EC               Enzyme                                 

[histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4 FAD-dependent demethylase;
KDM1 (gene name);
LSD1 (gene name);
lysine-specific histone demethylase 1
Acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen;
[histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4:acceptor oxidoreductase (demethylating)
a [histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4 + 2 acceptor + 2 H2O = a [histone H3]-L-lysine4 + 2 formaldehyde + 2 reduced acceptor (overall reaction) [RN:R12462];
(1a) a [histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4 + acceptor + H2O = a [histone H3]-N6-methyl-L-lysine4 + formaldehyde + reduced acceptor [RN:R12463];
(1b) a [histone H3]-N6-methyl-L-lysine4 + acceptor + H2O = a [histone H3]-L-lysine4 + formaldehyde + reduced acceptor [RN:R12464]
[histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4;
acceptor [CPD:C00028];
H2O [CPD:C00001];
[histone H3]-N6-methyl-L-lysine4
[histone H3]-L-lysine4;
formaldehyde [CPD:C00067];
reduced acceptor [CPD:C00030];
[histone H3]-N6-methyl-L-lysine4
The enzyme specifically removes methyl groups from mono- and dimethylated lysine4 of histone 3. During the reaction the substrate is oxidized by the FAD cofactor of the enzyme to generate the corresponding imine, which is subsequently hydrolysed in the form of formaldehyde.The enzyme is similar to flavin amine oxidases, and differs from all other known histone lysine demethylases, which are iron(II)- and 2-oxoglutarate-dependent dioxygenases. The physiological electron acceptor is not known with certainty. In vitro the enzyme can use oxygen, which is reduced to hydrogen peroxide, but generation of hydrogen peroxide in the chromatin environment is unlikely as it will result in oxidative damage of DNA.
EC created 2019
K11450  [histone H3]-N6,N6-dimethyl-L-lysine4 FAD-dependent demethylase
HSA: 23028(KDM1A)
PTR: 456614(KDM1A)
PPS: 100995039(KDM1A)
GGO: 101144258(KDM1A)
PON: 100171870(KDM1A)
NLE: 100579631(KDM1A)
MCC: 718609(KDM1A)
MCF: 102135743(KDM1A)
CSAB: 103225404(KDM1A)
CATY: 105595010(KDM1A)
PANU: 101010766(KDM1A)
RRO: 104663232(KDM1A)
RBB: 108538436(KDM1A)
TFN: 117093150(KDM1A)
PTEH: 111547709(KDM1A)
CJC: 100406478(KDM1A)
SBQ: 101034653(KDM1A)
MMUR: 105863495(KDM1A)
MMU: 99982(Kdm1a)
MCAL: 110292704(Kdm1a)
MPAH: 110322979(Kdm1a)
RNO: 500569(Kdm1a)
MCOC: 116096867(Kdm1a)
MUN: 110545399(Kdm1a)
CGE: 100770721(Kdm1a)
PLEU: 114697214(Kdm1a)
NGI: 103746403(Kdm1a)
HGL: 101706376(Kdm1a)
CPOC: 100723459(Kdm1a)
CCAN: 109681855(Kdm1a)
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OPI: 101536443(KDM1A)
TUP: 102491246(KDM1A)
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VVP: 112930162(KDM1A)
VLG: 121496707(KDM1A)
AML: 100469590(KDM1A)
UMR: 103666569(KDM1A)
UAH: 113268534(KDM1A)
ORO: 101371349(KDM1A)
ELK: 111154639
MPUF: 101680728(KDM1A)
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AJU: 106977650(KDM1A)
HHV: 120231390(KDM1A)
BTA: 532997(KDM1A)
BOM: 102287646(KDM1A)
BIU: 109574017(KDM1A)
BBUB: 102396562(KDM1A)
CHX: 102185879(KDM1A)
OAS: 101121409(KDM1A)
ODA: 120855026(KDM1A)
CCAD: 122426548(KDM1A)
SSC: 100127157(KDM1A)
CFR: 102517288(KDM1A)
CBAI: 105070864(KDM1A)
CDK: 105088880(KDM1A)
BACU: 103012479(KDM1A)
LVE: 103084888(KDM1A)
OOR: 101273117(KDM1A)
DLE: 111163462(KDM1A)
PCAD: 102995575(KDM1A)
PSIU: 116748436(KDM1A)
ECB: 100071646(KDM1A)
EPZ: 103551290(KDM1A)
EAI: 106839994(KDM1A)
MYB: 102261213(KDM1A)
MYD: 102754604(KDM1A)
MMYO: 118675325(KDM1A)
MLF: 102441324(KDM1A)
MNA: 107538326(KDM1A)
PKL: 118723786(KDM1A)
HAI: 109375888(KDM1A)
DRO: 112299203(KDM1A)
SHON: 118977833(KDM1A)
AJM: 119042278(KDM1A)
PDIC: 114497837(KDM1A)
MMF: 118626407(KDM1A)
RFQ: 117027824(KDM1A)
PALE: 102887129(KDM1A)
PGIG: 120596321(KDM1A)
RAY: 107513066(KDM1A)
MJV: 108391096(KDM1A)
TOD: 119235233(KDM1A)
LAV: 100663912(KDM1A)
TMU: 101347919
MDO: 100025161(KDM1A)
GAS: 123241010(KDM1A)
SHR: 100923421(KDM1A)
PCW: 110206041(KDM1A)
OAA: 100086658(KDM1A)
GGA: 419571(KDM1A)
PCOC: 116230114(KDM1A)
MGP: 100544521(KDM1A)
CJO: 107323904(KDM1A)
NMEL: 110387355(KDM1A)
APLA: 101803659(KDM1A)
ACYG: 106046571(KDM1A)
TGU: 100221744(KDM1A)
LSR: 110484269(KDM1A)
SCAN: 103822578(KDM1A)
PMOA: 120511678(KDM1A)
OTC: 121342723(KDM1A)
PRUF: 121359874(KDM1A)
GFR: 102041827(KDM1A)
FAB: 101810697(KDM1A)
PHI: 102109140(KDM1A)
PMAJ: 107214056(KDM1A)
CCAE: 111939020(KDM1A)
CCW: 104697964(KDM1A)
ETL: 114061578(KDM1A)
FPG: 101923221(KDM1A)
FCH: 102058829(KDM1A)
CLV: 102088529(KDM1A)
EGZ: 104132548(KDM1A)
NNI: 104015516(KDM1A)
ACUN: 113488263(KDM1A)
PADL: 103925455(KDM1A)
AAM: 106484726(KDM1A)
AROW: 112971154(KDM1A)
NPD: 112951862(KDM1A)
DNE: 112984542(KDM1A)
ASN: 102375236(KDM1A)
AMJ: 102563192(KDM1A)
CPOO: 109318445(KDM1A)
GGN: 109294012(KDM1A)
PSS: 102460305(KDM1A)
CMY: 102931629(KDM1A)
CPIC: 101940420(KDM1A)
TST: 117868370(KDM1A)
CABI: 116826277(KDM1A)
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ACS: 100557968(kdm1a)
PVT: 110089669(KDM1A)
SUND: 121915735(KDM1A)
PBI: 103067389(KDM1A)
PMUR: 107288027(KDM1A)
TSR: 106540788(KDM1A)
PGUT: 117669298(KDM1A)
VKO: 123026095(KDM1A)
PMUA: 114603591(KDM1A)
ZVI: 118087744(KDM1A)
GJA: 107116662(KDM1A)
XLA: 100127344(kdm1a.S) 108708259(kdm1a.L)
XTR: 100216250(kdm1a)
NPR: 108788279(KDM1A)
DRE: 558450(kdm1a)
SRX: 107711588
SGH: 107582487
CCAR: 109048821(kdm1a)
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DSE: 6616257
DSI: Dsimw501_GD14861(Dsim_GD14861)
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DGR: 6557229
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DNV: 108651092
DHE: 111600951
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SCAC: 106094569
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AAG: 5574767
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CPII: 120417587
AME: 726469
ACER: 108001570
BIM: 100740140
BBIF: 117205179
BVK: 117243561
BVAN: 117164701
BTER: 100647583
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OBB: 114871968
MGEN: 117220295
NMEA: 116426390
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SOC: 105200954
MPHA: 105832792
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PGC: 109854993
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CSOL: 105360759
TPRE: 106658470
MDL: 103580293
CGLO: 123271527
FAS: 105263211
DAM: 107041294
AGIF: 122855020
CCIN: 107267660
TCA: 103315031
DPA: 109547044
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NVL: 108560657
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PPYR: 116169590
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PPOT: 106103126
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PXY: 105386718(bursa)
API: 100168654
DNX: 107174085
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HAME: 121869618
HAZT: 108664332
EAF: 111695147
TUT: 107368558
DPTE: 113789474
CSCU: 111638896
PTEP: 107446922
SDM: 118182146
PCAN: 112561001
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PMAX: 117328302
OBI: 106869849
OSN: 115224219
LAK: 106170923
EGL: EGR_08887
NVE: 5512813
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PEQ: 110039551
AOF: 109844854
 » show all
1  [PMID:15811342]
Forneris F, Binda C, Vanoni MA, Mattevi A, Battaglioli E
Histone demethylation catalysed by LSD1 is a flavin-dependent oxidative process.
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Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database:
IUBMB Enzyme Nomenclature:
ExPASy - ENZYME nomenclature database:
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