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Database: Pfam
Entry: Glyco_hydro_99
LinkDB: Glyco_hydro_99
Original site: Glyco_hydro_99 
#=GF ID   Glyco_hydro_99
#=GF AC   PF16317.8
#=GF DE   Glycosyl hydrolase family 99
#=GF AU   Chang Y;0000-0002-2418-3433
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE   Jackhmmer BT_3863 (NP_812773.1) and PDB 4ACY
#=GF GA   33.00 33.00;
#=GF TC   33.10 33.00;
#=GF NC   32.90 32.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0058
#=GF RN   [1]
#=GF RM   22219371
#=GF RT   Structural and mechanistic insight into N-glycan processing by
#=GF RT   endo-α-mannosidase.
#=GF RA   Thompson AJ, Williams RJ, Hakki Z, Alonzi DS, Wennekes T,
#=GF RA   Gloster TM, Songsrirote K, Thomas-Oates JE, Wrodnigg TM, Spreitz
#=GF RA   J, Stütz AE, Butters TD, Williams SJ, Davies GJ;
#=GF RL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 109 (3), 781-786 (2012).
#=GF DR   INTERPRO; IPR026071;
#=GF DR   CAZY; GH99;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This domain, around 350 residues, is mainly found in some
#=GF CC   uncharacterized proteins from bacteroides to human. Some
#=GF CC   proteins in this family, annotated as endo-alpha-mannosidases
#=GF CC   cleave mannoside linkages internally within an N-linked glycan
#=GF CC   chain, short circuiting the classical N-glycan biosynthetic
#=GF CC   pathway. This domain reveals a (beta-alpha)(8) barrel fold in
#=GF CC   which the catalytic centre is present in a long
#=GF CC   substrate-binding groove, consistent with cleavage within the
#=GF CC   N-glycan chain, providing a foundation upon which to develop new
#=GF CC   enzyme inhibitors targeting the hijacking of N-glycan synthesis
#=GF CC   in viral disease and cancer [1].
#=GF SQ   1046
#=GS A0A1L8HE80_XENLA/76-426     AC A0A1L8HE80.1
#=GS A0A096LQ90_POEFO/1-276      AC A0A096LQ90.1
#=GS A0A3Q7XD93_URSAR/18-228     AC A0A3Q7XD93.1
#=GS A0A6P6LM76_CARAU/84-434     AC A0A6P6LM76.1
#=GS A0A669DWE5_ORENI/87-437     AC A0A669DWE5.1
#=GS M4AJI1_XIPMA/88-438         AC M4AJI1.1
#=GS B0XFY2_CULQU/118-448        AC B0XFY2.1
#=GS A0A212CI39_CEREH/18-368     AC A0A212CI39.1
#=GS A0A3Q2V963_HAPBU/87-437     AC A0A3Q2V963.1
#=GS K7E5Q9_MONDO/99-438         AC K7E5Q9.2
#=GS A0A0V0ZE49_9BILA/178-523    AC A0A0V0ZE49.1
#=GS A0A1S3KSV2_SALSA/1-275      AC A0A1S3KSV2.1
#=GS A0A2G7F6P1_9ACTN/42-314     AC A0A2G7F6P1.1
#=GS A0A6V8JXX7_9ACTN/1046-1364  AC A0A6V8JXX7.1
#=GS A0A1D7XW07_9FLAO/295-418    AC A0A1D7XW07.1
#=GS A0A672YUB9_9TELE/86-436     AC A0A672YUB9.1
#=GS A0A6J0WHN3_ODOVR/1-322      AC A0A6J0WHN3.1
#=GS G5C6H6_HETGA/9-307          AC G5C6H6.1
#=GS I3KH15_ORENI/85-435         AC I3KH15.2
#=GS A0A671SQD7_9TELE/84-434     AC A0A671SQD7.1
#=GS A0A087QVD1_APTFO/107-457    AC A0A087QVD1.1
#=GS A0A4U5M2H2_STECR/117-481    AC A0A4U5M2H2.1
#=GS A0A2K6BM59_MACNE/98-448     AC A0A2K6BM59.1
#=GS A0A0M3QU70_DROBS/135-461    AC A0A0M3QU70.1
#=GS E0W317_PEDHC/33-382         AC E0W317.1
#=GS S9WWD1_CAMFR/6-356          AC S9WWD1.1
#=GS A0A2F0BJG8_ESCRO/14-98      AC A0A2F0BJG8.1
#=GS H2MHD0_ORYLA/86-439         AC H2MHD0.2
#=GS A0A0L0D3E5_THETB/42-386     AC A0A0L0D3E5.1
#=GS A0A1H4MCP8_9ACTN/392-709    AC A0A1H4MCP8.1
#=GS A0A514BP54_9GAMM/30-366     AC A0A514BP54.1
#=GS A0A6J3ARE2_VICPA/98-453     AC A0A6J3ARE2.1
#=GS A0A6I9IIC1_VICPA/18-228     AC A0A6I9IIC1.1
#=GS A0A1M4XLH6_9ACTN/282-592    AC A0A1M4XLH6.1
#=GS A0A673WSM6_SALTR/82-432     AC A0A673WSM6.1
#=GS A0A3B1KA96_ASTMX/84-432     AC A0A3B1KA96.1
#=GS D2I2H7_AILME/97-447         AC D2I2H7.1
#=GS A0A164KGH6_9CRUS/51-402     AC A0A164KGH6.1
#=GS A0A670YN37_PSETE/98-448     AC A0A670YN37.1
#=GS A7S5C4_NEMVE/5-355          AC A7S5C4.1
#=GS A0A0P7U693_SCLFO/83-433     AC A0A0P7U693.1
#=GS W7T992_9PSEU/33-351         AC W7T992.1
#=GS G3TJ35_LOXAF/75-425         AC G3TJ35.1
#=GS G3P7I7_GASAC/85-433         AC G3P7I7.1
#=GS A0A509E2C4_9RHIZ/32-214     AC A0A509E2C4.1
#=GS A0A060YG50_ONCMY/1-129      AC A0A060YG50.1
#=GS A0A384B8N2_BALAS/98-448     AC A0A384B8N2.1
#=GS A0A6P6E682_OCTDE/98-448     AC A0A6P6E682.1
#=GS MANEA_HUMAN/98-448          AC Q5SRI9.1
#=GS MANEA_HUMAN/98-448          DR PDB; 6ZDF B; 98-448;
#=GS MANEA_HUMAN/98-448          DR PDB; 6ZDF A; 99-448;
#=GS MANEA_HUMAN/98-448          DR PDB; 6ZDF C; 98-448;
#=GS MANEA_HUMAN/98-448          DR PDB; 6ZDC A; 98-448;
#=GS A0A5C5ZQQ1_9BACT/28-214     AC A0A5C5ZQQ1.1
#=GS A0A1E7F9A2_9STRA/423-567    AC A0A1E7F9A2.1
#=GS A0A1N7FYV9_9SPHI/273-424    AC A0A1N7FYV9.1
#=GS A0A383VZS0_TETOB/1-346      AC A0A383VZS0.1
#=GS A0A2K6UPW8_SAIBB/98-190     AC A0A2K6UPW8.1
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#=GS A0A0V1CUA1_TRIBR/411-759    AC A0A0V1CUA1.1
#=GS A0A151NT90_ALLMI/1-273      AC A0A151NT90.1
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#=GS A0A3Q3X1G9_MOLML/85-269     AC A0A3Q3X1G9.1
#=GS A0A665T553_ECHNA/16-285     AC A0A665T553.1
#=GS A0A0V1P4S5_9BILA/371-720    AC A0A0V1P4S5.1
#=GS A0A173Z0Y2_9BACE/43-384     AC A0A173Z0Y2.1
#=GS A0A437CJT3_ORYJA/86-436     AC A0A437CJT3.1
#=GS A0A673MYF1_9TELE/84-434     AC A0A673MYF1.1
#=GS A0A2K6K7A1_RHIBE/19-228     AC A0A2K6K7A1.1
#=GS T1HBP3_RHOPR/212-395        AC T1HBP3.1
#=GS A0A1W6LIU9_9BACT/24-331     AC A0A1W6LIU9.1
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#=GS A0A232EWC5_9HYME/118-208    AC A0A232EWC5.1
#=GS G5BQC4_HETGA/98-448         AC G5BQC4.1
#=GS A0A2K6SA61_SAIBB/19-228     AC A0A2K6SA61.1
#=GS A0A183AY44_9TREM/60-164     AC A0A183AY44.1
#=GS A0A1H2W101_9PSEU/1032-1350  AC A0A1H2W101.1
#=GS A0A3Q7SDX5_VULVU/124-474    AC A0A3Q7SDX5.1
#=GS A0A6G7YBW1_9ACTN/43-305     AC A0A6G7YBW1.1
#=GS A0A226PCU6_COLVI/56-405     AC A0A226PCU6.1
#=GS A0A0K0DX16_STRER/151-521    AC A0A0K0DX16.1
#=GS A0A6I1QUK8_9CHLR/89-229     AC A0A6I1QUK8.1
#=GS L1J5Q5_GUITC/50-416         AC L1J5Q5.1
#=GS A0A151NG26_ALLMI/2-94       AC A0A151NG26.1
#=GS L9JVF5_TUPCH/98-448         AC L9JVF5.1
#=GS G5C4E8_HETGA/38-179         AC G5C4E8.1
#=GS A0A3Q7RZ79_VULVU/19-228     AC A0A3Q7RZ79.1
#=GS A0A384A5U9_BALAS/1-322      AC A0A384A5U9.1
#=GS A0A315VM14_GAMAF/85-244     AC A0A315VM14.1
#=GS A0A183DYR1_9BILA/1-107      AC A0A183DYR1.1
#=GS M7BYZ3_CHEMY/107-457        AC M7BYZ3.1
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#=GS A0A6P6MJF1_CARAU/85-435     AC A0A6P6MJF1.1
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#=GS A0A0M9ZK37_9ACTN/392-710    AC A0A0M9ZK37.1
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#=GS A0A430QNQ8_SCHBO/182-457    AC A0A430QNQ8.1
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#=GS A0A286Y1F1_CAVPO/98-448     AC A0A286Y1F1.1
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#=GS A2FNS1_TRIVA/1-326          AC A2FNS1.1
#=GS V4XRK7_9ARCH/177-459        AC V4XRK7.1
#=GS A0A3P6VDI8_LITSI/37-350     AC A0A3P6VDI8.1
#=GS A0A087XGY9_POEFO/85-435     AC A0A087XGY9.1
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#=GS A0A3Q3GZ69_9LABR/88-438     AC A0A3Q3GZ69.1
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#=GS A0A2Y9GPZ0_NEOSC/105-450    AC A0A2Y9GPZ0.1
#=GS K7FGP2_PELSI/78-427         AC K7FGP2.1
#=GS A0A2P6NV20_9EUKA/49-405     AC A0A2P6NV20.1
#=GS A0A665TGD8_ECHNA/85-435     AC A0A665TGD8.1
#=GS A0A556TQD6_BAGYA/83-433     AC A0A556TQD6.1
#=GS A0A1U7SZ96_ALLSI/25-288     AC A0A1U7SZ96.1
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#=GS K0R1R6_THAOC/232-522        AC K0R1R6.1
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