KEGG   ORTHOLOGY: K12587
Entry
K12587                      KO                                     

Symbol
MTR3, EXOSC6
Name
exosome complex component MTR3
Pathway
map03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12587  MTR3, EXOSC6; exosome complex component MTR3
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12587  MTR3, EXOSC6; exosome complex component MTR3
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Core exosome factors
     K12587  MTR3, EXOSC6; exosome complex component MTR3
Other DBs
COG: COG0689
Genes
HSA: 118460(EXOSC6)
PTR: 468014(EXOSC6)
PPS: 100970806(EXOSC6)
GGO: 101134561(EXOSC6)
PON: 100455722(EXOSC6)
NLE: 100594136 115838603(EXOSC6)
MCC: 712669(EXOSC6)
MCF: 102137221(EXOSC6)
CSAB: 103233151(EXOSC6)
CATY: 105575359(EXOSC6)
PANU: 101008978(EXOSC6)
RRO: 104677855(EXOSC6)
RBB: 108527378(EXOSC6)
TFN: 117088038(EXOSC6)
PTEH: 111536143(EXOSC6)
CJC: 100399403(EXOSC6)
SBQ: 101044345(EXOSC6)
MMUR: 105875437(EXOSC6)
MMU: 72544(Exosc6)
MCAL: 110300427(Exosc6)
MPAH: 110337567(Exosc6)
RNO: 307850(Exosc6)
MCOC: 116070189(Exosc6)
MUN: 110546020(Exosc6)
CGE: 113834673(Exosc6)
PLEU: 114708066(Exosc6)
NGI: 103725681(Exosc6)
HGL: 101718639(Exosc6)
CCAN: 109684980(Exosc6)
OCU: 108176744(EXOSC6)
CFA: 489713(EXOSC6)
VVP: 112929538(EXOSC6)
VLG: 121500033(EXOSC6)
UAH: 113252479(EXOSC6)
ORO: 101380931(EXOSC6)
ELK: 111153041
EJU: 114202050(EXOSC6)
MLX: 118023577(EXOSC6)
FCA: 101095147(EXOSC6)
PYU: 121009786(EXOSC6)
PBG: 122494454(EXOSC6)
PPAD: 109270634(EXOSC6)
AJU: 113604349(EXOSC6)
HHV: 120224691(EXOSC6)
BTA: 100126247(EXOSC6)
BBUB: 102396991(EXOSC6)
CHX: 108637949(EXOSC6)
OAS: 101115396(EXOSC6)
ODA: 120873344(EXOSC6)
CCAD: 122421126(EXOSC6)
SSC: 100737302(EXOSC6)
CFR: 116665808(EXOSC6)
CDK: 105097713(EXOSC6)
LVE: 103072771(EXOSC6)
OOR: 101282155(EXOSC6)
DLE: 111179524(EXOSC6)
PCAD: 112065208(EXOSC6)
ECB: 111772793(EXOSC6)
EAI: 106823434(EXOSC6)
MMYO: 118674415(EXOSC6)
MNA: 107525294(EXOSC6)
HAI: 109384819(EXOSC6)
DRO: 112300675(EXOSC6)
SHON: 118999229(EXOSC6)
AJM: 119055882(EXOSC6)
MMF: 118639147(EXOSC6)
PGIG: 120598447(EXOSC6)
RAY: 107520525(EXOSC6)
MJV: 108408033(EXOSC6)
TOD: 119249064(EXOSC6)
LAV: 100673117(EXOSC6)
TMU: 101350608
MDO: 100012149 103106710(EXOSC6)
SHR: 100921118 116421279(EXOSC6)
PCW: 110192536(EXOSC6) 110197724
OAA: 114815203(EXOSC6)
GGA: 107052160(EXOSC6)
PCOC: 116243820(EXOSC6)
CJO: 107319124(EXOSC6)
NMEL: 110404413(EXOSC6)
APLA: 113844805(EXOSC6)
TGU: 115496766(EXOSC6)
LSR: 110476259(EXOSC6)
SCAN: 103816840(EXOSC6)
PMOA: 120508026(EXOSC6)
OTC: 121333834(EXOSC6)
PRUF: 121348789(EXOSC6)
PHI: 102102269(EXOSC6)
PMAJ: 107209970(EXOSC6)
CCW: 120410592(EXOSC6)
ETL: 114068148(EXOSC6)
DNE: 112985434(EXOSC6)
CABI: 116833725(EXOSC6)
ACS: 103280040(exosc6)
PMUR: 107292565(EXOSC6)
TSR: 106552876(EXOSC6)
PGUT: 117670495(EXOSC6)
PMUA: 114602314(EXOSC6)
ZVI: 118086804(EXOSC6)
GJA: 107121794(EXOSC6)
XLA: 108714148(exosc6.L)
XTR: 549770(exosc6)
NPR: 108798357(EXOSC6)
DRE: 326786(exosc6)
CAUA: 113049498(exosc6)
IPU: 108271352(exosc6)
PHYP: 113536370(exosc6)
AMEX: 103033271(exosc6)
EEE: 113579117(exosc6)
TRU: 101076452(exosc6)
LCO: 104929141(exosc6)
NCC: 104957510(exosc6)
CGOB: 115009350(exosc6)
ELY: 117262404(exosc6)
PLEP: 121940588 121950557(exosc6)
SLUC: 116053009(exosc6)
ECRA: 117948452(exosc6)
PFLV: 114560555(exosc6)
GAT: 120809022(exosc6)
PPUG: 119195857(exosc6)
MSAM: 119893524(exosc6)
CUD: 121515208(exosc6)
MZE: 101479853(exosc6)
ONL: 100693135(exosc6)
OAU: 116315815(exosc6)
OLA: 101155271(exosc6)
OML: 112152264(exosc6)
XMA: 102231396(exosc6)
XCO: 114136134(exosc6)
XHE: 116731302(exosc6)
PRET: 103466754(exosc6)
CTUL: 119776348(exosc6)
NFU: 107389150(exosc6)
KMR: 108251121(exosc6)
ALIM: 106526111(exosc6)
AOCE: 111576592(exosc6)
CSEM: 103379512(exosc6)
POV: 109641519(exosc6)
LCF: 108901894(exosc6)
SDU: 111225229(exosc6)
SLAL: 111651582(exosc6)
XGL: 120793734(exosc6)
HCQ: 109526854(exosc6)
BPEC: 110169714(exosc6)
MALB: 109962524(exosc6)
SASA: 100196172(exosc6)
OTW: 112218512(exosc6)
OMY: 110494646(exosc6)
SALP: 112069686(exosc6)
SNH: 120066667(exosc6)
ELS: 105018505(exosc6)
SFM: 108933978(exosc6)
PKI: 111848084(exosc6)
AANG: 118228359(exosc6)
LOC: 102689147(exosc6)
PSPA: 121296056(exosc6) 121325587
ARUT: 117424723(exosc6)
CMK: 103173320(exosc6)
BFO: 118405079
BBEL: 109465804
CIN: 100179309
SCLV: 120338527
SPU: 584729
APLC: 110975326
SKO: 100369488
DME: Dmel_CG8025(Mtr3)
DER: 6545758
DSE: 6619418
DSI: Dsimw501_GD12240(Dsim_GD12240)
DAN: 6493707
DSR: 110178904
DPE: 6599080
DMN: 108152954
DWI: 6639005
DGR: 6558564
DAZ: 108613025
DNV: 108651427
DHE: 111604437
DVI: 6622965
CCAT: 101452028
BOD: 106617989
MDE: 101901574
SCAC: 106090206
LCQ: 111682655
ACOZ: 120958608
AARA: 120899953
AAG: 5568265
CPII: 120430998
AME: 551097
ACER: 107996331
BIM: 100741679
BBIF: 117212014
BVK: 117239179
BVAN: 117166116
BTER: 100650060
CCAL: 108622681
OBB: 114876278
MGEN: 117226976
NMEA: 116429312
CGIG: 122404490
SOC: 105197612
MPHA: 105841091
AEC: 105151937
ACEP: 105617631
PBAR: 105427702
VEM: 105559250
HST: 105186667
DQU: 106742470
CFO: 105252360
FEX: 115233442
LHU: 105669948
PGC: 109852219
OBO: 105276139
PCF: 106785625
NVI: 100122464
CSOL: 105363254
TPRE: 106653713
MDL: 103575694
FAS: 105264335
DAM: 107044865
CCIN: 107266308
TCA: 664182
DPA: 109545669
ATD: 109595812
AGB: 108904684
LDC: 111502557
NVL: 108559245
APLN: 108741889
PPYR: 116160141
OTU: 111418842
BMOR: 100101185
BMAN: 114245055
MSEX: 115452807
BANY: 112050454
PPOT: 106111946
PXU: 106118027
PRAP: 111002031
ZCE: 119836958
HAW: 110379432
TNL: 113494215
PXY: 105388651
API: 100167232
DNX: 107170744
AGS: 114127447
RMD: 113548816
BTAB: 109033243
DCI: 103515743
CLEC: 106670067
HHAL: 106681616
NLU: 111045649
FOC: 113203328
ZNE: 110827084
CSEC: 111874558
FCD: 110856228
DMK: 116936429
PVM: 113804048
HAME: 121864499
HAZT: 108667200
DSV: 119450504
RSAN: 119383609
RMP: 119170641
VDE: 111246012
VJA: 111268248
CEL: CELE_Y6D11A.1(exos-4.2)
BMY: BM_BM6288(Bma-exos-4.2)
TSP: Tsp_05854
PCAN: 112563173
BGT: 106055907
GAE: 121371961
CRG: 105330577
MYI: 110459685
PMAX: 117316805
OBI: 106882315
OSN: 115209682
LAK: 106152506
NVE: 5518366
EPA: 110235448
ATEN: 116290412
ADF: 107341724
AMIL: 114970845
PDAM: 113664204
SPIS: 111333737
DGT: 114517754
HMG: 100207150
AQU: 105311947
ATH: AT4G27490(RRP41L)
ALY: 9303574
CRB: 17879141
BRP: 103867212
BOE: 106344663
RSZ: 108828552
THJ: 104826376
CPAP: 110813403
CIT: 102620951
PVY: 116143800
TCC: 18590897
GRA: 105767927
GAB: 108450595
EGR: 104421643
VRA: 106754937
VAR: 108340667
VUN: 114168440
CCAJ: 109798858
APRC: 113857526
CAM: 101497104
LJA: Lj0g3v0300669.1(Lj0g3v0300669.1)
FVE: 101290719
PAVI: 110755393
MNT: 21391427
CSV: 101217447
CMO: 103501959
BHJ: 120087783
MCHA: 111011303
CMAX: 111483981
CMOS: 111449089
RCU: 8266260
JCU: 105628072
MESC: 110612944
JRE: 109008593
QLO: 115983204
VVI: 100251840
VRI: 117916643
SLY: 101260939
SPEN: 107023425
SOT: 102592274
NSY: 104249709
NTO: 104110754
NAU: 109236396
INI: 109170865
ITR: 116025991
SIND: 105170281
EGT: 105949210
HAN: 110904284
ECAD: 122603943
LSV: 111901478
CCAV: 112522518
DCR: 108212494
CSIN: 114273052
BVG: 104898661
SOE: 110802152
NNU: 104594884
MING: 122058136
DOSA: Os03t0844450-01(Os03g0844450) Os08t0116800-01(Os08g0116800)
OBR: 102719888
BDI: 100831709
ATS: 109778172
SBI: 8079367
ZMA: 100382718
SITA: 101773858
PHAI: 112883599
EGU: 105041761
MUS: 103976728
DCT: 110108611
PEQ: 110028920
AOF: 109850249
ATR: 18995814
PPP: 112280138
MNG: MNEG_3159
APRO: F751_2832
SCE: YGR158C(MTR3)
ERC: Ecym_6203
KMX: KLMA_40104(MTR3)
NCS: NCAS_0A05820(NCAS0A05820)
NDI: NDAI_0D02820(NDAI0D02820)
TPF: TPHA_0K01890(TPHA0K01890)
TBL: TBLA_0C04350(TBLA0C04350)
TDL: TDEL_0F02890(TDEL0F02890)
KAF: KAFR_0F03140(KAFR0F03140)
PIC: PICST_57180(MTR3)
CAL: CAALFM_CR02550CA(CaO19.168)
SLB: AWJ20_3112(MTR3)
NCR: NCU08026
NTE: NEUTE1DRAFT79727(NEUTE1DRAFT_79727)
MGR: MGG_07084
SSCK: SPSK_07783
MAW: MAC_09291
MAJ: MAA_02707
CMT: CCM_00390
BFU: BCIN_12g02720(Bcmtr3)
MBE: MBM_04285
ANI: AN2153.2
ANG: ANI_1_1672134(An15g06320)
ABE: ARB_07400
TVE: TRV_00203
PTE: PTT_14933
CNE: CNJ02640
CNB: CNBJ0820
ABP: AGABI1DRAFT97612(AGABI1DRAFT_97612)
ABV: AGABI2DRAFT63232(AGABI2DRAFT_63232)
MGL: MGL_1400
MRT: MRET_3959
DFA: DFA_05820
EHI: EHI_126330(117.t00038) EHI_166910(44.t00031)
BBO: BBOV_III011810(17.m10653)
SPAR: SPRG_10840
 » show all
Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
DOI:10.1073/pnas.0705526104
  Sequence
[sce:YGR158C]
Reference
  Authors
Basu U, Meng FL, Keim C, Grinstein V, Pefanis E, Eccleston J, Zhang T, Myers D, Wasserman CR, Wesemann DR, Januszyk K, Gregory RI, Deng H, Lima CD, Alt FW
  Title
The RNA exosome targets the AID cytidine deaminase to both strands of transcribed duplex DNA substrates.
  Journal
Cell 144:353-63 (2011)
DOI:10.1016/j.cell.2011.01.001
  Sequence
[hsa:118460] [mmu:72544]

DBGET integrated database retrieval system