#=GF ID IFT52_GIFT
#=GF AC PF23355.2
#=GF DE IFT52 GIFT domain
#=GF AU Chuguransky S;0000-0002-0520-0736
#=GF SE [1-3], AlphaFold prediction
#=GF GA 27.20 27.20;
#=GF TC 27.20 27.20;
#=GF NC 27.10 27.10;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 --cpu 8 -Z 90746521 HMM pfamseq
#=GF TP Domain
#=GF CL CL0014
#=GF RN [1]
#=GF RM 27466190
#=GF RT IFT52 mutations destabilize anterograde complex assembly,
#=GF RT disrupt ciliogenesis and result in short rib polydactyly
#=GF RT syndrome.
#=GF RA Zhang W, Taylor SP, Nevarez L, Lachman RS, Nickerson DA, Bamshad
#=GF RA M, Krakow D, Cohn DH;
#=GF RL Hum Mol Genet. 2016;25:4012-4020.
#=GF RN [2]
#=GF RM 25349261
#=GF RT Crystal structures of IFT70/52 and IFT52/46 provide insight into
#=GF RT intraflagellar transport B core complex assembly.
#=GF RA Taschner M, Kotsis F, Braeuer P, Kuehn EW, Lorentzen E;
#=GF RL J Cell Biol. 2014;207:269-282.
#=GF DR INTERPRO; IPR055458;
#=GF DR SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC This domain is found in various eukaryotic and prokaryotic
#=GF CC intra-flagellar transport proteins involved in gliding motility,
#=GF CC as well as in several hypothetical proteins. Intraflagellar
#=GF CC transport protein 52 homolog from human is included in this
#=GF CC entry, which is essential for anterograde complex integrity and
#=GF CC for the biosynthesis and maintenance of cilia [1]. This domain
#=GF CC has been described as the GIFT domain in IFT52 whose function is
#=GF CC not yet clear [1,2].
#=GF SQ 1747
#=GS R7UMT0_CAPTE/10-252 AC R7UMT0.1
#=GS A4HY54_LEIIN/216-353 AC A4HY54.2
#=GS A0AAF5D5D5_STRER/14-256 AC A0AAF5D5D5.1
#=GS A0A7L3HN70_9PASS/1-146 AC A0A7L3HN70.1
#=GS A0A8C1RXX0_CYPCA/8-252 AC A0A8C1RXX0.1
#=GS A0A5F5PT13_HORSE/17-262 AC A0A5F5PT13.1
#=GS A0A507E5K6_9FUNG/23-272 AC A0A507E5K6.1
#=GS V6M2X2_9EUKA/9-246 AC V6M2X2.1
#=GS A0A1X7V8I0_AMPQE/32-276 AC A0A1X7V8I0.1
#=GS A0A667H178_LYNCA/17-262 AC A0A667H178.1
#=GS A0A6J0DIZ0_PERMB/18-263 AC A0A6J0DIZ0.1
#=GS A0A8J4FQP6_9CHLO/10-263 AC A0A8J4FQP6.1
#=GS A0A7L0QPV0_SETKR/1-72 AC A0A7L0QPV0.1
#=GS A0A7K4XA51_REGSA/1-72 AC A0A7K4XA51.1
#=GS A0A1I2AZP4_9BACL/1324-1447 AC A0A1I2AZP4.1
#=GS A0A5F4W295_CALJA/165-364 AC A0A5F4W295.2
#=GS A0A1V4HE87_9BACL/1562-1682 AC A0A1V4HE87.1
#=GS A0A3Q7PBT8_CALUR/17-150 AC A0A3Q7PBT8.1
#=GS A0A6I9WZ18_9SAUR/8-253 AC A0A6I9WZ18.1
#=GS A0A9J6CP19_POLVA/3-228 AC A0A9J6CP19.1
#=GS A0A1T2X2G6_9BACL/1236-1360 AC A0A1T2X2G6.1
#=GS A0A914H4Z0_GLORO/88-244 AC A0A914H4Z0.1
#=GS A0A4D9CYG4_9STRA/5-129 AC A0A4D9CYG4.1
#=GS Q4SS99_TETNG/8-251 AC Q4SS99.1
#=GS A0A091JKD6_EGRGA/8-253 AC A0A091JKD6.1
#=GS A0A671R108_9TELE/205-244 AC A0A671R108.1
#=GS A0A8B9PBH1_APTOW/13-258 AC A0A8B9PBH1.1
#=GS A0A9P1C2L6_9DINO/863-1016 AC A0A9P1C2L6.1
#=GS A0A6G0W250_APHCR/15-256 AC A0A6G0W250.1
#=GS A0A0V0XW65_TRIPS/8-254 AC A0A0V0XW65.1
#=GS A0A0R3UF77_MESCO/15-253 AC A0A0R3UF77.2
#=GS Q4DYL4_TRYCC/27-179 AC Q4DYL4.1
#=GS A0A452CQ52_BALAS/1-36 AC A0A452CQ52.1
#=GS A0A7J8HH95_MOLMO/1-77 AC A0A7J8HH95.1
#=GS A0A2Z4LS30_9FLAO/52-173 AC A0A2Z4LS30.1
#=GS A0A662YGB3_NOTX5/26-311 AC A0A662YGB3.1
#=GS F2UMJ9_SALR5/7-251 AC F2UMJ9.1
#=GS A0A8C0ICD0_BUBBB/8-253 AC A0A8C0ICD0.1
#=GS A0A2A2KDQ8_9BILA/29-269 AC A0A2A2KDQ8.1
#=GS A0A5F7ZBB4_MACMU/8-205 AC A0A5F7ZBB4.1
#=GS A0A0G4GX75_VITBC/20-282 AC A0A0G4GX75.1
#=GS A0A068Y5Y8_ECHMU/15-126 AC A0A068Y5Y8.1
#=GS A0A8B8VDB0_BALMU/17-262 AC A0A8B8VDB0.1
#=GS H3GGX9_PHYRM/14-285 AC H3GGX9.1
#=GS A0A7K7AG97_9AVES/8-253 AC A0A7K7AG97.1
#=GS A0A1A6H993_NEOLE/73-150 AC A0A1A6H993.1
#=GS A0A671Z433_SPAAU/8-252 AC A0A671Z433.1
#=GS A0A341BLG9_NEOAA/8-263 AC A0A341BLG9.1
#=GS A0A8C0B7S2_9AVES/8-250 AC A0A8C0B7S2.1
#=GS A0A8C4SN30_ERPCA/16-260 AC A0A8C4SN30.1
#=GS A0A9W7BUC0_9STRA/12-282 AC A0A9W7BUC0.1
#=GS E2BQ86_HARSA/13-247 AC E2BQ86.1
#=GS A0A8S4FS62_PLUXY/7-253 AC A0A8S4FS62.1
#=GS A0A3P8U1S7_AMPPE/8-252 AC A0A3P8U1S7.1
#=GS A0A817NVN9_9BILA/23-282 AC A0A817NVN9.1
#=GS A0A0N4Y1D2_NIPBR/33-291 AC A0A0N4Y1D2.1
#=GS A0AA41N3I2_SCICA/8-253 AC A0AA41N3I2.1
#=GS A0A3P6T903_DIBLA/16-254 AC A0A3P6T903.1
#=GS A0A914A109_PATMI/9-169 AC A0A914A109.1
#=GS A0A455B526_PHYMC/1-36 AC A0A455B526.1
#=GS A0A341BIM1_NEOAA/1-36 AC A0A341BIM1.1
#=GS A0A0G2K177_RAT/8-246 AC A0A0G2K177.2
#=GS A0AAD5PV59_9CRUS/25-247 AC A0AAD5PV59.1
#=GS A0A7K6ISB4_9CORV/1-72 AC A0A7K6ISB4.1
#=GS A0A673J366_9TELE/8-249 AC A0A673J366.1
#=GS A0A913ZZN3_PATMI/16-286 AC A0A913ZZN3.1
#=GS A0A4W6D4D9_LATCA/8-252 AC A0A4W6D4D9.1
#=GS A0A8D2FYH4_THEGE/8-253 AC A0A8D2FYH4.1
#=GS A0A091V2X4_NIPNI/8-253 AC A0A091V2X4.1
#=GS A0A5A8CT03_CAFRO/229-332 AC A0A5A8CT03.1
#=GS A0A0L7KWW3_OPEBR/15-115 AC A0A0L7KWW3.1
#=GS A0A6J1VEA6_9SAUR/16-261 AC A0A6J1VEA6.1
#=GS A0A8C9ZCC2_SANLU/8-237 AC A0A8C9ZCC2.1
#=GS A0A7L2II18_9PICI/1-72 AC A0A7L2II18.1
#=GS A0A8C8BSL1_9STRI/8-250 AC A0A8C8BSL1.1
#=GS A0A803YPW2_MELGA/387-448 AC A0A803YPW2.1
#=GS A0A668RNZ8_OREAU/8-89 AC A0A668RNZ8.2
#=GS A0A6P3GL38_BISBB/8-253 AC A0A6P3GL38.1
#=GS F7CKM4_ORNAN/8-253 AC F7CKM4.2
#=GS A0AA47NC91_MERPO/8-263 AC A0AA47NC91.1
#=GS A0A8C6PEJ1_NOTFU/8-252 AC A0A8C6PEJ1.1
#=GS A0A8K1GLD0_9PASS/8-253 AC A0A8K1GLD0.1
#=GS A0A9P0MRP3_NEZVI/47-288 AC A0A9P0MRP3.1
#=GS A0A851BE14_PICGY/1-72 AC A0A851BE14.1
#=GS A0A7K4TEN8_9CHAR/1-72 AC A0A7K4TEN8.1
#=GS A0A087VJZ1_BALRE/8-253 AC A0A087VJZ1.1
#=GS A0A915DDG6_9BILA/101-252 AC A0A915DDG6.1
#=GS W7TQT8_9STRA/307-356 AC W7TQT8.1
#=GS A0A077ZA58_TRITR/1-186 AC A0A077ZA58.1
#=GS A0A669D024_ORENI/8-252 AC A0A669D024.1
#=GS A0AA36G797_9BILA/28-268 AC A0AA36G797.1
#=GS G3RYX5_GORGO/8-253 AC G3RYX5.1
#=GS A0AAE0VW52_9BIVA/16-257 AC A0AAE0VW52.1
#=GS A0AAY4EJH0_9TELE/8-252 AC A0AAY4EJH0.1
#=GS A0A0V0UUH5_9BILA/8-254 AC A0A0V0UUH5.1
#=GS A0A3P2ANA0_9FIRM/288-383 AC A0A3P2ANA0.1
#=GS A0A1D1VYD3_RAMVA/15-242 AC A0A1D1VYD3.1
#=GS E3LPV1_CAERE/17-272 AC E3LPV1.1
#=GS A0A4Z2CL71_SCHJA/13-257 AC A0A4Z2CL71.1
#=GS A0A2I0T581_LIMLA/1-77 AC A0A2I0T581.1
#=GS A0A9P1N8D6_9PELO/15-256 AC A0A9P1N8D6.1
#=GS A0A268KD18_9BACI/1287-1400 AC A0A268KD18.1
#=GS A0A668RNZ8_OREAU/96-302 AC A0A668RNZ8.2
#=GS A0AAY4EIT6_9TELE/8-255 AC A0AAY4EIT6.1
#=GS A0A6A4W3J6_AMPAM/3-219 AC A0A6A4W3J6.1
#=GS A0A8J9Y5B3_9NEOP/113-206 AC A0A8J9Y5B3.1
#=GS A0A7S3ZRS8_9STRA/19-279 AC A0A7S3ZRS8.1
#=GS A0A091GZI7_9AVES/1-216 AC A0A091GZI7.1
#=GS A0A672YWI2_9TELE/8-253 AC A0A672YWI2.1
#=GS A0A7K9FJ92_STEPR/1-72 AC A0A7K9FJ92.1
#=GS A0A7L4FS12_9COLU/1-72 AC A0A7L4FS12.1
#=GS A0A7K9NLM7_9CORV/1-72 AC A0A7K9NLM7.1
#=GS W5NZH8_SHEEP/8-247 AC W5NZH8.1
#=GS A0A7K6I090_9PASS/1-72 AC A0A7K6I090.1
#=GS A0A671E9I5_RHIFE/17-262 AC A0A671E9I5.1
#=GS A0A1U7TQ32_CARSF/146-238 AC A0A1U7TQ32.1
#=GS A0A914LB86_MELIC/5-271 AC A0A914LB86.1
#=GS A0A7L2PIP3_PYCJO/1-72 AC A0A7L2PIP3.1
#=GS A0AAE1AP74_9GAST/16-259 AC A0AAE1AP74.1
#=GS A0A8C5INM3_JUNHY/8-253 AC A0A8C5INM3.1
#=GS C1MLQ9_MICPC/20-282 AC C1MLQ9.1
#=GS A0A8K0C9I3_IGNLU/13-242 AC A0A8K0C9I3.1
#=GS A0A673UEX3_SURSU/17-255 AC A0A673UEX3.1
#=GS A0A5D8QD84_9THEO/1198-1458 AC A0A5D8QD84.1
#=GS A0A850W5Q3_FREMA/1-72 AC A0A850W5Q3.1
#=GS A0A7K5AQ07_9FURN/1-72 AC A0A7K5AQ07.1
#=GS A0A7K9EKM5_BARMA/1-49 AC A0A7K9EKM5.1
#=GS A0A7D9HPE5_PARCT/21-265 AC A0A7D9HPE5.1
#=GS A0A852HF12_9PASS/1-72 AC A0A852HF12.1
#=GS A0A090MRQ1_STRRB/14-256 AC A0A090MRQ1.1
#=GS A0A368F464_ANCCA/14-78 AC A0A368F464.1
#=GS A0A2P4SIL8_BAMTH/8-162 AC A0A2P4SIL8.1
#=GS A0A3Q7PCH7_CALUR/17-262 AC A0A3Q7PCH7.1
#=GS A0A093NEW3_PYGAD/8-253 AC A0A093NEW3.1
#=GS A0A2K6FL98_PROCO/9-238 AC A0A2K6FL98.1
#=GS A0A834N7R0_VESPE/16-248 AC A0A834N7R0.1
#=GS A0A8B7VCT4_CASCN/45-290 AC A0A8B7VCT4.1
#=GS A0AAE1NI14_9EUCA/21-264 AC A0AAE1NI14.1
#=GS A0A443SBT4_9ACAR/3-152 AC A0A443SBT4.1
#=GS A0A087UAB8_STEMI/19-75 AC A0A087UAB8.1
#=GS A0A3G9IKH8_9BACL/1584-1704 AC A0A3G9IKH8.1
#=GS A0A9W9ZTC4_9CNID/1-72 AC A0A9W9ZTC4.1
#=GS A0A099ZAE6_TINGU/1-224 AC A0A099ZAE6.1
#=GS A0A7L2BMU0_9PASS/1-72 AC A0A7L2BMU0.1
#=GS A0A3Q3T2G4_9TELE/8-252 AC A0A3Q3T2G4.2
#=GS V8PDI7_OPHHA/14-259 AC V8PDI7.1
#=GS A0AAE1BJ60_PETCI/23-266 AC A0AAE1BJ60.1
#=GS A0A833W2M2_9HYME/16-249 AC A0A833W2M2.1
#=GS A0A850V1X2_9CORV/8-253 AC A0A850V1X2.1
#=GS T1L0X8_TETUR/4-147 AC T1L0X8.2
#=GS A0A154P0D1_DUFNO/1-203 AC A0A154P0D1.1
#=GS A0A8T0ED48_ARGBR/1-136 AC A0A8T0ED48.1
#=GS L8HP62_9CETA/8-253 AC L8HP62.1
#=GS A0A2J8XW17_PONAB/8-253 AC A0A2J8XW17.1
#=GS A0A2K6NK08_RHIRO/8-253 AC A0A2K6NK08.1
#=GS A0A3P9BLD5_9CICH/8-252 AC A0A3P9BLD5.1
#=GS A0A7K9BHX4_DRONO/8-253 AC A0A7K9BHX4.1
#=GS A0A7L1BJ60_GYMTI/1-72 AC A0A7L1BJ60.1
#=GS A0A8C3SK88_CHESE/8-253 AC A0A8C3SK88.1
#=GS G3UPJ9_MELGA/151-357 AC G3UPJ9.2
#=GS A0A9J7CQ60_MUSDO/6-250 AC A0A9J7CQ60.1
#=GS A0A1S3J2K6_LINAN/16-257 AC A0A1S3J2K6.1
#=GS A0A1Y2AF34_9FUNG/63-221 AC A0A1Y2AF34.1
#=GS H2UMQ1_TAKRU/8-251 AC H2UMQ1.2
#=GS A0A9W9ZW02_9CNID/4-79 AC A0A9W9ZW02.1
#=GS A0A1D2MZ37_ORCCI/53-286 AC A0A1D2MZ37.1
#=GS A0A3R7NQ14_PENVA/17-260 AC A0A3R7NQ14.1
#=GS A0A4P9X515_9FUNG/1-251 AC A0A4P9X515.1
#=GS A0A7K5LSK9_VIRAL/1-72 AC A0A7K5LSK9.1
#=GS A0A7F8PZX4_LEPWE/17-262 AC A0A7F8PZX4.1
#=GS A0A8J2Q965_9BILA/30-269 AC A0A8J2Q965.1
#=GS A0A484DH14_PERFV/8-252 AC A0A484DH14.1
#=GS A0A852JPV9_SPIPA/1-72 AC A0A852JPV9.1
#=GS A0A6P4JGZ0_DROKI/6-252 AC A0A6P4JGZ0.1
#=GS A0A4U5LVP5_STECR/19-258 AC A0A4U5LVP5.1
#=GS A0A7L3KU48_9PASS/8-253 AC A0A7L3KU48.1
#=GS A0A7L1RP70_9PASS/1-72 AC A0A7L1RP70.1
#=GS A0A813G8B9_POLGL/2-257 AC A0A813G8B9.1
#=GS A0A671R108_9TELE/18-210 AC A0A671R108.1
#=GS A0A7K5MVF1_CARCD/1-72 AC A0A7K5MVF1.1
#=GS A0A8S1HG12_9PELO/21-266 AC A0A8S1HG12.1
#=GS A0A8C2VXJ1_CHILA/8-253 AC A0A8C2VXJ1.1
#=GS A0A0R3SDL1_HYMDI/14-149 AC A0A0R3SDL1.1
#=GS A0A6J0HVL2_9PASS/8-253 AC A0A6J0HVL2.1
#=GS A0A7K4UDH9_9SYLV/1-72 AC A0A7K4UDH9.1
#=GS A0A7K8RY25_9PASS/1-72 AC A0A7K8RY25.1
#=GS A0A8J2AIA6_9DINO/24-291 AC A0A8J2AIA6.1
#=GS A0A6P6IIL3_PUMCO/17-262 AC A0A6P6IIL3.1
#=GS A0A401RYT2_CHIPU/49-294 AC A0A401RYT2.1
#=GS A0A026W4H6_OOCBI/14-243 AC A0A026W4H6.1
#=GS H3DRG8_TETNG/1-119 AC H3DRG8.1
#=GS A0A7K8YS26_9PASS/1-72 AC A0A7K8YS26.1
#=GS A0A7K4KZ33_9AVES/8-253 AC A0A7K4KZ33.1
#=GS A0A4Z2IL73_9TELE/7-252 AC A0A4Z2IL73.1
#=GS A0AA36JLK4_9DINO/12-125 AC A0AA36JLK4.1
#=GS A0AA39G3Q2_MICHY/14-251 AC A0AA39G3Q2.1
#=GS A0A452CQ94_BALAS/1-77 AC A0A452CQ94.1
#=GS A0A7L0W7T6_ALELA/1-70 AC A0A7L0W7T6.1
#=GS A0A7L2R0K8_9PASS/1-72 AC A0A7L2R0K8.1
#=GS A0A6P8IUF2_ACTTE/19-263 AC A0A6P8IUF2.1
#=GS A0A7K4SE90_COLPI/1-72 AC A0A7K4SE90.1
#=GS H2YKM6_CIOSA/9-252 AC H2YKM6.1
#=GS T1KN82_TETUR/9-254 AC T1KN82.2
#=GS U6LU67_9EIME/177-356 AC U6LU67.1
#=GS A0A5J5DJJ3_9PERO/8-252 AC A0A5J5DJJ3.1
#=GS A0A0V0TDL2_9BILA/8-254 AC A0A0V0TDL2.1
#=GS A0A7L2PS84_9PASS/1-72 AC A0A7L2PS84.1
#=GS A0A811L786_9BILA/25-266 AC A0A811L786.1
#=GS A0A2U3X4H8_ODORO/17-262 AC A0A2U3X4H8.1
#=GS A0A084VMI8_ANOSI/5-249 AC A0A084VMI8.1
#=GS A0A1R2CZ67_9CILI/11-272 AC A0A1R2CZ67.1
#=GS A0A3P8VKE7_CYNSE/8-252 AC A0A3P8VKE7.1
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A0A913ZZH1_PATMI/58-302 .......................................................TIAFDVS.K.R....E......LF......S.P......Q......N.G.FKSLH...K....KL.R..S..S...W...K...I.............T.......S........Q.K...D.....E...I............T.ED..KL.A.....NV.KVFVLA...GPR..E.K.FTA...PE..................F.....EVIKRYL..E.S.G.GSVLVM..........M.......G...E.......G.G.....E...T...K....F......D...T.N......I.N.F........LLE..D..............Y....G..V.M.VN.N......................................D.SVV.......R.......T.....S.......Y...Y......K...Y..FHP....K....E.AL....I.A.N.G....V..L.N...........R.......A.I.S...............V.A.A.GK.VAH........S-....................ISED.EA...........................V.ND...A.............................KAL....TY..L.....F.....PF.GA.TLNV...........A......K..P....ATA...IL...ST......GTV.AFPLNRPICAL.H.SS............K..........Y.S.......................................KGKL.AVLGSVH......MFSDQYIDK.E.E..NAKI.....M.DVIFQWL...TT.D...SV.TLNAIDAD.......................................................................................................................................
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