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Database: Pfam
Entry: DUF3827
LinkDB: DUF3827
Original site: DUF3827 
#=GF ID   DUF3827
#=GF AC   PF12877.10
#=GF DE   Domain of unknown function (DUF3827)
#=GF AU   Zenonos ZA;0000-0002-8646-8127
#=GF AU   Mistry J;0000-0003-2479-5322
#=GF SE   jackhmmer:Q9HCM3
#=GF GA   24.00 24.00;
#=GF TC   24.00 24.00;
#=GF NC   23.30 23.70;
#=GF BM   hmmbuild --amino HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Domain_of_unknown_function
#=GF RN   [1]
#=GF RM   18974108
#=GF RT   Tandem duplication producing a novel oncogenic BRAF fusion gene
#=GF RT   defines the majority of pilocytic astrocytomas.
#=GF RA   Jones DT, Kocialkowski S, Liu L, Pearson DM, Backlund LM,
#=GF RA   Ichimura K, Collins VP;
#=GF RL   Cancer Res. 2008;68:8673-8677.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   19363522
#=GF RT   Oncogenic RAF1 rearrangement and a novel BRAF mutation as
#=GF RT   alternatives to KIAA1549:BRAF fusion in activating the MAPK
#=GF RT   pathway in pilocytic astrocytoma.
#=GF RA   Jones DT, Kocialkowski S, Liu L, Pearson DM, Ichimura K, Collins
#=GF RA   VP;
#=GF RL   Oncogene. 2009;28:2119-2123.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   19937730
#=GF RT   MAPK pathway activation and the origins of pediatric low-grade
#=GF RT   astrocytomas.
#=GF RA   Tatevossian RG, Lawson AR, Forshew T, Hindley GF, Ellison DW,
#=GF RA   Sheer D;
#=GF RL   J Cell Physiol. 2010;222:509-514.
#=GF DR   INTERPRO; IPR024606;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family contains the Swiss:Q9HCM3 protein which has been
#=GF CC   found to be fused fused to BRAF gene in many cases of pilocytic
#=GF CC   astrocytomas. The fusion is due mainly to a tandem duplication
#=GF CC   of 2 Mb at 7q34 [1-2].  Although nothing is known about the
#=GF CC   function of Swiss:Q9HCM3 protein, the BRAF protein is a well
#=GF CC   characterised oncoprotein. It is a serine/threonine protein
#=GF CC   kinase which is implicated in MAP/ERK signalling, a critical
#=GF CC   pathway for the regulation of cell division, differentiation and
#=GF CC   secretion [1-3].
#=GF SQ   1170
#=GS A0A3Q2DE85_CYPVA/27-157     AC A0A3Q2DE85.1
#=GS A0A226PW61_COLVI/1265-1348  AC A0A226PW61.1
#=GS A0A3Q2WV79_HAPBU/553-1230   AC A0A3Q2WV79.1
#=GS A0A803K1C7_XENTR/1629-1979  AC A0A803K1C7.1
#=GS A0A2I4APB3_9TELE/875-1106   AC A0A2I4APB3.1
#=GS A0A7E6E164_9CHIR/510-1149   AC A0A7E6E164.1
#=GS M7B6T0_CHEMY/750-1424       AC M7B6T0.1
#=GS A0A5F5Y2K9_FELCA/903-1542   AC A0A5F5Y2K9.1
#=GS A0A6P6N014_CARAU/277-696    AC A0A6P6N014.1
#=GS A0A803KBM8_XENTR/1447-2091  AC A0A803KBM8.1
#=GS A0A6J8E2X6_MYTCO/1359-1542  AC A0A6J8E2X6.1
#=GS A0A6P7MTD5_BETSP/766-1204   AC A0A6P7MTD5.1
#=GS A0A2U3X3H6_ODORO/965-1633   AC A0A2U3X3H6.1
#=GS A0A267FW31_9PLAT/1-135      AC A0A267FW31.1
#=GS A0A1D5R4P3_MACMU/903-1541   AC A0A1D5R4P3.2
#=GS A0A498NZG0_LABRO/42-177     AC A0A498NZG0.1
#=GS A0A670YQD7_PSETE/1-93       AC A0A670YQD7.1
#=GS A0A6F8ZRQ4_9TELE/402-459    AC A0A6F8ZRQ4.1
#=GS A0A0P7VNS4_SCLFO/670-1357   AC A0A0P7VNS4.1
#=GS A0A2K6SJE1_SAIBB/879-1550   AC A0A2K6SJE1.1
#=GS A0A673A0A5_9TELE/2-109      AC A0A673A0A5.1
#=GS A0A4U5U8F8_COLLU/370-775    AC A0A4U5U8F8.1
#=GS A0A3M7S8C3_BRAPC/4-118      AC A0A3M7S8C3.1
#=GS A0A5F5XCS0_FELCA/903-1542   AC A0A5F5XCS0.1
#=GS A0A3Q3CH27_HAPBU/691-1114   AC A0A3Q3CH27.1
#=GS G1RUR0_NOMLE/967-1633       AC G1RUR0.2
#=GS A0A6A5F1W0_PERFL/227-466    AC A0A6A5F1W0.1
#=GS A0A2I0UNU5_LIMLA/3141-3396  AC A0A2I0UNU5.1
#=GS A0A3Q3E140_9LABR/830-1525   AC A0A3Q3E140.1
#=GS A0A674K573_TERCA/924-1592   AC A0A674K573.1
#=GS G1LL85_AILME/1022-1661      AC G1LL85.2
#=GS A0A6J2AH14_ACIJB/1020-1659  AC A0A6J2AH14.1
#=GS A0A1A6GID7_NEOLE/1-63       AC A0A1A6GID7.1
#=GS A0A674E8I2_SALTR/68-475     AC A0A674E8I2.1
#=GS A0A7N8Y2W2_9TELE/772-1465   AC A0A7N8Y2W2.1
#=GS A0A667Z5M5_9TELE/801-1479   AC A0A667Z5M5.1
#=GS A0A493SUX4_ANAPP/1030-1697  AC A0A493SUX4.1
#=GS F1MY14_BOVIN/958-1623       AC F1MY14.3
#=GS A0A7R5KBU9_9PASS/1022-1693  AC A0A7R5KBU9.1
#=GS A0A1S3ML36_SALSA/884-1113   AC A0A1S3ML36.1
#=GS R0JQT1_ANAPL/249-757        AC R0JQT1.1
#=GS A0A6Q2ZF52_ESOLU/870-1573   AC A0A6Q2ZF52.1
#=GS A0A6A5FFH8_PERFL/723-1420   AC A0A6A5FFH8.1
#=GS A0A6P8WBK6_GYMAC/1082-1320  AC A0A6P8WBK6.1
#=GS A0A096LSD7_POEFO/414-1092   AC A0A096LSD7.1
#=GS W5MA00_LEPOC/878-1106       AC W5MA00.1
#=GS A0A6P6E8F5_OCTDE/1206-1873  AC A0A6P6E8F5.1
#=GS A0A2K5WIK5_MACFA/934-1572   AC A0A2K5WIK5.2
#=GS A0A226NPJ6_CALSU/974-1290   AC A0A226NPJ6.1
#=GS D3Z9D0_RAT/953-1618         AC D3Z9D0.3
#=GS G1MR43_MELGA/1-239          AC G1MR43.2
#=GS A0A1A6HLI8_NEOLE/1686-1799  AC A0A1A6HLI8.1
#=GS A0A671KU25_9TELE/1-266      AC A0A671KU25.1
#=GS A0A553PYS4_9TELE/869-1186   AC A0A553PYS4.1
#=GS K1PJS4_CRAGI/142-485        AC K1PJS4.1
#=GS A0A6F9AHQ1_9TELE/1344-1681  AC A0A6F9AHQ1.1
#=GS A0A553R8F6_9TELE/488-780    AC A0A553R8F6.1
#=GS A0A6I9JIK4_CHRAS/1022-1688  AC A0A6I9JIK4.1
#=GS W5NJW6_LEPOC/568-1242       AC W5NJW6.1
#=GS A0A4W5KD86_9TELE/3-108      AC A0A4W5KD86.1
#=GS A0A0P7WN05_SCLFO/568-756    AC A0A0P7WN05.1
#=GS A0A3Q4GL01_NEOBR/61-462     AC A0A3Q4GL01.1
#=GS A0A5A9PFP1_9TELE/557-1244   AC A0A5A9PFP1.1
#=GS F6TUW7_MONDO/1055-1672      AC F6TUW7.2
#=GS A0A2K5QMH3_CEBIM/1035-1701  AC A0A2K5QMH3.1
#=GS A0A667YXC5_9TELE/853-1527   AC A0A667YXC5.1
#=GS M3ZTY8_XIPMA/825-1512       AC M3ZTY8.2
#=GS A0A673ZA39_SALTR/1-107      AC A0A673ZA39.1
#=GS A0A673JPA4_9TELE/516-1198   AC A0A673JPA4.1
#=GS A0A3B5R2V1_XIPMA/1-112      AC A0A3B5R2V1.1
#=GS A0A6I9MSL4_9TELE/1-166      AC A0A6I9MSL4.1
#=GS D3YZ21_MOUSE/498-1134       AC D3YZ21.1
#=GS A0A6F9BSK5_9TELE/61-210     AC A0A6F9BSK5.1
#=GS G5B551_HETGA/1469-1655      AC G5B551.1
#=GS A0A3P4RUP2_GULGU/1-254      AC A0A3P4RUP2.1
#=GS A0A673LPA8_9TELE/788-1466   AC A0A673LPA8.1
#=GS A0A667YXC8_9TELE/1246-1511  AC A0A667YXC8.1
#=GS A0A672P0G4_SINGR/783-1461   AC A0A672P0G4.1
#=GS A0A3Q2UUH9_HAPBU/691-1100   AC A0A3Q2UUH9.1
#=GS H0VBD7_CAVPO/964-1630       AC H0VBD7.2
#=GS S7PX81_MYOBR/1020-1502      AC S7PX81.1
#=GS A0A7R5KRS4_9PASS/1022-1688  AC A0A7R5KRS4.1
#=GS A0A670J5U4_PODMU/1075-1746  AC A0A670J5U4.1
#=GS A0A099ZH70_TINGU/102-776    AC A0A099ZH70.1
#=GS A0A6P6MFG7_CARAU/892-1119   AC A0A6P6MFG7.1
#=GS A0A096MEK0_POEFO/574-998    AC A0A096MEK0.1
#=GS A0A401PI61_SCYTO/751-1100   AC A0A401PI61.1
#=GS A0A5N4DZZ0_CAMDR/950-1646   AC A0A5N4DZZ0.1
#=GS Q1LY95_DANRE/65-748         AC Q1LY95.1
#=GS A0A6P8V249_GYMAC/826-1518   AC A0A6P8V249.1
#=GS W5MA00_LEPOC/482-886        AC W5MA00.1
#=GS A0A6P8RPX8_GEOSA/1026-1686  AC A0A6P8RPX8.1
#=GS A0A668A9Q2_9TELE/1-106      AC A0A668A9Q2.1
#=GS A0A3N0XQQ3_ANAGA/446-572    AC A0A3N0XQQ3.1
#=GS A0A5N5NY19_PANHP/862-995    AC A0A5N5NY19.1
#=GS A0A674IIY7_TERCA/1389-2028  AC A0A674IIY7.1
#=GS A0A6P6E2L6_OCTDE/1079-1718  AC A0A6P6E2L6.1
#=GS A0A673WBW5_SALTR/12-122     AC A0A673WBW5.1
#=GS A0A3P9PDD0_POERE/488-574    AC A0A3P9PDD0.1
#=GS A0A5F4WA02_CALJA/869-1505   AC A0A5F4WA02.1
#=GS A0A5N5P893_PANHP/1-203      AC A0A5N5P893.1
#=GS A0A093HFN6_GAVST/163-802    AC A0A093HFN6.1
#=GS A0A226N281_CALSU/91-501     AC A0A226N281.1
#=GS A0A2P4T9Q9_BAMTH/3-286      AC A0A2P4T9Q9.1
#=GS A0A401PI61_SCYTO/514-756    AC A0A401PI61.1
#=GS A0A7R5KND0_9PASS/1022-1693  AC A0A7R5KND0.1
#=GS A0A6P7NFH6_BETSP/507-1178   AC A0A6P7NFH6.1
#=GS A0A4D9E306_9SAUR/980-1645   AC A0A4D9E306.1
#=GS F1MD25_BOVIN/493-1132       AC F1MD25.3
#=GS F7HS00_MACMU/1037-1703      AC F7HS00.3
#=GS A0A6P6MEG2_CARAU/896-1123   AC A0A6P6MEG2.1
#=GS A0A2K6SJE5_SAIBB/879-1550   AC A0A2K6SJE5.1
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#=GS A0A3Q2DDG7_CYPVA/1-102      AC A0A3Q2DDG7.1
#=GS A0A1S3QM53_SALSA/4-88       AC A0A1S3QM53.1
#=GS A0A1S3KWY4_SALSA/43-276     AC A0A1S3KWY4.1
#=GS A0A5A9NYC6_9TELE/249-667    AC A0A5A9NYC6.1
#=GS A0A6P8RQN3_GEOSA/778-1445   AC A0A6P8RQN3.1
#=GS A0A4U5UAC1_COLLU/768-999    AC A0A4U5UAC1.1
#=GS A0A3Q3ECW4_9LABR/2-132      AC A0A3Q3ECW4.1
#=GS A0A643BXN5_BALPH/966-1164   AC A0A643BXN5.1
#=GS A0A6I9PV11_9TELE/443-859    AC A0A6I9PV11.1
#=GS I3JDR9_ORENI/1456-1873      AC I3JDR9.2
#=GS A0A6P8VU79_GYMAC/669-1091   AC A0A6P8VU79.1
#=GS A0A6P6RCY0_CARAU/813-1480   AC A0A6P6RCY0.1
#=GS G3GYX7_CRIGR/899-1543       AC G3GYX7.1
#=GS W5NJW3_LEPOC/1000-1675      AC W5NJW3.1
#=GS A0A3Q2X799_HAPBU/437-556    AC A0A3Q2X799.1
#=GS A0A6P9ATE1_PANGU/1046-1717  AC A0A6P9ATE1.1
#=GS A0A3P8SE96_AMPPE/22-137     AC A0A3P8SE96.1
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#=GS A0A663EFA1_AQUCH/999-1665   AC A0A663EFA1.1
#=GS A0A672NZ18_SINGR/4-66       AC A0A672NZ18.1
#=GS A0A6P6N151_CARAU/676-910    AC A0A6P6N151.1
#=GS F6ZQ93_HORSE/1039-1705      AC F6ZQ93.3
#=GS A0A093H752_STRCA/162-801    AC A0A093H752.1
#=GS E1BSL4_CHICK/1316-1963      AC E1BSL4.4
#=GS A0A672UE11_STRHB/378-1017   AC A0A672UE11.1
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#=GS A0A2K6MMM1_RHIBE/1001-1667  AC A0A2K6MMM1.1
#=GS A0A1U8CF61_MESAU/1222-1858  AC A0A1U8CF61.1
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#=GS A0A087XWV9_POEFO/1082-1322  AC A0A087XWV9.2
#=GS A0A670HNQ6_PODMU/1027-1666  AC A0A670HNQ6.1
#=GS A0A4U5U8F8_COLLU/768-999    AC A0A4U5U8F8.1
#=GS A0A672NZF7_SINGR/524-1185   AC A0A672NZF7.1
#=GS A0A3B1KEA2_ASTMX/1-110      AC A0A3B1KEA2.1
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#=GS A0A1S3KQR5_SALSA/901-1130   AC A0A1S3KQR5.1
#=GS A0A672PVC5_SINGR/792-1249   AC A0A672PVC5.1
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#=GS A0A6P3Q1A0_PTEVA/1029-1668  AC A0A6P3Q1A0.1
#=GS A0A7F8KAM7_DELLE/1069-1707  AC A0A7F8KAM7.1
#=GS A0A663MD20_ATHCN/543-1177   AC A0A663MD20.1
#=GS A0A6P6LM64_CARAU/547-1239   AC A0A6P6LM64.1
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#=GS A0A6P6E8R9_OCTDE/1206-1873  AC A0A6P6E8R9.1
#=GS A0A5F7ZJP0_MACMU/1037-1520  AC A0A5F7ZJP0.1
#=GS A0A4W2CNN7_BOBOX/932-1230   AC A0A4W2CNN7.1
#=GS A0A7N9CYI4_MACFA/784-1414   AC A0A7N9CYI4.1
#=GS A0A672NIV0_SINGR/38-76      AC A0A672NIV0.1
#=GS A0A671KRP0_9TELE/1-103      AC A0A671KRP0.1
#=GS A0A2I2ZY80_GORGO/936-1234   AC A0A2I2ZY80.1
#=GS A0A6I9JSL0_CHRAS/830-1469   AC A0A6I9JSL0.1
#=GS A0A3Q0HML1_ALLSI/1651-2299  AC A0A3Q0HML1.1
#=GS A0A2U9BZ11_SCOMX/420-1080   AC A0A2U9BZ11.1
#=GS A0A674GMT8_TAEGU/958-1630   AC A0A674GMT8.1
#=GS A0A2G8JEJ2_STIJA/208-363    AC A0A2G8JEJ2.1
#=GS A0A3Q3W734_MOLML/118-211    AC A0A3Q3W734.1
#=GS A0A672GFC9_SALFA/1-103      AC A0A672GFC9.1
#=GS A0A3Q4HLR9_NEOBR/377-1022   AC A0A3Q4HLR9.1
#=GS A0A096NP65_PAPAN/931-1569   AC A0A096NP65.2
#=GS A0A6J0D5T2_PERMB/1061-1698  AC A0A6J0D5T2.1
#=GS A0A093HQL0_STRCA/102-787    AC A0A093HQL0.1
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