KEGG   ORTHOLOGY: K11600
Entry
K11600                      KO                                     

Symbol
RRP41, EXOSC4, SKI6
Name
exosome complex component RRP41
Pathway
map03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K11600  RRP41, EXOSC4, SKI6; exosome complex component RRP41
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K11600  RRP41, EXOSC4, SKI6; exosome complex component RRP41
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Core exosome factors
     K11600  RRP41, EXOSC4, SKI6; exosome complex component RRP41
 Prokaryotic type
  Archeal mRNA degradation factors
   Exosome components
    Cofactors
     K11600  RRP41, EXOSC4, SKI6; exosome complex component RRP41
Other DBs
COG: COG0689
Genes
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XCO: 114146402(exosc4)
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METH: MBMB1_0551
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MCUB: MCBB_0472(rrp41)
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MKA: MK0381(rph)
AFU: AF_0493
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PYN: PNA2_0136
PYS: Py04_1444
TKO: TK1634
TON: TON_0030
TGA: TGAM_2036(rrp41p)
TSI: TSIB_1349
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Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
DOI:10.1073/pnas.0705526104
  Sequence
[sce:YGR195W]
Reference
  Authors
Anderson JR, Mukherjee D, Muthukumaraswamy K, Moraes KC, Wilusz CJ, Wilusz J
  Title
Sequence-specific RNA binding mediated by the RNase PH domain of components of the exosome.
  Journal
RNA 12:1810-6 (2006)
DOI:10.1261/rna.144606
  Sequence
[hsa:54512]

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