KEGG   ENZYME: 3.6.4.13
Entry
EC 3.6.4.13                 Enzyme                                 

Name
RNA helicase;
CSFV NS3 helicase;
DBP2;
DbpA;
DDX17;
DDX25;
DDX3;
DDX3X;
DDX3Y;
DDX4;
DDX5;
DEAD-box protein DED1;
DEAD-box RNA helicase;
DEAH-box protein 2;
DEAH-box RNA helicase;
DED1;
Dex(H/D) RNA helicase;
EhDEAD1;
EhDEAD1 RNA helicase;
eIF4A helicase;
KOKV helicase;
Mtr4p;
nonstructural protein 3 helicase;
NPH-II;
RHA;
RNA helicase A;
RNA helicase DDX3;
RNA helicase Hera;
RNA-dependent ATPase;
TGBp1 NTPase/helicase domain;
VRH1;
GRTH/DDX25
Class
Hydrolases;
Acting on acid anhydrides;
Acting on acid anhydrides to facilitate cellular and subcellular movement
Sysname
ATP phosphohydrolase (RNA helix unwinding)
Reaction(IUBMB)
ATP + H2O = ADP + phosphate
Substrate
ATP [CPD:C00002];
H2O [CPD:C00001]
Product
ADP [CPD:C00008];
phosphate [CPD:C00009]
Comment
RNA helicases utilize the energy from ATP hydrolysis to unwind RNA. Some of them unwind RNA with a 3' to 5' polarity [3], other show 5' to 3' polarity [8]. Some helicases unwind DNA as well as RNA [7,8]. May be identical with EC 3.6.4.12 (DNA helicase).
History
EC 3.6.4.13 created 2009
Orthology
K03578  ATP-dependent helicase HrpA
K03579  ATP-dependent helicase HrpB
K03732  ATP-dependent RNA helicase RhlB
K05590  ATP-dependent RNA helicase SrmB
K05591  ATP-dependent RNA helicase DbpA
K05592  ATP-dependent RNA helicase DeaD
K11273  chromosome transmission fidelity protein 1
K11594  ATP-dependent RNA helicase DDX3X
K11701  helicase required for RNAi-mediated heterochromatin assembly 1
K11927  ATP-dependent RNA helicase RhlE
K12598  ATP-dependent RNA helicase DOB1
K12614  ATP-dependent RNA helicase DDX6/DHH1
K12646  ATP-dependent RNA helicase DDX58
K12647  interferon-induced helicase C domain-containing protein 1
K12649  ATP-dependent RNA helicase DHX58
K12811  ATP-dependent RNA helicase DDX46/PRP5
K12812  ATP-dependent RNA helicase UAP56/SUB2
K12813  pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
K12814  pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase-like protein PRP2
K12815  pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX38/PRP16
K12818  ATP-dependent RNA helicase DHX8/PRP22
K12820  pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15/PRP43
K12823  ATP-dependent RNA helicase DDX5/DBP2
K12835  ATP-dependent RNA helicase DDX42
K12854  pre-mRNA-splicing helicase BRR2
K12858  ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
K13025  ATP-dependent RNA helicase
K13026  ATP-dependent RNA helicase DHX57
K13116  ATP-dependent RNA helicase DDX41
K13117  ATP-dependent RNA helicase DDX35
K13131  ATP-dependent RNA helicase DDX20
K13177  ATP-dependent RNA helicase DDX1
K13178  ATP-dependent RNA helicase DDX17
K13179  ATP-dependent RNA helicase DDX18/HAS1
K13181  ATP-dependent RNA helicase DDX27
K13182  ATP-dependent RNA helicase DDX39
K13183  ATP-dependent RNA helicase DDX50
K13184  ATP-dependent RNA helicase A
K13185  ATP-dependent RNA helicase DHX30
K13982  probable ATP-dependent RNA helicase DDX4
K13983  putative helicase MOV10L1
K14433  ATP-dependent RNA helicase DQX1
K14442  ATP-dependent RNA helicase DHX36
K14776  ATP-dependent RNA helicase DDX10/DBP4
K14777  ATP-dependent RNA helicase DDX47/RRP3
K14778  ATP-dependent RNA helicase DDX49/DBP8
K14779  ATP-dependent RNA helicase DDX52/ROK1
K14780  ATP-dependent RNA helicase DHX37/DHR1
K14781  ATP-dependent RNA helicase DHR2
K14805  ATP-dependent RNA helicase DDX24/MAK5
K14806  ATP-dependent RNA helicase DDX31/DBP7
K14807  ATP-dependent RNA helicase DDX51/DBP6
K14808  ATP-dependent RNA helicase DDX54/DBP10
K14809  ATP-dependent RNA helicase DDX55/SPB4
K14810  ATP-dependent RNA helicase DDX56/DBP9
K14811  ATP-dependent RNA helicase DBP3
K16911  ATP-dependent RNA helicase DDX21
K17043  ATP-dependent RNA helicase DDX43
K17265  Ras GTPase-activating protein-binding protein 1
K17642  ATP-dependent RNA helicase DDX3Y
K17675  ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1/SUV3
K17678  ATP-dependent RNA helicase MRH4, mitochondrial
K17679  ATP-dependent RNA helicase MSS116, mitochondrial
K17820  ATP-dependent RNA helicase DHX33
K18408  ATP-dependent RNA helicase TDRD9
K18409  ATP-dependent RNA helicase TDRD12
K18422  helicase MOV-10
K18432  RNA helicase armi
K18655  ATP-dependent RNA helicase DDX19/DBP5
K18656  ATP-dependent RNA helicase DDX25
K18664  antiviral helicase SLH1
K18692  ATP-dependent RNA helicase CshB
K18711  ATP-dependent RNA helicase DHX40
K18994  pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX32
K18995  ATP-dependent RNA helicase DHX29
K19036  ATP-dependent RNA/DNA helicase IGHMBP2
K19466  ATP-dependent RNA helicase DDX59
K20096  ATP-dependent RNA helicase DDX28
K20099  ATP-dependent RNA helicase YTHDC2
K20101  ATP-dependent RNA helicase DHX34
K20103  ATP-dependent RNA helicase DDX60
K21505  Orthopoxvirus RNA helicase NPH-II
K21869  ATP-dependent RNA helicase DDX53
K22273  HCV serine protease / helicase NS3
K25022  SARS coronavirus helicase
K25328  Flavivirus serine protease NS3 catalytic subunit
Genes
HSA: 10146(G3BP1) 10212(DDX39A) 10521(DDX17) 11056(DDX52) 11218(DDX20) 11269(DDX19B) 11325(DDX42) 122402(TDRD9) 1653(DDX1) 1654(DDX3X) 1655(DDX5) 165545(DQX1) 1656(DDX6) 1659(DHX8) 1660(DHX9) 1662(DDX10) 1663(DDX11) 1665(DHX15) 168400(DDX53) 170506(DHX36) 22907(DHX30) 23020(SNRNP200) 23517(MTREX) 23586(DDX58) 29118(DDX25) 317781(DDX51) 3508(IGHMBP2) 4343(MOV10) 51202(DDX47) 51428(DDX41) 54456(MOV10L1) 54505(DHX29) 54514(DDX4) 54555(DDX49) 54606(DDX56) 55308(DDX19A) 55510(DDX43) 55601(DDX60) 55661(DDX27) 55760(DHX32) 55794(DDX28) 56919(DHX33) 57062(DDX24) 57647(DHX37) 57696(DDX55) 60625(DHX35) 64135(IFIH1) 64794(DDX31) 64848(YTHDC2) 6832(SUPV3L1) 79009(DDX50) 79039(DDX54) 79132(DHX58) 7919(DDX39B) 79665(DHX40) 83479(DDX59) 8449(DHX16) 8653(DDX3Y) 8886(DDX18) 90957(DHX57) 91351(DDX60L) 91646(TDRD12) 9188(DDX21) 9416(DDX23) 9704(DHX34) 9775(EIF4A3) 9785(DHX38) 9879(DDX46)
PTR: 107966214(DDX19A) 107969000 112204056 449508(DDX3Y) 450181(DDX17) 450499(DDX50) 450500(DDX21) 451384(IGHMBP2) 451534(DDX10) 451594(DDX6) 451649(DDX25) 451825 451868(DDX23) 452379(DDX51) 452413(DHX37) 453129(DDX24) 453195(TDRD9) 454183(DDX28) 454213(DDX19B) 454237(DHX38) 454607(DDX52) 454809(DHX40) 454941(EIF4A3) 455267(DDX5) 455783(DDX39A) 455866(DDX49) 455925(TDRD12) 456163(DHX34) 457099(MOV10) 457107(DDX20) 457568(DHX9) 458249(DHX35) 458320(DDX27) 459042(DDX1) 459169(DHX57) 459413(SNRNP200) 459566(DDX18) 459692(IFIH1) 460791(DHX36) 461011(DHX30) 461142(DHX15) 461595(DDX60L) 461867(DDX4) 461870(MTREX) 462004(YTHDC2) 462070(DDX46) 462310(DDX41) 462546(DHX16) 462821(DDX43) 463180(DDX39B) 464816(DDX31) 465035(DDX58) 465298(DDX47) 465368(DDX11) 466095(SUPV3L1) 468453(DHX33) 470409(DQX1) 471343(DDX60) 471711(G3BP1) 471819(DHX29) 473531(DDX53) 736293(DHX32) 737453(DDX59) 738094(MOV10L1) 738366(DDX56) 738909(DDX42) 739545(DDX54) 740465(DHX8) 742589 742679(DHX58) 742915(DDX3X) 745267(DDX55)
PPS: 100967598(DDX41) 100967975(DDX42) 100967985(DDX58) 100969288(SUPV3L1) 100970049(IGHMBP2) 100970251(DHX16) 100970420(DDX3X) 100972135(DDX51) 100972170(DDX6) 100973226(DDX39A) 100973357(DHX36) 100973521(DHX57) 100974169(DHX33) 100974687(DDX31) 100974955(MOV10L1) 100974963(DDX55) 100975243(SNRNP200) 100975496(DDX1) 100976703(DDX56) 100976930(DDX17) 100977429(DDX46) 100978005(DDX39B) 100978225(DDX5) 100978418(DHX9) 100978684(DHX32) 100979042(DDX25) 100979543(DDX43) 100980209(DHX8) 100980626(DHX34) 100980939(DDX10) 100981205(DHX40) 100981492(DDX20) 100981509(DDX19B) 100981559(IFIH1) 100983308(DDX52) 100983481(DDX27) 100984051(MOV10) 100984562(DHX37) 100984626(DDX19B) 100984954(DQX1) 100985302(DHX58) 100986047(DDX47) 100986176(DHX29) 100986439(DHX30) 100986470(DDX59) 100986507(SKIV2L2) 100986905(DDX60L) 100987242(DDX60) 100987784(DDX24) 100987865(G3BP1) 100988043 100989198(DDX4) 100990054(DDX18) 100990059 100990790(DHX15) 100990848(DDX53) 100991008(YTHDC2) 100991680(DDX23) 100992185(DDX54) 100992357(DHX35) 100992985(TDRD12) 100993642(TDRD9) 100993786(DHX38) 100995295(DDX49) 100995398(DDX21) 100995966(DDX50) 103785397(DDX28)
GGO: 101124409(DDX10) 101124642(DDX20) 101125025(IGHMBP2) 101125245(DDX21) 101125860(DHX9) 101125917(DHX58) 101126037 101126754(DDX41) 101127004(DHX16) 101127629(TDRD12) 101127882(DDX17) 101128064(DHX36) 101128333(DDX19B) 101128877(MOV10) 101129222(DDX50) 101129818(MOV10L1) 101130028(DHX35) 101130078(DDX6) 101130305(SUPV3L1) 101130463(DDX54) 101130489(DDX52) 101130741 101132420(DHX34) 101134914(DDX5) 101135084(DDX3X) 101135326(DDX58) 101136169(DDX31) 101136376(DDX39A) 101136789(DHX57) 101137293(DDX25) 101137314(DHX30) 101137942(DDX28) 101138032(DDX11) 101138116(DDX53) 101140016(DDX46) 101140846(DDX55) 101141623(EIF4A3) 101141726(DHX15) 101142401(DDX56) 101142588(IFIH1) 101143096(YTHDC2) 101143445(DDX24) 101143661(DDX1) 101143937(DDX60) 101144315(DDX60L) 101144828(G3BP1) 101145224(DDX27) 101145418(DHX38) 101145626(DDX59) 101145803(DDX43) 101147472(DDX39B) 101147654(DDX18) 101147897(DDX23) 101148950(DHX32) 101149254(DDX4) 101150411(DDX51) 101151498(SNRNP200) 101151519(TDRD9) 101151798(DHX29) 101152149(MTREX) 101152708(DQX1) 101152744(DDX42) 101152748(DHX8) 101153344(DHX33) 101153480(DHX40) 101153497(DDX49) 101154153(DHX37)
PON: 100171435(DHX58) 100171569(DDX3Y) 100171919(DDX24) 100172205(DHX30) 100172249(DDX23) 100172442(DHX35) 100172451(SUPV3L1) 100172476(G3BP1) 100173154(DHX40) 100173254(DDX18) 100173349(DDX42) 100173406(YTHDC2) 100173700(DHX38) 100173968(DHX8) 100173977(DDX5) 100174133(DDX1) 100174435(DHX15) 100174561(DDX39B) 100174587(DDX56) 100174753(DDX19A) 100190811(DDX6) 100431616(DDX60) 100432327(DDX20) 100433943(DHX37) 100434457(TDRD9) 100435128(MOV10L1) 100435388(DDX46) 100435607(TDRD12) 100435678(DDX21) 100436047(DDX50) 100437479(DDX39A) 100437507(DDX41) 100438692(DHX33) 100438807(IFIH1) 100438835(DDX27) 100439030(DDX25) 100441544(DHX16) 100443290(DDX58) 100445366(DDX54) 100446255(IGHMBP2) 100446823(DDX3X) 100447175(MTREX) 100447791(DHX29) 100447966(DDX31) 100448472 100448519(DDX49) 100448888(DDX17) 100449608(DDX4) 100449914(DHX9) 100450882(DDX47) 100451887(DDX51) 100453862(DDX55) 100454386(DDX52) 100454519(DHX34) 100455355 100456047(DHX32) 100456222(DHX36) 100456359(DDX43) 100456699(DDX53) 100457026(DDX28) 100458347(MOV10) 100459107(EIF4A3) 100459146(DDX59) 100459836(DHX57) 100461341(DDX60L) 100461569(DQX1)
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DME: Dmel_CG10077(CG10077) Dmel_CG10279(Rm62) Dmel_CG10333(CG10333) Dmel_CG10689(l(2)37Cb) Dmel_CG10777(mahe) Dmel_CG11107(Dhx15) Dmel_CG11403(CG11403) Dmel_CG11513(armi) Dmel_CG11680(mle) Dmel_CG12759(Dbp45A) Dmel_CG14443(CG14443) Dmel_CG14637(abs) Dmel_CG1582(CG1582) Dmel_CG1666(Hlc) Dmel_CG17023(Dbp80) Dmel_CG2173(Rs1) Dmel_CG3158(spn-E) Dmel_CG31755(SoYb) Dmel_CG3225(CG3225) Dmel_CG3228(kz) Dmel_CG32344(CG32344) Dmel_CG32533(CG32533) Dmel_CG32604(l(1)G0007) Dmel_CG3561(Dbp21E2) Dmel_CG4152(Mtr4) Dmel_CG46282(solo) Dmel_CG46283(vas) Dmel_CG4901(CG4901) Dmel_CG4916(me31B) Dmel_CG5589(CG5589) Dmel_CG5800(CG5800) Dmel_CG5931(l(3)72Ab) Dmel_CG6227(CG6227) Dmel_CG6375(pit) Dmel_CG6418(CG6418) Dmel_CG6539(Gem3) Dmel_CG7269(Hel25E) Dmel_CG7483(CG7483) Dmel_CG7878(CG7878) Dmel_CG8241(pea) Dmel_CG8611(CG8611) Dmel_CG9054(Ddx1) Dmel_CG9143(CG9143) Dmel_CG9253(CG9253) Dmel_CG9323(Rhau) Dmel_CG9630(CG9630) Dmel_CG9680(Dbp73D) Dmel_CG9748(bel) Dmel_CG9791(Suv3)
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