KEGG   Candida dubliniensis: CD36_24140
Entry
CD36_24140        CDS       T01140                                 
Name
(RefSeq) complexed with CEF1 protein 22, putative
  KO
K13100  pre-mRNA-splicing factor CWC22
Organism
cdu  Candida dubliniensis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:cdu00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome [BR:cdu03041]
    CD36_24140
Spliceosome [BR:cdu03041]
 Complex B
  U4/U6.U5 tri-snRNP components
   U4/U6.U5 tri-snRNP related factors
    CD36_24140
 Complex C
   U4/U6.U5 tri-SnRNP related factors
    CD36_24140
SSDB
Motif
Pfam: MA3
Other DBs
NCBI-GeneID: 8046419
NCBI-ProteinID: XP_002418888
UniProt: B9WCS1
Position
2:2097866..2099767
AA seq 633 aa
MNNSTTKPDTYDVSYQRTQWIETKKTIKQLLRQLTPSNIKQIVLQLFEVNLLRYRGLFIR
EIMKQQITNTNNKVELYASLIGIINSKIPEIGELLINRLILQFKKNYLNNHKKLTQSSII
FLCQLINQQVLNEILILQILQILLESNIPSTNINNNIELAMIILKHVGLYLFKHSNTALI
MILNRLKDLYQDGQNQLNLWNKQSIEYILKLARNDFKNALPIIKNGLDLVEEEDKETHVI
TLEDKLYSQDHLNVFIIDGNYQDNENEYNELKKEILGENTKKEEEEEEEEEITDMSQSEL
LQYQKTVYLTIMSSMSSDEAVHKLLKLNFKNNNKNKNKDKNKNNNKSNDNEILVDMVIKC
CSQEKTYSKYYGIIIEKLVSRNDYWHKIFIKLFKHYYDIIENFETNALRNLGKLFGHLFA
SDKIALDQAWIDIKLTEQDTNPGKRILLKFIFQEMIEELGINEVKQRLINDEYLKPYIVG
IFPVINVDEKDADSIRFSINFFTAIGLGVLTEEMRYVLDNLPEPEYDRGRSRSRSYSRSV
SESRSYSRSVSGSSYSRSRSYSRSQSRSPSQSPRGRQEFKTRQPNESRTPSRENLKRKRS
ESITDNNNNNNNNNNNNNNNNNNNLQDLLNNLK
NT seq 1902 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaacaactctacaactaaacctgatacatatgatgtatcatatcaaagaacccaatgg
attgaaactaaaaagaccattaaacagttattacggcaattaaccccttctaatatcaaa
caaattgtattacaattatttgaagtcaatcttttacgatatcgaggattatttattcga
gaaataatgaaacaacaaatcactaataccaacaacaaagttgaattatatgctagtctt
attggtataataaattctaaaatacctgaaattggtgaattattaatcaatagacttatc
ttacaatttaagaaaaattatcttaataaccataaaaaattaactcaatcatcaattata
ttcttatgtcaattaattaatcaacaagtattaaatgaaatattaatccttcaaatatta
caaatattattagaatctaatataccaagtacaaatattaataataatattgaattggcc
atgataatattgaaacatgttggattatatttatttaaacattcaaatacagcattaata
atgattttaaatcgattaaaagatttatatcaagatggacaaaatcaattaaatttatgg
aataaacaatctattgaatatatacttaaattggctcgaaatgattttaaaaatgctctt
cctattataaaaaatggattagatttagtagaggaagaagataaagaaactcatgtgatt
acattagaagataaattatattcacaagatcatttaaatgttttcatcatagatggaaat
tatcaagataatgaaaatgaatataatgaattaaagaaagaaattttgggtgaaaatact
aaaaaagaagaagaagaagaagaagaagaagaaataactgatatgtcacaatcagaatta
ttacaatatcagaaaacagtatatttaacaattatgtcatctatgtcatctgatgaagct
gttcataaattacttaaattgaatttcaagaacaacaacaagaacaagaacaaggacaag
aacaagaacaataacaaatcaaatgataatgaaattttggtagatatggtaattaaatgt
tgttcacaagagaaaacttatctgaaatattatggaattataattgagaaattagtatca
agaaatgattattggcataaaatatttattaaattatttaaacattattatgatataatt
gaaaattttgaaactaatgcattaagaaatttaggtaaattatttggtcatttatttgct
tcagataaaattgctttagatcaagcatggattgatattaaattaactgaacaagatact
aatccaggtaaaagaattttacttaaatttatatttcaagaaatgattgaagaattagga
ataaatgaagttaaacaaagattaattaatgatgaatatttaaaaccttatattgtcggg
attttccccgtaattaatgttgatgagaaagatgcagattcaattagattctcaattaat
tttttcacggctattggattaggagttttaactgaagaaatgagatatgtattagataat
ttaccggaaccagaatatgatcgtggtcgaagtagatcaagaagttattcaagaagtgtc
tcggaaagtaggagttattcaagaagtgtttcaggtagtagttattcacggtcaagaagt
tattctcgtagtcaatcaagatcaccaagtcaaagtccgagaggtcgacaagaatttaaa
actagacaacctaatgaatcaagaactccttcacgagaaaacttaaaacggaaacgaagt
gaatcaataacggataataacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaac
aacaacaacaatcttcaagatttgttaaacaatttaaaatag

  All links  
Gene (3)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (7)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system