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Database: Pfam
Entry: CMS1
LinkDB: CMS1
Original site: CMS1 
#=GF ID   CMS1
#=GF AC   PF14617.9
#=GF DE   U3-containing 90S pre-ribosomal complex subunit
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Pfam-B_3046 (release 26.0)
#=GF GA   35.00 35.00;
#=GF TC   35.10 35.20;
#=GF NC   34.90 34.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0023
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12957375
#=GF RT   Ribosome assembly in eukaryotes.
#=GF RA   Fromont-Racine M, Senger B, Saveanu C, Fasiolo F;
#=GF RL   Gene. 2003;313:17-42.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   15120992
#=GF RT   Ribosome biogenesis: of knobs and RNA processing.
#=GF RA   Granneman S, Baserga SJ;
#=GF RL   Exp Cell Res. 2004;296:43-50.
#=GF DR   INTERPRO; IPR032704;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This is a family of fungal and plant CMS1-like proteins. The
#=GF CC   family has similarity to the DEAD-box helicases. 
#=GF SQ   1441
#=GS A0A427YUI0_9TREE/58-319     AC A0A427YUI0.1
#=GS A0A5N7CMJ1_PETAA/12-292     AC A0A5N7CMJ1.1
#=GS A0A6P5X2K4_DURZI/9-255      AC A0A6P5X2K4.1
#=GS A0A2Y9JJD8_ENHLU/34-275     AC A0A2Y9JJD8.1
#=GS F1NQL6_CHICK/20-267         AC F1NQL6.4
#=GS A0A1E3IAU1_9TREE/72-322     AC A0A1E3IAU1.1
#=GS G3NEA9_GASAC/29-279         AC G3NEA9.1
#=GS A0A6A3IRE1_9STRA/46-286     AC A0A6A3IRE1.1
#=GS A9TIQ4_PHYPA/117-268        AC A9TIQ4.1
#=GS A0A4D8YJK1_SALSN/17-245     AC A0A4D8YJK1.1
#=GS A0A4T0PFX6_9BASI/33-282     AC A0A4T0PFX6.1
#=GS A0A060YUH5_ONCMY/56-327     AC A0A060YUH5.1
#=GS A0A1V4J3P8_PATFA/60-312     AC A0A1V4J3P8.1
#=GS A0A084R0V2_STAC4/1-247      AC A0A084R0V2.1
#=GS A0A2B7XLP3_9EURO/12-280     AC A0A2B7XLP3.1
#=GS A0A1S3PPV3_SALSA/70-338     AC A0A1S3PPV3.1
#=GS A0A284QUT3_ARMOS/45-299     AC A0A284QUT3.1
#=GS H9EWX3_MACMU/46-276         AC H9EWX3.1
#=GS A0A2H3CHS6_9AGAR/45-299     AC A0A2H3CHS6.1
#=GS A0A395HRW4_ASPHC/41-300     AC A0A395HRW4.1
#=GS A0A165UR00_9AGAM/2-224      AC A0A165UR00.1
#=GS K7N5J3_SOYBN/52-238         AC K7N5J3.1
#=GS J3KGZ5_COCIM/10-275         AC J3KGZ5.2
#=GS F0XUM2_GROCL/16-273         AC F0XUM2.1
#=GS A0A2T9YIB5_9FUNG/146-289    AC A0A2T9YIB5.1
#=GS A0A6J3JJV5_SAPAP/33-277     AC A0A6J3JJV5.1
#=GS N1JAF2_BLUG1/15-269         AC N1JAF2.1
#=GS A0A7H9AW65_ZYGMR/45-288     AC A0A7H9AW65.1
#=GS A0A6J3JJW4_SAPAP/3-242      AC A0A6J3JJW4.1
#=GS A0A448YEQ7_BRENA/46-294     AC A0A448YEQ7.1
#=GS A0A4Z1K872_9HELO/20-281     AC A0A4Z1K872.1
#=GS K7A0J3_PANTR/44-276         AC K7A0J3.1
#=GS A0A5N5N099_9PEZI/3-248      AC A0A5N5N099.1
#=GS R9AC60_WALI9/410-660        AC R9AC60.1
#=GS D3BK55_POLPP/178-413        AC D3BK55.1
#=GS A0A178ZG26_9EURO/12-269     AC A0A178ZG26.1
#=GS U3JTG6_FICAL/14-237         AC U3JTG6.1
#=GS A0A067E9F4_CITSI/12-158     AC A0A067E9F4.1
#=GS A0A2K6LX32_RHIBE/29-258     AC A0A2K6LX32.1
#=GS A0A1E1L5N4_9HELO/14-274     AC A0A1E1L5N4.1
#=GS A0A6P9BE89_PANGU/28-279     AC A0A6P9BE89.1
#=GS A0A0L6V3F7_9BASI/107-373    AC A0A0L6V3F7.1
#=GS F1QIT7_DANRE/24-292         AC F1QIT7.1
#=GS A0A5C3PMC1_9APHY/40-295     AC A0A5C3PMC1.1
#=GS A0A061EJS9_THECC/12-284     AC A0A061EJS9.1
#=GS A0A3Q2HL71_HORSE/56-276     AC A0A3Q2HL71.2
#=GS A0A1R3RVU0_ASPC5/37-293     AC A0A1R3RVU0.1
#=GS A0A6J8BSK4_MYTCO/22-266     AC A0A6J8BSK4.1
#=GS A0A1V8SCD3_9PEZI/28-285     AC A0A1V8SCD3.1
#=GS A0A3Q0D1P5_MESAU/43-272     AC A0A3Q0D1P5.1
#=GS A0A096MSA3_PAPAN/25-248     AC A0A096MSA3.2
#=GS A0A218UBI2_9PASE/3-175      AC A0A218UBI2.1
#=GS A0A369RRQ0_9METZ/34-272     AC A0A369RRQ0.1
#=GS A0A316Z0A0_9BASI/44-201     AC A0A316Z0A0.1
#=GS A0A0G4LJV4_9PEZI/89-272     AC A0A0G4LJV4.1
#=GS A0A6I9K4H7_CHRAS/33-277     AC A0A6I9K4H7.1
#=GS A0A6J2H750_9PASS/29-281     AC A0A6J2H750.1
#=GS A0A6J3JL21_SAPAP/38-253     AC A0A6J3JL21.1
#=GS A0A2U3YFE1_LEPWE/44-276     AC A0A2U3YFE1.1
#=GS M2T8M4_COCSN/20-278         AC M2T8M4.1
#=GS A0A4Q4UJT9_9PEZI/83-177     AC A0A4Q4UJT9.1
#=GS A0A2G5B9V9_COERN/29-263     AC A0A2G5B9V9.1
#=GS A0A6P5LCD4_PHACI/42-268     AC A0A6P5LCD4.1
#=GS A0A3L8S5R7_CHLGU/1-122      AC A0A3L8S5R7.1
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#=GS A0A3M2T082_9EURO/23-301     AC A0A3M2T082.1
#=GS G0V5G6_NAUCC/44-202         AC G0V5G6.1
#=GS A0A091W9R1_NIPNI/7-203      AC A0A091W9R1.1
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#=GS A9VA64_MONBE/19-284         AC A9VA64.1
#=GS A0A094KXV8_PODCR/7-203      AC A0A094KXV8.1
#=GS A0A5B8MCH7_9CHLO/107-250    AC A0A5B8MCH7.1
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#=GS A0A4X2KVV5_VOMUR/26-255     AC A0A4X2KVV5.1
#=GS A0A1E7FSP1_9STRA/30-271     AC A0A1E7FSP1.1
#=GS A0A0L0S7P5_ALLM3/319-429    AC A0A0L0S7P5.1
#=GS A0A226PT73_COLVI/11-273     AC A0A226PT73.1
#=GS A0A6J0ZFQ0_ODOVR/34-275     AC A0A6J0ZFQ0.1
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#=GS A0A0D2ISY1_9EURO/4-279      AC A0A0D2ISY1.1
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#=GS A0A103YFN2_CYNCS/2-255      AC A0A103YFN2.1
#=GS A0A1B8DBC2_9PEZI/23-276     AC A0A1B8DBC2.1
#=GS B6JZS6_SCHJY/1-261          AC B6JZS6.1
#=GS A0A1B8CRE4_9PEZI/23-276     AC A0A1B8CRE4.1
#=GS A0A453BTK8_AEGTS/1-107      AC A0A453BTK8.1
#=GS A0A091SCE0_NESNO/8-179      AC A0A091SCE0.1
#=GS K1QVX8_CRAGI/21-272         AC K1QVX8.1
#=GS A0A178EZN5_TRIRU/22-168     AC A0A178EZN5.1
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#=GS A0A6P8GMH2_CLUHA/3-276      AC A0A6P8GMH2.1
#=GS A0A6I9QJA1_ELAGV/10-252     AC A0A6I9QJA1.1
#=GS R7S1E6_PUNST/36-295         AC R7S1E6.1
#=GS S9VU24_SCHCR/36-284         AC S9VU24.1
#=GS A0A1V6PKU1_PENDC/11-280     AC A0A1V6PKU1.1
#=GS A0A0P1A5I3_PLAHL/1279-1523  AC A0A0P1A5I3.1
#=GS A0A4Q2D8K3_9AGAR/34-125     AC A0A4Q2D8K3.1
#=GS A0A0F4YHE2_TALEM/1-192      AC A0A0F4YHE2.1
#=GS A0A136J954_9PEZI/4-259      AC A0A136J954.1
#=GS A0A671V2K3_SPAAU/65-332     AC A0A671V2K3.1
#=GS A0A5F9CT11_RABIT/30-274     AC A0A5F9CT11.1
#=GS A0A6P6H0Q7_PUMCO/98-342     AC A0A6P6H0Q7.1
#=GS A8BK43_GIAIC/209-346        AC A8BK43.1
#=GS A0A4S4LQT8_9AGAM/190-282    AC A0A4S4LQT8.1
#=GS A0A6G1C1M2_9ORYZ/131-276    AC A0A6G1C1M2.1
#=GS A0A7C8ISN7_9PEZI/4-259      AC A0A7C8ISN7.1
#=GS M7SI40_EUTLA/9-151          AC M7SI40.1
#=GS A0A6H5JHZ2_9PHAE/23-345     AC A0A6H5JHZ2.1
#=GS A0A3B5KCF3_TAKRU/20-282     AC A0A3B5KCF3.2
#=GS A0A4W6D9J3_LATCA/13-242     AC A0A4W6D9J3.1
#=GS J3PDL9_GAET3/7-271          AC J3PDL9.1
#=GS A4IGS3_XENTR/21-273         AC A4IGS3.1
#=GS A0A1B9GER3_9TREE/73-320     AC A0A1B9GER3.1
#=GS A0A6J3A3D6_VICPA/11-251     AC A0A6J3A3D6.1
#=GS K0RD87_THAOC/29-304         AC K0RD87.1
#=GS A0A4Q4VPP0_9PEZI/1-81       AC A0A4Q4VPP0.1
#=GS G8C137_TETPH/40-293         AC G8C137.1
#=GS A0A1E3Q839_LIPST/1-105      AC A0A1E3Q839.1
#=GS R7Z0W6_CONA1/23-269         AC R7Z0W6.1
#=GS F9XPM2_ZYMTI/1-237          AC F9XPM2.1
#=GS G3TJ11_LOXAF/7-225          AC G3TJ11.1
#=GS A0A2P6U0T1_CHLSO/233-361    AC A0A2P6U0T1.1
#=GS A0A2K5YTN9_MANLE/28-258     AC A0A2K5YTN9.1
#=GS A0A3M2RXD3_9HYPO/1-248      AC A0A3M2RXD3.1
#=GS A0A2U9CC58_SCOMX/24-291     AC A0A2U9CC58.1
#=GS A0A2P5D0S1_PARAD/7-274      AC A0A2P5D0S1.1
#=GS A0A2N3NAC7_9PEZI/2-252      AC A0A2N3NAC7.1
#=GS I2FX30_USTH4/246-360        AC I2FX30.1
#=GS A0A6J1C8S6_MOMCH/6-259      AC A0A6J1C8S6.1
#=GS A0A6J3JK56_SAPAP/76-232     AC A0A6J3JK56.1
#=GS W1QHW1_OGAPD/41-266         AC W1QHW1.1
#=GS A0A0L0NEP9_TOLOC/1-246      AC A0A0L0NEP9.1
#=GS A0A0G2E4J0_9EURO/5-135      AC A0A0G2E4J0.1
#=GS B8MMW6_TALSN/3-288          AC B8MMW6.1
#=GS A0A6P8I202_ACTTE/12-274     AC A0A6P8I202.1
#=GS A0A0D3FUG2_9ORYZ/127-267    AC A0A0D3FUG2.1
#=GS F7VUW1_SORMK/3-245          AC F7VUW1.1
#=GS D5G8P2_TUBMM/30-297         AC D5G8P2.1
#=GS A0A2J6S6K2_9HELO/26-275     AC A0A2J6S6K2.1
#=GS A5DIN4_PICGU/38-280         AC A5DIN4.2
#=GS A0A6J0T0Y0_9SAUR/26-275     AC A0A6J0T0Y0.1
#=GS W9ZNF0_9EURO/1-262          AC W9ZNF0.1
#=GS A0A6A5F399_PERFL/18-285     AC A0A6A5F399.1
#=GS A0A178EZN5_TRIRU/163-243    AC A0A178EZN5.1
#=GS A0A6P8QLJ6_GEOSA/22-280     AC A0A6P8QLJ6.1
#=GS A0A316YF63_9BASI/190-302    AC A0A316YF63.1
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#=GS E9ECI2_METAQ/1-245          AC E9ECI2.1
#=GS G1LBP9_AILME/19-262         AC G1LBP9.2
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#=GS A0A663DUV8_AQUCH/30-280     AC A0A663DUV8.1
#=GS A0A5G2RAG5_PIG/32-276       AC A0A5G2RAG5.1
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#=GS CMS1_HUMAN/45-275           AC Q9BQ75.2
#=GS A0A5E8AYX2_9ASCO/224-335    AC A0A5E8AYX2.1
#=GS A0A094CBZ1_9PEZI/22-275     AC A0A094CBZ1.1
#=GS A0A094DB81_9PEZI/23-276     AC A0A094DB81.1
#=GS Q0CBY8_ASPTN/38-300         AC Q0CBY8.1
#=GS A0A5C6PQK7_9TELE/11-233     AC A0A5C6PQK7.1
#=GS A0A0U5CDB0_9EURO/15-292     AC A0A0U5CDB0.1
#=GS A0A091HFY4_BUCRH/6-203      AC A0A091HFY4.1
#=GS A0A455BPV7_PHYMC/2-178      AC A0A455BPV7.1
#=GS A1CJA1_ASPCL/13-287         AC A1CJA1.1
#=GS Q0V6N6_PHANO/19-269         AC Q0V6N6.2
#=GS V4VT95_CITCL/7-263          AC V4VT95.1
#=GS A0A0G4M0Y7_9PEZI/2-98       AC A0A0G4M0Y7.1
#=GS A0A455BLT5_PHYMC/35-273     AC A0A455BLT5.1
#=GS A0A2P6QV20_ROSCH/16-265     AC A0A2P6QV20.1
#=GS A0A0M8N072_9HYPO/1-247      AC A0A0M8N072.1
#=GS U5H7E8_USTV1/74-321         AC U5H7E8.1
#=GS A0A1Y2FNI4_PROLT/56-346     AC A0A1Y2FNI4.1
#=GS A0A425BPH0_9PEZI/19-212     AC A0A425BPH0.1
#=GS A0A091SY04_PELCR/10-179     AC A0A091SY04.1
#=GS A0A667Z1K9_9TELE/26-291     AC A0A667Z1K9.1
#=GS A0A177CUH0_9PLEO/21-277     AC A0A177CUH0.1
#=GS A0A423X2W1_9PEZI/13-281     AC A0A423X2W1.1
#=GS A0A061EKJ3_THECC/12-283     AC A0A061EKJ3.1
#=GS V7B9U4_PHAVU/1-229          AC V7B9U4.1
#=GS A0A439DIF8_9PEZI/5-259      AC A0A439DIF8.1
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