KEGG   ORTHOLOGY: K12590
Entry
K12590                      KO                                     

Symbol
RRP46, EXOSC5
Name
exosome complex component RRP46
Pathway
map03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ko00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    K12590  RRP46, EXOSC5; exosome complex component RRP46
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis
    K12590  RRP46, EXOSC5; exosome complex component RRP46
Messenger RNA biogenesis [BR:ko03019]
 Eukaryotic type
  mRNA degradation factors
   3'-5' decay
    Core exosome factors
     K12590  RRP46, EXOSC5; exosome complex component RRP46
Other DBs
COG: COG0689
Genes
HSA: 56915(EXOSC5)
PTR: 740020(EXOSC5)
PPS: 100981624(EXOSC5)
GGO: 101153127(EXOSC5)
PON: 100462188(EXOSC5)
NLE: 100579732(EXOSC5)
MCC: 705203(EXOSC5)
MCF: 102133515(EXOSC5)
CSAB: 103234733(EXOSC5)
CATY: 105598023(EXOSC5)
PANU: 101007297(EXOSC5)
RRO: 104676083(EXOSC5)
RBB: 108536161(EXOSC5)
TFN: 117075951(EXOSC5)
PTEH: 111554139(EXOSC5)
CJC: 100407420(EXOSC5)
SBQ: 101042770
MMUR: 105869119(EXOSC5)
MMU: 27998(Exosc5)
MCAL: 110297862(Exosc5)
MPAH: 110336616(Exosc5)
RNO: 308441(Exosc5)
MCOC: 116101854(Exosc5)
MUN: 110561186(Exosc5)
CGE: 100773940(Exosc5)
PLEU: 114685296(Exosc5)
NGI: 103751517(Exosc5)
HGL: 101705555(Exosc5)
CCAN: 109685626(Exosc5)
OCU: 100357530(EXOSC5)
OPI: 101532904(EXOSC5)
TUP: 102482229(EXOSC5)
CFA: 611350(EXOSC5)
VVP: 112928347(EXOSC5)
VLG: 121485633(EXOSC5)
AML: 100484369(EXOSC5)
UMR: 103677384(EXOSC5)
UAH: 113243537(EXOSC5)
ORO: 101364269(EXOSC5)
ELK: 111161415
MPUF: 101692902(EXOSC5)
EJU: 114202551(EXOSC5)
MLX: 118022631(EXOSC5)
FCA: 101087437(EXOSC5)
PYU: 121018494(EXOSC5)
PBG: 122494002(EXOSC5)
PTG: 102960175(EXOSC5)
PPAD: 109257974(EXOSC5)
AJU: 106987711(EXOSC5)
HHV: 120241777(EXOSC5)
BTA: 100138962(EXOSC5)
BOM: 102284202(EXOSC5)
BIU: 109572634(EXOSC5)
BBUB: 102412444(EXOSC5)
CHX: 102171001(EXOSC5)
OAS: 101123655(EXOSC5)
ODA: 120872443(EXOSC5)
CCAD: 122420715(EXOSC5) 122438416
SSC: 100512107(EXOSC5)
CFR: 102505218(EXOSC5)
CBAI: 105062881(EXOSC5)
CDK: 105093371(EXOSC5)
BACU: 103004263(EXOSC5)
LVE: 103075004(EXOSC5)
OOR: 101285438(EXOSC5)
DLE: 111180822(EXOSC5)
PCAD: 102976419(EXOSC5)
ECB: 100064997(EXOSC5)
EPZ: 103562534(EXOSC5)
EAI: 106843819(EXOSC5)
MYB: 102240837(EXOSC5)
MYD: 102773849(EXOSC5)
MMYO: 118674600(EXOSC5)
MNA: 107534221(EXOSC5)
HAI: 109376584(EXOSC5)
DRO: 112320104(EXOSC5)
SHON: 118982084(EXOSC5)
AJM: 119058459(EXOSC5)
MMF: 118639464(EXOSC5)
PALE: 102881374(EXOSC5)
PGIG: 120586593(EXOSC5)
RAY: 107505483(EXOSC5)
MJV: 108383702(EXOSC5)
TOD: 119249311 119249355(EXOSC5)
LAV: 100668210(EXOSC5)
TMU: 101343292
MDO: 100019273(EXOSC5)
PCW: 110202387(EXOSC5)
OAA: 114812008(EXOSC5)
GGA: 100858931(EXOSC5)
PCOC: 116238693(EXOSC5)
CJO: 107307101(EXOSC5)
TGU: 100221009(EXOSC5)
LSR: 110482524(EXOSC5)
SCAN: 103825659
PMOA: 120496178(EXOSC5)
OTC: 121347756(EXOSC5)
PRUF: 121351294(EXOSC5)
FAB: 101815690
PHI: 102113698(EXOSC5)
PMAJ: 107215755(EXOSC5)
CCAE: 111941579(EXOSC5)
CCW: 120411567(EXOSC5)
ETL: 114055226(EXOSC5)
FPG: 101913308(EXOSC5)
FCH: 102056253(EXOSC5)
NPD: 112958815
AMJ: 102566841(EXOSC5)
CMY: 102933748(EXOSC5)
CPIC: 101945065(EXOSC5)
CABI: 116833847(EXOSC5)
ACS: 100558943(exosc5)
PVT: 110088523(EXOSC5)
PBI: 103048271(EXOSC5)
PMUR: 107295263(EXOSC5) 107301379
PGUT: 117677595(EXOSC5)
PMUA: 114603300(EXOSC5)
ZVI: 118086358(EXOSC5)
GJA: 107119234(EXOSC5)
XLA: 108700579 733302(exosc5.L)
XTR: 100170617(exosc5)
NPR: 108786673(EXOSC5)
DRE: 751632(exosc5)
SGH: 107554480(exosc5)
IPU: 108264710(exosc5)
PHYP: 113526700(exosc5)
AMEX: 103039313(exosc5)
EEE: 113589580(exosc5)
TRU: 101068839(exosc5)
LCO: 104934298(exosc5)
ELY: 117259980(exosc5)
PLEP: 121943327(exosc5)
SLUC: 116041137(exosc5)
ECRA: 117942006(exosc5)
PFLV: 114552764(exosc5)
GAT: 120819738(exosc5)
PPUG: 119209287(exosc5)
MSAM: 119883298(exosc5)
CUD: 121525142(exosc5)
MZE: 101473849(exosc5)
ONL: 100710370(exosc5)
OAU: 116336502(exosc5)
OLA: 101161262(exosc5)
OML: 112149779(exosc5)
XMA: 102237386(exosc5)
XCO: 114133573(exosc5)
XHE: 116707576(exosc5)
PRET: 103475103(exosc5)
CVG: 107091611(exosc5)
CTUL: 119785731(exosc5)
NFU: 107379836(exosc5)
KMR: 108244680(exosc5)
ALIM: 106529670(exosc5)
AOCE: 111579595(exosc5)
CSEM: 103377991(exosc5)
POV: 109630417(exosc5)
LCF: 108876230(exosc5)
SDU: 111216978(exosc5)
SLAL: 111662260(exosc5)
XGL: 120791697(exosc5)
HCQ: 109510878(exosc5)
BPEC: 110163609(exosc5)
MALB: 109963216(exosc5)
SASA: 106613374(exosc5)
OTW: 112238970(exosc5)
OMY: 110503283(exosc5)
SALP: 112078419(exosc5)
ELS: 105029595(exosc5)
SFM: 108941540(exosc5)
PKI: 111841459(exosc5)
AANG: 118209124(exosc5)
LOC: 102684638(exosc5)
PSPA: 121304919(exosc5)
ARUT: 117970713(exosc5)
LCM: 102353937(EXOSC5)
CMK: 103172893(exosc5)
RTP: 109936505(exosc5)
BFO: 118430967
BBEL: 109464126
CIN: 100183725
SCLV: 120326355
SPU: 588368
APLC: 110979247
SKO: 100373258
DME: Dmel_CG4043(Rrp46)
DER: 6552027
DSE: 6606950
DSI: Dsimw501_GD18693(Dsim_GD18693)
DAN: 6500251
DSR: 110189881
DPE: 6588163
DMN: 108153986
DWI: 6647418
DGR: 6563020
DAZ: 108621130
DNV: 115564156
DHE: 111601763
DVI: 6629409
CCAT: 101452038
BOD: 106623541
MDE: 101898613
SCAC: 106086728
LCQ: 111686087
ACOZ: 120948958
AARA: 120895540
AAG: 5568404
AALB: 109427510
CPII: 120422533
AME: 552103
ACER: 107994380
BIM: 100741159
BBIF: 117208639
BVK: 117236664
BVAN: 117158198
BTER: 100645077
CCAL: 108630965
OBB: 114875328
MGEN: 117227317
NMEA: 116427395
CGIG: 122398967
SOC: 105195794
MPHA: 105830306
AEC: 105150748
ACEP: 105618179
PBAR: 105429783
HST: 105182934
DQU: 106746016
CFO: 105248344
LHU: 105668716
PGC: 109860032
OBO: 105282446
PCF: 106791623
NVI: 100680039
CSOL: 105360958
TPRE: 106653857
MDL: 103573301
FAS: 105269202
DAM: 107036956
CCIN: 107264898
TCA: 103313858
DPA: 109543810
ATD: 109609156
AGB: 108909165
LDC: 111518091
NVL: 108568567
APLN: 108743945
PPYR: 116182127
OTU: 111418832
BMOR: 101736615
BMAN: 114248424
MSEX: 115449250
BANY: 112054628
PMAC: 106708792
PPOT: 106101145
PXU: 106120267
PRAP: 111001195
ZCE: 119828480
HAW: 110379247
TNL: 113504955
PXY: 105393344
API: 100167827
DNX: 107163001
AGS: 114124335
RMD: 113556132
BTAB: 109044358
DCI: 103524905
CLEC: 106666307
HHAL: 106678468
NLU: 120351165
FOC: 113218235
ZNE: 110827315
CSEC: 111867392
FCD: 110844139
DMK: 116936635
PVM: 113820602
HAME: 121874969
HAZT: 108678120
DSV: 119456403
RSAN: 119393508
RMP: 119171650
DPTE: 113790498
PTEP: 107439788
SDM: 118197028
CEL: CELE_C14A4.5(crn-5)
CBR: CBG03059(Cbr-crn-5)
BMY: BM_BM10430(Bma-crn-5)
PCAN: 112558748
BGT: 106078634
GAE: 121378981
CRG: 105339181
MYI: 110447469
PMAX: 117326849
OBI: 106880623
OSN: 115211905
LAK: 106151463
EGL: EGR_09011
NVE: 5514916
EPA: 110240375
ATEN: 116306362
ADF: 107331207
AMIL: 114956588
PDAM: 113672246
SPIS: 111341509
DGT: 114519963
HMG: 100211050
AQU: 100640546
ATH: AT3G46210
CRB: 17885310
BRP: 103873315
BOE: 106328401
RSZ: 108806414
THJ: 104814772
CPAP: 110809864
CIT: 102609391
PVY: 116127992
TCC: 18587970
EGR: 104437777
VRA: 106758682
VAR: 108320702
VUN: 114183338
CCAJ: 109802232
APRC: 113872654
CAM: 101499023
LJA: Lj1g3v0415020.1(Lj1g3v0415020.1) Lj1g3v2631940.1(Lj1g3v2631940.1) Lj1g3v2631940.2(Lj1g3v2631940.2) Lj2g3v0561300.1(Lj2g3v0561300.1) Lj2g3v0561300.2(Lj2g3v0561300.2)
ADU: 107479441
AIP: 107630582
LANG: 109327639
FVE: 101303476
RCN: 112172900
PPER: 18791557
PMUM: 103320210
PAVI: 110761155
ZJU: 107420679
CSV: 101205616
CMO: 103488187
BHJ: 120075678
MCHA: 111004823
CMAX: 111496308
CMOS: 111454378
CPEP: 111798976
RCU: 8275651
JCU: 105648217
HBR: 110653777
MESC: 110601768
PEU: 105113256
QLO: 115972131
TWL: 119993068
VVI: 100262803
VRI: 117912923
SLY: 101256312
SPEN: 107029075
SOT: 102597142
CANN: 107868169
NSY: 104249723
NTO: 104111989
NAU: 109211980
INI: 109179733
ITR: 116006679
SIND: 105164746
EGT: 105977103
HAN: 110883506
ECAD: 122582340
LSV: 111891302
CCAV: 112520294
DCR: 108214222
CSIN: 114312005
BVG: 104885303
NNU: 104588279
NCOL: 116250462
OSA: 4334824
DOSA: Os03t0854200-01(Os03g0854200)
OBR: 102720312
BDI: 100846048
ATS: 109761713
SBI: 8061392
ZMA: 100280057
SITA: 101768506
PHAI: 112875120
PDA: 103704708
EGU: 105053848
MUS: 103981826
DCT: 110092002
PEQ: 110023189
AOF: 109837431
ATR: 18443355
PPP: 112281407
SCE: YGR095C(RRP46)
ERC: Ecym_1249
KMX: KLMA_50432(RRP46)
NCS: NCAS_0E01120(NCAS0E01120)
NDI: NDAI_0G01250(NDAI0G01250)
TPF: TPHA_0D02930(TPHA0D02930)
TBL: TBLA_0F01670(TBLA0F01670)
TDL: TDEL_0F03160(TDEL0F03160)
KAF: KAFR_0K01570(KAFR0K01570)
PIC: PICST_32283(RRP46)
CAL: CAALFM_C206660WA(CaO19.81)
SLB: AWJ20_5133(RRP46)
NCR: NCU03268
NTE: NEUTE1DRAFT72274(NEUTE1DRAFT_72274)
MGR: MGG_16298
SSCK: SPSK_05418
MAW: MAC_05255
MAJ: MAA_03975
CMT: CCM_06177
MBE: MBM_06170
ANI: AN7665.2
ANG: ANI_1_640034(An03g05100)
ABE: ARB_05764
TVE: TRV_04478
PTE: PTT_06997
SPO: SPBC115.01c(rrp46)
CNE: CND04940
CNB: CNBD1410
TASA: A1Q1_02387
ABP: AGABI1DRAFT114059(AGABI1DRAFT_114059)
ABV: AGABI2DRAFT193899(AGABI2DRAFT_193899)
MRT: MRET_3514
DFA: DFA_06297
TAN: TA06325
TPV: TP01_0907
BBO: BBOV_IV008670(23.m06422)
CPV: cgd4_1950
NGD: NGA_2084400(RRP46)
SPAR: SPRG_04585
 » show all
Reference
  Authors
Wang HW, Wang J, Ding F, Callahan K, Bratkowski MA, Butler JS, Nogales E, Ke A
  Title
Architecture of the yeast Rrp44 exosome complex suggests routes of RNA recruitment for 3' end processing.
  Journal
Proc Natl Acad Sci U S A 104:16844-9 (2007)
DOI:10.1073/pnas.0705526104
  Sequence
[sce:YGR095C]
Reference
  Authors
Allmang C, Petfalski E, Podtelejnikov A, Mann M, Tollervey D, Mitchell P
  Title
The yeast exosome and human PM-Scl are related complexes of 3' - 5' exonucleases.
  Journal
Genes Dev 13:2148-58 (1999)
DOI:10.1101/gad.13.16.2148
  Sequence
[sce:YGR095C] [hsa:56915]
Reference
  Authors
Mukherjee D, Gao M, O'Connor JP, Raijmakers R, Pruijn G, Lutz CS, Wilusz J
  Title
The mammalian exosome mediates the efficient degradation of mRNAs that contain AU-rich elements.
  Journal
EMBO J 21:165-74 (2002)
DOI:10.1093/emboj/21.1.165
  Sequence
[hsa:56915]

DBGET integrated database retrieval system