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Database: Pfam
Entry: BLM10_mid
LinkDB: BLM10_mid
Original site: BLM10_mid 
#=GF ID   BLM10_mid
#=GF AC   PF16507.8
#=GF DE   Proteasome-substrate-size regulator, mid region
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   pdb_1vsy_4
#=GF GA   25.20 25.20;
#=GF TC   25.40 25.50;
#=GF NC   25.10 25.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   15099583
#=GF RT   New HEAT-like repeat motifs in proteins regulating proteasome
#=GF RT   structure and function.
#=GF RA   Kajava AV, Gorbea C, Ortega J, Rechsteiner M, Steven AC;
#=GF RL   J Struct Biol. 2004;146:425-430.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   20227375
#=GF RT   Structure of a Blm10 complex reveals common mechanisms for
#=GF RT   proteasome binding and gate opening.
#=GF RA   Sadre-Bazzaz K, Whitby FG, Robinson H, Formosa T, Hill CP;
#=GF RL   Mol Cell. 2010;37:728-735.
#=GF DR   INTERPRO; IPR032430;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   The ordered regions of the yeast BLM10 or PA200 (human
#=GF CC   homologue), full-length protein encode 32 HEAT repeat (HR)-like
#=GF CC   modules [1], each comprising two helices joined by a turn, with
#=GF CC   adjacent repeats connected by a linker. Whereas a standard HEAT
#=GF CC   repeat is composed of ~50 residues, the BLM10 HEAT repeats are
#=GF CC   highly variable. The length of helices ranges from 8 to 35
#=GF CC   residues, turns range from 2 to 87 residues, and linkers range
#=GF CC   from 1 to 88 residues, with the longest linker, between HR21 and
#=GF CC   HR22, containing additional secondary structures (two strands
#=GF CC   and three helices). BLM10_mid is the middle ordered region of
#=GF CC   the three in BLM10. BLM10 is found to surround the proteasome
#=GF CC   entry pore in the 1.2 MDa complex of proteasome and BLM10 to
#=GF CC   form a largely closed dome that is expected to restrict access
#=GF CC   of potential substrates. Thus Blm10 and PA200 are predominantly
#=GF CC   nuclear and stimulate the degradation of model peptides,
#=GF CC   although they do not appear to stimulate the degradation of
#=GF CC   proteins, recognise ubiquitin, or utilise ATP [2].
#=GF SQ   2788
#=GS A0A6P4DXD7_ARADU/510-830    AC A0A6P4DXD7.1
#=GS A0A5M3N4W2_CONPW/436-984    AC A0A5M3N4W2.1
#=GS A8WWY3_CAEBR/595-851        AC A8WWY3.1
#=GS J7RKJ9_KAZNA/466-985        AC J7RKJ9.1
#=GS A0A1L9S0G7_ASPWE/507-1034   AC A0A1L9S0G7.1
#=GS A0A016TN42_9BILA/1-123      AC A0A016TN42.1
#=GS A0A485N5J4_LYNPA/239-719    AC A0A485N5J4.1
#=GS F1PXW1_CANLF/249-747        AC F1PXW1.3
#=GS A0A238BIZ5_9BILA/313-454    AC A0A238BIZ5.1
#=GS A0A1D1VRN1_RAMVA/333-837    AC A0A1D1VRN1.1
#=GS A0A2T4GJV5_FUSCU/386-913    AC A0A2T4GJV5.1
#=GS A0A4D9AKJ6_SALSN/576-889    AC A0A4D9AKJ6.1
#=GS A0A4U0VNG0_9PEZI/239-774    AC A0A4U0VNG0.1
#=GS A0A1L9PML4_ASPVE/376-903    AC A0A1L9PML4.1
#=GS A0A016TN33_9BILA/23-243     AC A0A016TN33.1
#=GS A0A2S4ULC6_9BASI/48-176     AC A0A2S4ULC6.1
#=GS A0A6P5WMC5_DURZI/506-829    AC A0A6P5WMC5.1
#=GS A0A3P8V4G6_CYNSE/334-832    AC A0A3P8V4G6.1
#=GS L2G171_COLFN/386-913        AC L2G171.1
#=GS K2S8X0_MACPH/380-934        AC K2S8X0.1
#=GS A0A4R8RC43_COLTR/387-914    AC A0A4R8RC43.1
#=GS A0A0K3CR25_RHOTO/397-936    AC A0A0K3CR25.1
#=GS A0A4W6EAR9_LATCA/349-539    AC A0A4W6EAR9.1
#=GS A0A671S5R0_9TELE/318-803    AC A0A671S5R0.1
#=GS A0A4U5VC52_COLLU/267-763    AC A0A4U5VC52.1
#=GS A0A0V0Y7M3_TRIPS/299-464    AC A0A0V0Y7M3.1
#=GS A0A672S8A5_SINGR/644-793    AC A0A672S8A5.1
#=GS A0A6Q2YBF1_ESOLU/315-814    AC A0A6Q2YBF1.1
#=GS A0A671S9N6_9TELE/332-830    AC A0A671S9N6.1
#=GS A0A446XAA0_TRITD/511-827    AC A0A446XAA0.1
#=GS A0A6P5WL08_DURZI/309-519    AC A0A6P5WL08.1
#=GS A0A0V0S789_9BILA/465-764    AC A0A0V0S789.1
#=GS A0A4U0UHC2_9PEZI/390-937    AC A0A4U0UHC2.1
#=GS A0A199VDF9_ANACO/284-490    AC A0A199VDF9.1
#=GS A0A0E0HPE4_ORYNI/509-772    AC A0A0E0HPE4.1
#=GS H3HEF1_PHYRM/475-708        AC H3HEF1.1
#=GS A0A0L9VCX5_PHAAN/309-519    AC A0A0L9VCX5.1
#=GS W1Q9D2_OGAPD/466-961        AC W1Q9D2.1
#=GS A0A182DZX7_ONCOC/319-468    AC A0A182DZX7.1
#=GS A8X773_CAEBR/378-864        AC A8X773.2
#=GS A0A6P5WLI6_DURZI/506-829    AC A0A6P5WLI6.1
#=GS A0A5F9DBY2_RABIT/290-788    AC A0A5F9DBY2.1
#=GS A0A2K5P654_CERAT/330-617    AC A0A2K5P654.1
#=GS A0A4W3GXC9_CALMI/333-831    AC A0A4W3GXC9.1
#=GS A0A7I4C2F2_PHYPA/279-482    AC A0A7I4C2F2.1
#=GS A0A2G8S774_9APHY/437-973    AC A0A2G8S774.1
#=GS A0A1R3RUF6_ASPC5/376-903    AC A0A1R3RUF6.1
#=GS A0A158P870_ANGCA/285-736    AC A0A158P870.1
#=GS A0A3Q0J0I2_DIACI/78-166     AC A0A3Q0J0I2.1
#=GS A0A2K5S0A2_CEBIM/315-813    AC A0A2K5S0A2.1
#=GS A0A178ZIQ9_9EURO/383-909    AC A0A178ZIQ9.1
#=GS A0A094D526_9PEZI/375-902    AC A0A094D526.1
#=GS A0A6P5WKZ9_DURZI/434-757    AC A0A6P5WKZ9.1
#=GS G0SAC4_CHATD/388-911        AC G0SAC4.1
#=GS A0A4X2LAP3_VOMUR/289-787    AC A0A4X2LAP3.1
#=GS A0A1J6KE28_NICAT/309-518    AC A0A1J6KE28.1
#=GS A0A1Y2HKP9_9FUNG/744-1038   AC A0A1Y2HKP9.1
#=GS A0A6P3QS13_PTEVA/326-824    AC A0A6P3QS13.1
#=GS A0A4W6FG73_LATCA/631-774    AC A0A4W6FG73.1
#=GS A0A672TRY0_STRHB/323-821    AC A0A672TRY0.1
#=GS A0A2S6C5K4_9PEZI/399-945    AC A0A2S6C5K4.1
#=GS A0A1X7RAL9_9SACH/460-980    AC A0A1X7RAL9.1
#=GS R8BV79_TOGMI/389-916        AC R8BV79.1
#=GS A0A663E848_AQUCH/309-807    AC A0A663E848.1
#=GS W5L008_ASTMX/315-813        AC W5L008.2
#=GS A0A452QW37_URSAM/263-426    AC A0A452QW37.1
#=GS A0A671QPG7_9TELE/333-817    AC A0A671QPG7.1
#=GS A0A6J0PL32_ELAGV/229-431    AC A0A6J0PL32.1
#=GS A0A200QPC8_9MAGN/504-827    AC A0A200QPC8.1
#=GS A0A0D1Z207_9EURO/239-358    AC A0A0D1Z207.1
#=GS A0A226MIF3_CALSU/497-647    AC A0A226MIF3.1
#=GS A0A0R3W6M3_TAEAS/202-343    AC A0A0R3W6M3.2
#=GS A0A3Q4MTV8_NEOBR/315-813    AC A0A3Q4MTV8.1
#=GS A0A4V6ACC3_POPAL/309-520    AC A0A4V6ACC3.1
#=GS A0A3Q3B2B6_KRYMA/315-813    AC A0A3Q3B2B6.1
#=GS M3D5Q9_SPHMS/398-945        AC M3D5Q9.1
#=GS A0A2R9C9F6_PANPA/330-828    AC A0A2R9C9F6.1
#=GS A0A1B9GC91_9TREE/503-1036   AC A0A1B9GC91.1
#=GS J7RNL1_KAZNA/498-1016       AC J7RNL1.1
#=GS A0A446XAG0_TRITD/125-321    AC A0A446XAG0.1
#=GS A0A0K0E7E6_STRER/311-453    AC A0A0K0E7E6.1
#=GS A0A091RQL2_NESNO/1-230      AC A0A091RQL2.1
#=GS A0A2K6RH56_RHIRO/330-828    AC A0A2K6RH56.1
#=GS A0A5N5IFU6_9ROSA/501-829    AC A0A5N5IFU6.1
#=GS A0A3Q0EJJ8_CARSF/238-736    AC A0A3Q0EJJ8.1
#=GS A0A3P9BE49_9CICH/334-832    AC A0A3P9BE49.1
#=GS A0A1S3A1W4_ERIEU/330-750    AC A0A1S3A1W4.1
#=GS A0A671Y2J5_SPAAU/333-831    AC A0A671Y2J5.1
#=GS A0A3P9QID1_POERE/315-813    AC A0A3P9QID1.1
#=GS A0A6P7L3Y2_BETSP/308-802    AC A0A6P7L3Y2.1
#=GS M1C061_SOLTU/310-520        AC M1C061.1
#=GS A0A3Q0GCN6_ALLSI/335-833    AC A0A3Q0GCN6.1
#=GS A0A6A6LBZ6_HEVBR/302-509    AC A0A6A6LBZ6.1
#=GS A0A1X2GKQ6_9FUNG/220-744    AC A0A1X2GKQ6.1
#=GS A0A5F4BW33_CANLF/216-714    AC A0A5F4BW33.1
#=GS A0A6P9EQB3_JUGRE/503-827    AC A0A6P9EQB3.1
#=GS D4B1I6_ARTBC/381-908        AC D4B1I6.1
#=GS A0A284RAV9_ARMOS/127-660    AC A0A284RAV9.1
#=GS A0A421DF91_9EURO/375-902    AC A0A421DF91.1
#=GS A0A2S4ULC6_9BASI/172-404    AC A0A2S4ULC6.1
#=GS A0A2D3VC03_9PEZI/388-936    AC A0A2D3VC03.1
#=GS L9JFT5_TUPCH/271-447        AC L9JFT5.1
#=GS A0A067CX57_SAPPC/248-730    AC A0A067CX57.1
#=GS A0A1Q3EC45_LENED/711-950    AC A0A1Q3EC45.1
#=GS A0A4W6E6P5_LATCA/334-832    AC A0A4W6E6P5.1
#=GS A0A446YA86_TRITD/508-827    AC A0A446YA86.1
#=GS V5ER73_KALBG/468-1001       AC V5ER73.1
#=GS A0A674IPX1_TERCA/331-539    AC A0A674IPX1.1
#=GS H0ELF6_GLAL7/332-859        AC H0ELF6.1
#=GS A0A392P8R4_9FABA/1-114      AC A0A392P8R4.1
#=GS A0A232ER46_9HYME/340-839    AC A0A232ER46.1
#=GS A0A6J5XEH0_PRUAR/309-512    AC A0A6J5XEH0.1
#=GS A0A063BXK5_USTVR/385-912    AC A0A063BXK5.1
#=GS A0A0V0Y813_TRIPS/299-464    AC A0A0V0Y813.1
#=GS E3LNF3_CAERE/369-727        AC E3LNF3.1
#=GS Q0CQT1_ASPTN/372-899        AC Q0CQT1.1
#=GS A0A167RI74_CALVF/359-861    AC A0A167RI74.1
#=GS A0A3M7P4G6_BRAPC/10-188     AC A0A3M7P4G6.1
#=GS I3KG36_ORENI/330-535        AC I3KG36.2
#=GS A0A1V8TIA1_9PEZI/392-937    AC A0A1V8TIA1.1
#=GS A0A0V0Y788_TRIPS/303-482    AC A0A0V0Y788.1
#=GS A0A376B1A2_9ASCO/520-1039   AC A0A376B1A2.1
#=GS A0A0C3QXF4_9AGAM/450-988    AC A0A0C3QXF4.1
#=GS I3JTZ4_ORENI/287-785        AC I3JTZ4.2
#=GS A0A1S3E8E2_CICAR/307-517    AC A0A1S3E8E2.1
#=GS A0A453RDJ9_AEGTS/388-589    AC A0A453RDJ9.1
#=GS A0A2K6SS98_SAIBB/323-821    AC A0A2K6SS98.1
#=GS A0A1M2VAV9_TRAPU/391-926    AC A0A1M2VAV9.1
#=GS C4R5J2_KOMPG/440-975        AC C4R5J2.1
#=GS A0A2C5XYD5_9HYPO/387-914    AC A0A2C5XYD5.1
#=GS A0A0Q3H6C4_BRADI/309-510    AC A0A0Q3H6C4.1
#=GS A0A673MHV7_9TELE/315-813    AC A0A673MHV7.1
#=GS A0A5E4CBA5_MARMO/183-681    AC A0A5E4CBA5.1
#=GS G1PP76_MYOLU/252-750        AC G1PP76.1
#=GS Q4U987_THEAN/453-932        AC Q4U987.1
#=GS A0A0L0S5D0_ALLM3/672-972    AC A0A0L0S5D0.1
#=GS K3XUR3_SETIT/309-511        AC K3XUR3.1
#=GS I0YL55_COCSC/293-353        AC I0YL55.1
#=GS A0A2V5HDN3_ASPV1/376-903    AC A0A2V5HDN3.1
#=GS A0A423WC05_9PEZI/340-867    AC A0A423WC05.1
#=GS A0A0D2U2D4_GOSRA/507-829    AC A0A0D2U2D4.1
#=GS A0A6P5N704_ARADU/269-451    AC A0A6P5N704.1
#=GS A0A094JYS3_9PEZI/375-902    AC A0A094JYS3.1
#=GS A0A1Y1ZS38_9PLEO/375-920    AC A0A1Y1ZS38.1
#=GS A0A162S4A9_9CRUS/322-821    AC A0A162S4A9.1
#=GS A0A1X6PES2_PORUM/361-685    AC A0A1X6PES2.1
#=GS A0A2N5USC2_9BASI/388-905    AC A0A2N5USC2.1
#=GS A0A5F5Y2Q3_FELCA/352-850    AC A0A5F5Y2Q3.1
#=GS A0A158PT03_9BILA/515-896    AC A0A158PT03.1
#=GS A0A0M0JWS9_9EUKA/396-545    AC A0A0M0JWS9.1
#=GS A0A672JF04_SALFA/317-815    AC A0A672JF04.1
#=GS A0A0V1PBZ0_9BILA/320-812    AC A0A0V1PBZ0.1
#=GS A0A087XQJ8_POEFO/330-824    AC A0A087XQJ8.2
#=GS A0A151HY87_9HYME/327-828    AC A0A151HY87.1
#=GS A0A182DZX7_ONCOC/478-854    AC A0A182DZX7.1
#=GS C3YGW3_BRAFL/314-812        AC C3YGW3.1
#=GS A0A6J1APX9_9ROSI/507-830    AC A0A6J1APX9.1
#=GS A0A6J0PLF2_ELAGV/229-431    AC A0A6J0PLF2.1
#=GS D5GCA7_TUBMM/375-569        AC D5GCA7.1
#=GS U1G8X2_ENDPU/383-909        AC U1G8X2.1
#=GS A0A1S2Y871_CICAR/237-443    AC A0A1S2Y871.2
#=GS Q2UJS8_ASPOR/376-903        AC Q2UJS8.1
#=GS A0A0E0HPE2_ORYNI/509-772    AC A0A0E0HPE2.1
#=GS A0A0W0FXW4_9AGAR/433-552    AC A0A0W0FXW4.1
#=GS A0A3Q0J0I2_DIACI/1-90       AC A0A3Q0J0I2.1
#=GS A0A671QJC5_9TELE/328-812    AC A0A671QJC5.1
#=GS A0A2U4BYY3_TURTR/330-828    AC A0A2U4BYY3.1
#=GS A0A383ULT8_BLUGH/384-911    AC A0A383ULT8.1
#=GS A0A433PEF5_9FUNG/1-355      AC A0A433PEF5.1
#=GS D7UAP4_VITVI/501-828        AC D7UAP4.1
#=GS A0A6P8IGK8_ACTTE/310-811    AC A0A6P8IGK8.1
#=GS A0A286UQL3_9AGAM/394-462    AC A0A286UQL3.1
#=GS A0A665WZ60_ECHNA/315-810    AC A0A665WZ60.1
#=GS A0A5N6GBJ9_PETAA/376-903    AC A0A5N6GBJ9.1
#=GS A0A2N6NQK7_BEABA/385-912    AC A0A2N6NQK7.1
#=GS A0A0D2XW19_FUSO4/344-871    AC A0A0D2XW19.1
#=GS A0A1Y2ASH5_9FUNG/342-860    AC A0A1Y2ASH5.1
#=GS A0A6P4ZZR1_BRABE/390-888    AC A0A6P4ZZR1.1
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