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Database: Pfam
Entry: DUF2075
LinkDB: DUF2075
Original site: DUF2075 
#=GF ID   DUF2075
#=GF AC   PF09848.12
#=GF DE   Schlafen group 3, DNA/RNA helicase domain
#=GF AU   COGs;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF SE   COGs (COG3410)
#=GF GA   20.30 20.30;
#=GF TC   20.30 20.30;
#=GF NC   20.20 20.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0023
#=GF RN   [1]
#=GF RM   23570387
#=GF RT   The schlafen family of proteins and their regulation by
#=GF RT   interferons.
#=GF RA   Mavrommatis E, Fish EN, Platanias LC;
#=GF RL   J Interferon Cytokine Res. 2013;33:206-210.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   18355440
#=GF RT   Subcellular localization of the Schlafen protein family.
#=GF RA   Neumann B, Zhao L, Murphy K, Gonda TJ;
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun. 2008;370:62-66.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   31504772
#=GF RT   A protein architecture guided screen for modification dependent
#=GF RT   restriction endonucleases.
#=GF RA   Lutz T, Flodman K, Copelas A, Czapinska H, Mabuchi M, Fomenkov
#=GF RA   A, He X, Bochtler M, Xu SY;
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2019;47:9761-9776.
#=GF DR   INTERPRO; IPR018647;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This domain is found in at the C terminus of group 3 Schlafen
#=GF CC   proteins from mammals, and represents the DNA/RNA helicase
#=GF CC   domain [2]. Schlafen proteins are involved in the control of
#=GF CC   cell proliferation, induction of immune responses, and in the
#=GF CC   regulation of viral replication [1,2,3]. These proteins inhibit
#=GF CC   DNA replication and promote cell death in response to DNA
#=GF CC   damage. They play a role in genome surveillance to kill cells
#=GF CC   with defective replication [3]. This domain is also found in
#=GF CC   various uncharacterised prokaryotic proteins fused to a DNA
#=GF CC   helicase, GIY-YIG or PD-(D/E)XK catalytic domain or
#=GF CC   HsdR-N(terminal) domain, which are similar to AAA DNA helicase,
#=GF CC   Type III restriction enzyme ATPase, RecD and RuvB helicase [3].
#=GF SQ   1874
#=GS A0A287A8K2_PIG/587-772      AC A0A287A8K2.2
#=GS A0A327WHI5_9ACTN/152-498    AC A0A327WHI5.1
#=GS D5RU24_9PROT/56-234         AC D5RU24.1
#=GS A0A2P8Q539_9ACTN/259-610    AC A0A2P8Q539.1
#=GS A7TK24_VANPO/81-448         AC A7TK24.1
#=GS A0A1L7CF11_9CORY/188-414    AC A0A1L7CF11.1
#=GS D6XXW6_BACIE/267-604        AC D6XXW6.1
#=GS A0A2V1MZS3_9LACO/193-545    AC A0A2V1MZS3.1
#=GS A0A2U3D5Y2_9BACL/207-428    AC A0A2U3D5Y2.1
#=GS A0A161LVV7_9BACT/236-630    AC A0A161LVV7.1
#=GS A0A235GCY3_9NOCA/263-611    AC A0A235GCY3.1
#=GS R7LIF1_9BACT/240-677        AC R7LIF1.1
#=GS F7PTV5_9MOLU/173-512        AC F7PTV5.1
#=GS A0A1V4K2N3_PATFA/563-652    AC A0A1V4K2N3.1
#=GS R6NTU6_9CLOT/238-673        AC R6NTU6.1
#=GS A0A371S4Y9_9BACI/5-46       AC A0A371S4Y9.1
#=GS A0A1V4ACR0_9ACTN/259-606    AC A0A1V4ACR0.1
#=GS T2KL21_FORAG/155-521        AC T2KL21.1
#=GS A0A1T4YUI2_9ACTN/181-560    AC A0A1T4YUI2.1
#=GS F7E9W8_CALJA/586-728        AC F7E9W8.2
#=GS A0A161LIP1_9ACTN/261-606    AC A0A161LIP1.1
#=GS A0A0A0M436_9LACO/1-177      AC A0A0A0M436.1
#=GS G9ZM12_9LACO/49-388         AC G9ZM12.1
#=GS R7GKW2_9CLOT/1-47           AC R7GKW2.1
#=GS A0A517NJU8_9BACT/37-95      AC A0A517NJU8.1
#=GS A0A1G7B5N0_9NOCA/236-584    AC A0A1G7B5N0.1
#=GS R6VB09_9FIRM/208-416        AC R6VB09.1
#=GS A0A261GDA7_9BIFI/282-767    AC A0A261GDA7.1
#=GS A0A1H8T9P8_9BACI/184-532    AC A0A1H8T9P8.1
#=GS A0A1H1NU46_9CELL/187-574    AC A0A1H1NU46.1
#=GS A0A1C4K4M3_9ACTN/414-577    AC A0A1C4K4M3.1
#=GS Q9HK67_THEAC/232-577        AC Q9HK67.1
#=GS A0A5R8Q9C1_9FIRM/215-418    AC A0A5R8Q9C1.1
#=GS A0A5C5U6W5_9GAMM/264-608    AC A0A5C5U6W5.1
#=GS A0A0S7B7J5_9CHLR/235-630    AC A0A0S7B7J5.1
#=GS A1A222_BIFAA/236-699        AC A1A222.1
#=GS A0A1C5EUL0_9ACTN/805-1152   AC A0A1C5EUL0.1
#=GS A0A6G4V7S1_9ACTN/254-599    AC A0A6G4V7S1.1
#=GS A0A340WAX3_LIPVE/590-754    AC A0A340WAX3.1
#=GS A0A2T0NAD8_9ACTN/259-613    AC A0A2T0NAD8.1
#=GS A3QIQ9_SHELP/237-623        AC A3QIQ9.1
#=GS A0A2U8E161_9BACT/246-640    AC A0A2U8E161.1
#=GS A0A0C3HFH9_9PEZI/230-613    AC A0A0C3HFH9.1
#=GS A0A0Q9BXP7_9CELL/265-613    AC A0A0Q9BXP7.1
#=GS A0A6N3IFC7_9DELT/238-632    AC A0A6N3IFC7.1
#=GS R5HFZ2_9SPIR/233-609        AC R5HFZ2.1
#=GS E4T685_PALPW/236-630        AC E4T685.1
#=GS A0A7N5JBH3_AILME/572-777    AC A0A7N5JBH3.1
#=GS A0A1H2X9J3_9GAMM/238-358    AC A0A1H2X9J3.1
#=GS A0A1B6BH63_9FIRM/5-166      AC A0A1B6BH63.1
#=GS A0A292IHA4_9MOLU/312-405    AC A0A292IHA4.1
#=GS A0A0U1QSU2_9BACL/48-396     AC A0A0U1QSU2.1
#=GS C9LVL2_SELS3/234-624        AC C9LVL2.1
#=GS A0A378UIL1_BERDE/217-603    AC A0A378UIL1.1
#=GS A0A2K6C7U6_MACNE/543-693    AC A0A2K6C7U6.1
#=GS A0A6L8WA30_9PROT/1-179      AC A0A6L8WA30.1
#=GS A0A0B7MLU8_9FIRM/243-605    AC A0A0B7MLU8.1
#=GS A0A413QPI6_9FIRM/234-588    AC A0A413QPI6.1
#=GS A0A1T4MQX1_9ENTE/219-456    AC A0A1T4MQX1.1
#=GS A0A1H0PP64_9ACTN/263-611    AC A0A1H0PP64.1
#=GS A0A176QB13_9MICO/260-609    AC A0A176QB13.1
#=GS A0A0R1P3I5_9LACO/42-394     AC A0A0R1P3I5.1
#=GS A0A1V9ADT1_9PSEU/263-616    AC A0A1V9ADT1.1
#=GS A0A344TXR7_9ACTN/260-608    AC A0A344TXR7.1
#=GS K8ZL47_9ENTE/179-532        AC K8ZL47.1
#=GS E3NPC6_CAERE/128-517        AC E3NPC6.1
#=GS A0A3B0BA81_9MICO/130-509    AC A0A3B0BA81.1
#=GS G1SJV1_RABIT/595-718        AC G1SJV1.3
#=GS S2ZTQ3_9ACTN/260-607        AC S2ZTQ3.1
#=GS A0A448HVY8_MYCCI/261-610    AC A0A448HVY8.1
#=GS A0A286DQX2_9ACTN/259-614    AC A0A286DQX2.1
#=GS A0A2S6NHY2_RHOGL/242-630    AC A0A2S6NHY2.1
#=GS A0A1G7K889_9BACL/264-610    AC A0A1G7K889.1
#=GS Q21ED4_SACD2/234-629        AC Q21ED4.1
#=GS A0A1G5IN92_9FIRM/249-685    AC A0A1G5IN92.1
#=GS A0A6P5LT61_PHACI/594-714    AC A0A6P5LT61.1
#=GS A0A419HL34_9PSEU/268-610    AC A0A419HL34.1
#=GS Q87QR9_VIBPA/79-453         AC Q87QR9.1
#=GS F6GGT1_LACS5/206-395        AC F6GGT1.1
#=GS A0A6J1XCF9_ACIJB/571-731    AC A0A6J1XCF9.1
#=GS A0A0R2G293_9LACO/104-461    AC A0A0R2G293.1
#=GS A0A0Q8Z2Q1_9ACTN/260-607    AC A0A0Q8Z2Q1.1
#=GS A0A239TH42_9STAP/216-578    AC A0A239TH42.1
#=GS A0A2T5B1K4_MYCDI/246-638    AC A0A2T5B1K4.1
#=GS D5QF62_KOMHA/33-381         AC D5QF62.1
#=GS A0A4R7VF99_9PSEU/189-245    AC A0A4R7VF99.1
#=GS A0A5Q4T626_9ACTN/260-607    AC A0A5Q4T626.1
#=GS R5JGA7_9FIRM/208-386        AC R5JGA7.1
#=GS A0A365KX58_9BACL/181-526    AC A0A365KX58.1
#=GS A0A2K5PF37_CEBIM/543-685    AC A0A2K5PF37.1
#=GS YP245_YEAST/69-441          AC Q12179.1
#=GS A0A1S8W6S0_9FUNG/443-577    AC A0A1S8W6S0.1
#=GS A0A1D3TTK9_9FIRM/265-609    AC A0A1D3TTK9.1
#=GS A0A091VD16_NIPNI/590-689    AC A0A091VD16.1
#=GS W5PA10_SHEEP/591-715        AC W5PA10.1
#=GS A0A374DB23_9FIRM/207-571    AC A0A374DB23.1
#=GS A0A6P3RHU3_PTEVA/590-763    AC A0A6P3RHU3.1
#=GS I3ILJ5_9BACT/236-630        AC I3ILJ5.1
#=GS A0A1Q5JWP3_9ACTN/195-547    AC A0A1Q5JWP3.1
#=GS A0A3N2N4J1_9BACT/196-406    AC A0A3N2N4J1.1
#=GS A0A1B9AFL8_9BACI/182-526    AC A0A1B9AFL8.1
#=GS A0A0G3EHB2_9BACT/247-641    AC A0A0G3EHB2.1
#=GS A0A2M6VN90_9BURK/282-676    AC A0A2M6VN90.1
#=GS W9GNX9_9MICO/260-609        AC W9GNX9.1
#=GS U6F8F1_LACHE/43-395         AC U6F8F1.1
#=GS R5SSM8_9GAMM/233-609        AC R5SSM8.1
#=GS A0A0M8SK38_9ACTN/260-608    AC A0A0M8SK38.1
#=GS A0A0B5RVX1_9FLAO/260-605    AC A0A0B5RVX1.1
#=GS A0A1K1QZR8_9BACL/262-608    AC A0A1K1QZR8.1
#=GS A0A3E0DR65_9GAMM/261-606    AC A0A3E0DR65.1
#=GS A0A1D5R838_MACMU/586-722    AC A0A1D5R838.2
#=GS H2NTD2_PONAB/593-723        AC H2NTD2.1
#=GS A0A097ICW6_9CORY/245-614    AC A0A097ICW6.1
#=GS A0A1W1YB34_9LACT/208-563    AC A0A1W1YB34.1
#=GS A0A2K6C7T3_MACNE/225-366    AC A0A2K6C7T3.1
#=GS A0A0C2HIB7_9DELT/207-399    AC A0A0C2HIB7.1
#=GS Q4L9X5_STAHJ/204-559        AC Q4L9X5.1
#=GS A0A0R2B4B3_9LACO/41-390     AC A0A0R2B4B3.1
#=GS G8QUC3_SPHPG/261-535        AC G8QUC3.1
#=GS A0A0L8NXE3_9ACTN/189-244    AC A0A0L8NXE3.1
#=GS A0A151BZV8_9MICO/249-597    AC A0A151BZV8.1
#=GS A0A7D8UJA1_9HELO/279-662    AC A0A7D8UJA1.1
#=GS A0A1L3GJ28_PELAE/261-603    AC A0A1L3GJ28.1
#=GS SLFN9_MOUSE/592-767         AC B1ARD6.1
#=GS A0A1N6SIX7_9SPHI/246-434    AC A0A1N6SIX7.1
#=GS A0A252BLY3_9PROT/49-397     AC A0A252BLY3.1
#=GS A0A2H5B4Z7_9ACTN/287-642    AC A0A2H5B4Z7.1
#=GS A0A418UTR5_9ACTO/249-318    AC A0A418UTR5.1
#=GS A0A248YNK6_9ACTN/264-613    AC A0A248YNK6.1
#=GS A0A1N7GLW2_9ACTN/270-616    AC A0A1N7GLW2.1
#=GS A0A143YPE2_9LACT/208-575    AC A0A143YPE2.1
#=GS A0A1H4DFD5_ALKAM/235-632    AC A0A1H4DFD5.1
#=GS A0A2R7K7A9_9SPHI/280-621    AC A0A2R7K7A9.1
#=GS A0A2I3NDH8_PAPAN/592-714    AC A0A2I3NDH8.1
#=GS C5E281_LACTC/77-441         AC C5E281.1
#=GS A0A1I5C5Q5_9MICO/192-578    AC A0A1I5C5Q5.1
#=GS A0A0R2KVF9_9LACO/195-548    AC A0A0R2KVF9.1
#=GS A0A3N2D0T4_9MICO/262-628    AC A0A3N2D0T4.1
#=GS A0A4S8EY74_9BURK/220-286    AC A0A4S8EY74.1
#=GS A0A0M8YDF9_9ACTN/242-589    AC A0A0M8YDF9.1
#=GS M1LX39_9CLOT/265-611        AC M1LX39.1
#=GS A0A0R2HNV0_9FIRM/229-461    AC A0A0R2HNV0.1
#=GS A0A485NCS3_LYNPA/571-731    AC A0A485NCS3.1
#=GS A0A6B2V3S3_9ACTN/213-565    AC A0A6B2V3S3.1
#=GS A0A1H7IYP1_9FIRM/241-676    AC A0A1H7IYP1.1
#=GS A0A5Q0LI07_9ACTN/311-675    AC A0A5Q0LI07.1
#=GS C6WS54_ACTMD/192-249        AC C6WS54.1
#=GS A0A091TBJ8_PHALP/604-724    AC A0A091TBJ8.1
#=GS R5I6D1_9BACT/1-268          AC R5I6D1.1
#=GS A0A4V1XLR9_9PEZI/90-473     AC A0A4V1XLR9.1
#=GS SLFN8_MOUSE/592-767         AC B1ARD8.1
#=GS A0A415DZB7_9FIRM/178-542    AC A0A415DZB7.1
#=GS A0A0Q4B123_9ARCH/270-610    AC A0A0Q4B123.1
#=GS A0A6B8VU29_9CORY/235-586    AC A0A6B8VU29.1
#=GS A0A368WD32_9BACL/261-605    AC A0A368WD32.1
#=GS A0A1S8TL36_9CLOT/1-269      AC A0A1S8TL36.1
#=GS A0A6G4U8D3_9ACTN/259-606    AC A0A6G4U8D3.1
#=GS A0A1T5CT21_9SPHI/236-631    AC A0A1T5CT21.1
#=GS A0A4Q4IM60_9BACL/51-398     AC A0A4Q4IM60.1
#=GS A0A495XT04_9MICO/260-608    AC A0A495XT04.1
#=GS A0A1M7Q254_9BACI/262-607    AC A0A1M7Q254.1
#=GS A0A542DEV4_9PSEU/262-607    AC A0A542DEV4.1
#=GS B5IP82_9CYAN/261-604        AC B5IP82.1
#=GS A0A238LC34_9RHOB/234-623    AC A0A238LC34.1
#=GS A0A2A3YNL8_9MICO/180-560    AC A0A2A3YNL8.1
#=GS Q74KC4_LACJO/39-390         AC Q74KC4.1
#=GS E6TR26_BACCJ/265-611        AC E6TR26.1
#=GS A0A543C0P7_9ACTN/260-606    AC A0A543C0P7.1
#=GS A0A1B2R5Y2_9BORD/265-606    AC A0A1B2R5Y2.1
#=GS A0A1V6N355_9EURY/264-610    AC A0A1V6N355.1
#=GS A0A069PBQ2_9BURK/221-331    AC A0A069PBQ2.1
#=GS S5VQL0_STRC3/260-607        AC S5VQL0.1
#=GS S3B2W3_9ACTN/266-613        AC S3B2W3.1
#=GS G7GXC3_9ACTN/268-617        AC G7GXC3.1
#=GS K4RCB1_STRDJ/262-607        AC K4RCB1.1
#=GS A0A5B2TI83_9PROT/239-623    AC A0A5B2TI83.1
#=GS A0A2K1Q229_9GAMM/264-609    AC A0A2K1Q229.1
#=GS R7D5N2_9ACTN/224-664        AC R7D5N2.1
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