GenomeNet

Database: Pfam
Entry: FANCF
LinkDB: FANCF
Original site: FANCF 
#=GF ID   FANCF
#=GF AC   PF11107.11
#=GF DE   Fanconi anemia group F protein (FANCF)
#=GF AU   Pollington J;0000-0002-8158-8998
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF SE   PRODOM
#=GF GA   24.00 24.00;
#=GF TC   24.40 24.00;
#=GF NC   23.30 23.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Repeat
#=GF CL   CL0020
#=GF RN   [1]
#=GF RM   16418574
#=GF RT   Promoter hypermethylation of FANCF plays an important role in
#=GF RT   the occurrence of ovarian cancer through disrupting Fanconi
#=GF RT   anemia-BRCA pathway. 
#=GF RA   Wang Z, Li M, Lu S, Zhang Y, Wang H; 
#=GF RL   Cancer Biol Ther. 2006;5:256-260.
#=GF DR   INTERPRO; IPR035428;
#=GF DR   SO; 0001068; polypeptide_repeat;
#=GF CC   FANCF regulates its own expression by methylation at both mRNA
#=GF CC   and protein levels. Methylation-induced inactivation of FANCF
#=GF CC   has an important role on the occurrence of ovarian cancers by
#=GF CC   disrupting the FA-BRCA pathway [1].
#=GF SQ   508
#=GS K7U4R6_MAIZE/10-225       AC K7U4R6.1
#=GS A0A287V4X1_HORVV/198-316  AC A0A287V4X1.1
#=GS A0A087GP69_ARAAL/10-345   AC A0A087GP69.1
#=GS A0A7M7HPB8_STRPU/1-273    AC A0A7M7HPB8.1
#=GS A0A200PVU1_9MAGN/10-235   AC A0A200PVU1.1
#=GS A0A401S4X3_CHIPU/1-352    AC A0A401S4X3.1
#=GS A0A4W6D8R4_LATCA/70-278   AC A0A4W6D8R4.1
#=GS A0A665V643_ECHNA/1-342    AC A0A665V643.1
#=GS A0A2I4BMT0_9TELE/37-371   AC A0A2I4BMT0.1
#=GS A0A0E0K6T0_ORYPU/10-224   AC A0A0E0K6T0.1
#=GS M0ZWX5_SOLTU/11-79        AC M0ZWX5.1
#=GS M3Z6V9_MUSPF/1-354        AC M3Z6V9.1
#=GS A0A0E0NMQ5_ORYRU/10-225   AC A0A0E0NMQ5.1
#=GS A0A6J1A2E0_9ROSI/21-366   AC A0A6J1A2E0.1
#=GS A0A2T7FDQ0_9POAL/10-224   AC A0A2T7FDQ0.1
#=GS A0A671UVX3_SPAAU/1-339    AC A0A671UVX3.1
#=GS B3RWE4_TRIAD/12-372       AC B3RWE4.1
#=GS A0A6P3FMA4_OCTDE/1-345    AC A0A6P3FMA4.1
#=GS A0A1X2IH04_9FUNG/6-157    AC A0A1X2IH04.1
#=GS A0A287V4T6_HORVV/4-221    AC A0A287V4T6.1
#=GS A0A5C7I2Y5_9ROSI/10-231   AC A0A5C7I2Y5.1
#=GS A0A2U3X5X3_ODORO/1-354    AC A0A2U3X5X3.1
#=GS A0A068U5N4_COFCA/10-204   AC A0A068U5N4.1
#=GS A0A1V4JP92_PATFA/1-353    AC A0A1V4JP92.1
#=GS A0A226MIE4_CALSU/1-334    AC A0A226MIE4.1
#=GS A0A6I9S2E8_ELAGV/10-377   AC A0A6I9S2E8.1
#=GS A0A4U1F714_MONMO/1-355    AC A0A4U1F714.1
#=GS A0A0E0NMQ9_ORYRU/10-225   AC A0A0E0NMQ9.1
#=GS A0A0E0K6S9_ORYPU/10-224   AC A0A0E0K6S9.1
#=GS T1LCL2_TRIUA/1-196        AC T1LCL2.1
#=GS A0A3Q3FP58_9LABR/1-342    AC A0A3Q3FP58.1
#=GS A0A446WRY2_TRITD/6-211    AC A0A446WRY2.1
#=GS A0A673UDB6_SURSU/1-355    AC A0A673UDB6.1
#=GS A0A6P8TR10_GYMAC/1-337    AC A0A6P8TR10.1
#=GS A0A446WRX9_TRITD/1-184    AC A0A446WRX9.1
#=GS A0A3P4LVX8_GULGU/1-354    AC A0A3P4LVX8.1
#=GS M7B7H8_CHEMY/1-84         AC M7B7H8.1
#=GS A0A6P8S4C7_GEOSA/1-329    AC A0A6P8S4C7.1
#=GS A0A484GZ46_SOUCH/1-355    AC A0A484GZ46.1
#=GS A0A315W6E9_GAMAF/1-331    AC A0A315W6E9.1
#=GS A0A1U7TI24_CARSF/1-356    AC A0A1U7TI24.1
#=GS A0A3B6NXI6_WHEAT/224-344  AC A0A3B6NXI6.1
#=GS A0A1S3J7N5_LINUN/3-206    AC A0A1S3J7N5.1
#=GS A0A3Q3BHT1_KRYMA/1-333    AC A0A3Q3BHT1.1
#=GS A0A168NCN7_ABSGL/5-154    AC A0A168NCN7.1
#=GS A0A446WRZ8_TRITD/213-334  AC A0A446WRZ8.1
#=GS A0A5D6XRJ4_9STRA/7-322    AC A0A5D6XRJ4.1
#=GS A0A453Q1C7_AEGTS/187-307  AC A0A453Q1C7.1
#=GS A0A2R6PEK4_ACTCC/10-231   AC A0A2R6PEK4.1
#=GS I3JNI3_ORENI/1-341        AC I3JNI3.2
#=GS A0A0D9VMJ7_9ORYZ/1-215    AC A0A0D9VMJ7.1
#=GS A0A369S578_9METZ/12-372   AC A0A369S578.1
#=GS A0A453Q102_AEGTS/17-234   AC A0A453Q102.1
#=GS A0A1U8P3E6_GOSHI/10-354   AC A0A1U8P3E6.1
#=GS A0A5E4EM41_PRUDU/10-347   AC A0A5E4EM41.1
#=GS A0A397IA58_9GLOM/1-423    AC A0A397IA58.1
#=GS A0A0E0GES0_ORYNI/211-302  AC A0A0E0GES0.1
#=GS A0A6A4WY14_AMPAM/4-190    AC A0A6A4WY14.1
#=GS A0A078HEY3_BRANA/11-175   AC A0A078HEY3.1
#=GS A0A6P7SLQ6_OCTVU/1-361    AC A0A6P7SLQ6.1
#=GS A0A6P6ICV8_PUMCO/1-355    AC A0A6P6ICV8.1
#=GS A0A384BSB5_URSMA/1-352    AC A0A384BSB5.1
#=GS A0A2Y9D8I8_TRIMA/1-355    AC A0A2Y9D8I8.1
#=GS A0A540NH10_MALBA/10-292   AC A0A540NH10.1
#=GS A0A5E4EN28_PRUDU/10-159   AC A0A5E4EN28.1
#=GS A0A4W3J8S6_CALMI/1-114    AC A0A4W3J8S6.1
#=GS A0A2G2ZWF5_CAPAN/11-219   AC A0A2G2ZWF5.1
#=GS A0A6J2HKS2_9PASS/1-356    AC A0A6J2HKS2.1
#=GS A0A6J2AH84_ACIJB/1-355    AC A0A6J2AH84.1
#=GS A0A5J5BNY0_9ASTE/10-99    AC A0A5J5BNY0.1
#=GS A0A0E0K6S8_ORYPU/222-355  AC A0A0E0K6S8.1
#=GS A0A0E0CT10_9ORYZ/1-216    AC A0A0E0CT10.1
#=GS A0A1S3PDP3_SALSA/1-352    AC A0A1S3PDP3.1
#=GS A0A446VU03_TRITD/1-201    AC A0A446VU03.1
#=GS A0A2T7FDQ0_9POAL/220-358  AC A0A2T7FDQ0.1
#=GS A0A4S8JA04_MUSBA/11-245   AC A0A4S8JA04.1
#=GS A0A0E0NMQ7_ORYRU/221-358  AC A0A0E0NMQ7.1
#=GS A0A6P8HLS0_ACTTE/1-427    AC A0A6P8HLS0.1
#=GS A0A446WRY8_TRITD/1-122    AC A0A446WRY8.1
#=GS A0A6J0WNB7_ODOVR/1-354    AC A0A6J0WNB7.1
#=GS F1QDH6_DANRE/1-331        AC F1QDH6.1
#=GS A0A3Q0DC85_MESAU/1-69     AC A0A3Q0DC85.1
#=GS A0A287V4T5_HORVV/223-341  AC A0A287V4T5.1
#=GS A0A061DWF7_THECC/10-358   AC A0A061DWF7.1
#=GS A0A6P6A1B3_DURZI/10-373   AC A0A6P6A1B3.1
#=GS A0A453Q1A7_AEGTS/179-297  AC A0A453Q1A7.1
#=GS A0A0D9Z018_9ORYZ/1-216    AC A0A0D9Z018.1
#=GS W9QPA2_9ROSA/10-184       AC W9QPA2.1
#=GS A0A672PU95_SINGR/1-330    AC A0A672PU95.1
#=GS A0A0D9Z018_9ORYZ/211-349  AC A0A0D9Z018.1
#=GS A0A3P8V6K7_CYNSE/1-343    AC A0A3P8V6K7.1
#=GS A0A3Q2CEZ6_CYPVA/1-339    AC A0A3Q2CEZ6.1
#=GS A0A6J1A387_9ROSI/21-366   AC A0A6J1A387.1
#=GS A0A287V4U1_HORVV/223-341  AC A0A287V4U1.1
#=GS A0A4D9ETC9_9SAUR/1-342    AC A0A4D9ETC9.1
#=GS A0A287V4T2_HORVV/1-192    AC A0A287V4T2.1
#=GS A0A6J8CH65_MYTCO/3-335    AC A0A6J8CH65.1
#=GS A0A401P955_SCYTO/1-329    AC A0A401P955.1
#=GS A0A3Q0DC85_MESAU/64-241   AC A0A3Q0DC85.1
#=GS A0A2G9HB28_9LAMI/10-236   AC A0A2G9HB28.1
#=GS A0A4W4DVP0_ELEEL/1-342    AC A0A4W4DVP0.1
#=GS A0A0E0NMQ6_ORYRU/10-225   AC A0A0E0NMQ6.1
#=GS F7AJY4_MONDO/1-370        AC F7AJY4.2
#=GS A0A0E0NMR0_ORYRU/221-358  AC A0A0E0NMR0.1
#=GS A0A6G1ATG8_CROCR/1-355    AC A0A6G1ATG8.1
#=GS A0A3Q7PMQ7_CALUR/1-354    AC A0A3Q7PMQ7.1
#=GS A0A1Q3C0L6_CEPFO/10-370   AC A0A1Q3C0L6.1
#=GS J3LIA7_ORYBR/218-356      AC J3LIA7.1
#=GS A0A453Q1I0_AEGTS/8-183    AC A0A453Q1I0.1
#=GS A0A0E0GES0_ORYNI/1-214    AC A0A0E0GES0.1
#=GS U5DEX0_AMBTC/10-381       AC U5DEX0.1
#=GS A0A397TFL2_9GLOM/1-377    AC A0A397TFL2.1
#=GS A0A3B6NXI6_WHEAT/4-221    AC A0A3B6NXI6.1
#=GS A0A0E0NMQ6_ORYRU/221-358  AC A0A0E0NMQ6.1
#=GS A0A453Q102_AEGTS/237-357  AC A0A453Q102.1
#=GS A0A446WRY2_TRITD/213-334  AC A0A446WRY2.1
#=GS A0A287V587_HORVV/1-110    AC A0A287V587.1
#=GS A0A0E0NMR1_ORYRU/10-225   AC A0A0E0NMR1.1
#=GS A0A2P4SYQ4_BAMTH/1-338    AC A0A2P4SYQ4.1
#=GS A0A453Q1C2_AEGTS/1-134    AC A0A453Q1C2.1
#=GS A0A5E4ELQ2_PRUDU/10-352   AC A0A5E4ELQ2.1
#=GS A0A0Q3TAX5_AMAAE/1-357    AC A0A0Q3TAX5.1
#=GS A0A3M6TRR3_POCDA/1-414    AC A0A3M6TRR3.1
#=GS A0A6P7Z6A8_9AMPH/1-329    AC A0A6P7Z6A8.1
#=GS A0A669QLP8_PHACC/1-333    AC A0A669QLP8.1
#=GS A0A6P5TVW4_PRUAV/10-165   AC A0A6P5TVW4.1
#=GS A0A1D6QB08_MAIZE/223-354  AC A0A1D6QB08.1
#=GS A0A218URX9_9PASE/237-474  AC A0A218URX9.1
#=GS A0A671LP19_9TELE/1-319    AC A0A671LP19.1
#=GS A0A2H5NKR4_CITUN/10-357   AC A0A2H5NKR4.1
#=GS A0A060ZAM3_ONCMY/1-350    AC A0A060ZAM3.1
#=GS K3YSD5_SETIT/10-226       AC K3YSD5.1
#=GS A0A061DPJ4_THECC/10-358   AC A0A061DPJ4.1
#=GS A0A674I060_TERCA/1-339    AC A0A674I060.1
#=GS A0A671F4G4_RHIFE/1-355    AC A0A671F4G4.1
#=GS A0A5B6UNA1_9ROSI/10-366   AC A0A5B6UNA1.1
#=GS F6ZAZ7_HORSE/1-355        AC F6ZAZ7.2
#=GS A0A287V4S7_HORVV/1-180    AC A0A287V4S7.1
#=GS A0A2K6NAH9_RHIRO/1-353    AC A0A2K6NAH9.1
#=GS A0A397XUS3_BRACM/11-177   AC A0A397XUS3.1
#=GS V4T9K4_CITCL/10-357       AC V4T9K4.1
#=GS A0A0E0NMQ9_ORYRU/221-358  AC A0A0E0NMQ9.1
#=GS A0A0E0K6T1_ORYPU/10-224   AC A0A0E0K6T1.1
#=GS A0A3Q1CP17_AMPOC/1-339    AC A0A3Q1CP17.1
#=GS A0A1S3W2E8_ERIEU/1-121    AC A0A1S3W2E8.1
#=GS A0A2Y9NZP3_DELLE/1-355    AC A0A2Y9NZP3.1
#=GS A0A4W6D8R4_LATCA/1-56     AC A0A4W6D8R4.1
#=GS A0A286ZKC7_PIG/18-372     AC A0A286ZKC7.2
#=GS A0A446VTZ2_TRITD/219-343  AC A0A446VTZ2.1
#=GS A0A2R8ZLM2_PANPA/1-354    AC A0A2R8ZLM2.1
#=GS A0A287V4S6_HORVV/4-221    AC A0A287V4S6.1
#=GS A0A287V4S6_HORVV/223-341  AC A0A287V4S6.1
#=GS FANCF_MOUSE/1-336         AC E9Q5Z5.1
#=GS A0A3B6NWH0_WHEAT/4-221    AC A0A3B6NWH0.1
#=GS A0A2K1XYA0_POPTR/10-232   AC A0A2K1XYA0.1
#=GS A0A4U5UFS4_COLLU/22-312   AC A0A4U5UFS4.1
#=GS A0A6F9AH08_9TELE/16-91    AC A0A6F9AH08.1
#=GS A0A4W2BRY0_BOBOX/1-355    AC A0A4W2BRY0.1
#=GS A0A6P3IQX4_BISBI/1-355    AC A0A6P3IQX4.1
#=GS A0A0E0NMQ7_ORYRU/10-225   AC A0A0E0NMQ7.1
#=GS A0A6I9THD9_SESIN/10-163   AC A0A6I9THD9.1
#=GS A0A3B6QKR2_WHEAT/224-344  AC A0A3B6QKR2.1
#=GS A0A6P5TWA8_PRUAV/10-347   AC A0A6P5TWA8.1
#=GS A0A7N4NUW8_SARHA/1-365    AC A0A7N4NUW8.1
#=GS H3A681_LATCH/1-334        AC H3A681.1
#=GS A0A340XER8_LIPVE/1-355    AC A0A340XER8.1
#=GS A0A1S3W2E8_ERIEU/117-295  AC A0A1S3W2E8.1
#=GS A0A2K1XYA9_POPTR/10-232   AC A0A2K1XYA9.1
#=GS A0A446VTY5_TRITD/4-226    AC A0A446VTY5.1
#=GS A0A1U8P678_GOSHI/10-354   AC A0A1U8P678.1
#=GS A0A2U1Q6D4_ARTAN/11-344   AC A0A2U1Q6D4.1
#=GS A0A453Q0Y9_AEGTS/144-264  AC A0A453Q0Y9.1
#=GS A0A0Q3MAH3_BRADI/10-226   AC A0A0Q3MAH3.1
#=GS A7RVR8_NEMVE/1-411        AC A7RVR8.1
#=GS A0A1U8AGN9_NELNU/10-260   AC A0A1U8AGN9.1
#=GS A0A3L8S2M5_CHLGU/1-341    AC A0A3L8S2M5.1
#=GS A0A6P3YAZ4_DINQU/25-315   AC A0A6P3YAZ4.1
#=GS A0A1D6QB05_MAIZE/222-355  AC A0A1D6QB05.1
#=GS A0A4W3J8S6_CALMI/136-264  AC A0A4W3J8S6.1
#=GS FANCF_HUMAN/1-354         AC Q9NPI8.1
#=GS FANCF_HUMAN/1-354         DR PDB; 2IQC A; 159-354;
#=GS A0A1U8ADB1_NELNU/10-259   AC A0A1U8ADB1.1
#=GS A0A314ZGP5_PRUYE/10-251   AC A0A314ZGP5.1
#=GS A0A6I9T7B6_SESIN/10-162   AC A0A6I9T7B6.1
#=GS A0A446VU08_TRITD/219-343  AC A0A446VU08.1
#=GS A0A0E0NMQ8_ORYRU/10-225   AC A0A0E0NMQ8.1
#=GS A0A452HCH1_9SAUR/1-342    AC A0A452HCH1.1
#=GS A0A3B6PUT9_WHEAT/213-334  AC A0A3B6PUT9.1
#=GS A0A2U3V698_TURTR/1-355    AC A0A2U3V698.1
#=GS A0A6P6A0I9_DURZI/10-360   AC A0A6P6A0I9.1
#=GS A0A091VX24_NIPNI/123-338  AC A0A091VX24.1
#=GS A0A287V4R6_HORVV/11-167   AC A0A287V4R6.1
#=GS A0A6P6UV11_COFAR/10-347   AC A0A6P6UV11.1
#=GS A0A1J6JVN7_NICAT/11-239   AC A0A1J6JVN7.1
#=GS A0A0E0NMR1_ORYRU/221-358  AC A0A0E0NMR1.1
#=GS Q0DWI0_ORYSJ/10-225       AC Q0DWI0.1
#=GS A0A6J0WKD5_ODOVR/1-360    AC A0A6J0WKD5.1
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