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Database: Pfam
Entry: Glucodextran_B
LinkDB: Glucodextran_B
Original site: Glucodextran_B 
#=GF ID   Glucodextran_B
#=GF AC   PF09136.13
#=GF DE   Glucodextranase, domain B
#=GF AU   Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF SE   pdb_1ug9 & Pfam-N
#=GF GA   27.00 27.00;
#=GF TC   27.00 27.00;
#=GF NC   26.90 26.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0159
#=GF RN   [1]
#=GF RM   14660574
#=GF RT   Structural insights into substrate specificity and function of
#=GF RT   glucodextranase. 
#=GF RA   Mizuno M, Tonozuka T, Suzuki S, Uotsu-Tomita R, Kamitori S,
#=GF RA   Nishikawa A, Sakano Y; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2004;279:10575-10583.
#=GF DR   INTERPRO; IPR015219;
#=GF DR   SCOP; 1ug9; fa;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Members of this family adopt a structure consisting of
#=GF CC   seven/eight-strand antiparallel beta-sheets, in a Greek-key
#=GF CC   topology, similar to the immunoglobulin beta-sandwich fold. They
#=GF CC   act as cell wall anchors, where they interact with the S-layer
#=GF CC   present in the cell wall of Gram-positive bacteria by
#=GF CC   hydrophobic interactions. In glucodextranase, Domain B is buried
#=GF CC   in the S-layer, and a flexible linker located between domain B
#=GF CC   and the catalytic unit confers motion to the catalytic unit,
#=GF CC   which is capable of efficient hydrolysis of the substrates
#=GF CC   located close to the cell surface [1].
#=GF SQ   1076
#=GS A0A2S6FYZ3_9CLOT/1681-1764  AC A0A2S6FYZ3.1
#=GS A0A268JSG4_9BACI/1100-1185  AC A0A268JSG4.1
#=GS A0A1B9AFD9_9BACI/1280-1361  AC A0A1B9AFD9.1
#=GS A0A098ESB7_9BACL/1186-1270  AC A0A098ESB7.1
#=GS A0A177NSI2_9GAMM/260-349    AC A0A177NSI2.1
#=GS A0A1B1Z9G5_9BACI/1355-1428  AC A0A1B1Z9G5.1
#=GS A0A0P6W3G6_9BACI/1261-1342  AC A0A0P6W3G6.1
#=GS W0EHA6_9FIRM/764-842        AC W0EHA6.1
#=GS A0A235F953_9BACI/1355-1428  AC A0A235F953.1
#=GS A0A6J4XZB3_9DELT/1684-1770  AC A0A6J4XZB3.1
#=GS A0A0P6W3G6_9BACI/1174-1258  AC A0A0P6W3G6.1
#=GS A0A2V3JHK0_9EURY/1530-1611  AC A0A2V3JHK0.1
#=GS A0A1C0Y795_9BACL/1033-1116  AC A0A1C0Y795.1
#=GS A0A133V6T3_9EURY/1136-1225  AC A0A133V6T3.1
#=GS A0A401FZ82_9DELT/522-606    AC A0A401FZ82.1
#=GS A0A554A1U4_9BACI/1246-1328  AC A0A554A1U4.1
#=GS A0A223KXM8_9BACI/1145-1230  AC A0A223KXM8.1
#=GS R6PFC5_9CLOT/8-86           AC R6PFC5.1
#=GS A0A1Y4HID7_9FIRM/187-257    AC A0A1Y4HID7.1
#=GS A0A1Y5KAY7_9BACL/302-380    AC A0A1Y5KAY7.1
#=GS A0A5R9F747_9BACI/1318-1391  AC A0A5R9F747.1
#=GS A0A1H9HA49_9SPIO/558-631    AC A0A1H9HA49.1
#=GS W0EGE9_9FIRM/470-546        AC W0EGE9.1
#=GS A0A2Z4FLT0_9DELT/328-413    AC A0A2Z4FLT0.1
#=GS A0A223KTU0_9BACI/1162-1246  AC A0A223KTU0.1
#=GS W9AK29_9BACI/1273-1354      AC W9AK29.1
#=GS A0A2I0N3Q0_9CLOT/1516-1597  AC A0A2I0N3Q0.1
#=GS A0A2Z4W9S7_9CLOT/1153-1226  AC A0A2Z4W9S7.1
#=GS A0A0M8K5X0_9CHLR/242-322    AC A0A0M8K5X0.1
#=GS A0A1I6V076_9PSEU/129-206    AC A0A1I6V076.1
#=GS A0A4U7N0Q8_9RHOB/438-517    AC A0A4U7N0Q8.1
#=GS F4LV55_TEPAE/30-114         AC F4LV55.1
#=GS A0A1I0ESR2_9BACI/1177-1261  AC A0A1I0ESR2.1
#=GS A0A401FS79_9DELT/450-539    AC A0A401FS79.1
#=GS A0A0J1FXX5_9FIRM/184-273    AC A0A0J1FXX5.1
#=GS A0A1R1EK55_9BACL/781-866    AC A0A1R1EK55.1
#=GS E6JZD1_PARDN/1237-1322      AC E6JZD1.1
#=GS A0A5B8Z1M7_9BACI/1259-1340  AC A0A5B8Z1M7.1
#=GS A0A3A5FUJ6_9DELT/707-787    AC A0A3A5FUJ6.1
#=GS A0A3E0WHA6_9GAMM/324-411    AC A0A3E0WHA6.1
#=GS A0A0M9DWY4_9DELT/155-241    AC A0A0M9DWY4.1
#=GS A0A345PJT2_9BACI/925-1006   AC A0A345PJT2.1
#=GS A0A3B0CGU9_9BACL/1860-1942  AC A0A3B0CGU9.1
#=GS W4LRI8_9BACT/23-106         AC W4LRI8.1
#=GS A0A1T0CK89_9GAMM/40-129     AC A0A1T0CK89.1
#=GS A0A1H8ENW8_9BACL/1367-1441  AC A0A1H8ENW8.1
#=GS A0A0W1KHA3_9ACTO/1073-1156  AC A0A0W1KHA3.1
#=GS A0A1M6ITX8_9FIRM/385-462    AC A0A1M6ITX8.1
#=GS A0A371SIY6_9BACI/1160-1245  AC A0A371SIY6.1
#=GS A0A2P8F5W8_9RHOB/439-518    AC A0A2P8F5W8.1
#=GS A0A417YM62_9BACI/1244-1325  AC A0A417YM62.1
#=GS A0A562VKU6_9DELT/324-405    AC A0A562VKU6.1
#=GS A0A1L8ZQA1_9BACI/1259-1340  AC A0A1L8ZQA1.1
#=GS A0A2N8FMS9_9PSED/36-98      AC A0A2N8FMS9.1
#=GS H8MHX4_CORCM/230-304        AC H8MHX4.1
#=GS A0A223KXM8_9BACI/1233-1314  AC A0A223KXM8.1
#=GS A0A091B9X8_9GAMM/306-390    AC A0A091B9X8.1
#=GS D5X9E0_THEPJ/715-796        AC D5X9E0.1
#=GS A0A4Q2YBG1_9BACT/400-486    AC A0A4Q2YBG1.1
#=GS K9F1W5_9ACTO/1053-1126      AC K9F1W5.1
#=GS A0A1Q3GT25_9BACT/69-155     AC A0A1Q3GT25.1
#=GS A5GCU9_GEOUR/885-968        AC A5GCU9.1
#=GS R7N4A2_9FIRM/188-276        AC R7N4A2.1
#=GS A0A094WP79_ALKAL/1202-1287  AC A0A094WP79.1
#=GS A0A212PFV9_9DELT/489-568    AC A0A212PFV9.1
#=GS A0A398D732_9BACT/942-1024   AC A0A398D732.1
#=GS A0A133U7N5_9EURY/66-151     AC A0A133U7N5.1
#=GS A0A172TN84_9BACL/830-906    AC A0A172TN84.1
#=GS A0A3A9KJX0_9BACI/628-705    AC A0A3A9KJX0.1
#=GS A0A398CTI7_9BACT/1100-1179  AC A0A398CTI7.1
#=GS W4M5I1_9BACT/45-126         AC W4M5I1.1
#=GS A0A410E0H8_9CLOT/1157-1242  AC A0A410E0H8.1
#=GS R5RTC8_9FIRM/176-265        AC R5RTC8.1
#=GS E0S574_BUTPB/239-323        AC E0S574.1
#=GS A0A268JSG4_9BACI/1188-1270  AC A0A268JSG4.1
#=GS A0A1R1DA62_9BACL/1860-1942  AC A0A1R1DA62.1
#=GS A0A2I0N3A8_9CLOT/1490-1572  AC A0A2I0N3A8.1
#=GS A0A329LVL9_9BACL/1069-1145  AC A0A329LVL9.1
#=GS A0A6P1MCH8_9FIRM/490-574    AC A0A6P1MCH8.1
#=GS R9PR79_AGAAL/408-498        AC R9PR79.1
#=GS A0A5K7YYM5_9DELT/216-300    AC A0A5K7YYM5.1
#=GS W0EGE9_9FIRM/1-73           AC W0EGE9.1
#=GS A0A0J1FYH1_9FIRM/184-273    AC A0A0J1FYH1.1
#=GS A0A656YXT5_9EURY/213-296    AC A0A656YXT5.1
#=GS A0A0M0GLB1_SPOGL/1243-1325  AC A0A0M0GLB1.1
#=GS A0LKT8_SYNFM/484-567        AC A0LKT8.1
#=GS A0A5D0SRL1_9BACT/447-530    AC A0A5D0SRL1.1
#=GS A0A398CW90_9BACT/734-814    AC A0A398CW90.1
#=GS A0A416E8H2_9FIRM/469-548    AC A0A416E8H2.1
#=GS A0A1M5EAZ1_9BACI/842-927    AC A0A1M5EAZ1.1
#=GS A0A069DE68_9BACL/1439-1523  AC A0A069DE68.1
#=GS A0A212PKH7_9DELT/328-405    AC A0A212PKH7.1
#=GS A0A211ZVG7_9PROT/445-524    AC A0A211ZVG7.1
#=GS A0LH84_SYNFM/127-210        AC A0LH84.1
#=GS A0A1M5EB65_9BACI/1121-1206  AC A0A1M5EB65.1
#=GS A5G5X6_GEOUR/428-509        AC A5G5X6.1
#=GS A0Q1M8_CLONN/1016-1088      AC A0Q1M8.1
#=GS A0A165QYH4_9GAMM/449-535    AC A0A165QYH4.1
#=GS A0A1H8AWS5_9BACL/125-205    AC A0A1H8AWS5.1
#=GS A0A6B3PT18_9BACT/679-766    AC A0A6B3PT18.1
#=GS A0A4R8H136_9FIRM/1065-1146  AC A0A4R8H136.1
#=GS A0A1M5K6E1_9BACI/1234-1316  AC A0A1M5K6E1.1
#=GS A0A1H0PLH0_9BACI/1120-1196  AC A0A1H0PLH0.1
#=GS A0A250IRL2_9DELT/234-306    AC A0A250IRL2.1
#=GS S2YN04_9BACL/1175-1259      AC S2YN04.1
#=GS Q65JX1_BACLD/1154-1239      AC Q65JX1.1
#=GS A0A1G8ZLD3_9ACTN/156-231    AC A0A1G8ZLD3.1
#=GS W4M4R2_9BACT/321-402        AC W4M4R2.1
#=GS A0A0L0QUD4_VIRPA/1170-1255  AC A0A0L0QUD4.1
#=GS F5LER4_9BACL/192-276        AC F5LER4.1
#=GS A0A0A8WKP0_9DELT/506-593    AC A0A0A8WKP0.1
#=GS A0A1G8QQ40_9BACI/1515-1597  AC A0A1G8QQ40.1
#=GS A0A1H9BA19_9BACI/1230-1311  AC A0A1H9BA19.1
#=GS A0A0U2UTF9_9BACL/188-270    AC A0A0U2UTF9.1
#=GS A0A2L2XGN9_9FIRM/164-241    AC A0A2L2XGN9.1
#=GS A0A366XYE1_9BACI/1346-1421  AC A0A366XYE1.1
#=GS A0A285CLM2_9BACI/1254-1335  AC A0A285CLM2.1
#=GS A0A5A9XTR2_9DELT/3493-3579  AC A0A5A9XTR2.1
#=GS A0A6C0FXT5_9BACL/612-683    AC A0A6C0FXT5.1
#=GS A0A1B1Z1C6_9BACI/1170-1255  AC A0A1B1Z1C6.1
#=GS A0A1E5L000_9ENTE/1177-1266  AC A0A1E5L000.1
#=GS Q67RJ0_SYMTH/1511-1593      AC Q67RJ0.1
#=GS A5G8L5_GEOUR/2125-2206      AC A5G8L5.1
#=GS A0A0Q3TEW9_9BACI/1264-1345  AC A0A0Q3TEW9.1
#=GS A0A1M5EB65_9BACI/1209-1290  AC A0A1M5EB65.1
#=GS A0A4R3LBU7_9BACL/1156-1240  AC A0A4R3LBU7.1
#=GS A0A062VEP9_9EURY/145-229    AC A0A062VEP9.1
#=GS A0A6N8HLN3_9BACI/835-920    AC A0A6N8HLN3.1
#=GS A0A372JGC1_9ACTN/43-134     AC A0A372JGC1.1
#=GS A0A1I0DMQ4_9BACI/1222-1303  AC A0A1I0DMQ4.1
#=GS B9M4K6_GEODF/517-606        AC B9M4K6.1
#=GS Q748W6_GEOSL/486-567        AC Q748W6.1
#=GS A0A0B5BD83_9DELT/567-646    AC A0A0B5BD83.1
#=GS A0A4Q0T461_9BACT/771-859    AC A0A4Q0T461.1
#=GS A0A4S4BPD1_9BACL/946-1017   AC A0A4S4BPD1.1
#=GS A0A1V4HQ11_9BACL/314-397    AC A0A1V4HQ11.1
#=GS A0A0M9EJK7_9RHOB/439-519    AC A0A0M9EJK7.1
#=GS W0EHA6_9FIRM/130-207        AC W0EHA6.1
#=GS A5GBS8_GEOUR/1794-1878      AC A5GBS8.1
#=GS A0A0D8CQ42_9GAMM/305-387    AC A0A0D8CQ42.1
#=GS A0A2S0U5E3_9BACL/1561-1643  AC A0A2S0U5E3.1
#=GS A0A1B8UY28_9BACL/197-280    AC A0A1B8UY28.1
#=GS A0A5C4T5N6_9BACL/409-483    AC A0A5C4T5N6.1
#=GS F5LEC3_9BACL/475-559        AC F5LEC3.1
#=GS A0A5K7YVW7_9DELT/621-705    AC A0A5K7YVW7.1
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#=GS A0A2V3JNT6_9EURY/223-309    AC A0A2V3JNT6.1
#=GS D5X9E0_THEPJ/542-622        AC D5X9E0.1
#=GS A0A075LG26_9BACI/1173-1257  AC A0A075LG26.1
#=GS A0A255R747_9BACT/3339-3412  AC A0A255R747.1
#=GS A0A1C1A7E3_9BACL/304-385    AC A0A1C1A7E3.1
#=GS A0A3A1R0P5_9BACI/1263-1344  AC A0A3A1R0P5.1
#=GS A0A3S3QUT2_9DELT/441-521    AC A0A3S3QUT2.1
#=GS Q39YY7_GEOMG/824-908        AC Q39YY7.1
#=GS A0A5K7YPP3_9DELT/51-134     AC A0A5K7YPP3.1
#=GS U5L9Y1_9BACI/1254-1335      AC U5L9Y1.1
#=GS A0A1H9JT60_9BACI/1306-1387  AC A0A1H9JT60.1
#=GS B9M6T9_GEODF/1337-1429      AC B9M6T9.1
#=GS A0A075LG26_9BACI/1260-1342  AC A0A075LG26.1
#=GS A0A1Y5RS06_9RHOB/438-517    AC A0A1Y5RS06.1
#=GS A0A5K7YVT7_9DELT/2381-2461  AC A0A5K7YVT7.1
#=GS A0A1H0EQK3_9BACI/1134-1216  AC A0A1H0EQK3.1
#=GS A0A168U1F5_9CYAN/29-106     AC A0A168U1F5.1
#=GS A0A511UWD0_9BACI/1225-1307  AC A0A511UWD0.1
#=GS A0A2W0H8M0_9BACI/1410-1494  AC A0A2W0H8M0.1
#=GS A0A5B8Z5H2_9BACI/1158-1243  AC A0A5B8Z5H2.1
#=GS K8EKV6_CARML/1169-1257      AC K8EKV6.2
#=GS A0A0M4GAB8_9BACI/1307-1388  AC A0A0M4GAB8.1
#=GS A0A2W0HGF5_9BACI/1414-1497  AC A0A2W0HGF5.1
#=GS A0A239QTU3_9MICO/1014-1083  AC A0A239QTU3.1
#=GS A0A4Y8I8M2_9BACT/404-491    AC A0A4Y8I8M2.1
#=GS R5TJQ9_9FIRM/238-322        AC R5TJQ9.1
#=GS A0A0M0GRZ6_9BACI/1252-1333  AC A0A0M0GRZ6.1
#=GS A0A133UC22_9EURY/186-269    AC A0A133UC22.1
#=GS A0A1I2NGP3_9BACL/1169-1237  AC A0A1I2NGP3.1
#=GS A0A2Z2KMM3_9BACL/309-390    AC A0A2Z2KMM3.1
#=GS A0A660L9E7_9THEO/1544-1626  AC A0A660L9E7.1
#=GS A0A0C2VVH8_9BACL/1152-1238  AC A0A0C2VVH8.1
#=GS A0A3A5FUJ6_9DELT/622-704    AC A0A3A5FUJ6.1
#=GS A0A254R8S1_9RHOB/375-459    AC A0A254R8S1.1
#=GS A0A2S7WAA0_9FLAO/790-878    AC A0A2S7WAA0.1
#=GS A0A1V4HQ11_9BACL/575-655    AC A0A1V4HQ11.1
#=GS A0A559QH07_9ALTE/244-329    AC A0A559QH07.1
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