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Database: Pfam
Entry: DUF3827
LinkDB: DUF3827
Original site: DUF3827 
#=GF ID   DUF3827
#=GF AC   PF12877.9
#=GF DE   Domain of unknown function (DUF3827)
#=GF AU   Zenonos ZA;0000-0002-8646-8127
#=GF AU   Mistry J;0000-0003-2479-5322
#=GF SE   jackhmmer:Q9HCM3
#=GF GA   20.20 20.20;
#=GF TC   20.20 20.20;
#=GF NC   20.10 20.10;
#=GF BM   hmmbuild --amino HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Domain_of_unknown_function
#=GF RN   [1]
#=GF RM   18974108
#=GF RT   Tandem duplication producing a novel oncogenic BRAF fusion gene
#=GF RT   defines the majority of pilocytic astrocytomas.
#=GF RA   Jones DT, Kocialkowski S, Liu L, Pearson DM, Backlund LM,
#=GF RA   Ichimura K, Collins VP;
#=GF RL   Cancer Res. 2008;68:8673-8677.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   19363522
#=GF RT   Oncogenic RAF1 rearrangement and a novel BRAF mutation as
#=GF RT   alternatives to KIAA1549:BRAF fusion in activating the MAPK
#=GF RT   pathway in pilocytic astrocytoma.
#=GF RA   Jones DT, Kocialkowski S, Liu L, Pearson DM, Ichimura K, Collins
#=GF RA   VP;
#=GF RL   Oncogene. 2009;28:2119-2123.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   19937730
#=GF RT   MAPK pathway activation and the origins of pediatric low-grade
#=GF RT   astrocytomas.
#=GF RA   Tatevossian RG, Lawson AR, Forshew T, Hindley GF, Ellison DW,
#=GF RA   Sheer D;
#=GF RL   J Cell Physiol. 2010;222:509-514.
#=GF DR   INTERPRO; IPR024606;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family contains the Swiss:Q9HCM3 protein which has been
#=GF CC   found to be fused fused to BRAF gene in many cases of pilocytic
#=GF CC   astrocytomas. The fusion is due mainly to a tandem duplication
#=GF CC   of 2 Mb at 7q34 [1-2].  Although nothing is known about the
#=GF CC   function of Swiss:Q9HCM3 protein, the BRAF protein is a well
#=GF CC   characterised oncoprotein. It is a serine/threonine protein
#=GF CC   kinase which is implicated in MAP/ERK signalling, a critical
#=GF CC   pathway for the regulation of cell division, differentiation and
#=GF CC   secretion [1-3].
#=GF SQ   860
#=GS A0A446NSS4_TRITD/8-72       AC A0A446NSS4.1
#=GS A0A6A1QFP8_BALPH/1-69       AC A0A6A1QFP8.1
#=GS A0A226PW61_COLVI/1265-1348  AC A0A226PW61.1
#=GS A0A3Q3KVG1_9LABR/830-1530   AC A0A3Q3KVG1.1
#=GS A0A5A9P342_9TELE/1134-1510  AC A0A5A9P342.1
#=GS A0A094K8E1_ANTCR/30-338     AC A0A094K8E1.1
#=GS A0A3Q2WV79_HAPBU/553-1230   AC A0A3Q2WV79.1
#=GS A0A3Q0DW27_CARSF/1006-1423  AC A0A3Q0DW27.1
#=GS A0A3Q3NFJ0_9TELE/449-1120   AC A0A3Q3NFJ0.1
#=GS A0A341CYS2_NEOAA/991-1657   AC A0A341CYS2.1
#=GS A0A498NZG0_LABRO/175-243    AC A0A498NZG0.1
#=GS R7USC2_CAPTE/1228-1302      AC R7USC2.1
#=GS M7B6T0_CHEMY/750-1424       AC M7B6T0.1
#=GS A0A5F5Y2K9_FELCA/903-1542   AC A0A5F5Y2K9.1
#=GS A0A553Q0E5_9TELE/6-228      AC A0A553Q0E5.1
#=GS A0A2I4BW72_9TELE/783-1478   AC A0A2I4BW72.1
#=GS A0A3Q3W734_MOLML/3-62       AC A0A3Q3W734.1
#=GS A0A2U3X3H6_ODORO/965-1633   AC A0A2U3X3H6.1
#=GS A0A060Y8Q3_ONCMY/1120-1180  AC A0A060Y8Q3.1
#=GS A0A1A6FZQ3_NEOLE/1-211      AC A0A1A6FZQ3.1
#=GS A0A267FW31_9PLAT/1-135      AC A0A267FW31.1
#=GS A0A1D5R4P3_MACMU/903-1541   AC A0A1D5R4P3.2
#=GS A0A5N5NY19_PANHP/860-995    AC A0A5N5NY19.1
#=GS A0A2P4TA26_BAMTH/255-556    AC A0A2P4TA26.1
#=GS A0A5N5P6G4_PANHP/452-651    AC A0A5N5P6G4.1
#=GS A0A0P7VNS4_SCLFO/670-1357   AC A0A0P7VNS4.1
#=GS A0A2K6SJE1_SAIBB/879-1550   AC A0A2K6SJE1.1
#=GS A0A3L8SCU3_CHLGU/507-694    AC A0A3L8SCU3.1
#=GS A0A3Q7XMP0_URSAR/1147-1786  AC A0A3Q7XMP0.1
#=GS A0A4W4GES1_ELEEL/1-119      AC A0A4W4GES1.1
#=GS A0A673A0A5_9TELE/2-109      AC A0A673A0A5.1
#=GS A0A444U975_ACIRT/1292-1865  AC A0A444U975.1
#=GS A0A5F5XCS0_FELCA/903-1542   AC A0A5F5XCS0.1
#=GS A0A485NPJ0_LYNPA/948-1614   AC A0A485NPJ0.1
#=GS A0A315WBG2_GAMAF/1295-1629  AC A0A315WBG2.1
#=GS A0A6A5F1W0_PERFL/1-466      AC A0A6A5F1W0.1
#=GS A0A3Q3CH27_HAPBU/691-1114   AC A0A3Q3CH27.1
#=GS A0A3P9QBG8_POERE/64-728     AC A0A3P9QBG8.1
#=GS A0A337SG04_FELCA/26-155     AC A0A337SG04.1
#=GS A0A096NR39_PAPAN/1008-1674  AC A0A096NR39.2
#=GS F6ZGR6_MOUSE/383-1020       AC F6ZGR6.2
#=GS A0A3B5R2V1_XIPMA/1-111      AC A0A3B5R2V1.1
#=GS G1RUR0_NOMLE/967-1633       AC G1RUR0.2
#=GS A0A2I0UNU5_LIMLA/3141-3396  AC A0A2I0UNU5.1
#=GS A0A3Q3E140_9LABR/830-1525   AC A0A3Q3E140.1
#=GS A0A5N4DP74_CAMDR/355-753    AC A0A5N4DP74.1
#=GS A0A3P8SGN8_AMPPE/62-462     AC A0A3P8SGN8.1
#=GS G1PB21_MYOLU/985-1649       AC G1PB21.1
#=GS A0A4W5JY22_9TELE/1-254      AC A0A4W5JY22.1
#=GS A0A667YXC8_9TELE/848-1240   AC A0A667YXC8.1
#=GS Q1LV93_DANRE/1-117          AC Q1LV93.1
#=GS A0A1A6GID7_NEOLE/1-63       AC A0A1A6GID7.1
#=GS A0A2K5JX17_COLAP/987-1653   AC A0A2K5JX17.1
#=GS H3CCS0_TETNG/1-590          AC H3CCS0.1
#=GS A0A091KG00_EGRGA/164-803    AC A0A091KG00.1
#=GS A0A3P8W9I6_CYNSE/1362-1767  AC A0A3P8W9I6.1
#=GS A0A0P7VA89_SCLFO/175-789    AC A0A0P7VA89.1
#=GS A0A553NGT6_9TELE/512-1163   AC A0A553NGT6.1
#=GS A0A667Z5M5_9TELE/801-1479   AC A0A667Z5M5.1
#=GS A0A315WBG2_GAMAF/824-1143   AC A0A315WBG2.1
#=GS A0A4W5NZB3_9TELE/2-48       AC A0A4W5NZB3.1
#=GS A0A493SUX4_ANAPP/1030-1697  AC A0A493SUX4.1
#=GS A0A452E3E1_CAPHI/493-1132   AC A0A452E3E1.1
#=GS F1MY14_BOVIN/958-1623       AC F1MY14.3
#=GS A0A4Z2I7Y2_9TELE/97-212     AC A0A4Z2I7Y2.1
#=GS A0A2K5WIK5_MACFA/935-1573   AC A0A2K5WIK5.1
#=GS A0A3Q3N1E8_9TELE/61-176     AC A0A3Q3N1E8.1
#=GS A0A5A9P342_9TELE/738-1137   AC A0A5A9P342.1
#=GS A0A093CSJ3_TAUER/163-802    AC A0A093CSJ3.1
#=GS A0A0L8G8G3_OCTBM/1-146      AC A0A0L8G8G3.1
#=GS A0A1S3ML36_SALSA/884-1113   AC A0A1S3ML36.1
#=GS R0JQT1_ANAPL/249-757        AC R0JQT1.1
#=GS A0A6Q2ZF52_ESOLU/870-1573   AC A0A6Q2ZF52.1
#=GS I3JDR9_ORENI/1866-2110      AC I3JDR9.2
#=GS A0A6A5FFH8_PERFL/723-1420   AC A0A6A5FFH8.1
#=GS F1SGR4_PIG/501-1140         AC F1SGR4.3
#=GS A0A5N5P893_PANHP/193-428    AC A0A5N5P893.1
#=GS G1MHX2_AILME/952-1622       AC G1MHX2.1
#=GS A0A096LSD7_POEFO/414-1092   AC A0A096LSD7.1
#=GS W5MA00_LEPOC/878-1106       AC W5MA00.1
#=GS A0A3Q2EKV9_CYPVA/9-118      AC A0A3Q2EKV9.1
#=GS A0A4W6E1T8_LATCA/839-1534   AC A0A4W6E1T8.1
#=GS A0A3Q3FNN3_KRYMA/425-544    AC A0A3Q3FNN3.1
#=GS A0A226NPJ6_CALSU/974-1290   AC A0A226NPJ6.1
#=GS D3Z9D0_RAT/953-1618         AC D3Z9D0.3
#=GS A0A1S3WE45_ERIEU/1137-1802  AC A0A1S3WE45.1
#=GS A0A5G2R4D3_PIG/1019-1684    AC A0A5G2R4D3.1
#=GS A0A5A9NYC6_9TELE/658-891    AC A0A5A9NYC6.1
#=GS W5NJW6_LEPOC/568-1242       AC W5NJW6.1
#=GS A0A1V4JP29_PATFA/989-1628   AC A0A1V4JP29.1
#=GS A0A2K6DGT9_MACNE/931-1569   AC A0A2K6DGT9.1
#=GS A0A5A9PFP1_9TELE/557-1244   AC A0A5A9PFP1.1
#=GS F6TUW7_MONDO/1055-1672      AC F6TUW7.2
#=GS A0A2K5QMH3_CEBCA/1035-1701  AC A0A2K5QMH3.1
#=GS A0A667YXC5_9TELE/853-1527   AC A0A667YXC5.1
#=GS A0A553R8F6_9TELE/398-489    AC A0A553R8F6.1
#=GS W5K6H7_ASTMX/448-579        AC W5K6H7.2
#=GS M3ZTY8_XIPMA/825-1512       AC M3ZTY8.2
#=GS A0A2K5LAJ1_CERAT/1037-1703  AC A0A2K5LAJ1.1
#=GS A0A3Q7UMM9_VULVU/1032-1670  AC A0A3Q7UMM9.1
#=GS G3U9R8_LOXAF/1-509          AC G3U9R8.1
#=GS A0A401S9V8_CHIPU/533-1169   AC A0A401S9V8.1
#=GS A0A2I3GUP5_NOMLE/928-1210   AC A0A2I3GUP5.1
#=GS A0A6I8RKK9_XENTR/1507-1721  AC A0A6I8RKK9.1
#=GS A0A673UVP4_SURSU/925-1059   AC A0A673UVP4.1
#=GS A0A1S3KQ21_SALSA/910-1612   AC A0A1S3KQ21.1
#=GS D3YZ21_MOUSE/498-1134       AC D3YZ21.1
#=GS A0A4W5KD86_9TELE/3-109      AC A0A4W5KD86.1
#=GS A0A4W3HKN7_CALMI/637-1294   AC A0A4W3HKN7.1
#=GS G5B551_HETGA/1469-1655      AC G5B551.1
#=GS A0A3P4RUP2_GULGU/1-254      AC A0A3P4RUP2.1
#=GS A0A094KTG3_ANTCR/1-346      AC A0A094KTG3.1
#=GS V8PF93_OPHHA/977-1113       AC V8PF93.1
#=GS W5Q8F7_SHEEP/927-1566       AC W5Q8F7.1
#=GS M3XXK0_MUSPF/962-1628       AC M3XXK0.1
#=GS A0A3S2PX09_ORYJA/595-1251   AC A0A3S2PX09.1
#=GS A0A3N0XQQ3_ANAGA/449-572    AC A0A3N0XQQ3.1
#=GS A0A4W3JLP1_CALMI/344-988    AC A0A4W3JLP1.1
#=GS A0A667ZU35_9TELE/1-106      AC A0A667ZU35.1
#=GS A0A673UVP4_SURSU/1055-1513  AC A0A673UVP4.1
#=GS A0A060YHH5_ONCMY/2-143      AC A0A060YHH5.1
#=GS A0A672UGJ8_STRHB/1368-2007  AC A0A672UGJ8.1
#=GS A0A087Y5Z9_POEFO/557-1234   AC A0A087Y5Z9.2
#=GS A0A4U5VQD1_COLLU/469-1070   AC A0A4U5VQD1.1
#=GS H0VBD7_CAVPO/964-1630       AC H0VBD7.2
#=GS A0A3Q1FMU2_9TELE/1-90       AC A0A3Q1FMU2.1
#=GS A0A3Q1E963_9TELE/2-107      AC A0A3Q1E963.1
#=GS S7PX81_MYOBR/1020-1502      AC S7PX81.1
#=GS A0A2K5XW12_MANLE/940-1238   AC A0A2K5XW12.1
#=GS A0A3Q1C816_AMPOC/817-1517   AC A0A3Q1C816.1
#=GS A0A267DDP3_9PLAT/63-238     AC A0A267DDP3.1
#=GS A0A553Q0E3_9TELE/438-845    AC A0A553Q0E3.1
#=GS A0A5E4BXW3_MARMO/946-1017   AC A0A5E4BXW3.1
#=GS A0A2I0UNU5_LIMLA/3004-3156  AC A0A2I0UNU5.1
#=GS H3CQT2_TETNG/1-455          AC H3CQT2.1
#=GS A0A5N5NY19_PANHP/454-873    AC A0A5N5NY19.1
#=GS A0A670J5U4_PODMU/1075-1746  AC A0A670J5U4.1
#=GS A0A315V281_GAMAF/552-990    AC A0A315V281.1
#=GS A0A099ZH70_TINGU/102-776    AC A0A099ZH70.1
#=GS A0A673Z7V7_SALTR/924-1621   AC A0A673Z7V7.1
#=GS G1MR37_MELGA/249-649        AC G1MR37.1
#=GS A0A1U7RV53_ALLSI/1001-1669  AC A0A1U7RV53.1
#=GS A0A5N4DZZ0_CAMDR/950-1646   AC A0A5N4DZZ0.1
#=GS Q1LY95_DANRE/65-748         AC Q1LY95.1
#=GS G1PRB5_MYOLU/925-1563       AC G1PRB5.1
#=GS W5MA00_LEPOC/482-886        AC W5MA00.1
#=GS A0A2I4APH0_9TELE/877-1106   AC A0A2I4APH0.1
#=GS A0A673SYY6_SURSU/1105-1633  AC A0A673SYY6.1
#=GS A0A2K5XW07_MANLE/934-1467   AC A0A2K5XW07.1
#=GS E2B6T4_HARSA/352-498        AC E2B6T4.1
#=GS A0A668A9Q2_9TELE/1-106      AC A0A668A9Q2.1
#=GS A0A1S3KY59_SALSA/44-276     AC A0A1S3KY59.1
#=GS A0A060WBC3_ONCMY/886-1317   AC A0A060WBC3.1
#=GS A0A091H6Q6_BUCRH/163-563    AC A0A091H6Q6.1
#=GS A0A093SP10_PHACA/24-327     AC A0A093SP10.1
#=GS A0A6A5FQQ4_PERFL/456-873    AC A0A6A5FQQ4.1
#=GS G1LL85_AILME/927-1566       AC G1LL85.1
#=GS Q1LV92_DANRE/465-573        AC Q1LV92.1
#=GS A0A674E8I2_SALTR/68-474     AC A0A674E8I2.1
#=GS A0A673WBW5_SALTR/12-122     AC A0A673WBW5.1
#=GS M4A4Y4_XIPMA/455-577        AC M4A4Y4.2
#=GS A0A673ZA39_SALTR/1-108      AC A0A673ZA39.1
#=GS A0A3P8UUR5_CYNSE/13-105     AC A0A3P8UUR5.1
#=GS A0A5N5P893_PANHP/1-203      AC A0A5N5P893.1
#=GS A0A093ER18_TYTAL/163-802    AC A0A093ER18.1
#=GS A0A093HFN6_GAVST/163-802    AC A0A093HFN6.1
#=GS A0A226N281_CALSU/91-501     AC A0A226N281.1
#=GS A0A210QPV3_MIZYE/1097-1367  AC A0A210QPV3.1
#=GS A0A2P4T9Q9_BAMTH/3-286      AC A0A2P4T9Q9.1
#=GS A0A401PI61_SCYTO/514-756    AC A0A401PI61.1
#=GS A0A3B5QR40_XIPMA/1-119      AC A0A3B5QR40.1
#=GS A0A3P8Z7Y2_ESOLU/503-731    AC A0A3P8Z7Y2.2
#=GS W5K0E3_ASTMX/739-1424       AC W5K0E3.2
#=GS A0A4D9E306_9SAUR/980-1645   AC A0A4D9E306.1
#=GS A0A2Y9FYL5_TRIMA/1015-1566  AC A0A2Y9FYL5.1
#=GS F1MD25_BOVIN/493-1132       AC F1MD25.3
#=GS T1KIY6_TETUR/305-471        AC T1KIY6.1
#=GS F7HS00_MACMU/1037-1703      AC F7HS00.3
#=GS A0A4W2CS22_BOBOX/493-1132   AC A0A4W2CS22.1
#=GS A0A2K6SJE5_SAIBB/879-1550   AC A0A2K6SJE5.1
#=GS A0A1S3MZ26_SALSA/143-820    AC A0A1S3MZ26.1
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