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Database: Pfam
Entry: CPDase
LinkDB: CPDase
Original site: CPDase 
#=GF ID   CPDase
#=GF AC   PF07823.13
#=GF DE   Cyclic phosphodiesterase-like protein
#=GF AU   Fenech M;0000-0001-7933-4617
#=GF SE   Pfam-B_73368 (release 14.0)
#=GF GA   20.70 20.70;
#=GF TC   20.70 20.70;
#=GF NC   20.60 20.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0247
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11080166
#=GF RT   Structure and mechanism of activity of the cyclic
#=GF RT   phosphodiesterase of Appr>p, a product of the tRNA splicing
#=GF RT   reaction. 
#=GF RA   Hofmann A, Zdanov A, Genschik P, Ruvinov S, Filipowicz W,
#=GF RA   Wlodawer A; 
#=GF RL   EMBO J 2000;19:6207-6217.
#=GF DR   INTERPRO; IPR012386;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Cyclic phosphodiesterase (CPDase, Swiss:O04147) is involved in
#=GF CC   the tRNA splicing pathway. This protein exhibits a bilobal
#=GF CC   arrangement of two alpha-beta modules. Two antiparallel helices
#=GF CC   are found on the outer side of each lobe and frame an
#=GF CC   antiparallel beta-sheet that is wrapped around an accessible
#=GF CC   cleft.  Moreover, the beta-strands of each lobe interact with
#=GF CC   the other lobe. The central water-filled cavity houses the
#=GF CC   enzyme's active site [1].
#=GF SQ   580
#=GS A0A067P2D1_PLEOS/3-178      AC A0A067P2D1.1
#=GS A0A1B7TBZ2_9ASCO/1-253      AC A0A1B7TBZ2.1
#=GS A0A177VSH5_9BASI/13-210     AC A0A177VSH5.1
#=GS M4DWT7_BRARP/24-192         AC M4DWT7.1
#=GS A0A287GB07_HORVV/82-217     AC A0A287GB07.1
#=GS A0A178E4W5_9PLEO/1-193      AC A0A178E4W5.1
#=GS A0A1E3QSC4_9ASCO/1-235      AC A0A1E3QSC4.1
#=GS A0A2P7YD41_9ASCO/18-269     AC A0A2P7YD41.1
#=GS A0A1U8AYQ3_NELNU/14-184     AC A0A1U8AYQ3.1
#=GS M2SX98_COCSN/1-190          AC M2SX98.1
#=GS CPD1_ASHGO/1-216            AC Q758H6.1
#=GS A0A0C9VTA3_SPHS4/1-176      AC A0A0C9VTA3.1
#=GS A0A151R6H7_CAJCA/5-177      AC A0A151R6H7.1
#=GS J5S9K3_SACK1/1-240          AC J5S9K3.1
#=GS A0A565CFR7_9BRAS/22-190     AC A0A565CFR7.1
#=GS A0A167NP75_CALVF/1-181      AC A0A167NP75.1
#=GS A0A103XEW7_CYNCS/16-144     AC A0A103XEW7.1
#=GS A0A1E3Q3U2_LIPST/1-195      AC A0A1E3Q3U2.1
#=GS A0A4V1IY63_9FUNG/13-187     AC A0A4V1IY63.1
#=GS A0A0L0G6A5_9EUKA/19-220     AC A0A0L0G6A5.1
#=GS A0A256FJF2_9RHIZ/1-169      AC A0A256FJF2.1
#=GS A0A6A3TNR0_9STRA/7-133      AC A0A6A3TNR0.1
#=GS G3B832_CANTC/1-237          AC G3B832.1
#=GS A0A3N4HTB1_ASCIM/264-324    AC A0A3N4HTB1.1
#=GS A0A287GB16_HORVV/14-95      AC A0A287GB16.1
#=GS A0A5B8MGN9_9CHLO/21-214     AC A0A5B8MGN9.1
#=GS I2FMA9_USTH4/11-224         AC I2FMA9.1
#=GS A0A5C3EXJ8_9BASI/139-233    AC A0A5C3EXJ8.1
#=GS A0A2P5C0R7_PARAD/16-187     AC A0A2P5C0R7.1
#=GS A0A0D7BU48_9AGAR/2-179      AC A0A0D7BU48.1
#=GS A0A0D2UDH4_GOSRA/56-227     AC A0A0D2UDH4.1
#=GS H6L403_SAPGL/1-58           AC H6L403.1
#=GS A0A284QWB7_ARMOS/8-175      AC A0A284QWB7.1
#=GS A0A2P5X546_GOSBA/12-183     AC A0A2P5X546.1
#=GS A0A1G4JI81_9SACH/1-219      AC A0A1G4JI81.1
#=GS A0A423VDC8_9PEZI/1-202      AC A0A423VDC8.1
#=GS A0A137QI79_9AGAR/1-185      AC A0A137QI79.1
#=GS A0A1Z5TQC2_HORWE/1-229      AC A0A1Z5TQC2.1
#=GS A0A4S2MSG1_9PEZI/17-207     AC A0A4S2MSG1.1
#=GS A0A1M2V9Z5_TRAPU/10-180     AC A0A1M2V9Z5.1
#=GS D0MX84_PHYIT/6-128          AC D0MX84.1
#=GS A0A0F4GE36_9PEZI/1-196      AC A0A0F4GE36.1
#=GS M5WHW2_PRUPE/17-188         AC M5WHW2.1
#=GS A0A2S5B661_9BASI/343-527    AC A0A2S5B661.1
#=GS A0A423VYL5_9PEZI/1-202      AC A0A423VYL5.1
#=GS A0A1V2L1E4_CYBFA/1-209      AC A0A1V2L1E4.1
#=GS B8P1N6_POSPM/1-199          AC B8P1N6.1
#=GS A0A165JP93_XYLHT/1-235      AC A0A165JP93.1
#=GS A0A0D0A865_9AGAM/4-179      AC A0A0D0A865.1
#=GS A0A0C2Z876_HEBCY/1-202      AC A0A0C2Z876.1
#=GS F8Q7M2_SERL3/11-216         AC F8Q7M2.1
#=GS A0A0L6UCU8_9BASI/6-148      AC A0A0L6UCU8.1
#=GS A0A1Z5SVG9_HORWE/1-86       AC A0A1Z5SVG9.1
#=GS G2QFB1_MYCTT/1-241          AC G2QFB1.1
#=GS A0A371D3C5_9APHY/1-106      AC A0A371D3C5.1
#=GS A0A2X0KFM7_9BASI/140-214    AC A0A2X0KFM7.1
#=GS J8Q4Q7_SACAR/1-240          AC J8Q4Q7.1
#=GS A0A2C9U697_MANES/21-192     AC A0A2C9U697.1
#=GS C4Y4A9_CLAL4/12-273         AC C4Y4A9.1
#=GS A0A166EL57_9AGAM/1-108      AC A0A166EL57.1
#=GS A0A1J9RBW3_9PEZI/1-208      AC A0A1J9RBW3.1
#=GS A0A4Q4WKY1_9PEZI/1-204      AC A0A4Q4WKY1.1
#=GS A0A0C9TRQ9_PAXIN/1-200      AC A0A0C9TRQ9.1
#=GS A0A4D9AWN7_SALSN/16-187     AC A0A4D9AWN7.1
#=GS A0A1Z4JNC5_LEPBY/15-138     AC A0A1Z4JNC5.1
#=GS K3WU85_GLOUD/21-189         AC K3WU85.1
#=GS A0A6A4C6D8_9STRA/12-180     AC A0A6A4C6D8.1
#=GS A0A1B9I6J6_9TREE/14-191     AC A0A1B9I6J6.1
#=GS A0A4V1Q3X1_9AGAR/1-194      AC A0A4V1Q3X1.1
#=GS A0A0C9TZC3_SPHS4/1-176      AC A0A0C9TZC3.1
#=GS M2NK12_BAUPA/1-167          AC M2NK12.1
#=GS A0A067JBH8_JATCU/45-216     AC A0A067JBH8.1
#=GS I1HHK0_BRADI/12-185         AC I1HHK0.1
#=GS A0A1Y2J4M2_PYCCO/1-200      AC A0A1Y2J4M2.1
#=GS G4UZG7_NEUT9/1-212          AC G4UZG7.1
#=GS A0A1R3JGJ1_COCAP/12-183     AC A0A1R3JGJ1.1
#=GS A0A316ULY1_9BASI/1-216      AC A0A316ULY1.1
#=GS A0A0K9R033_SPIOL/7-179      AC A0A0K9R033.1
#=GS A0A1Y2FD74_PROLT/1-183      AC A0A1Y2FD74.1
#=GS A0A446K794_TRITD/13-86      AC A0A446K794.1
#=GS A0A5D6XK14_9STRA/81-170     AC A0A5D6XK14.1
#=GS A0A4Y7QC57_9AGAM/1-191      AC A0A4Y7QC57.1
#=GS A0A0H2RFW1_9AGAM/1-194      AC A0A0H2RFW1.1
#=GS U4V4P2_9RHIZ/1-169          AC U4V4P2.1
#=GS A0A0H2RM41_9AGAM/1-177      AC A0A0H2RM41.1
#=GS A0A0J0XPR2_9TREE/33-238     AC A0A0J0XPR2.1
#=GS A0A2H3DPX0_ARMGA/1-194      AC A0A2H3DPX0.1
#=GS A0A0G4GXP2_VITBC/1-172      AC A0A0G4GXP2.1
#=GS A0A2H3CJF6_9AGAR/1-195      AC A0A2H3CJF6.1
#=GS A0A085FF47_9BRAD/67-168     AC A0A085FF47.1
#=GS G8YDB7_PICSO/1-260          AC G8YDB7.1
#=GS A0A397YBI4_BRACM/24-192     AC A0A397YBI4.1
#=GS A0A2P6QSC1_ROSCH/7-180      AC A0A2P6QSC1.1
#=GS A0A4U0UA97_9PEZI/1-194      AC A0A4U0UA97.1
#=GS A0A1S4D8P3_TOBAC/22-194     AC A0A1S4D8P3.1
#=GS U5GZ04_USTV1/11-210         AC U5GZ04.1
#=GS N1Q809_PSEFD/1-162          AC N1Q809.1
#=GS A0A2P6N195_9EUKA/41-213     AC A0A2P6N195.1
#=GS A0A238FCF0_9BASI/10-209     AC A0A238FCF0.1
#=GS A0A5N5DHR9_9PEZI/34-241     AC A0A5N5DHR9.1
#=GS W1Q0U1_AMBTC/8-178          AC W1Q0U1.1
#=GS A0A2H3BPJ0_9AGAR/1-190      AC A0A2H3BPJ0.1
#=GS G7E7W7_MIXOS/6-198          AC G7E7W7.1
#=GS G8ZYJ5_TORDC/1-192          AC G8ZYJ5.1
#=GS A0A059LI98_9CHLO/25-202     AC A0A059LI98.1
#=GS A0A2T3AAI6_9PEZI/1-205      AC A0A2T3AAI6.1
#=GS A0A1J7HJ70_LUPAN/6-178      AC A0A1J7HJ70.1
#=GS M1CRL3_SOLTU/22-193         AC M1CRL3.1
#=GS A0A1S7HAC5_9SACH/1-218      AC A0A1S7HAC5.1
#=GS A0A448Z9E4_9STRA/104-309    AC A0A448Z9E4.1
#=GS A0A3Q7FD24_SOLLC/16-188     AC A0A3Q7FD24.1
#=GS A0A1Y1ZZH1_9PLEO/1-192      AC A0A1Y1ZZH1.1
#=GS A0A3N4M4M4_9PEZI/1-184      AC A0A3N4M4M4.1
#=GS A0A178ALS4_9PLEO/1-192      AC A0A178ALS4.1
#=GS C5M3M7_CANTT/6-250          AC C5M3M7.1
#=GS A0A0D3BKE0_BRAOL/24-192     AC A0A0D3BKE0.1
#=GS A0A165IE74_9BASI/10-190     AC A0A165IE74.1
#=GS M3JZP6_CANMX/1-247          AC M3JZP6.1
#=GS W2YCI7_PHYPR/9-177          AC W2YCI7.1
#=GS B0C261_ACAM1/1-170          AC B0C261.1
#=GS R4X7R1_TAPDE/4-198          AC R4X7R1.1
#=GS A0A4U0U3G3_9PEZI/1-195      AC A0A4U0U3G3.1
#=GS A0A078F898_BRANA/24-192     AC A0A078F898.1
#=GS A0A316W8B6_9BASI/1-203      AC A0A316W8B6.1
#=GS A0A2V1EDE7_9PLEO/1-191      AC A0A2V1EDE7.1
#=GS A0A059C8C7_EUCGR/7-179      AC A0A059C8C7.1
#=GS A0A2H3DUD4_ARMGA/1-147      AC A0A2H3DUD4.1
#=GS A0A081CEG9_PSEA2/429-625    AC A0A081CEG9.1
#=GS A0A4Q4YDK0_9PEZI/1-204      AC A0A4Q4YDK0.1
#=GS E3KIR6_PUCGT/5-188          AC E3KIR6.1
#=GS C5E1Z8_LACTC/1-215          AC C5E1Z8.1
#=GS S9W407_SCHCR/27-191         AC S9W407.1
#=GS A0A2G5BFV9_COERN/1-184      AC A0A2G5BFV9.1
#=GS A0A1U8PS10_GOSHI/56-207     AC A0A1U8PS10.1
#=GS A0A286UVA6_9AGAM/3-228      AC A0A286UVA6.1
#=GS A0A2G5C569_AQUCA/18-190     AC A0A2G5C569.1
#=GS A0A0P4UZ80_9CYAN/12-165     AC A0A0P4UZ80.1
#=GS W2QZL2_PHYPN/9-177          AC W2QZL2.1
#=GS A0A5B0N638_PUCGR/5-188      AC A0A5B0N638.1
#=GS A0A4U0XUE7_9PEZI/1-201      AC A0A4U0XUE7.1
#=GS A0A1E7FQ32_9STRA/157-335    AC A0A1E7FQ32.1
#=GS A0A250WQX1_9CHLO/58-238     AC A0A250WQX1.1
#=GS A0A1E4SKS5_9ASCO/1-259      AC A0A1E4SKS5.1
#=GS A0A1U8PRW0_GOSHI/56-227     AC A0A1U8PRW0.1
#=GS D8LH76_ECTSI/3-96           AC D8LH76.1
#=GS A0A4S8JAK5_MUSBA/12-215     AC A0A4S8JAK5.1
#=GS A0A2V3TTA2_9RHIZ/4-168      AC A0A2V3TTA2.1
#=GS A0A1J8QWB3_9AGAM/4-204      AC A0A1J8QWB3.1
#=GS J4IBC4_9APHY/6-193          AC J4IBC4.1
#=GS A0A067GRK3_CITSI/16-187     AC A0A067GRK3.1
#=GS A0A5E4FPK4_PRUDU/17-124     AC A0A5E4FPK4.1
#=GS W9VPH3_9EURO/1-203          AC W9VPH3.1
#=GS A0A1Y2G3W0_9BASI/1-200      AC A0A1Y2G3W0.1
#=GS I2GZR6_TETBL/1-266          AC I2GZR6.1
#=GS A0A059C769_EUCGR/7-179      AC A0A059C769.1
#=GS A0A3N4HTB1_ASCIM/1-182      AC A0A3N4HTB1.1
#=GS A0A175WBY1_9PEZI/1-223      AC A0A175WBY1.1
#=GS A0A1N6WH82_9BRAD/4-166      AC A0A1N6WH82.1
#=GS A0A2S6BRM3_9PEZI/35-227     AC A0A2S6BRM3.1
#=GS A0A178ZU79_9EURO/1-204      AC A0A178ZU79.1
#=GS A0A5B1QIR9_9AGAM/1-202      AC A0A5B1QIR9.1
#=GS A0A165QPK3_9APHY/1-105      AC A0A165QPK3.1
#=GS A0A0C3AWI9_9AGAM/1-183      AC A0A0C3AWI9.1
#=GS K5WX39_PHACS/4-174          AC K5WX39.1
#=GS A0A317XLU1_9BASI/12-226     AC A0A317XLU1.1
#=GS A0A5D3CNS3_CUCME/18-111     AC A0A5D3CNS3.1
#=GS A0A0D2EY30_9EURO/1-201      AC A0A0D2EY30.1
#=GS S2E7X0_9ARCH/1-164          AC S2E7X0.1
#=GS A0A452ZK97_AEGTS/35-208     AC A0A452ZK97.1
#=GS A0A517LP35_9PEZI/72-271     AC A0A517LP35.1
#=GS A0A0D2SU01_GOSRA/56-172     AC A0A0D2SU01.1
#=GS A0A284RVY9_ARMOS/5-170      AC A0A284RVY9.1
#=GS V9E6K8_PHYPR/9-177          AC V9E6K8.1
#=GS A0A4Y9Z9Z8_9AGAM/4-179      AC A0A4Y9Z9Z8.1
#=GS A0A165QPK3_9APHY/108-191    AC A0A165QPK3.1
#=GS R7Z0B9_CONA1/20-211         AC R7Z0B9.1
#=GS CPD1_YARLI/1-216            AC Q6CGD3.2
#=GS A0A2H0ZDM3_CANAR/1-262      AC A0A2H0ZDM3.1
#=GS A0A239Q1Y5_9RHOB/1-169      AC A0A239Q1Y5.1
#=GS M5GGF1_DACPD/3-184          AC M5GGF1.1
#=GS A0A3B6A0F4_WHEAT/11-184     AC A0A3B6A0F4.1
#=GS A0A2T6ZDW1_TUBBO/1-196      AC A0A2T6ZDW1.1
#=GS A0A2T0FJH4_9ASCO/6-220      AC A0A2T0FJH4.1
#=GS A0A1Q3CJX4_CEPFO/46-218     AC A0A1Q3CJX4.1
#=GS A0A2N5V703_9BASI/5-188      AC A0A2N5V703.1
#=GS A0A200PTG7_9MAGN/12-184     AC A0A200PTG7.1
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#=GS V4LXV9_EUTSA/25-193         AC V4LXV9.1
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