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Database: Pfam
Entry: DNA_pol_phi
LinkDB: DNA_pol_phi
Original site: DNA_pol_phi 
#=GF ID   DNA_pol_phi
#=GF AC   PF04931.15
#=GF DE   DNA polymerase phi
#=GF PI   DNA_pol_V; 
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_10566 (release 7.6)
#=GF GA   27.60 27.60;
#=GF TC   28.00 28.00;
#=GF NC   27.50 27.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12093911
#=GF RT   The fifth essential DNA polymerase phi in Saccharomyces
#=GF RT   cerevisiae is localized to the nucleolus and plays an important
#=GF RT   role in synthesis of rRNA. 
#=GF RA   Shimizu K, Kawasaki Y, Hiraga S, Tawaramoto M, Nakashima N,
#=GF RA   Sugino A; 
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A 2002;99:9133-9138.
#=GF DR   INTERPRO; IPR007015;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family includes the fifth essential DNA polymerase in yeast
#=GF CC   EC:2.7.7.7. Pol5p is localised exclusively to the nucleolus and
#=GF CC   binds near or at the enhancer region of rRNA-encoding DNA
#=GF CC   repeating units.
#=GF SQ   1821
#=GS A0A1U8JJI9_GOSHI/169-262    AC A0A1U8JJI9.1
#=GS I2GWK9_TETBL/52-872         AC I2GWK9.1
#=GS A0A2P4Z7T5_9HYPO/99-885     AC A0A2P4Z7T5.1
#=GS W6XXV9_COCCA/356-1174       AC W6XXV9.1
#=GS I2G4A9_USTH4/90-926         AC I2G4A9.1
#=GS A0A5F5XJP1_FELCA/75-845     AC A0A5F5XJP1.1
#=GS A0A1V2L8P9_CYBFA/41-701     AC A0A1V2L8P9.1
#=GS MBB1A_RAT/70-833            AC O35821.2
#=GS A0A3S2P197_ORYJA/1-533      AC A0A3S2P197.1
#=GS A0A2H5TXV1_RHIID/549-906    AC A0A2H5TXV1.1
#=GS A0A341AN95_NEOAA/137-905    AC A0A341AN95.1
#=GS A0A1U7YP52_NICSY/3-72       AC A0A1U7YP52.1
#=GS A0A178ZHV1_9EURO/52-896     AC A0A178ZHV1.1
#=GS M2N9X7_BAUPA/74-853         AC M2N9X7.1
#=GS A0A2I0TLW5_LIMLA/62-470     AC A0A2I0TLW5.1
#=GS A0A5A9P9B9_9TELE/1-399      AC A0A5A9P9B9.1
#=GS A0A200QK24_9MAGN/155-972    AC A0A200QK24.1
#=GS G4UCG6_NEUT9/101-872        AC G4UCG6.1
#=GS A0A1X7STT2_AMPQE/1-282      AC A0A1X7STT2.1
#=GS Q2UM78_ASPOR/53-837         AC Q2UM78.1
#=GS A0A5C3L3S1_9AGAR/91-903     AC A0A5C3L3S1.1
#=GS A0A507CDY7_9FUNG/81-889     AC A0A507CDY7.1
#=GS A0A2I2FKK7_9EURO/60-831     AC A0A2I2FKK7.1
#=GS A0A161HH18_9ASCO/91-886     AC A0A161HH18.1
#=GS A0A2T9Y8J4_9FUNG/1-44       AC A0A2T9Y8J4.1
#=GS A0A154PTV4_DUFNO/69-817     AC A0A154PTV4.1
#=GS A0A5N5CWV6_9PEZI/66-852     AC A0A5N5CWV6.1
#=GS A7E9A0_SCLS1/97-349         AC A7E9A0.1
#=GS A0A2S4PU53_9PEZI/280-841    AC A0A2S4PU53.1
#=GS A0A4T0VN02_9PEZI/123-901    AC A0A4T0VN02.1
#=GS A0A6I8PE37_ORNAN/59-806     AC A0A6I8PE37.1
#=GS K7ILW9_NASVI/46-790         AC K7ILW9.1
#=GS A0A3Q3X2S3_MOLML/63-472     AC A0A3Q3X2S3.1
#=GS B3MYZ4_DROAN/110-860        AC B3MYZ4.2
#=GS A0A0C3ANX2_9AGAM/64-860     AC A0A0C3ANX2.1
#=GS K8EHI6_9CHLO/88-987         AC K8EHI6.1
#=GS A0A1X2HQG2_SYNRA/65-855     AC A0A1X2HQG2.1
#=GS K3YPC9_SETIT/161-991        AC K3YPC9.1
#=GS A0A1G4IVK2_9SACH/43-876     AC A0A1G4IVK2.1
#=GS A0A3M6VHV7_9STRA/523-1281   AC A0A3M6VHV7.1
#=GS A0A553P160_9TELE/106-752    AC A0A553P160.1
#=GS A0A395SEI6_FUSSP/113-880    AC A0A395SEI6.1
#=GS V5F327_KALBG/90-912         AC V5F327.1
#=GS A0A1V8V2N1_9PEZI/87-688     AC A0A1V8V2N1.1
#=GS A0A1Z5TUI6_HORWE/72-836     AC A0A1Z5TUI6.1
#=GS N1PJF9_DOTSN/75-845         AC N1PJF9.1
#=GS A0A3P8U4J6_AMPPE/127-925    AC A0A3P8U4J6.1
#=GS A0A395J0R9_9HELO/181-288    AC A0A395J0R9.1
#=GS A0A2P8ZKT7_BLAGE/73-328     AC A0A2P8ZKT7.1
#=GS A0A665XDC3_ECHNA/64-856     AC A0A665XDC3.1
#=GS A0A2R9B1Y4_PANPA/72-836     AC A0A2R9B1Y4.1
#=GS A0A060SK59_PYCCI/71-878     AC A0A060SK59.1
#=GS A0A0N4THI3_BRUPA/2-110      AC A0A0N4THI3.1
#=GS W4KK64_HETIT/66-882         AC W4KK64.1
#=GS A0A1B8B1L7_FUSPO/113-880    AC A0A1B8B1L7.1
#=GS M7UB61_BOTF1/97-870         AC M7UB61.1
#=GS A0A4Y7I5L6_PAPSO/132-803    AC A0A4Y7I5L6.1
#=GS A0A444GEW3_ENSVE/765-937    AC A0A444GEW3.1
#=GS A0A0J7YPC1_BETVU/11-164     AC A0A0J7YPC1.1
#=GS A8Q2S8_MALGO/82-885         AC A8Q2S8.1
#=GS A0A4D9ER11_9SAUR/67-846     AC A0A4D9ER11.1
#=GS A0A2C5YXT3_9HYPO/88-772     AC A0A2C5YXT3.1
#=GS G1S6B5_NOMLE/622-767        AC G1S6B5.2
#=GS A0A1D5PUM1_CHICK/66-679     AC A0A1D5PUM1.3
#=GS A0A5N7DB78_9EURO/61-844     AC A0A5N7DB78.1
#=GS A0A158NUL4_ATTCE/74-815     AC A0A158NUL4.1
#=GS C1G8R9_PARBD/59-860         AC C1G8R9.1
#=GS A0A673YMV7_SALTR/696-807    AC A0A673YMV7.1
#=GS A0A2K5QLT5_CEBCA/47-813     AC A0A2K5QLT5.1
#=GS A0A0L6U720_9BASI/56-850     AC A0A0L6U720.1
#=GS A0A2S4UHB6_9BASI/212-643    AC A0A2S4UHB6.1
#=GS A0A0H2S3A1_9AGAM/83-868     AC A0A0H2S3A1.1
#=GS G0WI71_NAUDC/46-903         AC G0WI71.1
#=GS A0A315US14_GAMAF/294-576    AC A0A315US14.1
#=GS A0A4S2L3Z6_9HYME/65-812     AC A0A4S2L3Z6.1
#=GS W4G3D7_9STRA/387-800        AC W4G3D7.1
#=GS A0A091KAL4_COLST/1-763      AC A0A091KAL4.1
#=GS A0A1L8HGB4_XENLA/77-861     AC A0A1L8HGB4.1
#=GS B4I942_DROSE/115-850        AC B4I942.1
#=GS A0A2K5HBB2_COLAP/607-689    AC A0A2K5HBB2.1
#=GS Q6Z0Z0_ORYSJ/176-1044       AC Q6Z0Z0.1
#=GS A0A0D3AYP3_BRAOL/101-237    AC A0A0D3AYP3.1
#=GS A0A433Q7C1_9FUNG/70-193     AC A0A433Q7C1.1
#=GS A0A672UW61_STRHB/657-721    AC A0A672UW61.1
#=GS A0A1V8U5T5_9PEZI/86-877     AC A0A1V8U5T5.1
#=GS A0A067KVQ7_JATCU/185-979    AC A0A067KVQ7.1
#=GS A0A4Q9Q0V0_9APHY/71-883     AC A0A4Q9Q0V0.1
#=GS K9F8E1_PEND2/61-839         AC K9F8E1.1
#=GS A0A3P8WWR0_CYNSE/61-860     AC A0A3P8WWR0.1
#=GS A0A1Q3E522_LENED/66-136     AC A0A1Q3E522.1
#=GS A0A0R3QZG9_9BILA/408-679    AC A0A0R3QZG9.1
#=GS A0A673YMV7_SALTR/104-684    AC A0A673YMV7.1
#=GS A0A3R7MKG7_PENVA/18-400     AC A0A3R7MKG7.1
#=GS A0A151K375_9HYME/74-815     AC A0A151K375.1
#=GS H0EFC8_GLAL7/502-801        AC H0EFC8.1
#=GS A0A674PD32_TAKRU/65-845     AC A0A674PD32.1
#=GS A0A1E5RQZ6_HANUV/49-928     AC A0A1E5RQZ6.1
#=GS D3BLV0_POLPP/143-684        AC D3BLV0.1
#=GS A0A178AWE5_9PLEO/76-871     AC A0A178AWE5.1
#=GS A0A068TLZ6_COFCA/228-1024   AC A0A068TLZ6.1
#=GS A0A3L6QF20_PANMI/70-919     AC A0A3L6QF20.1
#=GS A0A2P5IEZ3_9PEZI/119-892    AC A0A2P5IEZ3.1
#=GS A0A2P6PQH5_ROSCH/163-983    AC A0A2P6PQH5.1
#=GS W9CPB5_SCLBF/92-866         AC W9CPB5.1
#=GS A0A553P157_9TELE/728-875    AC A0A553P157.1
#=GS I1M2K6_SOYBN/157-964        AC I1M2K6.1
#=GS A0A1Y2WCC0_9PEZI/94-868     AC A0A1Y2WCC0.1
#=GS A0A4T0JPN8_WALIC/86-872     AC A0A4T0JPN8.1
#=GS A0A484EBZ6_BRELC/59-784     AC A0A484EBZ6.1
#=GS C4R176_KOMPG/42-819         AC C4R176.1
#=GS A0A094EX79_9PEZI/112-859    AC A0A094EX79.1
#=GS K0SEP9_THAOC/158-594        AC K0SEP9.1
#=GS A0A5B0R090_PUCGR/56-875     AC A0A5B0R090.1
#=GS G9NMM8_HYPAI/752-889        AC G9NMM8.1
#=GS A0A060X379_ONCMY/365-904    AC A0A060X379.1
#=GS E1ZRW4_CHLVA/119-951        AC E1ZRW4.1
#=GS A0A3M7BAM1_HORWE/72-836     AC A0A3M7BAM1.1
#=GS A0A0F8V496_9EURO/63-839     AC A0A0F8V496.1
#=GS A0A2H2ILT3_CAEJA/1-81       AC A0A2H2ILT3.1
#=GS A0A0C7NCI2_9SACH/53-868     AC A0A0C7NCI2.1
#=GS A0A674MXL8_TAKRU/62-827     AC A0A674MXL8.1
#=GS A0A176W9J4_MARPO/696-1011   AC A0A176W9J4.1
#=GS A0A094CS43_9PEZI/1-577      AC A0A094CS43.1
#=GS G0SD85_CHATD/101-862        AC G0SD85.1
#=GS M5EAK0_MALS4/75-834         AC M5EAK0.1
#=GS A0A5C3QZJ9_9AGAR/67-882     AC A0A5C3QZJ9.1
#=GS U1HH43_ENDPU/563-1363       AC U1HH43.1
#=GS A0A063BUN6_USTVR/97-906     AC A0A063BUN6.1
#=GS A0A087QWK3_APTFO/7-781      AC A0A087QWK3.1
#=GS A0A4S4LAG4_9AGAM/234-989    AC A0A4S4LAG4.1
#=GS A0A267GG39_9PLAT/67-402     AC A0A267GG39.1
#=GS A0A067C0R7_SAPPC/58-749     AC A0A067C0R7.1
#=GS A0A5N6DP36_ASPPA/61-845     AC A0A5N6DP36.1
#=GS A0A2N3N224_9PEZI/105-835    AC A0A2N3N224.1
#=GS A0A2H3HTN9_FUSOX/94-432     AC A0A2H3HTN9.1
#=GS H2T8I3_TAKRU/65-864         AC H2T8I3.3
#=GS A0A4P6XS70_9ASCO/41-874     AC A0A4P6XS70.1
#=GS A0A5N5IHV7_9ROSA/166-985    AC A0A5N5IHV7.1
#=GS A0A2K5VWV4_MACFA/72-835     AC A0A2K5VWV4.1
#=GS A0A6A6L6A9_HEVBR/68-235     AC A0A6A6L6A9.1
#=GS A0A1R1YCN4_9FUNG/692-925    AC A0A1R1YCN4.1
#=GS A0A6G0ZJP1_APHCR/50-802     AC A0A6G0ZJP1.1
#=GS A0A1L9SDY6_9EURO/58-877     AC A0A1L9SDY6.1
#=GS A0A4V1IVE3_9FUNG/119-269    AC A0A4V1IVE3.1
#=GS A0A2S5BC53_9BASI/55-646     AC A0A2S5BC53.1
#=GS A0A1U7ZLE0_NELNU/179-992    AC A0A1U7ZLE0.1
#=GS A0A2Y9L2V3_ENHLU/72-838     AC A0A2Y9L2V3.1
#=GS A0A5N6KVB6_9ROSI/898-966    AC A0A5N6KVB6.1
#=GS A0A2R6W776_MARPO/243-708    AC A0A2R6W776.1
#=GS A0A0L8FLL4_OCTBM/3-162      AC A0A0L8FLL4.1
#=GS A0A643CKH4_BALPH/95-514     AC A0A643CKH4.1
#=GS A1DML7_NEOFI/61-832         AC A1DML7.1
#=GS C1GRM9_PARBA/61-866         AC C1GRM9.2
#=GS G4ZUH3_PHYSP/59-820         AC G4ZUH3.1
#=GS A0A2K5ETQ6_AOTNA/72-832     AC A0A2K5ETQ6.1
#=GS A1CTC1_ASPCL/61-846         AC A1CTC1.1
#=GS A0A485NA23_LYNPA/1-521      AC A0A485NA23.1
#=GS A0A3B3IMX1_ORYLA/8-804      AC A0A3B3IMX1.1
#=GS A0A5P1E864_ASPOF/5-203      AC A0A5P1E864.1
#=GS A0A1D6GZU8_MAIZE/6-643      AC A0A1D6GZU8.1
#=GS A0A1X6N7Z5_9APHY/66-866     AC A0A1X6N7Z5.1
#=GS A0A5C3PF39_9APHY/68-879     AC A0A5C3PF39.1
#=GS A0A4Y7QIW5_9AGAM/74-889     AC A0A4Y7QIW5.1
#=GS U4U6H5_DENPD/63-794         AC U4U6H5.1
#=GS A0A1D6GZU7_MAIZE/156-1008   AC A0A1D6GZU7.1
#=GS A0A0V0UKJ0_9BILA/52-242     AC A0A0V0UKJ0.1
#=GS A0A553NZP8_TIGCA/8-436      AC A0A553NZP8.1
#=GS D5G8V8_TUBMM/46-841         AC D5G8V8.1
#=GS W6MFS8_9ASCO/41-907         AC W6MFS8.1
#=GS A0A067TS23_GALM3/74-875     AC A0A067TS23.1
#=GS A0A1Y3N8H2_PIRSE/1-396      AC A0A1Y3N8H2.1
#=GS A0A0K0DB80_ANGCA/364-532    AC A0A0K0DB80.1
#=GS A0A3S0ZEH3_ELYCH/10-143     AC A0A3S0ZEH3.1
#=GS A0A103Y3K3_CYNCS/173-766    AC A0A103Y3K3.1
#=GS A0A5C2S734_9APHY/70-885     AC A0A5C2S734.1
#=GS A0A1D6GZU5_MAIZE/156-1015   AC A0A1D6GZU5.1
#=GS A0A2J6PVP9_9HELO/101-872    AC A0A2J6PVP9.1
#=GS A0A2G4T0V0_RHIZD/64-819     AC A0A2G4T0V0.1
#=GS A0A699ZIS5_HAELA/315-533    AC A0A699ZIS5.1
#=GS A0A3M2SW53_9EURO/60-845     AC A0A3M2SW53.1
#=GS A0A0B0NGE1_GOSAR/179-986    AC A0A0B0NGE1.1
#=GS A0A5D2S067_GOSMU/180-990    AC A0A5D2S067.1
#=GS B8N4J5_ASPFN/61-845         AC B8N4J5.1
#=GS A0A2T3ZDW1_9HYPO/754-889    AC A0A2T3ZDW1.1
#=GS G0R999_HYPJQ/106-893        AC G0R999.1
#=GS A0A5F4CAL1_CANLF/198-741    AC A0A5F4CAL1.1
#=GS A0A2N5VF05_9BASI/57-885     AC A0A2N5VF05.1
#=GS A7TI86_VANPO/45-851         AC A7TI86.1
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