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Database: Pfam
Entry: Med4
LinkDB: Med4
Original site: Med4 
#=GF ID   Med4
#=GF AC   PF10018.12
#=GF DE   Vitamin-D-receptor interacting Mediator subunit 4
#=GF PI   VDRIP; 
#=GF AU   KOGs;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF SE   KOGs (KOG4552)
#=GF GA   26.30 26.30;
#=GF TC   26.30 26.30;
#=GF NC   26.20 26.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   MED4
#=GF WK   Mediator_(coactivator)
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10235266
#=GF RT   Ligand-dependent transcription activation by nuclear receptors
#=GF RT   requires the DRIP complex. 
#=GF RA   Rachez C, Lemon BD, Suldan Z, Bromleigh V, Gamble M, Naar AM,
#=GF RA   Erdjument-Bromage H, Tempst P, Freedman LP; 
#=GF RL   Nature. 1999;398:824-828.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10235267
#=GF RT   Composite co-activator ARC mediates chromatin-directed
#=GF RT   transcriptional activation. 
#=GF RA   Naar AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R; 
#=GF RL   Nature. 1999;398:828-832.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   15175151
#=GF RT   A unified nomenclature for protein subunits of mediator
#=GF RT   complexes linking transcriptional regulators to RNA polymerase
#=GF RT   II. 
#=GF RA   Bourbon HM, Aguilera A, Ansari AZ, Asturias FJ, Berk AJ,
#=GF RA   Bjorklund S, Blackwell TK, Borggrefe T, Carey M, Carlson M,
#=GF RA   Conaway JW, Conaway RC, Emmons SW, Fondell JD, Freedman LP,
#=GF RA   Fukasawa T, Gustafsson CM, Han M, He X, Herman PK, Hinnebusch
#=GF RA   AG, Holmberg S, 
#=GF RL   Mol Cell. 2004;14:553-557.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019258;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Members of this family function as part of the Mediator (Med)
#=GF CC   complex, which links DNA-bound transcriptional regulators and
#=GF CC   the general transcription machinery, particularly the RNA
#=GF CC   polymerase II enzyme. They play a role in basal transcription by
#=GF CC   mediating activation or repression according to the specific
#=GF CC   complement of transcriptional regulators bound to the promoter
#=GF CC   [1][2].
#=GF SQ   1510
#=GS A0A2U3YAS5_LEPWE/63-206     AC A0A2U3YAS5.1
#=GS A0A4D9EC30_9SAUR/55-198     AC A0A4D9EC30.1
#=GS A0A286ZZ81_PIG/64-207       AC A0A286ZZ81.1
#=GS A0A1A5ZU72_9TREE/66-236     AC A0A1A5ZU72.1
#=GS A0A6A3CNM1_HIBSY/122-303    AC A0A6A3CNM1.1
#=GS A0A4Q4VG39_9PEZI/30-345     AC A0A4Q4VG39.1
#=GS A0A1L9NPN4_ASPTC/33-279     AC A0A1L9NPN4.1
#=GS A0A5N6U2U4_9EURO/33-266     AC A0A5N6U2U4.1
#=GS A0A369JNT8_HYPMA/59-230     AC A0A369JNT8.1
#=GS A0A446TBA3_TRITD/128-316    AC A0A446TBA3.1
#=GS A0A2B7ZTT8_9EURO/33-312     AC A0A2B7ZTT8.1
#=GS A0A1V8V343_9PEZI/30-259     AC A0A1V8V343.1
#=GS A0A7D8UPX1_9HELO/30-284     AC A0A7D8UPX1.1
#=GS I2FP56_USTH4/67-295         AC I2FP56.1
#=GS K5VVR5_PHACS/64-245         AC K5VVR5.1
#=GS A0A194UWA0_9PEZI/30-275     AC A0A194UWA0.1
#=GS A0A5A9P3M0_9TELE/51-194     AC A0A5A9P3M0.1
#=GS A0A2X0M772_9BASI/62-269     AC A0A2X0M772.1
#=GS E9GLB6_DAPPU/43-193         AC E9GLB6.1
#=GS T0RJW7_SAPDV/47-221         AC T0RJW7.1
#=GS MED4_XENTR/45-188           AC Q5M8Y7.1
#=GS A0A4Q4WP75_9PEZI/30-327     AC A0A4Q4WP75.1
#=GS W9IPH2_FUSOX/31-332         AC W9IPH2.1
#=GS A0A0L0VBI0_9BASI/57-240     AC A0A0L0VBI0.1
#=GS A0A1W0WE28_HYPDU/76-281     AC A0A1W0WE28.1
#=GS A0A287EDW2_HORVV/129-317    AC A0A287EDW2.1
#=GS A0A2S4PSX1_9PEZI/30-288     AC A0A2S4PSX1.1
#=GS A0A556UZ80_BAGYA/44-184     AC A0A556UZ80.1
#=GS A0A024GRI1_9STRA/731-895    AC A0A024GRI1.1
#=GS A0A656KN25_BLUGR/30-274     AC A0A656KN25.1
#=GS A0A151IUW1_9HYME/19-158     AC A0A151IUW1.1
#=GS W9XB76_9EURO/33-291         AC W9XB76.1
#=GS A0A6P4ZL51_BRABE/47-214     AC A0A6P4ZL51.1
#=GS A0A2P7YCQ3_9ASCO/109-297    AC A0A2P7YCQ3.1
#=GS A0A444EAU9_ENSVE/129-311    AC A0A444EAU9.1
#=GS H9JA17_BOMMO/43-185         AC H9JA17.1
#=GS A0A6G1GFP2_9PEZI/30-277     AC A0A6G1GFP2.1
#=GS A0A2A4JPG8_HELVI/43-186     AC A0A2A4JPG8.1
#=GS A0A2P6N1Z4_9EUKA/36-169     AC A0A2P6N1Z4.1
#=GS A0A1B9HZG6_9TREE/80-248     AC A0A1B9HZG6.1
#=GS A0A067TBK4_GALM3/35-195     AC A0A067TBK4.1
#=GS A0A1S3PPY0_SALSA/45-187     AC A0A1S3PPY0.1
#=GS A0A1E4SKX9_9ASCO/103-276    AC A0A1E4SKX9.1
#=GS N1PIN1_DOTSN/30-257         AC N1PIN1.1
#=GS A0A0N4TU69_BRUPA/40-215     AC A0A0N4TU69.1
#=GS A0A091KWQ9_COLST/22-165     AC A0A091KWQ9.1
#=GS A0A1L8H9E6_XENLA/45-188     AC A0A1L8H9E6.1
#=GS A0A094GPH8_9PEZI/30-265     AC A0A094GPH8.1
#=GS A0A3M2TAV6_9EURO/33-270     AC A0A3M2TAV6.1
#=GS A0A4X2M357_VOMUR/64-207     AC A0A4X2M357.1
#=GS A0A1V6Y9B4_PENNA/33-278     AC A0A1V6Y9B4.1
#=GS A0A2K0VZW5_GIBNY/31-332     AC A0A2K0VZW5.1
#=GS A0A1E3IPK2_9TREE/55-227     AC A0A1E3IPK2.1
#=GS A0A397TVU4_9GLOM/51-237     AC A0A397TVU4.1
#=GS A0A6P3F9D5_OCTDE/63-206     AC A0A6P3F9D5.1
#=GS B9IIY8_POPTR/121-299        AC B9IIY8.1
#=GS A0A2A9PLZ8_9HYPO/30-300     AC A0A2A9PLZ8.1
#=GS A0A0D3AZH3_BRAOL/6-144      AC A0A0D3AZH3.1
#=GS A0A2C5ZC28_9HYPO/30-302     AC A0A2C5ZC28.1
#=GS A0A0S7DEX6_9EURO/33-295     AC A0A0S7DEX6.1
#=GS A0A4V3S9N1_OPIFE/1-86       AC A0A4V3S9N1.1
#=GS A0A5C3QP10_9AGAR/35-211     AC A0A5C3QP10.1
#=GS A0A2G5V5B5_9PELO/47-245     AC A0A2G5V5B5.1
#=GS A0A2A2JUG2_9BILA/1-147      AC A0A2A2JUG2.1
#=GS H3AIZ3_LATCH/46-189         AC H3AIZ3.1
#=GS A0A5B1QIB2_9AGAM/34-180     AC A0A5B1QIB2.1
#=GS A0A671S1R5_9TELE/55-196     AC A0A671S1R5.1
#=GS V2XEX7_MONRO/49-212         AC V2XEX7.1
#=GS A0A367JLP7_RHIAZ/43-214     AC A0A367JLP7.1
#=GS A0A4W5NUH6_9TELE/45-187     AC A0A4W5NUH6.1
#=GS A0A5D6Y451_9STRA/45-218     AC A0A5D6Y451.1
#=GS A0A316Z9I2_9BASI/71-252     AC A0A316Z9I2.1
#=GS A0A430QRB0_SCHBO/9-154      AC A0A430QRB0.1
#=GS A0A0L1IV78_ASPNO/33-282     AC A0A0L1IV78.1
#=GS H2UFX6_TAKRU/49-191         AC H2UFX6.3
#=GS C4Y8T9_CLAL4/111-293        AC C4Y8T9.1
#=GS A0A421JQ43_9ASCO/112-282    AC A0A421JQ43.1
#=GS A0A0T6ATC3_9SCAR/42-239     AC A0A0T6ATC3.1
#=GS H6QP53_PUCGT/131-293        AC H6QP53.1
#=GS A0A1J8QKR7_9AGAM/36-198     AC A0A1J8QKR7.1
#=GS Q5B255_EMENI/33-276         AC Q5B255.1
#=GS A0A665TI06_ECHNA/93-234     AC A0A665TI06.1
#=GS A0A317WSX1_9EURO/33-293     AC A0A317WSX1.1
#=GS A0A2T3Z384_9HYPO/30-274     AC A0A2T3Z384.1
#=GS A0A094B0E2_9PEZI/30-259     AC A0A094B0E2.1
#=GS B4N3Q4_DROWI/39-221         AC B4N3Q4.1
#=GS A0A093NQN2_PYGAD/22-165     AC A0A093NQN2.1
#=GS A0A0D1WZJ8_EXOME/34-269     AC A0A0D1WZJ8.1
#=GS A0A093Q9M5_9PASS/22-165     AC A0A093Q9M5.1
#=GS A0A428TTX3_9HYPO/3-170      AC A0A428TTX3.1
#=GS A0A485P2C8_LYNPA/17-160     AC A0A485P2C8.1
#=GS A0A094G4H8_9PEZI/30-267     AC A0A094G4H8.1
#=GS A0A0D7B8P1_9AGAR/40-209     AC A0A0D7B8P1.1
#=GS A0A2P4YJ39_9STRA/46-225     AC A0A2P4YJ39.1
#=GS A0A0D2DUA7_9EURO/33-293     AC A0A0D2DUA7.1
#=GS A0A2K6NNV3_RHIRO/63-206     AC A0A2K6NNV3.1
#=GS A0A2J6SIW8_9HELO/30-287     AC A0A2J6SIW8.1
#=GS A0A179I129_CORDF/30-324     AC A0A179I129.1
#=GS A0A484BXL9_DRONA/1-161      AC A0A484BXL9.1
#=GS A0A087XYD9_POEFO/46-189     AC A0A087XYD9.1
#=GS W6QU86_PENRF/33-276         AC W6QU86.1
#=GS A0A2H3E7H4_ARMGA/42-183     AC A0A2H3E7H4.1
#=GS A0A0J8RA73_COCIT/33-286     AC A0A0J8RA73.1
#=GS A0A5N3XF34_MUNRE/63-206     AC A0A5N3XF34.1
#=GS C6H7M0_AJECH/17-104         AC C6H7M0.1
#=GS A0A1U7V1X0_NICSY/123-287    AC A0A1U7V1X0.1
#=GS A0A2P8XZY5_BLAGE/70-134     AC A0A2P8XZY5.1
#=GS A0A665TH01_ECHNA/49-190     AC A0A665TH01.1
#=GS A0A1Y2DFT8_9PEZI/30-292     AC A0A1Y2DFT8.1
#=GS A0A3P7E2P7_WUCBA/40-157     AC A0A3P7E2P7.1
#=GS F0X890_GROCL/30-338         AC F0X890.1
#=GS A0A384AHW0_BALAS/75-218     AC A0A384AHW0.1
#=GS A0A199VLU5_ANACO/94-283     AC A0A199VLU5.1
#=GS A0A0P1AJW5_PLAHL/47-227     AC A0A0P1AJW5.1
#=GS A0A316VPW6_9BASI/78-316     AC A0A316VPW6.1
#=GS A0A0D0BEX7_9AGAM/36-206     AC A0A0D0BEX7.1
#=GS A0A251USB1_HELAN/121-291    AC A0A251USB1.1
#=GS A0A267GGS1_9PLAT/59-233     AC A0A267GGS1.1
#=GS E5ACG6_LEPMJ/65-292         AC E5ACG6.1
#=GS A0A6P3QUY6_PTEVA/63-206     AC A0A6P3QUY6.1
#=GS A0A4W4EMC4_ELEEL/49-191     AC A0A4W4EMC4.1
#=GS A0A5M9JP76_MONFR/3-77       AC A0A5M9JP76.1
#=GS A0A4E0RKX1_FASHE/39-180     AC A0A4E0RKX1.1
#=GS B6QAN8_TALMQ/32-323         AC B6QAN8.1
#=GS A0A0E0QUH4_ORYRU/126-316    AC A0A0E0QUH4.1
#=GS A0A392MIC9_9FABA/106-275    AC A0A392MIC9.1
#=GS B4LFV4_DROVI/39-215         AC B4LFV4.1
#=GS A0A2K1QJQ9_9PEZI/30-281     AC A0A2K1QJQ9.1
#=GS A0A093HNE9_STRCA/24-167     AC A0A093HNE9.1
#=GS MED4_DEBHA/113-307          AC Q6BKB5.2
#=GS A0A194XA35_9HELO/30-294     AC A0A194XA35.1
#=GS A0A4P9X586_9FUNG/141-281    AC A0A4P9X586.1
#=GS A0A2Y9NGC9_DELLE/63-206     AC A0A2Y9NGC9.1
#=GS A0A2R6XNF7_MARPO/83-233     AC A0A2R6XNF7.1
#=GS A0A1B7N8T0_9AGAM/35-195     AC A0A1B7N8T0.1
#=GS A0A3P9CY63_9CICH/45-188     AC A0A3P9CY63.1
#=GS S7ZYE7_DACHA/30-277         AC S7ZYE7.1
#=GS A0A427YVA8_9TREE/62-238     AC A0A427YVA8.1
#=GS A0A4S4LYS2_9AGAM/144-293    AC A0A4S4LYS2.1
#=GS W2ZVT2_PHYPR/49-219         AC W2ZVT2.1
#=GS E2B3N6_HARSA/43-181         AC E2B3N6.1
#=GS A0A084QI75_STAC4/30-296     AC A0A084QI75.1
#=GS N1JQF3_BLUG1/30-273         AC N1JQF3.1
#=GS A0A0C9X9N9_9AGAR/35-199     AC A0A0C9X9N9.1
#=GS A0A4T0X181_9ASCO/30-217     AC A0A4T0X181.1
#=GS I1KCN1_SOYBN/113-277        AC I1KCN1.1
#=GS A0A183SMY7_SCHSO/39-216     AC A0A183SMY7.1
#=GS G1T326_RABIT/63-206         AC G1T326.2
#=GS G3J6C4_CORMM/31-331         AC G3J6C4.1
#=GS A0A4Q9PTC7_9APHY/83-242     AC A0A4Q9PTC7.1
#=GS A0A2I4HLQ7_JUGRE/123-304    AC A0A2I4HLQ7.1
#=GS A0A3L6T3Y0_PANMI/123-297    AC A0A3L6T3Y0.1
#=GS A0A3M6VUY4_9STRA/49-212     AC A0A3M6VUY4.1
#=GS A0A6J2UB39_DROLE/43-209     AC A0A6J2UB39.1
#=GS A0A3Q3MCL8_9TELE/64-203     AC A0A3Q3MCL8.2
#=GS A0A0R3X2D6_HYDTA/1-103      AC A0A0R3X2D6.1
#=GS A0A317SLR2_9PEZI/30-241     AC A0A317SLR2.1
#=GS A0A316UTT9_9BASI/296-636    AC A0A316UTT9.1
#=GS A0A1Y2VCM7_9PEZI/30-294     AC A0A1Y2VCM7.1
#=GS A0A060S6E6_PYCCI/78-237     AC A0A060S6E6.1
#=GS A0A1E4TEN5_9ASCO/32-239     AC A0A1E4TEN5.1
#=GS A0A2P5F215_TREOI/138-328    AC A0A2P5F215.1
#=GS A0A437A271_9PEZI/30-284     AC A0A437A271.1
#=GS A0A1B7TF95_9ASCO/53-265     AC A0A1B7TF95.1
#=GS A0A6P8H8P1_ACTTE/55-203     AC A0A6P8H8P1.1
#=GS C1E1S3_MICCC/8-142          AC C1E1S3.1
#=GS A0A0K0DSJ9_STRER/50-173     AC A0A0K0DSJ9.1
#=GS F6YFK2_HORSE/63-206         AC F6YFK2.3
#=GS G2QLA2_MYCTT/30-304         AC G2QLA2.1
#=GS A0A5N5NY41_9PEZI/30-317     AC A0A5N5NY41.1
#=GS A0A2U9CD21_SCOMX/46-186     AC A0A2U9CD21.1
#=GS M2UU41_COCH5/30-269         AC M2UU41.1
#=GS A0A238BK40_9BILA/40-216     AC A0A238BK40.1
#=GS A0A139HG02_9PEZI/514-737    AC A0A139HG02.1
#=GS A0A6P5CMX9_BOSIN/34-177     AC A0A6P5CMX9.1
#=GS A0A401H5D0_9APHY/50-230     AC A0A401H5D0.1
#=GS A0A376B718_9ASCO/115-339    AC A0A376B718.1
#=GS A0A6P3WS71_DINQU/43-179     AC A0A6P3WS71.1
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