#=GF ID Caps_synth
#=GF AC PF05704.19
#=GF DE Capsular polysaccharide synthesis protein
#=GF AU Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE Pfam-B_7575 (release 8.0)
#=GF GA 24.50 24.50;
#=GF TC 24.50 24.50;
#=GF NC 24.40 24.40;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 -Z 90746521 --cpu 8 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF CL CL0110
#=GF RN [1]
#=GF RM 11179285
#=GF RT Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae type 4,
#=GF RT 6B, 8, and 18C capsular polysaccharide gene clusters.
#=GF RA Jiang SM, Wang L, Reeves PR;
#=GF RL Infect Immun 2001;69:1244-1255.
#=GF RN [2]
#=GF RM 9838125
#=GF RT Molecular structure of the gene cluster responsible for the
#=GF RT synthesis of the polysaccharide capsule of Streptococcus
#=GF RT pneumoniae type 33F.
#=GF RA Llull D, Lopez R, Garcia E, Munoz R;
#=GF RL Biochim Biophys Acta 1998;1443:217-224.
#=GF RN [3]
#=GF RM 10688204
#=GF RT The genome sequence of the food-borne pathogen Campylobacter
#=GF RT jejuni reveals hypervariable sequences.
#=GF RA Parkhill J, Wren BW, Mungall K, Ketley JM, Churcher C, Basham D,
#=GF RA Chillingworth T, Davies RM, Feltwell T, Holroyd S, Jagels K,
#=GF RA Karlyshev AV, Moule S, Pallen MJ, Penn CW, Quail MA, Rajandream
#=GF RA MA, Rutherford KM, van Vliet AH, Whitehead S, Barrell BG;
#=GF RL Nature 2000;403:665-668.
#=GF RN [4]
#=GF RM 7752885
#=GF RT Region II of the Haemophilus influenzae type be capsulation
#=GF RT locus is involved in serotype-specific polysaccharide synthesis.
#=GF RA Van Eldere J, Brophy L, Loynds B, Celis P, Hancock I, Carman S,
#=GF RA Kroll JS, Moxon ER;
#=GF RL Mol Microbiol 1995;15:107-118.
#=GF RN [5]
#=GF RM 10094675
#=GF RT acs1 of Haemophilus influenzae type a capsulation locus region
#=GF RT II encodes a bifunctional ribulose 5-phosphate reductase-
#=GF RT CDP-ribitol pyrophosphorylase.
#=GF RA Follens A, Veiga-da-Cunha M, Merckx R, van Schaftingen E, van
#=GF RA Eldere J;
#=GF RL J Bacteriol 1999;181:2001-2007.
#=GF DR INTERPRO; IPR008441;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This family consists of several capsular polysaccharide
#=GF CC proteins. Capsular polysaccharide (CPS) is a major virulence
#=GF CC factor in Streptococcus pneumoniae [1].
#=GF SQ 1365
#=GS A0A367LPH6_9HYPO/25-209 AC A0A367LPH6.1
#=GS A0A812LFM0_9DINO/409-670 AC A0A812LFM0.1
#=GS A0A1L9S7Q2_9EURO/20-204 AC A0A1L9S7Q2.1
#=GS A0A2V5GX91_ASPV1/14-206 AC A0A2V5GX91.1
#=GS A0A5J4ZB75_PORPP/124-335 AC A0A5J4ZB75.1
#=GS A0A1H4C8D2_9FIRM/39-313 AC A0A1H4C8D2.1
#=GS A0A8H6VKY3_9PEZI/17-221 AC A0A8H6VKY3.1
#=GS A0A439DE69_9PEZI/40-235 AC A0A439DE69.1
#=GS A0A5B1QVT0_9AGAM/25-216 AC A0A5B1QVT0.1
#=GS A0A8H7B1L4_9PLEO/555-759 AC A0A8H7B1L4.1
#=GS A0A9P1GKD0_9DINO/18-296 AC A0A9P1GKD0.1
#=GS A0A374WAI5_9BACE/36-312 AC A0A374WAI5.1
#=GS A0A2T4A1P5_TRIHA/30-221 AC A0A2T4A1P5.1
#=GS A0A1B8GFV3_9PEZI/37-226 AC A0A1B8GFV3.2
#=GS A0A388TCV0_TERA1/13-282 AC A0A388TCV0.1
#=GS A0A423XCF4_9PEZI/31-210 AC A0A423XCF4.1
#=GS L2FQ10_COLFN/27-219 AC L2FQ10.1
#=GS A0A072P9D3_9EURO/24-206 AC A0A072P9D3.1
#=GS A0A0C3C0Z4_HEBCY/21-205 AC A0A0C3C0Z4.1
#=GS A0A511XG22_9PROT/32-197 AC A0A511XG22.1
#=GS A0A139HXT1_9PEZI/8-189 AC A0A139HXT1.1
#=GS A0A2P4ZE80_9HYPO/33-229 AC A0A2P4ZE80.1
#=GS A0A4Y9Q1X4_9MICO/76-312 AC A0A4Y9Q1X4.1
#=GS W9CI99_SCLBF/28-221 AC W9CI99.1
#=GS A0A9W9J530_9EURO/17-203 AC A0A9W9J530.1
#=GS A0A4Y8CUJ9_9HELO/22-210 AC A0A4Y8CUJ9.1
#=GS A0A177DU33_ALTAL/27-215 AC A0A177DU33.1
#=GS A0A8H7TCC0_9HELO/12-216 AC A0A8H7TCC0.1
#=GS A0A812QCP5_9DINO/63-235 AC A0A812QCP5.1
#=GS A0A9P9F8J6_9HYPO/24-207 AC A0A9P9F8J6.1
#=GS A0A812K8Y3_9DINO/356-633 AC A0A812K8Y3.1
#=GS A0A0D1YLY9_9PEZI/43-224 AC A0A0D1YLY9.1
#=GS A0A0A2EZY0_9PORP/21-305 AC A0A0A2EZY0.1
#=GS A0A327Z6W7_9ACTN/387-649 AC A0A327Z6W7.1
#=GS A0A5P2G066_9BACT/16-306 AC A0A5P2G066.1
#=GS A0A6A6Q4K7_9PEZI/12-206 AC A0A6A6Q4K7.1
#=GS A0AAE1ID65_9HYPO/20-208 AC A0AAE1ID65.1
#=GS A0A813F5L6_POLGL/53-239 AC A0A813F5L6.1
#=GS A0A1Y2X9T3_9PEZI/26-246 AC A0A1Y2X9T3.1
#=GS A0A6A5SFR9_9PLEO/20-206 AC A0A6A5SFR9.1
#=GS A0A1B8PN23_MORNO/24-312 AC A0A1B8PN23.1
#=GS A0A0E9NP82_SAICN/558-606 AC A0A0E9NP82.1
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#=GS A0A1V6UIS6_9EURO/21-206 AC A0A1V6UIS6.1
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#=GS A0A8H5NHS6_9HYPO/20-202 AC A0A8H5NHS6.1
#=GS A0A5P8YWF0_9RHOB/2-152 AC A0A5P8YWF0.1
#=GS A0A9P1C759_9DINO/172-352 AC A0A9P1C759.1
#=GS A0A0A7ID73_9BIFI/50-302 AC A0A0A7ID73.1
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#=GS A0A0M0LI99_9BACI/2-65 AC A0A0M0LI99.1
#=GS A0A417QTE3_9FIRM/1-158 AC A0A417QTE3.1
#=GS A0A9W9BSJ7_9HYPO/19-204 AC A0A9W9BSJ7.1
#=GS A0A151GB97_DRECN/44-276 AC A0A151GB97.1
#=GS U2SRM2_9FUSO/35-334 AC U2SRM2.1
#=GS A0A2V1BTT8_9HELO/20-212 AC A0A2V1BTT8.1
#=GS K9AHD3_9MICO/76-305 AC K9AHD3.1
#=GS A0A2T8HJJ8_9SPHI/17-308 AC A0A2T8HJJ8.1
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#=GS D8DVH7_9BACT/49-332 AC D8DVH7.1
#=GS A0A167I8P2_CORFA/17-208 AC A0A167I8P2.1
#=GS A9BR13_DELAS/48-206 AC A9BR13.1
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#=GS D0BKT5_9LACT/24-313 AC D0BKT5.1
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#=GS A0AAE8N8R7_9PEZI/13-265 AC A0AAE8N8R7.1
#=GS A0A553I8Q5_9PEZI/26-214 AC A0A553I8Q5.1
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#=GS A0A428QAT7_9HYPO/14-219 AC A0A428QAT7.1
#=GS H7EMH2_9SPIR/37-305 AC H7EMH2.1
#=GS A0A2P5HEY2_9PEZI/3-204 AC A0A2P5HEY2.1
#=GS A0A1B8D4C4_9PEZI/275-475 AC A0A1B8D4C4.1
#=GS A0A9W9VSK5_9EURO/23-206 AC A0A9W9VSK5.1
#=GS A0A3N6RM31_9CYAN/1-150 AC A0A3N6RM31.1
#=GS A0AAD6NLY7_ARTDA/15-203 AC A0AAD6NLY7.1
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#=GS A0A319ED31_ASPSB/15-210 AC A0A319ED31.1
#=GS A0A6A5WEA4_9PLEO/10-206 AC A0A6A5WEA4.1
#=GS A0A239RLG9_9BACT/4-277 AC A0A239RLG9.1
#=GS A0A9P1BRC4_9DINO/57-228 AC A0A9P1BRC4.1
#=GS A0A8H5NL08_9HYPO/38-259 AC A0A8H5NL08.1
#=GS V2T7Y2_9GAMM/35-255 AC V2T7Y2.1
#=GS A0A8H4XH00_9HYPO/25-258 AC A0A8H4XH00.1
#=GS A0A8T4K304_9FIRM/25-297 AC A0A8T4K304.1
#=GS A0A1L9PFT1_ASPVE/2-204 AC A0A1L9PFT1.1
#=GS A0A6A5TK25_9PLEO/28-209 AC A0A6A5TK25.1
#=GS A0AAE8SPI0_9HYPO/17-204 AC A0AAE8SPI0.1
#=GS A0A9P8QGR9_9HYPO/40-227 AC A0A9P8QGR9.1
#=GS A0A1Q9ECZ7_SYMMI/552-725 AC A0A1Q9ECZ7.1
#=GS A0A3M2T692_9EURO/19-221 AC A0A3M2T692.1
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#=GS N4W1J6_COLOR/4-229 AC N4W1J6.1
#=GS A0A7H8R1S1_TALRU/11-208 AC A0A7H8R1S1.1
#=GS A0A3E3I7S1_9FIRM/34-303 AC A0A3E3I7S1.1
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#=GS A0A388TJT6_9BACT/3-202 AC A0A388TJT6.1
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#=GS M7SB04_EUTLA/29-242 AC M7SB04.1
#=GS A0A1X7L3G7_9SPHI/9-132 AC A0A1X7L3G7.1
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#=GS A0A9P6GIU8_9PLEO/17-227 AC A0A9P6GIU8.1
#=GS A0A432ZCN0_9GAMM/64-290 AC A0A432ZCN0.1
#=GS A0A543EDM4_9MICO/70-304 AC A0A543EDM4.1
#=GS A0A974S1X7_PERPY/2-197 AC A0A974S1X7.1
#=GS J3K4G3_COCIM/61-263 AC J3K4G3.2
#=GS A0A9P7S0W2_9AGAR/24-154 AC A0A9P7S0W2.1
#=GS R9JL44_9FIRM/893-1157 AC R9JL44.1
#=GS A0A9P8VCW6_9PEZI/37-228 AC A0A9P8VCW6.1
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#=GS A0A9P4PKD9_9PLEO/23-207 AC A0A9P4PKD9.1
#=GS A0A0U1Q334_9BURK/48-168 AC A0A0U1Q334.1
#=GS A0A9X9SMF2_NEISU/8-175 AC A0A9X9SMF2.1
#=GS A0A2T3E3Y3_9HYPH/1-224 AC A0A2T3E3Y3.1
#=GS A0A0U1Q3C1_9BURK/26-182 AC A0A0U1Q3C1.1
#=GS A0AAD5HKY2_9HYPO/23-213 AC A0AAD5HKY2.1
#=GS A0A395N7C9_TRIAR/24-269 AC A0A395N7C9.1
#=GS A0A9P7UE03_9PEZI/8-214 AC A0A9P7UE03.1
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