GenomeNet

Database: Pfam
Entry: LDcluster4
LinkDB: LDcluster4
Original site: LDcluster4 
#=GF ID   LDcluster4
#=GF AC   PF18306.3
#=GF DE   SLOG cluster4 family
#=GF AU   Iyer LM;0000-0002-4844-2022
#=GF AU   Aravind L;0000-0003-0771-253X
#=GF AU   Burroughs AM;0000-0002-2229-8771
#=GF AU   El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE   Laks
#=GF GA   26.30 26.30;
#=GF TC   26.30 26.30;
#=GF NC   26.20 26.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0349
#=GF RN   [1]
#=GF RM   26590262
#=GF RT   Comparative genomic analyses reveal a vast, novel network of
#=GF RT   nucleotide-centric systems in biological conflicts, immunity and
#=GF RT   signaling.
#=GF RA   Burroughs AM, Zhang D, Schaffer DE, Iyer LM, Aravind L;
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2015;43:10633-10654.
#=GF DR   INTERPRO; IPR041164;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Family in the SLOG superfamily, observed as a standalone domain
#=GF CC   with little informative genome context, although related
#=GF CC   families in the SLOG superfamily are predicted to function in
#=GF CC   diverse conflict contexts [1].
#=GF SQ   1151
#=GS A0A0J6XSC3_9ACTN/147-203    AC A0A0J6XSC3.1
#=GS A0A239SM02_9BURK/7-185      AC A0A239SM02.1
#=GS A0A6I6SD52_9ACTN/161-219    AC A0A6I6SD52.1
#=GS A0A5S4ZPG5_9FIRM/3-153      AC A0A5S4ZPG5.1
#=GS A0A1G8G3L4_9MICO/148-206    AC A0A1G8G3L4.1
#=GS A0A6I1QNG7_9CHLR/1-156      AC A0A6I1QNG7.1
#=GS A0A6B0TA38_9EURY/1-145      AC A0A6B0TA38.1
#=GS A0A075K333_9GAMM/6-150      AC A0A075K333.1
#=GS A0A2G2YV72_CAPAN/11-96      AC A0A2G2YV72.1
#=GS A0A521DDD9_9BACT/1-146      AC A0A521DDD9.1
#=GS F8L6Y5_SIMNZ/2-176          AC F8L6Y5.1
#=GS A0A1H4Z6J7_9ACTN/151-209    AC A0A1H4Z6J7.1
#=GS D3S2C3_FERPA/2-147          AC D3S2C3.1
#=GS A0A561WRR2_ACTTI/169-226    AC A0A561WRR2.1
#=GS A0A1G9LM53_9FIRM/12-161     AC A0A1G9LM53.1
#=GS D9T5A0_MICAI/191-246        AC D9T5A0.1
#=GS A0A558NLZ4_9GAMM/7-164      AC A0A558NLZ4.1
#=GS A0A563D7X6_9BACT/2-171      AC A0A563D7X6.1
#=GS A0A087RNV3_9ARCH/3-159      AC A0A087RNV3.1
#=GS A0A2V2NBU5_9EURY/3-147      AC A0A2V2NBU5.1
#=GS K3ZAW5_SETIT/14-96          AC K3ZAW5.1
#=GS A0A2R6T4Q6_9ARCH/1-148      AC A0A2R6T4Q6.1
#=GS T0NG94_9EURY/3-148          AC T0NG94.1
#=GS A0A1C5HZW9_9ACTN/1-152      AC A0A1C5HZW9.1
#=GS K4LHW2_THEPS/10-160         AC K4LHW2.1
#=GS U1PBD2_9EURY/1-148          AC U1PBD2.1
#=GS B7KAB0_GLOC7/3-154          AC B7KAB0.1
#=GS A0A345NSC0_9MICO/1-148      AC A0A345NSC0.1
#=GS A0A2X4WWB3_9NOCA/7-151      AC A0A2X4WWB3.1
#=GS A0A365YTH7_9ACTN/7-154      AC A0A365YTH7.1
#=GS R4PJX9_9BACT/2-171          AC R4PJX9.1
#=GS C0GHM8_9FIRM/4-155          AC C0GHM8.1
#=GS A0A1G7D9U8_9ACTN/150-205    AC A0A1G7D9U8.1
#=GS A0A4U1HCN0_9DELT/53-204     AC A0A4U1HCN0.1
#=GS A0A4Q7LQ64_9BURK/15-158     AC A0A4Q7LQ64.1
#=GS A0A1D9F653_9MICC/40-101     AC A0A1D9F653.1
#=GS A0A0B5ETA9_STRA4/168-223    AC A0A0B5ETA9.1
#=GS A0A1U7MRC2_9MICO/13-161     AC A0A1U7MRC2.1
#=GS V6L4I9_9ACTN/162-217        AC V6L4I9.1
#=GS A0A1G9PJM5_9ACTN/10-129     AC A0A1G9PJM5.1
#=GS I4BZ69_ACEMN/8-153          AC I4BZ69.1
#=GS A0A1C5ITJ0_9ACTN/167-222    AC A0A1C5ITJ0.1
#=GS F6FPX0_ISOV2/2-152          AC F6FPX0.1
#=GS A0A151BTM4_9MICO/147-206    AC A0A151BTM4.1
#=GS A0A2W6PJ39_9ACTN/155-210    AC A0A2W6PJ39.1
#=GS A0A418SKY7_9RHOB/57-199     AC A0A418SKY7.1
#=GS A0A0S9NXQ0_9BURK/28-175     AC A0A0S9NXQ0.1
#=GS A0A1G9WAS5_9EURY/1-146      AC A0A1G9WAS5.1
#=GS A0A453H544_AEGTS/21-106     AC A0A453H544.1
#=GS A0A285VEJ7_9MICO/4-144      AC A0A285VEJ7.1
#=GS A0A1H6FUX6_THEAL/4-142      AC A0A1H6FUX6.1
#=GS A0A177HGS8_9ACTN/1-126      AC A0A177HGS8.1
#=GS A0A453CHS8_AEGTS/27-93      AC A0A453CHS8.1
#=GS T0XYG9_9BACT/8-174          AC T0XYG9.1
#=GS A0A3A6PT17_9EURY/1-147      AC A0A3A6PT17.1
#=GS G7WM75_METH6/1-144          AC G7WM75.1
#=GS T0LTP6_9EURY/8-154          AC T0LTP6.1
#=GS I0GX39_ACTM4/179-239        AC I0GX39.1
#=GS A0A699ZIC4_HAELA/33-135     AC A0A699ZIC4.1
#=GS C0QTX6_PERMH/1-144          AC C0QTX6.1
#=GS S7U626_DESML/12-161         AC S7U626.1
#=GS C5CGW3_KOSOT/1-163          AC C5CGW3.1
#=GS A0A2W2K5Y6_9ACTN/2-107      AC A0A2W2K5Y6.1
#=GS A0A447G3S8_9ARCH/4-158      AC A0A447G3S8.1
#=GS A0A1Q5ATZ1_9ACTN/1-105      AC A0A1Q5ATZ1.1
#=GS A0A4V3BYY6_9BRAD/61-208     AC A0A4V3BYY6.1
#=GS A0A5P0YR78_9ACTN/23-152     AC A0A5P0YR78.1
#=GS A0A370N9L3_9BURK/1-154      AC A0A370N9L3.1
#=GS D8J4C4_HALJB/1-145          AC D8J4C4.1
#=GS A0A1Q1FIP9_9EURY/1-146      AC A0A1Q1FIP9.1
#=GS A0A3N6EDC6_9ACTN/153-210    AC A0A3N6EDC6.1
#=GS A0A2N0FK50_9ACTN/19-153     AC A0A2N0FK50.1
#=GS A0A2G3A2P7_CAPAN/13-96      AC A0A2G3A2P7.1
#=GS C6A3N5_THESM/1-162          AC C6A3N5.1
#=GS F4B9C4_ACIHW/27-157         AC F4B9C4.1
#=GS K9Q599_9CYAN/4-156          AC K9Q599.1
#=GS A0A0K2AZ68_STRA7/158-216    AC A0A0K2AZ68.1
#=GS A0A0K1ECK3_CHOCO/3-152      AC A0A0K1ECK3.1
#=GS A0A1K0FKG8_9ACTN/1-111      AC A0A1K0FKG8.1
#=GS A0A432M5T9_9GAMM/7-159      AC A0A432M5T9.1
#=GS E1QDB0_DESB2/4-149          AC E1QDB0.1
#=GS A0A2T0S190_9ACTN/163-221    AC A0A2T0S190.1
#=GS A0A1V6MW19_9ACTN/155-210    AC A0A1V6MW19.1
#=GS N0BHD1_9EURY/1-145          AC N0BHD1.1
#=GS A0A2A2Z9V2_9ACTN/154-209    AC A0A2A2Z9V2.1
#=GS A0A428XAP3_9ACTN/2-156      AC A0A428XAP3.1
#=GS A5KSA5_9BACT/3-169          AC A5KSA5.1
#=GS A0A372G132_9ACTN/174-229    AC A0A372G132.1
#=GS A0A0S9NXM6_9BURK/1-148      AC A0A0S9NXM6.1
#=GS A0A2P8AVV2_9ACTN/167-222    AC A0A2P8AVV2.1
#=GS A0A510DRZ6_9CREN/1-159      AC A0A510DRZ6.1
#=GS A0A3N1LYI3_9PROT/60-205     AC A0A3N1LYI3.1
#=GS A0A1G8X634_9EURY/1-148      AC A0A1G8X634.1
#=GS A0A6I5X9Q5_9MICO/162-217    AC A0A6I5X9Q5.1
#=GS A0A261KU24_9CYAN/55-211     AC A0A261KU24.1
#=GS L0K6G2_9EURY/1-146          AC L0K6G2.1
#=GS A9G0V0_SORC5/1558-1697      AC A9G0V0.1
#=GS A0A5N0TE39_9MICO/3-164      AC A0A5N0TE39.1
#=GS A0A4P1R0Z8_LUPAN/7-92       AC A0A4P1R0Z8.1
#=GS A0A3N4ZA37_9MICO/5-167      AC A0A3N4ZA37.1
#=GS A0A1C5HRP3_9ACTN/168-223    AC A0A1C5HRP3.1
#=GS V4HGB0_9EURY/1-146          AC V4HGB0.1
#=GS A0A3N2P440_9ACTN/1-127      AC A0A3N2P440.1
#=GS A0A2N0J867_9ACTN/19-164     AC A0A2N0J867.1
#=GS A0A495XYG0_9MICO/172-229    AC A0A495XYG0.1
#=GS A0A0U3FHP6_9CREN/3-150      AC A0A0U3FHP6.1
#=GS A0A5A8D4N5_CAFRO/14-138     AC A0A5A8D4N5.1
#=GS E6SEX9_INTC7/141-200        AC E6SEX9.1
#=GS A0A1V1P3G1_9DELT/15-163     AC A0A1V1P3G1.1
#=GS A0A268U4F9_9HELI/1-161      AC A0A268U4F9.1
#=GS A0A0V7ZNZ0_9CYAN/3-154      AC A0A0V7ZNZ0.1
#=GS A0A1Q9TAM0_9PSEU/1-113      AC A0A1Q9TAM0.1
#=GS A0A1R4EYP0_9MICO/149-206    AC A0A1R4EYP0.1
#=GS A0A6I4NEY4_9ACTN/162-217    AC A0A6I4NEY4.1
#=GS A0A0D0V709_9ACTN/181-239    AC A0A0D0V709.1
#=GS A0A4U8U7V1_9HELI/2-166      AC A0A4U8U7V1.1
#=GS A0A0U1KVX6_9FIRM/1-161      AC A0A0U1KVX6.1
#=GS A0A6A9T894_9EURY/1-147      AC A0A6A9T894.1
#=GS A0A3E2YRQ4_9ACTN/168-224    AC A0A3E2YRQ4.1
#=GS A0A650A6E9_9EURY/1-147      AC A0A650A6E9.1
#=GS A0A2P6U669_9ACTN/2-150      AC A0A2P6U669.1
#=GS A0A0F5YJ00_9CYAN/3-154      AC A0A0F5YJ00.1
#=GS A0A1H3VP14_9EURY/1-147      AC A0A1H3VP14.1
#=GS Q0W6K2_METAR/59-221         AC Q0W6K2.1
#=GS A0A365H836_9ACTN/2-150      AC A0A365H836.1
#=GS A0A494V6G1_9ACTN/154-213    AC A0A494V6G1.1
#=GS A0A561B0W8_9ACTN/157-217    AC A0A561B0W8.1
#=GS A0A1N7DIZ0_9NOCA/9-156      AC A0A1N7DIZ0.1
#=GS A4YF25_METS5/1-159          AC A4YF25.1
#=GS D8G790_9CYAN/1-176          AC D8G790.1
#=GS F4XP93_9CYAN/3-154          AC F4XP93.1
#=GS C7DH06_MICA2/4-167          AC C7DH06.1
#=GS A0A1H9VRT0_9PSEU/147-206    AC A0A1H9VRT0.1
#=GS A0A542QN95_9ACTN/151-206    AC A0A542QN95.1
#=GS A0A1K2FN32_9ACTN/155-210    AC A0A1K2FN32.1
#=GS A0A444FAS5_ENSVE/20-150     AC A0A444FAS5.1
#=GS A0A5C7HLN5_9ROSI/447-515    AC A0A5C7HLN5.1
#=GS A0A170PDH2_9CHLR/3-151      AC A0A170PDH2.2
#=GS S5ZC70_9CREN/1-161          AC S5ZC70.1
#=GS F5UB13_9CYAN/3-154          AC F5UB13.1
#=GS A0A143B7C9_9DELT/7-154      AC A0A143B7C9.1
#=GS W0JUD4_9EURY/1-146          AC W0JUD4.1
#=GS A0A1H1B833_9MICC/169-227    AC A0A1H1B833.1
#=GS A0A444J7G2_9DELT/49-106     AC A0A444J7G2.1
#=GS A0A0X3W6R6_9ACTN/158-213    AC A0A0X3W6R6.1
#=GS A0A1Z4S8L3_9NOSO/3-154      AC A0A1Z4S8L3.1
#=GS A0A285VM39_9MICO/181-240    AC A0A285VM39.1
#=GS A0A367Q3V0_9NOSO/3-154      AC A0A367Q3V0.1
#=GS A0A4Q7ZNN7_9ACTN/2-153      AC A0A4Q7ZNN7.1
#=GS A0A444BNR4_9MICO/144-201    AC A0A444BNR4.1
#=GS A0A3N4UF96_9ACTN/154-209    AC A0A3N4UF96.1
#=GS A0A1T5IPN1_9BACT/1-146      AC A0A1T5IPN1.1
#=GS A0A2A3GYU1_9ACTN/152-207    AC A0A2A3GYU1.1
#=GS A0A2U0H3X5_9MICO/11-147     AC A0A2U0H3X5.1
#=GS A0A1G6IBZ8_9ACTN/7-152      AC A0A1G6IBZ8.1
#=GS W4U3R8_CUTAC/15-69          AC W4U3R8.1
#=GS T2GBN4_DESGG/1-145          AC T2GBN4.1
#=GS Q6KYW1_PICTO/3-148          AC Q6KYW1.1
#=GS A0A101QSD7_9ACTN/152-207    AC A0A101QSD7.1
#=GS A0A0A0JMA4_9MICO/131-190    AC A0A0A0JMA4.1
#=GS Q2J8X2_FRACC/33-152         AC Q2J8X2.1
#=GS A0A504ET51_9RHIZ/156-212    AC A0A504ET51.1
#=GS A0A5E4F5E4_PRUDU/5-119      AC A0A5E4F5E4.1
#=GS A0A6B2U5G3_9ACTN/176-230    AC A0A6B2U5G3.1
#=GS A0A120D5Y7_9BACT/1-145      AC A0A120D5Y7.1
#=GS D5C2G8_NITHN/53-220         AC D5C2G8.1
#=GS A0A1G7ANH8_9PROT/59-205     AC A0A1G7ANH8.1
#=GS A0A1G7W3W7_9ACTN/2-150      AC A0A1G7W3W7.1
#=GS E1TJK4_BURSG/1-171          AC E1TJK4.1
#=GS A0A0F0H9Q2_9ACTN/155-210    AC A0A0F0H9Q2.1
#=GS A6LK78_THEM4/1-158          AC A6LK78.1
#=GS M1Z041_NITG3/5-175          AC M1Z041.1
#=GS B4VWC6_9CYAN/3-133          AC B4VWC6.1
#=GS A0A126P4E6_9BRAD/1-144      AC A0A126P4E6.1
#=GS A0A2K3NJ33_TRIPR/19-90      AC A0A2K3NJ33.1
#=GS A0A2S4Z2P5_9ACTN/155-210    AC A0A2S4Z2P5.1
#=GS A0A1E3XDZ2_9BACT/4-162      AC A0A1E3XDZ2.1
#=GS A0A2H5ZZ50_9BACT/4-158      AC A0A2H5ZZ50.1
#=GS A0A3A9ZIN9_9ACTN/15-155     AC A0A3A9ZIN9.1
#=GS A0A075WRA0_9BACT/5-149      AC A0A075WRA0.1
#=GS A0A4R4R6S1_9ACTN/2-150      AC A0A4R4R6S1.1
#=GS A0A1E5QDU2_9CYAN/3-154      AC A0A1E5QDU2.1
#=GS A0A0Q0XM04_9EURY/3-148      AC A0A0Q0XM04.1
#=GS A0A1M4Y6G9_STRHI/2-160      AC A0A1M4Y6G9.1
#=GS K9QVZ8_NOSS7/3-154          AC K9QVZ8.1
#=GS B8FN71_DESAL/1-150          AC B8FN71.1
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#=GS A0A1G6MA48_9BACT/2-164      AC A0A1G6MA48.1
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