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Database: Pfam
Entry: FmiP_Thoc5
LinkDB: FmiP_Thoc5
Original site: FmiP_Thoc5 
#=GF ID   FmiP_Thoc5
#=GF AC   PF09766.12
#=GF DE   Fms-interacting protein/Thoc5
#=GF PI   FimP;
#=GF AU   KOGs;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF AU   El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE   KOGs (KOG2216)
#=GF GA   29.40 29.40;
#=GF TC   30.30 29.90;
#=GF NC   28.70 29.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   20051105
#=GF RT   THOC5/FMIP, an mRNA export TREX complex protein, is essential
#=GF RT   for hematopoietic primitive cell survival in vivo.
#=GF RA   Mancini A, Niemann-Seyde SC, Pankow R, El Bounkari O,
#=GF RA   Klebba-Farber S, Koch A, Jaworska E, Spooncer E, Gruber AD,
#=GF RA   Whetton AD, Tamura T;
#=GF RL   BMC Biol. 2010;8:1.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   21937706
#=GF RT   An ataxia-telangiectasia-mutated (ATM) kinase mediated response
#=GF RT   to DNA damage down-regulates the mRNA-binding potential of
#=GF RT   THOC5.
#=GF RA   Ramachandran S, Tran DD, Klebba-Faerber S, Kardinal C, Whetton
#=GF RA   AD, Tamura T;
#=GF RL   RNA. 2011;17:1957-1966.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   10597251
#=GF RT   FMIP, a novel Fms-interacting protein, affects
#=GF RT   granulocyte/macrophage differentiation. 
#=GF RA   Tamura T, Mancini A, Joos H, Koch A, Hakim C, Dumanski J,
#=GF RA   Weidner KM, Niemann H; 
#=GF RL   Oncogene. 1999;18:6488-6495.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019163;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This entry carries part of the crucial 144 N-terminal residues
#=GF CC   of the FmiP (Fms interacting protein). A member of the THO
#=GF CC   (suppressors of the transcriptional defects of hpr1delta by
#=GF CC   overexpression) complex which is a subcomplex of the
#=GF CC   transcription/export (TREX) complex [1]. It is essential for the
#=GF CC   binding of the protein to the cytoplasmic domain of activated
#=GF CC   Fms-molecules in M-CSF induced haematopoietic differentiation of
#=GF CC   macrophages. Fmip is also known as THOC5 (THO complex subunit 5)
#=GF CC   a 683 amino acids long protein which contains a nuclear
#=GF CC   localisation sequence (NLS), a leucine zipper and a PEST like
#=GF CC   sequence (aa. 303-319) that carries three ataxia-telangiectasia
#=GF CC   mutated (ATM) kinase specific phosphorylation sites. The
#=GF CC   C-terminus contains a THOC1 binding site [2]. The level of
#=GF CC   FMIP/Thoc5 expression might form a threshold that determines
#=GF CC   whether cells differentiate into macrophages or into
#=GF CC   granulocytes [3].
#=GF SQ   1946
#=GS A0A5N6ZCK4_9EURO/59-232     AC A0A5N6ZCK4.1
#=GS A0A4E0RY77_FASHE/68-351     AC A0A4E0RY77.1
#=GS A0A6P3GBR1_BISBI/97-452     AC A0A6P3GBR1.1
#=GS J3P7X5_GAET3/62-224         AC J3P7X5.1
#=GS A0A1Z5JZY9_FISSO/66-274     AC A0A1Z5JZY9.1
#=GS A0A3B1IJK0_ASTMX/49-405     AC A0A3B1IJK0.1
#=GS A7EH90_SCLS1/63-210         AC A7EH90.1
#=GS A0A428P011_9HYPO/63-198     AC A0A428P011.1
#=GS A0A152A540_9MYCE/120-344    AC A0A152A540.1
#=GS A0A507R150_MONPU/65-213     AC A0A507R150.1
#=GS A0A674CA67_SALTR/107-221    AC A0A674CA67.1
#=GS A0A165IF11_XYLHT/66-214     AC A0A165IF11.1
#=GS A0A5N4C8W5_CAMDR/97-452     AC A0A5N4C8W5.1
#=GS A0A4W6GB57_LATCA/98-454     AC A0A4W6GB57.1
#=GS A0A2B7WZU6_9EURO/63-206     AC A0A2B7WZU6.1
#=GS A0A433PKV2_9FUNG/60-485     AC A0A433PKV2.1
#=GS A0A6A1QGK3_BALPH/91-446     AC A0A6A1QGK3.1
#=GS A0A3S3PKW0_9ACAR/75-426     AC A0A3S3PKW0.1
#=GS A0A2V1CS22_9HELO/63-209     AC A0A2V1CS22.1
#=GS A0A1X2IQ99_9FUNG/55-232     AC A0A1X2IQ99.1
#=GS A0A2J6QFM6_9HELO/63-210     AC A0A2J6QFM6.1
#=GS A0A6D2ID52_9BRAS/60-402     AC A0A6D2ID52.1
#=GS A0A672IC65_SALFA/98-454     AC A0A672IC65.1
#=GS A0A183ALI1_9TREM/8-196      AC A0A183ALI1.1
#=GS B7PKR7_IXOSC/22-379         AC B7PKR7.1
#=GS A0A3M9YQB9_9PEZI/65-211     AC A0A3M9YQB9.1
#=GS A0A2N5VVT8_9BASI/75-228     AC A0A2N5VVT8.1
#=GS A0A179ITZ9_CORDF/61-208     AC A0A179ITZ9.1
#=GS A0A6A4EFY2_9STRA/1-53       AC A0A6A4EFY2.1
#=GS C7YKQ5_FUSV7/63-210         AC C7YKQ5.1
#=GS A0A094HG78_9PEZI/59-205     AC A0A094HG78.1
#=GS A0A2Y9KXU2_ENHLU/97-452     AC A0A2Y9KXU2.1
#=GS A0A0G2FWN7_9PEZI/68-215     AC A0A0G2FWN7.1
#=GS A0A2R9BS59_PANPA/49-404     AC A0A2R9BS59.1
#=GS A0A6P6AVC6_DURZI/71-428     AC A0A6P6AVC6.1
#=GS A0A2K6UF74_SAIBB/66-277     AC A0A2K6UF74.1
#=GS A0A6P6ME89_CARAU/135-491    AC A0A6P6ME89.1
#=GS A0A453PQZ5_AEGTS/126-478    AC A0A453PQZ5.1
#=GS A0A673IF96_9TELE/102-471    AC A0A673IF96.1
#=GS A0A2K6P004_RHIRO/97-452     AC A0A2K6P004.1
#=GS A0A1J9QNK2_9EURO/63-211     AC A0A1J9QNK2.1
#=GS A0A4W5M2U6_9TELE/97-454     AC A0A4W5M2U6.1
#=GS A0A3D8R0X0_9HELO/59-206     AC A0A3D8R0X0.1
#=GS A0A5F9D259_RABIT/97-452     AC A0A5F9D259.1
#=GS A0A0D3BUS0_BRAOL/80-436     AC A0A0D3BUS0.1
#=GS Q4WN92_ASPFU/64-212         AC Q4WN92.1
#=GS A0A1Y1I8Q1_KLENI/54-398     AC A0A1Y1I8Q1.1
#=GS A0A0D9VLG3_9ORYZ/185-361    AC A0A0D9VLG3.1
#=GS A0A4Z2DAS6_SCHJA/77-455     AC A0A4Z2DAS6.1
#=GS A0A016VET6_9BILA/89-282     AC A0A016VET6.1
#=GS A0A0D2E5I1_9EURO/63-211     AC A0A0D2E5I1.1
#=GS A0A6H0Y082_9PEZI/64-219     AC A0A6H0Y082.1
#=GS A0A3Q3BXD0_HAPBU/98-454     AC A0A3Q3BXD0.1
#=GS A0A0D3CNT0_BRAOL/61-389     AC A0A0D3CNT0.1
#=GS A0A4X2KN29_VOMUR/97-452     AC A0A4X2KN29.1
#=GS A0A7E4RFE5_CIMLE/315-397    AC A0A7E4RFE5.1
#=GS A0A0C3GGP2_PILCF/43-199     AC A0A0C3GGP2.1
#=GS A0A1B9I0V4_9TREE/68-240     AC A0A1B9I0V4.1
#=GS A0A4U0W8F4_9BASI/54-218     AC A0A4U0W8F4.1
#=GS A0A0V0UIH8_9BILA/310-413    AC A0A0V0UIH8.1
#=GS A0A4Z2DBH4_SCHJA/21-399     AC A0A4Z2DBH4.1
#=GS A0A553I9A3_9PEZI/165-283    AC A0A553I9A3.1
#=GS A0A4W6GAQ0_LATCA/98-454     AC A0A4W6GAQ0.1
#=GS A0A2S4VK17_9BASI/1283-1445  AC A0A2S4VK17.1
#=GS A0A1Y2FEN2_9BASI/49-199     AC A0A1Y2FEN2.1
#=GS A0A3Q0F255_VIGRR/74-431     AC A0A3Q0F255.1
#=GS A0A6A2WIG4_HIBSY/196-254    AC A0A6A2WIG4.1
#=GS A0A0R0K3I8_SOYBN/74-431     AC A0A0R0K3I8.1
#=GS A0A674PFK1_TAKRU/98-454     AC A0A674PFK1.1
#=GS B4LP00_DROVI/42-390         AC B4LP00.1
#=GS A0A0A0KZS2_CUCSA/73-430     AC A0A0A0KZS2.1
#=GS A0A367LM82_9HYPO/59-206     AC A0A367LM82.1
#=GS A0A0V1HUI4_9BILA/618-992    AC A0A0V1HUI4.1
#=GS A0A091FXE4_CORBR/108-447    AC A0A091FXE4.1
#=GS A0A2K6URP8_SAIBB/61-414     AC A0A2K6URP8.1
#=GS I1K802_SOYBN/74-431         AC I1K802.1
#=GS A0A2A3E2Y0_APICC/105-463    AC A0A2A3E2Y0.1
#=GS A0A0C9YF05_9AGAR/43-204     AC A0A0C9YF05.1
#=GS THOC5_CHICK/96-376          AC Q5ZJK1.1
#=GS M7SFZ9_EUTLA/63-211         AC M7SFZ9.1
#=GS A0A135UMG5_9PEZI/71-218     AC A0A135UMG5.1
#=GS A0A2L2T2E8_9HYPO/63-210     AC A0A2L2T2E8.1
#=GS A0A168AAD4_9PEZI/71-218     AC A0A168AAD4.1
#=GS Q0CRH0_ASPTN/64-212         AC Q0CRH0.1
#=GS A0A2C5YUU2_9HYPO/63-210     AC A0A2C5YUU2.1
#=GS Q6CCB7_YARLI/41-186         AC Q6CCB7.1
#=GS A0A319BW84_9EURO/63-224     AC A0A319BW84.1
#=GS A0A232LYZ4_9EURO/61-196     AC A0A232LYZ4.1
#=GS A0A453PQR7_AEGTS/1-112      AC A0A453PQR7.1
#=GS A0A5N5NGK8_PANHP/114-470    AC A0A5N5NGK8.1
#=GS A0A5N6SNQ7_ASPPS/64-237     AC A0A5N6SNQ7.1
#=GS A0A1S4A6T8_TOBAC/1-174      AC A0A1S4A6T8.1
#=GS Q5KB52_CRYNJ/66-226         AC Q5KB52.2
#=GS A0A452REY2_URSAM/97-157     AC A0A452REY2.1
#=GS A0A6I9YYM8_9SAUR/1-113      AC A0A6I9YYM8.1
#=GS A0A0D8Y1X5_DICVI/12-295     AC A0A0D8Y1X5.1
#=GS U1HRB1_ENDPU/62-210         AC U1HRB1.1
#=GS A0A1S8VDD4_9FUNG/6-150      AC A0A1S8VDD4.1
#=GS A0A0G4GFJ9_VITBC/102-474    AC A0A0G4GFJ9.1
#=GS A0A5J5B4X4_9ASTE/66-277     AC A0A5J5B4X4.1
#=GS A0A0D1XHM9_9PEZI/56-218     AC A0A0D1XHM9.1
#=GS A0A3Q1HNH5_ANATE/107-463    AC A0A3Q1HNH5.1
#=GS A0A1Y1ZMI2_9FUNG/61-356     AC A0A1Y1ZMI2.1
#=GS A0A1D6HLA9_MAIZE/9-157      AC A0A1D6HLA9.1
#=GS A0A4Y7J383_PAPSO/66-423     AC A0A4Y7J383.1
#=GS A0A2K5U7V8_MACFA/97-161     AC A0A2K5U7V8.1
#=GS A0A0D2KDU5_9CHLO/42-412     AC A0A0D2KDU5.1
#=GS A0A397XIN0_BRACM/70-408     AC A0A397XIN0.1
#=GS A0A016VDR7_9BILA/2-61       AC A0A016VDR7.1
#=GS G2RE20_THETT/66-213         AC G2RE20.1
#=GS A0A0V1HW32_9BILA/674-1048   AC A0A0V1HW32.1
#=GS K1PM37_CRAGI/99-456         AC K1PM37.1
#=GS A0A2K6LJ84_RHIBE/97-446     AC A0A2K6LJ84.1
#=GS A0A674F442_SALTR/103-460    AC A0A674F442.1
#=GS A0A087YF39_POEFO/99-455     AC A0A087YF39.2
#=GS A0A1Y1WYV8_9FUNG/59-414     AC A0A1Y1WYV8.1
#=GS A0A1V1TBH4_9FUNG/63-211     AC A0A1V1TBH4.1
#=GS L8GF07_ACACA/1-313          AC L8GF07.1
#=GS A0A446WMZ6_TRITD/74-429     AC A0A446WMZ6.1
#=GS A0A369H0V8_9HYPO/59-206     AC A0A369H0V8.1
#=GS A0A183KV24_9TREM/1-91       AC A0A183KV24.1
#=GS A0A0E0K5M9_ORYPU/77-431     AC A0A0E0K5M9.1
#=GS A0A3M6YTK1_HORWE/73-235     AC A0A3M6YTK1.1
#=GS A0A409Y692_9AGAR/44-207     AC A0A409Y692.1
#=GS A0A0V1DDE1_TRIBR/107-489    AC A0A0V1DDE1.1
#=GS A0A670ZQV8_PSETE/49-404     AC A0A670ZQV8.1
#=GS A0A194UXR2_9PEZI/54-197     AC A0A194UXR2.1
#=GS A0A2Y9KWR9_ENHLU/1-326      AC A0A2Y9KWR9.1
#=GS A0A4Z1KZA2_9HELO/63-210     AC A0A4Z1KZA2.1
#=GS A0A6G1GDI2_9PEZI/1-121      AC A0A6G1GDI2.1
#=GS A0A452REN1_URSAM/172-425    AC A0A452REN1.1
#=GS A0A5F8HHG3_MONDO/97-210     AC A0A5F8HHG3.1
#=GS A0A674F491_SALTR/97-454     AC A0A674F491.1
#=GS A0A6P4HT31_DROKI/42-382     AC A0A6P4HT31.1
#=GS A0A397JF33_9GLOM/75-249     AC A0A397JF33.1
#=GS A0A6J1RYT2_FRAOC/53-413     AC A0A6J1RYT2.1
#=GS A0A452REY2_URSAM/159-421    AC A0A452REY2.1
#=GS A0A287D4N7_ICTTR/97-464     AC A0A287D4N7.1
#=GS A0A3S2PGM4_CHISP/97-466     AC A0A3S2PGM4.1
#=GS A0A0L8HE59_OCTBM/82-438     AC A0A0L8HE59.1
#=GS Q5SVF8_MOUSE/1-300          AC Q5SVF8.8
#=GS A0A446WN16_TRITD/74-428     AC A0A446WN16.1
#=GS A0A672NDK1_SINGR/118-474    AC A0A672NDK1.1
#=GS A0A4P1QYH9_LUPAN/82-439     AC A0A4P1QYH9.1
#=GS M9LXA0_PSEA3/46-191         AC M9LXA0.1
#=GS A0A4W2C705_BOBOX/320-501    AC A0A4W2C705.1
#=GS A0A2T3ZQW2_9HYPO/62-209     AC A0A2T3ZQW2.1
#=GS A0A482SU89_9ARCH/8-154      AC A0A482SU89.1
#=GS A0A6P3RC92_PTEVA/97-452     AC A0A6P3RC92.1
#=GS A0A3Q7H235_SOLLC/67-422     AC A0A3Q7H235.1
#=GS A0A132AKF9_SARSC/1-81       AC A0A132AKF9.1
#=GS A0A4S8JVI9_MUSBA/54-411     AC A0A4S8JVI9.1
#=GS A0A319DVF2_9EURO/63-230     AC A0A319DVF2.1
#=GS G7E753_MIXOS/126-286        AC G7E753.1
#=GS A0A0N4V4W4_ENTVE/85-360     AC A0A0N4V4W4.1
#=GS A0A0D2TNX0_GOSRA/73-430     AC A0A0D2TNX0.1
#=GS A0A1Y2WXW6_9PEZI/63-211     AC A0A1Y2WXW6.1
#=GS A0A093H4C3_DRYPU/98-450     AC A0A093H4C3.1
#=GS A0A6J2JUS9_BOMMA/97-465     AC A0A6J2JUS9.1
#=GS A0A6J2JU40_BOMMA/97-465     AC A0A6J2JU40.1
#=GS A0A4T0I1K6_WALIC/25-184     AC A0A4T0I1K6.1
#=GS A0A5B0Q001_PUCGR/78-231     AC A0A5B0Q001.1
#=GS B2VZU6_PYRTR/92-239         AC B2VZU6.1
#=GS A0A074XNJ4_9PEZI/62-220     AC A0A074XNJ4.1
#=GS A0A1V9XML5_9ACAR/1-276      AC A0A1V9XML5.1
#=GS E9E2Z2_METAQ/62-222         AC E9E2Z2.1
#=GS A0A397UIX9_9GLOM/80-251     AC A0A397UIX9.1
#=GS A0A165QUG5_EXIGL/37-184     AC A0A165QUG5.1
#=GS A0A6J0YLV0_ODOVR/97-506     AC A0A6J0YLV0.1
#=GS A2QPF5_ASPNC/63-202         AC A2QPF5.1
#=GS A0A060SVQ6_PYCCI/1-140      AC A0A060SVQ6.1
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