) 116706862(riox1)
PFLV : 114549899(kdm5a) 114553776 114558273 114558626 114572971(riox1)
GAT : 120807956(riox1) 120817229(kdm5a) 120829417(kdm5bb) 120829915(kdm5c) 120835294(kdm5ba)
PPUG : 119194751(riox1) 119206805 119210480(kdm5a) 119221904 119222330(kdm5c) 119229883(kdm5ba)
MSAM : 119885931(kdm5ba) 119896774(kdm5a) 119901504 119905207(kdm5bb) 119905221(kdm5c) 119908808(riox1)
CUD : 121505583(kdm5a) 121506920(kdm5ba) 121517192(kdm5c) 121517439(kdm5bb) 121521468(riox1)
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OML : 112144908(kdm5ba) 112153722(kdm5a) 112157677(riox1) 112158848(kdm5bb) 112159637(kdm5c)
XMA : 102217839 102222341(kdm5a) 102226754 102231454(kdm5c) 102235572
XCO : 114136279 114140344 114143684 114158239 114160957(kdm5a)
XHE : 116707729(kdm5c) 116710930 116712225 116734273(riox1) 116736765(kdm5a)
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NFU : 107377721 107383969(kdm5a) 107385670(kdm5b) 107390506 107391307
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ALIM : 106513272(kdm5b) 106519344 106521815(kdm5a) 106525670 106527724
NWH : 119411942(kdm5ba) 119417487(kdm5bb) 119417559(kdm5c) 119418309(riox1) 119428186(kdm5a)
AOCE : 111571796 111572088 111573173(kdm5a) 111579740 111580302(kdm5c)
MCEP : 124999565(riox1) 124999842(kdm5a) 125001892(kdm5c) 125006763(kdm5ba) 125011346(kdm5bb)
CSEM : 103381232(c7h14orf169) 103382913(kdm5a) 103385382 103385604 103386032
POV : 109629139 109635132(kdm5c) 109636096 109642727 109644697(kdm5a)
SSEN : 122765842(kdm5a) 122768121(kdm5ba) 122775768 122776899(kdm5bb) 122777041(kdm5c) 122784601(riox1)
HHIP : 117757637(kdm5a) 117758517(riox1) 117761190(kdm5ba) 117764197(kdm5bb) 117764490(kdm5c)
HSP : 118099488(riox1) 118101820(kdm5a) 118104557(kdm5ba) 118110699(kdm5c) 118111393(kdm5bb)
LCF : 108873507(riox1) 108882178 108890488(kdm5bb) 108890583 108898916(kdm5ba)
SDU : 111221477 111224734(kdm5a) 111234892 111234913(kdm5c) 111237580(riox1)
SLAL : 111651986(kdm5a) 111654193(kdm5c) 111661395(riox1) 111661918 111667789
XGL : 120788910(riox1) 120798127(kdm5a) 120803546(kdm5c) 120803958(kdm5bb) 120807183(kdm5ba)
HCQ : 109512943(kdm5c) 109514677(riox1) 109522375(kdm5b) 109530074(kdm5a)
SSCV : 125977925 125988112 125989081 125990074 125992170
BPEC : 110164233(riox1) 110164505 110164696(kdm5c) 110164872(kdm5a) 110171262
MALB : 109956240 109960867(kdm5a) 109962343 109966708(kdm5c) 109970307
BSPL : 114849888(riox1) 114856017(kdm5ba) 114858650(kdm5bb) 114859069(kdm5c) 114862570(kdm5a)
SASA : 106565423 106567205 106567237 106571660 106572432 106572475 106575952(kdm5a) 106583259 106608197
STRU : 115150438 115159950 115165692 115165740 115168037 115168078 115174601 115180426 115198640 115207980
OTW : 112216076 112216185 112216188 112216758 112217927 112221870(kdm5bb) 112250477 112254736
OMY : 110490148 110492734(kdm5bb) 110492776 110494185 110500291 110522552 110528247 110529775 110532487 110532524
OGO : 123990907 123994742 123995725 124003024 124017688 124031134 124032101 124032135 124045927 124045947(kdm5bb)
ONE : 115102365 115102398 115106848 115107911 115132334 115132368 115133259 115139161 115141277 115143056
SALP : 111951446 111951526 111954191 111965319 111970225 111977066 112069089
SNH : 120019127 120024164 120031757 120049835 120059223 120059241 120061132(kdm5bb) 120061155 120062251 120065244
CCLU : 121538056 121538092 121545666 121545695 121548544 121552393 121554974 121575137 121577810 121581243
ELS : 105016939(kdm5b) 105017561(riox1) 105020259(kdm5a) 105022334 105022366
SFM : 108918439 108924117(riox1) 108930475(kdm5b) 108931603(kdm5a) 108934831
PKI : 111833285(kdm5a) 111839833(kdm5b) 111841139(riox1) 111847775
AANG : 118207678(kdm5bb) 118211005(kdm5ba) 118211078(kdm5c) 118219251(kdm5a) 118229175(riox1)
LOC : 102687619(kdm5b) 102690207(kdm5a) 102690247(clg1h14orf169)
PSPA : 121299622 121299640 121305503 121317174(riox1) 121317849(kdm5a) 121328496
ARUT : 117411433(riox1) 117430542 117964478 117973573
PSEX : 120525792(riox1) 120526301 120533740(kdm5a) 120542968(kdm5c)
LCM : 102352369(RIOX1) 102354446 102357112(KDM5A) 102367371(KDM5B)
CMK : 103181758(riox1) 103181874(kdm5a) 103190333
CPLA : 122552664(riox1) 122559453(kdm5a) 122563341
BFO : 118413074 118416400 118418186
BBEL : 109477337 109484918
SCLV : 120327006 120341028
APLC : 110974950 110982530
DME : Dmel_CG2982(NO66) Dmel_CG9088(Kdm5)
DSE : 116802029 6612514 6613558
DSI : Dsimw501_GD22616(Dsim_GD22616)
DYA : Dyak_GE16340 Dyak_GE18962
DPO : 117183205 117185202 117185203 117185205 26533390 6903334 6903974
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BCOO : 119071048 119072009 119076252
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BBIF : 117206519 117216404
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CCAL : 108623075 108624157
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CGIG : 122397785 122403328
MPHA : 105830462 105837910
ACEP : 105617083 105622879
PBAR : 105423324 105431133
PFUC : 122519508 122522959
CSOL : 105359430 105368275
TPRE : 106650151 106657024
CGLO : 123260654 123268977
AGIF : 122848926 122851761
CINS : 118065180 118069435
CCIN : 107263919 107269517
CSET : 123310038 123311346
APLN : 108733758 108740416
PPYR : 116165310 116169446
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MSEX : 115441216 115441256 115446655 119191484
DPL : KGM_200115 KGM_208458 KGM_214532
BANY : 112044876 112047021 112050888
NIQ : 126771241 126772336 126777825
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Taxonomy
Reference
Authors
Seward DJ, Cubberley G, Kim S, Schonewald M, Zhang L, Tripet B, Bentley DL
Title
Demethylation of trimethylated histone H3 Lys4 in vivo by JARID1 JmjC proteins.
Journal
Sequence
Reference
Authors
Klose RJ, Yan Q, Tothova Z, Yamane K, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Gilliland DG, Zhang Y, Kaelin WG Jr
Title
The retinoblastoma binding protein RBP2 is an H3K4 demethylase.
Journal
Sequence
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Authors
Iwase S, Lan F, Bayliss P, de la Torre-Ubieta L, Huarte M, Qi HH, Whetstine JR, Bonni A, Roberts TM, Shi Y
Title
The X-linked mental retardation gene SMCX/JARID1C defines a family of histone H3 lysine 4 demethylases.
Journal
Sequence
Reference
Authors
Christensen J, Agger K, Cloos PA, Pasini D, Rose S, Sennels L, Rappsilber J, Hansen KH, Salcini AE, Helin K
Title
RBP2 belongs to a family of demethylases, specific for tri-and dimethylated lysine 4 on histone 3.
Journal
Sequence
Other DBs