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Database: Pfam
Entry: MMS19_C
LinkDB: MMS19_C
Original site: MMS19_C 
#=GF ID   MMS19_C
#=GF AC   PF12460.11
#=GF DE   RNAPII transcription regulator C-terminal
#=GF PI   MMS19_N;
#=GF AU   Gavin OL;
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Prosite
#=GF GA   32.90 32.90;
#=GF TC   32.90 32.90;
#=GF NC   32.80 32.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Repeat
#=GF CL   CL0020
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11328871
#=GF RT   Cloning the human and mouse MMS19 genes and functional
#=GF RT   complementation of a yeast mms19 deletion mutant.
#=GF RA   Queimado L, Rao M, Schultz RA, Koonin EV, Aravind L, Nardo T,
#=GF RA   Stefanini M, Friedberg EC;
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2001;29:1884-1891.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   21725325
#=GF RT   Coordination of DNA replication and histone modification by the
#=GF RT   Rik1-Dos2 complex.
#=GF RA   Li F, Martienssen R, Cande WZ;
#=GF RL   Nature. 2011;475:244-248.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   32632277
#=GF RT   Structural insights into Fe-S protein biogenesis by the CIA
#=GF RT   targeting complex.
#=GF RA   Kassube SA, Thoma NH;
#=GF RL   Nat Struct Mol Biol. 2020;27:735-742.
#=GF DR   INTERPRO; IPR024687;
#=GF DR   SO; 0001068; polypeptide_repeat;
#=GF CC   MMS19 is required for both nucleotide excision repair (NER) and
#=GF CC   RNA polymerase II (RNAP II) transcription [1]. This C-terminal
#=GF CC   domain, along with the N-terminal, MMS19_N, form part of a
#=GF CC   silencing complex in fission yeast that contains Dos2, Rik1,
#=GF CC   Mms19 and Cdc20 (the catalytic subunit of DNA
#=GF CC   polymerase-epsilon). This complex regulates RNA polymerase II
#=GF CC   (RNA Pol II) activity in heterochromatin and is required for DNA
#=GF CC   replication and heterochromatin assembly [2]. This domain has a
#=GF CC   HEAT-like repeat structure [3].
#=GF SQ   2105
#=GS A0A067E9C9_CITSI/573-1053   AC A0A067E9C9.1
#=GS Q7SGF8_NEUCR/722-1119       AC Q7SGF8.3
#=GS A0A4U0WIW2_9PEZI/405-536    AC A0A4U0WIW2.1
#=GS A0A2Y9J3F3_ENHLU/555-982    AC A0A2Y9J3F3.1
#=GS A0A507CMD8_9FUNG/542-994    AC A0A507CMD8.1
#=GS A0A6J5WMK1_PRUAR/642-1116   AC A0A6J5WMK1.1
#=GS A0A5F5PL86_HORSE/512-939    AC A0A5F5PL86.1
#=GS A0A1Q5T0V8_9EURO/446-568    AC A0A1Q5T0V8.1
#=GS A0A7N4P9W1_SARHA/553-979    AC A0A7N4P9W1.1
#=GS M5FVV8_DACPD/443-571        AC M5FVV8.1
#=GS A0A674AQV2_SALTR/521-951    AC A0A674AQV2.1
#=GS A0A2I0W2H5_9ASPA/622-1100   AC A0A2I0W2H5.1
#=GS A0A4U5VNT3_COLLU/544-930    AC A0A4U5VNT3.1
#=GS A0A1E3Q3A7_LIPST/557-992    AC A0A1E3Q3A7.1
#=GS A0A6A3QXW6_9STRA/631-1099   AC A0A6A3QXW6.1
#=GS A0A2R6QK38_ACTCC/680-1104   AC A0A2R6QK38.1
#=GS A0A3Q7GKU6_SOLLC/653-1090   AC A0A3Q7GKU6.1
#=GS A0A2J7QSJ7_9NEOP/545-763    AC A0A2J7QSJ7.1
#=GS A0A340X8D1_LIPVE/299-726    AC A0A340X8D1.1
#=GS Q0U7R7_PHANO/443-566        AC Q0U7R7.2
#=GS A0A024TNW2_9STRA/583-1019   AC A0A024TNW2.1
#=GS G0RQC8_HYPJQ/741-1107       AC G0RQC8.1
#=GS A0A166HZ94_9AGAM/487-942    AC A0A166HZ94.1
#=GS A0A1G4BB61_9PEZI/450-569    AC A0A1G4BB61.1
#=GS A0A3B6RRB4_WHEAT/627-968    AC A0A3B6RRB4.1
#=GS A0A443NVQ0_9MAGN/630-1111   AC A0A443NVQ0.1
#=GS A0A670HXH5_PODMU/542-972    AC A0A670HXH5.1
#=GS A0A395H6L6_9EURO/545-997    AC A0A395H6L6.1
#=GS C5DMI2_LACTC/571-969        AC C5DMI2.1
#=GS A0A167IVT2_METRR/445-567    AC A0A167IVT2.1
#=GS C4Y2M7_CLAL4/543-963        AC C4Y2M7.1
#=GS A0A674AQH5_SALTR/594-855    AC A0A674AQH5.1
#=GS A0A0J8RYV8_COCIT/543-996    AC A0A0J8RYV8.1
#=GS W2ZK36_PHYPR/631-1093       AC W2ZK36.1
#=GS A0A0E0LHR7_ORYPU/633-1091   AC A0A0E0LHR7.1
#=GS A0A2K6AI43_MANLE/555-982    AC A0A2K6AI43.1
#=GS A0A2V1BK17_9HELO/444-567    AC A0A2V1BK17.1
#=GS A0A2Y9HWD4_NEOSC/554-981    AC A0A2Y9HWD4.1
#=GS A0A2N1JEH9_9BASI/605-1057   AC A0A2N1JEH9.1
#=GS A0A6I8SD13_XENTR/573-1000   AC A0A6I8SD13.2
#=GS A0A2U9CN16_SCOMX/551-983    AC A0A2U9CN16.1
#=GS A0A1Y1UJ33_9TREE/539-1010   AC A0A1Y1UJ33.1
#=GS H2ZLN5_CIOSA/499-929        AC H2ZLN5.1
#=GS A0A2I3RC98_PANTR/512-939    AC A0A2I3RC98.1
#=GS A0A674AQN9_SALTR/547-977    AC A0A674AQN9.1
#=GS A0A507E2V0_9FUNG/537-1004   AC A0A507E2V0.1
#=GS A0A3E2HMT7_SCYLI/586-1061   AC A0A3E2HMT7.1
#=GS A0A1L0DD12_9ASCO/593-1014   AC A0A1L0DD12.1
#=GS A0A060WQA0_ONCMY/547-977    AC A0A060WQA0.1
#=GS A0A2K5I694_COLAP/555-982    AC A0A2K5I694.1
#=GS A0A4W4E520_ELEEL/550-979    AC A0A4W4E520.1
#=GS H9JNE1_BOMMO/446-873        AC H9JNE1.1
#=GS J8Q146_SACAR/577-981        AC J8Q146.1
#=GS F4Q2R9_CAVFA/610-1065       AC F4Q2R9.1
#=GS A0A2T4GNU0_FUSCU/701-1090   AC A0A2T4GNU0.1
#=GS A0A093XXH6_9PEZI/447-568    AC A0A093XXH6.1
#=GS A0A316ZBV3_9BASI/654-1134   AC A0A316ZBV3.1
#=GS A0A369RXA7_9METZ/562-989    AC A0A369RXA7.1
#=GS A0A2R9CNW5_PANPA/457-884    AC A0A2R9CNW5.1
#=GS A0A4W3IBQ0_CALMI/564-739    AC A0A4W3IBQ0.1
#=GS A0A673GQF2_9TELE/390-725    AC A0A673GQF2.1
#=GS A0A1G4J595_9SACH/568-967    AC A0A1G4J595.1
#=GS A0A4S8LCB7_DENBC/541-987    AC A0A4S8LCB7.1
#=GS A0A3P8XJ71_ESOLU/513-718    AC A0A3P8XJ71.2
#=GS A0A2I0LJT4_COLLI/512-932    AC A0A2I0LJT4.1
#=GS A0A1X2I1T3_9FUNG/538-895    AC A0A1X2I1T3.1
#=GS A0A7H9HRH2_9SACH/565-964    AC A0A7H9HRH2.1
#=GS MMS19_DICDI/621-1069        AC Q54J88.2
#=GS E3RHZ9_PYRTT/550-981        AC E3RHZ9.1
#=GS A0A674I447_TERCA/464-885    AC A0A674I447.1
#=GS A0A0D2PIB6_HYPSF/519-971    AC A0A0D2PIB6.1
#=GS A0A4Z2F7J2_9TELE/1-329      AC A0A4Z2F7J2.1
#=GS A0A091DX52_FUKDA/557-965    AC A0A091DX52.1
#=GS A0A0D2K9S1_9EURO/552-1001   AC A0A0D2K9S1.1
#=GS A0A4U5QW44_POPAL/628-1104   AC A0A4U5QW44.1
#=GS A0A0L1J095_ASPNO/898-968    AC A0A0L1J095.1
#=GS A0A6J0BHD7_NEOLC/525-911    AC A0A6J0BHD7.1
#=GS U4TY21_DENPD/575-865        AC U4TY21.1
#=GS A0A1X0RXB8_RHIZD/547-897    AC A0A1X0RXB8.1
#=GS A0A420HDD5_9PEZI/438-567    AC A0A420HDD5.1
#=GS A0A2I0T9C5_LIMLA/346-617    AC A0A2I0T9C5.1
#=GS A0A5F5PU70_HORSE/457-884    AC A0A5F5PU70.1
#=GS A0A0D2UJH7_GOSRA/562-1054   AC A0A0D2UJH7.1
#=GS A0A668U2U3_OREAU/549-981    AC A0A668U2U3.1
#=GS A0A061HRD9_BLUGR/546-1028   AC A0A061HRD9.1
#=GS A0A2G7G5X9_9EURO/545-992    AC A0A2G7G5X9.1
#=GS A0A384AJF8_BALAS/555-982    AC A0A384AJF8.1
#=GS H3BBP1_LATCH/578-873        AC H3BBP1.1
#=GS K8YR67_NANGC/1-273          AC K8YR67.1
#=GS A0A0D2BUF4_9EURO/395-844    AC A0A0D2BUF4.1
#=GS A0A0G2EWG9_9EURO/530-963    AC A0A0G2EWG9.1
#=GS A0A1D1W5Z7_RAMVA/570-979    AC A0A1D1W5Z7.1
#=GS G9PA32_HYPAI/448-567        AC G9PA32.1
#=GS V5FWV1_BYSSN/545-988        AC V5FWV1.1
#=GS C1H1N9_PARBA/543-1018       AC C1H1N9.2
#=GS A0A402E5U4_9SAUR/524-954    AC A0A402E5U4.1
#=GS A0A2J6QKK0_9HELO/597-1069   AC A0A2J6QKK0.1
#=GS V9FFY6_PHYPR/631-1093       AC V9FFY6.1
#=GS K2R3L9_MACPH/387-570        AC K2R3L9.1
#=GS A0A1L9SK81_9EURO/446-568    AC A0A1L9SK81.1
#=GS A0A6I8RKS7_XENTR/629-1056   AC A0A6I8RKS7.2
#=GS A0A151ZH41_9MYCE/553-976    AC A0A151ZH41.1
#=GS A0A6J3Q6A9_TURTR/554-914    AC A0A6J3Q6A9.1
#=GS A0A446YVY3_TRITD/610-1060   AC A0A446YVY3.1
#=GS E2RRC2_CANLF/554-981        AC E2RRC2.2
#=GS A0A5N4DHZ5_CAMDR/537-964    AC A0A5N4DHZ5.1
#=GS A0A439DG85_9PEZI/711-1125   AC A0A439DG85.1
#=GS A0A2K6ETQ7_PROCO/555-982    AC A0A2K6ETQ7.1
#=GS B2WDL7_PYRTR/550-978        AC B2WDL7.1
#=GS A6QZL1_AJECN/490-651        AC A6QZL1.1
#=GS A0A0D2GJN1_9EURO/448-570    AC A0A0D2GJN1.1
#=GS C5M9K7_CANTT/595-1019       AC C5M9K7.1
#=GS A0A6A4MSN8_9ERIC/736-1154   AC A0A6A4MSN8.1
#=GS A0A6P7L822_BETSP/550-988    AC A0A6P7L822.1
#=GS D2VAU3_NAEGR/586-1022       AC D2VAU3.1
#=GS A0A1U7LUZ1_NEOID/571-683    AC A0A1U7LUZ1.1
#=GS Q5KH84_CRYNJ/534-992        AC Q5KH84.1
#=GS A0A179I0V1_PURLI/732-1111   AC A0A179I0V1.1
#=GS A0A1S3AC79_ERIEU/555-982    AC A0A1S3AC79.1
#=GS A0A0D7B3N6_9AGAR/537-987    AC A0A0D7B3N6.1
#=GS G4N7Q6_MAGO7/445-568        AC G4N7Q6.1
#=GS A0A2T3YZG5_9HYPO/446-567    AC A0A2T3YZG5.1
#=GS A0A0D1XY37_9PEZI/557-972    AC A0A0D1XY37.1
#=GS A0A1J9RET9_9EURO/446-568    AC A0A1J9RET9.1
#=GS J9JVN1_ACYPI/529-937        AC J9JVN1.2
#=GS A0A2K3PHG9_TRIPR/5-362      AC A0A2K3PHG9.1
#=GS A0A6I8V3G7_DROPS/542-913    AC A0A6I8V3G7.1
#=GS E2BRK3_HARSA/1-212          AC E2BRK3.1
#=GS S2KFI9_MUCC1/557-984        AC S2KFI9.1
#=GS A0A316UIQ8_9BASI/660-1124   AC A0A316UIQ8.1
#=GS W9XFL8_9EURO/448-570        AC W9XFL8.1
#=GS A0A267DUR9_9PLAT/560-938    AC A0A267DUR9.1
#=GS B8MQJ8_TALSN/545-1006       AC B8MQJ8.1
#=GS A0A1Y1XE61_9FUNG/532-961    AC A0A1Y1XE61.1
#=GS M0R6T4_RAT/556-983          AC M0R6T4.1
#=GS A0A1S8BID1_9PEZI/2-265      AC A0A1S8BID1.1
#=GS A0A1J9RE94_9PEZI/555-992    AC A0A1J9RE94.1
#=GS A0A2I2ZB72_GORGO/457-884    AC A0A2I2ZB72.1
#=GS A0A395SHH6_9HYPO/448-567    AC A0A395SHH6.1
#=GS A0A225AC18_9EURO/545-987    AC A0A225AC18.1
#=GS G1STS3_RABIT/555-982        AC G1STS3.2
#=GS S8B0A8_PENO1/446-568        AC S8B0A8.1
#=GS A0A384CZD2_URSMA/533-960    AC A0A384CZD2.1
#=GS A0A3N4L7F4_9PEZI/548-988    AC A0A3N4L7F4.1
#=GS A0A3D8SDC7_9HELO/774-1106   AC A0A3D8SDC7.1
#=GS A0A674I1T9_TERCA/525-936    AC A0A674I1T9.1
#=GS A0A446YW08_TRITD/618-1077   AC A0A446YW08.1
#=GS A0A0G4MMI9_9PEZI/748-1185   AC A0A0G4MMI9.1
#=GS N1JF06_BLUG1/418-550        AC N1JF06.1
#=GS A0A287XTK0_HORVV/2-328      AC A0A287XTK0.1
#=GS A0A165EKY9_9APHY/552-1013   AC A0A165EKY9.1
#=GS A0A1C7ND66_9FUNG/565-989    AC A0A1C7ND66.1
#=GS A0A5N5NBB1_9ROSI/744-1071   AC A0A5N5NBB1.1
#=GS A0A446XWM0_TRITD/627-1073   AC A0A446XWM0.1
#=GS W2RM37_9EURO/361-793        AC W2RM37.1
#=GS A0A068S8C7_9FUNG/543-985    AC A0A068S8C7.1
#=GS A0A6P8HNP9_ACTTE/209-640    AC A0A6P8HNP9.1
#=GS D0NXI8_PHYIT/659-1105       AC D0NXI8.1
#=GS A0A0D2JZL6_9EURO/448-570    AC A0A0D2JZL6.1
#=GS A0A2K6ETP3_PROCO/457-884    AC A0A2K6ETP3.1
#=GS A0A3Q7W4I7_URSAR/554-981    AC A0A3Q7W4I7.1
#=GS A0A3Q7PRT9_CALUR/418-845    AC A0A3Q7PRT9.1
#=GS A0A5N7D4K7_9EURO/446-568    AC A0A5N7D4K7.1
#=GS A0A091LE59_CATAU/496-912    AC A0A091LE59.1
#=GS A0A6A5BLA9_NAEFO/711-1062   AC A0A6A5BLA9.1
#=GS A0A3B6SN75_WHEAT/624-968    AC A0A3B6SN75.1
#=GS A0A072PUG3_9EURO/392-845    AC A0A072PUG3.1
#=GS A0A4U0WNL5_9PEZI/444-575    AC A0A4U0WNL5.1
#=GS A0A0N1IDI7_PAPMA/488-850    AC A0A0N1IDI7.1
#=GS A0A2D3V4C8_9PEZI/543-953    AC A0A2D3V4C8.1
#=GS F0ZCI4_DICPU/541-987        AC F0ZCI4.1
#=GS A0A2K6LL50_RHIBE/512-939    AC A0A2K6LL50.1
#=GS A0A6G0YCX9_APHCR/490-939    AC A0A6G0YCX9.1
#=GS A0A446XWP0_TRITD/625-992    AC A0A446XWP0.1
#=GS A0A1B8AFE5_FUSPO/449-567    AC A0A1B8AFE5.1
#=GS A0A433C7Q8_9FUNG/8-80       AC A0A433C7Q8.1
#=GS A0A4X2LBR8_VOMUR/456-882    AC A0A4X2LBR8.1
#=GS B6Q825_TALMQ/449-568        AC B6Q825.1
#=GS A0A1E4TH03_9ASCO/519-919    AC A0A1E4TH03.1
#=GS A0A1E3IRP7_9TREE/557-1010   AC A0A1E3IRP7.1
#=GS F2U9A6_SALR5/473-945        AC F2U9A6.1
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