KEGG   ENZYME: 2.4.2.21
Entry
EC 2.4.2.21                 Enzyme                                 
Name
nicotinate-nucleotide---dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase;
nicotinate mononucleotide-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase;
nicotinate ribonucleotide:benzimidazole (adenine) phosphoribosyltransferase;
nicotinate-nucleotide:dimethylbenzimidazole phospho-D-ribosyltransferase;
CobT;
nicotinate mononucleotide (NaMN):5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
Class
Transferases;
Glycosyltransferases;
Pentosyltransferases
Sysname
nicotinate-nucleotide:5,6-dimethylbenzimidazole phospho-D-ribosyltransferase
Reaction(IUBMB)
beta-nicotinate D-ribonucleotide + 5,6-dimethylbenzimidazole = nicotinate + alpha-ribazole 5'-phosphate [RN:R04148]
Reaction(KEGG)
R04148
Substrate
beta-nicotinate D-ribonucleotide [CPD:C01185];
5,6-dimethylbenzimidazole [CPD:C03114]
Product
nicotinate [CPD:C00253];
alpha-ribazole 5'-phosphate [CPD:C04778]
Comment
Also acts on benzimidazole, and the clostridial enzyme acts on adenine to form 7-alpha-D-ribosyladenine 5'-phosphate. The product of the reaction, alpha-ribazole 5'-phosphate, forms part of the corrin-biosynthesis pathway and is a substrate for EC 2.7.8.26, adenosylcobinamide-GDP ribazoletransferase [4]. It can also be dephosphorylated to form alpha-ribazole by the action of EC 3.1.3.73, alpha-ribazole phosphatase.
History
EC 2.4.2.21 created 1972
Pathway
ec00860  Porphyrin metabolism
ec01100  Metabolic pathways
Orthology
K00768  nicotinate-nucleotide--dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase
Genes
ECOb1991(cobT)
ECJJW1969(cobT)
ECDECDH10B_2135(cobT)
EBWBWG_1785(cobT)
ECOKECMDS42_1619(cobT)
ECEZ3151(cobT)
ECSECs_2786(cobT)
ECFECH74115_2836(cobT)
ETWECSP_2656(cobT)
ELXCDCO157_2570(cobT)
EOIECO111_2637(cobT)
EOJECO26_2881(cobT)
EOHECO103_2452(cobT)
ECOOECRM13514_2623(cobT)
ECOHECRM13516_2551(cobT)
ESLO3K_09615(cobT)
ESOO3O_16010(cobT)
ESMO3M_09580(cobT)
ECKEC55989_2225(cobT)
ECGE2348C_2124(cobT)
EOKG2583_2501(cobT)
ELRECO55CA74_12020(cobT)
ELHETEC_2101
ECWEcE24377A_2273(cobT)
EUNUMNK88_2513(cobT)
ECPECP_1989
ENAECNA114_2062(cobT)
ECOSEC958_2307(cobT)
ECVAPECO1_1072(cobT)
ECOAAPECO78_13750(cobT)
ECXEcHS_A2114(cobT)
ECMEcSMS35_1133(cobT)
ECYECSE_2275
ECRECIAI1_2072(cobT)
ECQECED1_2327(cobT)
EUMECUMN_2327(cobT)
ECTECIAI39_1056(cobT)
EOCCE10_2282(cobT)
EBRECB_01900(cobT)
EBLECD_01900(cobT)
EBEB21_01889(cobT)
EBDECBD_1658
ECIUTI89_C2229(cobT)
EIHECOK1_2190(cobT)
ECZECS88_2056(cobT)
ECCc2477(cobT)
ELOEC042_2229(cobT)
ELNNRG857_10120(cobT)
ESEECSF_1849
ECLEcolC_1637
EKOEKO11_1790
EKFKO11_12780(cobT)
EABECABU_c22860(cobT)
EDHEcDH1_1665
EDJECDH1ME8569_1927(cobT)
ELUUM146_07045(cobT)
ELWECW_m2163(cobT)
ELLWFL_10590(cobT)
ELCi14_2287(cobT)
ELDi02_2287(cobT)
ELPP12B_c1027(cobT)
ELFLF82_0336(cobT)
ECOLLY180_10315(cobT)
ECOIECOPMV1_02114(cobT)
ECOJP423_11160(cobT)
EALEAKF1_ch4326(cobT)
EMAC1192_01980(cobT)
ESZFEM44_24860(cobT)
STYSTY2219(cobT)
STTt0858(cobT)
SEXSTBHUCCB_9150
SENTTY21A_04365(cobT)
STMSTM2016(cobT)
SEOSTM14_2504(cobT)
SEVSTMMW_20471
SEYSL1344_1992(cobT)
SEMSTMDT12_C20380(cobT)
SEJSTMUK_2046(cobT)
SEBSTM474_2101(cobT)
SEFUMN798_2181(cobT)
SETUSTU288_06470(cobT)
SETCCFSAN001921_06705(cobT)
SENRSTMDT2_19891(cobT)
SENDDT104_20741(cobT)
SENICY43_10895(cobT)
SEENSE451236_16290(cobT)
SPTSPA0855(cobT)
SEKSSPA0800
SPQSPAB_01089
SEISPC_1699(cobT)
SECSCH_2024(cobT)
SEHSeHA_C2238(cobT)
SHBSU5_02610
SENHCFSAN002069_21740(cobT)
SEEHSEEH1578_19360(cobT)
SEESNSL254_A2192(cobT)
SENNSN31241_31170
SEWSeSA_A2185(cobT)
SEASeAg_B2138(cobT)
SENSQ786_09950(cobT)
SEDSeD_A2351(cobT)
SEGSG2040(cobT)
SELSPUL_0884(cobT)
SEGASPUCDC_0884(cobT)
SETSEN2014(cobT)
SENAAU38_10165(cobT)
SENOAU37_10175(cobT)
SENVAU39_10175(cobT)
SENQAU40_11420(cobT)
SENLIY59_10460(cobT)
SENJCFSAN001992_01355(cobT)
SEECCFSAN002050_17040(cobT)
SEEBSEEB0189_009385(cobT)
SEEPI137_04000(cobT)
SENBBN855_21010(cobT)
SENEIA1_10060(cobT)
SENCSEET0819_17225(cobT)
SESSARI_00872
SALZEOS98_08930(cobT)
SFLSF2059(cobT)
SFXS2169(cobT)
SFVSFV_2063(cobT)
SFESFxv_2293(cobT)
SFNSFy_2940
SFSSFyv_3011
SFTNCTC1_02252(cobT)
SSNSSON_2052(cobT)
SBOSBO_1212(cobT)
SBCSbBS512_E0967(cobT)
SDYSDY_2242(cobT)
SDZAsd1617_03035
SHQA0259_13815(cobT)
ESHC1N69_08040(cobT)
ENRH650_05785(cobT)
ENFAKI40_1806(cobT)
CCONAFK62_16850(cobT)
KPNKPN_02463(cobT) KPN_03182(cobT)
KPUKP1_3667(cobT) KP1_4446(cobT)
KPMKPHS_35230 KPHS_42460
KPPA79E_0928 A79E_1643
KPHKPNIH24_07565(cobT) KPNIH24_11010(cobT)
KPZKPNIH27_16855(cobT) KPNIH27_20565(cobT)
KPVKPNIH29_17475(cobT) KPNIH29_21335(cobT)
KPWKPNIH30_17795(cobT) KPNIH30_21355(cobT)
KPYKPNIH31_16775(cobT) KPNIH31_20620(cobT)
KPGKPNIH32_18120(cobT) KPNIH32_22215(cobT)
KPCKPNIH10_17240(cobT) KPNIH10_21145(cobT)
KPQKPR0928_17225(cobT) KPR0928_20630(cobT)
KPTVK055_4344(cobT) VK055_5057(cobT2)
KPOKPN2242_15375(cobT) KPN2242_18860(cobT)
KPRKPR_1640(cobT) KPR_1853(cobT)
KPJN559_1059 N559_1795
KPID364_12565(cobT) D364_16155(cobT)
KPAKPNJ1_01064 KPNJ1_01913
KPSKPNJ2_01095 KPNJ2_01877
KPXPMK1_00663(cobT_1) PMK1_04906(cobT_2)
KPBFH42_08430(cobT) FH42_11870(cobT)
KPNEKU54_005215(cobT) KU54_008810(cobT)
KPNULI86_05225(cobT) LI86_08780(cobT)
KPNKBN49_0926(cobT) BN49_3680(cobT2)
KVAKvar_0888 Kvar_1615
KPEKPK_0934(cobT) KPK_1724
KPKA593_02060(cobT) A593_06040(cobT)
KVDKR75_03490 KR75_26060
KVQSP68_06215 SP68_10035
KOXKOX_01340(cobT)
KOEA225_4732
KOYJ415_08355(cobT)
KOMHR38_27475(cobT)
KOKKONIH1_23780(cobT)
KOCAB185_12610(cobT)
KQUAVR78_21460 AVR78_25660
EAEEAE_23295(cobT)
EARCCG29214
KQVB8P98_05145(cobT) B8P98_09630(cobT)
KLLBJF97_23610
KLWDA718_05580(cobT)
KARLGL98_04725(cobT) LGL98_08440(cobT)
KGRJJJ10_05600(cobT)
RORRORB6_02270(cobT)
RONTE10_19060(cobT)
RAODSD31_08635(cobT)
RTGNCTC13098_02375(cobT)
REEelectrica_01720(cobT)
CROROD_21011(cobT)
CKOCKO_00822
CFDCFNIH1_21075(cobT)
CBRAA6J81_01235(cobT)
CWECO701_08150(cobT)
CYOCD187_09335(cobT)
CPOTFOB25_20645(cobT)
CFQC2U38_15195(cobT)
CSEDJY391_08910(cobT)
CAMAF384_10290(cobT)
CAFAL524_12395(cobT)
CIFAL515_10170(cobT)
CFARCI104_16075(cobT)
CIRC2U53_25885(cobT)
CIEAN232_14115(cobT)
CPARCUC49_05545(cobT)
CTELGBC03_14405(cobT)
CITZE4Z61_02975(cobT)
CARSE1B03_16605(cobT)
EBTEBL_c14950(cobT)
PGELG71_20555(cobT)
ESCEntcl_1782
KLEAO703_13030(cobT)
KSAC813_00230
KORAWR26_09265(cobT)
KRDA3780_14710(cobT)
KCOBWI95_19900
KOTEH164_08305(cobT)
KPSEIP581_14345(cobT)
KIENCTC12125_00666(cobT)
KASKATP_16250(cobT)
LPNUKQ929_03075(cobT)
LAZA8A57_17740
BUFD8682_20910(cobT) D8682_24295(cobT)
BAGEBADSM9389_15460
BFTMNO13_05130(cobT) MNO13_08275(cobT)
METYMRY16398_18820(cobT)
AHNNCTC12129_03317(cobT_2)
ASUBNLZ15_07945(cobT)
YREHEC60_09695(cobT)
KINAB182_08260(cobT)
PDZHHA33_11385(cobT)
PSGCG163CM_06320(cobT)
EBFD782_1639
EBCC2U52_18845(cobT)
EBUCUC76_20400(cobT) CUC76_24135(cobT)
YENYE2707(cobT)
YEPYE105_C1580
YEYY11_15901
YELLC20_02055(cobT)
YEWCH47_2054(cobT)
YETCH48_3177(cobT)
YEFFORC2_2686
YEEYE5303_31381(cobT)
YALAT01_4060(cobT)
YFRAW19_745(cobT)
YINCH53_3392(cobT)
YKRCH54_917(cobT)
YROCH64_105(cobT)
YAKACZ76_01540(cobT)
YMADA391_08265(cobT)
YHID5F51_11385(cobT)
YCAF0T03_13855(cobT)
YMOHRD69_13280(cobT)
YASN0H69_16965(cobT)
SFWWN53_18895(cobT)
SFGAV650_14130(cobT)
RAHRahaq_2610
RACEJHW33_04135(cobT)
RAQRahaq2_2066
RAAQ7S_12995(cobT)
ROXBV494_03785
RVCJ9880_20025(cobT)
BGJAWC36_11355(cobT)
BRBEH207_06545(cobT)
BNGEH206_15025(cobT)
BIZHC231_15965(cobT)
SLIGGTU79_14805(cobT)
PLUplu2980(cobT)
PLUMA4R40_14890(cobT)
PAYPAU_01618(cobT)
PTTVY86_16790(cobT)
PAKHB0X70_15260
PLUICE143_15255(cobT)
XBOXBJ1_0833(cobT)
XBVXBW1_1578(cobT)
XNEXNC1_1169(cobT)
XNMXNC2_1149(cobT)
XPOXPG1_0793(cobT)
XBUHGO23_15180(cobT)
MMKMU9_995
EICNT01EI_1851
ETRETAE_1847(cobT)
ETDETAF_1666
ETEETEE_3894(cobU)
ETCETAC_08465(cobT)
EDWQY76_11040(cobT)
EDLAAZ33_09400(cobT)
EHOA9798_08695
HAVAT03_05725(cobT) AT03_08690(cobT)
HPARAL518_20260(cobT)
OPODSM2777_13945(cobT) DSM2777_20735(cobT)
PFQQQ39_10675(cobT)
PRAGEKN56_09750(cobT)
LRINCTC12151_01597(cobT)
XCCXCC3059(cobT)
XCBXC_1099
XCAxcc-b100_1136(cobT)
XCPXCR_3396
XCVXCV3315(cobT)
XAXXACM_3101(cobT)
XACXAC3186(cobT)
XCIXCAW_03473(cobT)
XCTJ151_03368
XCJJ158_03347
XCUJ159_03343
XCNJ169_03366
XCWJ162_03347
XCRJ163_03343
XCMJ164_03343
XCFJ172_03359
XFUXFF4834R_chr14440(cobT)
XAOXAC29_16210(cobT)
XOMXOO1241(XOO1241)
XOOXOO1351(cobT)
XOPPXO_01924
XOYAZ54_17720
XORXOC_3394
XOZBE73_05660
XVEBJD12_06770
XPEBJD13_22925
XHRXJ27_21195
XGABI317_17945
XPHXppCFBP6546_18115(cobT)
XANAC801_15925
XARXB05_10620
XEUXSP_003082(cobT)
XHDLMG31886_11690(cobT)
XPRMUG10_15915(cobT)
SACZAOT14_05910(cobT)
STEKAXG53_15040
PJPLAG73_00285(cobT)
LABLA76x_1226(cobT)
LAQGLA29479_1975(cobT)
LCPLC55x_4224(cobT)
LGULG3211_4015(cobT)
LEZGLE_4083(cobT)
LEMLEN_1117(cobT)
LMBC9I47_2546
LUEDCD74_07955(cobT)
LYJFKV23_13090(cobT)
LSOLGOY17_04095(cobT)
FAUFraau_1294
DJICH75_15905
DJAHY57_07025
DCSISN74_02915(cobT)
DTLH8F01_13690(cobT)
DTADYST_04013
LPYFIV34_19065(cobT)
VCHVC_1237
VCFIR04_11500
VCSMS6_1021
VCEVch1786_I0742(cobT)
VCQEN18_09490
VCJVCD_003111
VCIO3Y_05760(cobT)
VCOVC0395_A0859(cobT)
VCRVC395_1356(cobT)
VCMVCM66_1192(cobT)
VCLVCLMA_A1084
VCXVAA049_2507(cobT)
VCZVAB027_1916(cobT)
VVUVV1_2788(cobT)
VVYVV1474
VVMVVMO6_01743
VVLVV93_v1c13840(cobT)
VPAVP1304
VPBVPBB_1229
VPKM636_15285
VPFM634_08430
VPHVPUCM_1913
VHAVIBHAR_02126
VCAM892_02680
VAGN646_0342 N646_0343
VEXVEA_003693
VDBAL552_14755(cobT)
VHRAL538_01955(cobT)
VNAPN96_06830
VOWA9237_01330
VROBSZ04_14410
VSPVS_1702
VEJVEJY3_06340(cobT)
VFUvfu_A02111
VNIVIBNI_A1492
VANVAA_03084
LAGN175_07130
VAUVANGNB10_cI1528c(cobT)
VCYIX92_06305
VCTJV59_32155
VTUIX91_06900
VEUIXK98_15350(cobT)
VSIMTO69_07400(cobT)
VFLAL536_14305(cobT)
VMIAL543_15500(cobT)
VSCVSVS12_01605(cobU)
VGABSQ33_02220
VSHBSZ05_13270
VQICCZ37_05380(cobT)
VTAA0502(cobT)
VAFD1115_08055(cobT)
VNLD3H41_06485(cobT)
VCCFAZ90_08395(cobT)
VASGT360_07555(cobT)
VSRVspart_01989(cobT)
VKABTD91_12955(cobT)
VZIG5S32_06035(cobT) G5S32_07555(cobT)
VNVIF132_08795(cobT)
VGIMID13_06855(cobT)
VSLLTQ54_01660(cobT)
VPLSA104470976_00985(cobT)
VJPNP165_07190(cobT)
VPGLZI70_13475(cobT)
PPRPBPRA1182(VV1474)
PGBH744_2c2254
PDSCAY62_08990
PAEPA1279(cobU)
PAEVN297_1319(cobT)
PAEIN296_1319(cobT)
PAUPA14_47670(cobU)
PAPPSPA7_4111(cobT)
PAGPLES_40331(cobU)
PAFPAM18_3750(cobT)
PNCNCGM2_2163(cobT)
PAEBNCGM1900_5295(cobT)
PDKPADK2_19250(cobT)
PSGG655_18770(cobT)
PRPM062_06960
PAEPPA1S_19510
PAERPA1R_gp4886
PAEMU769_19360
PAELT223_20605
PAESSCV20265_4134
PAEGAI22_14450
PAECM802_1316(cobT)
PAEOM801_1318(cobT)
PMYPmen_1757
PMKMDS_3105
PREPCA10_18280(cobT)
PPSEBN5_1590(cobT)
PFUWKF707C_38790
PALCA0T30_09000
PCQPcP3B5_15510(cobT)
PMUIG4G71_10075(cobT)
PPUPP_1679(cobU)
PPFPput_4040
PPGPputGB1_1278
PPWPputW619_1238
PPTPPS_1330
PPBPPUBIRD1_3938(cobT)
PPIYSA_02426
PPXT1E_3643(cobT)
PPUHB479_06430(cobT)
PPUTL483_05950
PPUNPP4_40920(cobT)
PPUDDW66_1252 DW66_1614
PFVPsefu_1881
PMONX969_04525
PMOTX970_04500
PMOSO165_016280
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PORAPT59_07150
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MEDMELS_0668 MELS_0694
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CGLCgl2200(Cgl2200)
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SPAVSpa2297_05950 Spa2297_08985
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STSIA4E84_07710 A4E84_11230
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SRJSRO_5288 SRO_5924
SLKSLUN_07080 SLUN_10645(cobT)
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SQZFQU76_04560(cobT) FQU76_07480
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SASTCD934_24625(cobT) CD934_27955
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STIRDDW44_01845 DDW44_04170(cobT)
SKACP970_31775(cobT) CP970_36030(cobT)
SGZC0216_21195 C0216_23890(cobT)
SVNCP980_23985(cobT) CP980_26955(cobT)
SNKCP967_25190(cobT) CP967_28640(cobT)
SHAWCEB94_08155 CEB94_11765(cobT)
SRKFGW37_06295(cobT) FGW37_09155
SFICEIZ62_24240(cobT) EIZ62_27435(cobT)
SGALCP966_06170(cobT)
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SVRCP971_24235 CP971_26925(cobT)
SPADDVK44_03585(cobT) DVK44_06810(cobT)
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SLFJEQ17_33585(cobT) JEQ17_37915(cobT)
SDECL3078_08840(cobT) L3078_12740(cobT)
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SCTSCAT_1300(cobT) SCAT_5271
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HDFAArcSl_1957(cobT)
MELUMTLP_10000(cobT)
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Reference
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PARTIAL PURIFICATION AND PROPERTIES OF A SINGLE DISPLACEMENT TRANS-N-GLYCOSIDASE.
  Journal
J Biol Chem 240:413-8 (1965)
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  Authors
Friedmann HC, Fyfe JA.
  Title
Pseudovitamin B 12 biosynthesis. Enzymatic formation of a new adenylic acid, 7-alpha-D-ribofuranosyladenine 5'-phosphate.
  Journal
J Biol Chem 244:1667-71 (1969)
Reference
3  [PMID:4238408]
  Authors
Fyfe JA, Friedmann HC.
  Title
Vitamin B 12 biosynthesis. Enzyme studies on the formation of the alpha-glycosidic nucleotide precursor.
  Journal
J Biol Chem 244:1659-66 (1969)
Reference
4  [PMID:1917841]
  Authors
Cameron B, Blanche F, Rouyez MC, Bisch D, Famechon A, Couder M, Cauchois L, Thibaut D, Debussche L, Crouzet J
  Title
Genetic analysis, nucleotide sequence, and products of two Pseudomonas denitrificans cob genes encoding nicotinate-nucleotide: dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase and cobalamin (5'-phosphate) synthase.
  Journal
J Bacteriol 173:6066-73 (1991)
DOI:10.1128/JB.173.19.6066-6073.1991
  Sequence
Reference
5  [PMID:11441022]
  Authors
Cheong CG, Escalante-Semerena JC, Rayment I.
  Title
Structural investigation of the biosynthesis of alternative lower ligands for cobamides by nicotinate mononucleotide: 5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase from Salmonella enterica.
  Journal
J Biol Chem 276:37612-20 (2001)
DOI:10.1074/jbc.M105390200
  Sequence
[stm:STM2016]
Reference
6  [PMID:12101181]
  Authors
Cheong CG, Escalante-Semerena JC, Rayment I.
  Title
Capture of a labile substrate by expulsion of water molecules from the active site of nicotinate mononucleotide:5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase (CobT) from Salmonella enterica.
  Journal
J Biol Chem 277:41120-7 (2002)
DOI:10.1074/jbc.M203535200
Other DBs
ExplorEnz - The Enzyme Database: 2.4.2.21
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