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Database: Pfam
Entry: NFACT_N
LinkDB: NFACT_N
Original site: NFACT_N 
#=GF ID   NFACT_N
#=GF AC   PF05833.13
#=GF DE   NFACT N-terminal and middle domains
#=GF PI   FbpA;
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_8577 (release 8.0)
#=GF GA   31.00 31.00;
#=GF TC   31.00 31.00;
#=GF NC   30.80 30.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0303
#=GF RN   [1]
#=GF RM   25578875
#=GF RT   Structure and assembly pathway of the ribosome quality control
#=GF RT   complex.
#=GF RA   Shao S, Brown A, Santhanam B, Hegde RS;
#=GF RL   Mol Cell. 2015;57:433-444.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   31155236
#=GF RT   Alanine Tails Signal Proteolysis in Bacterial
#=GF RT   Ribosome-Associated Quality Control.
#=GF RA   Lytvynenko I, Paternoga H, Thrun A, Balke A, Muller TA, Chiang
#=GF RA   CH, Nagler K, Tsaprailis G, Anders S, Bischofs I, Maupin-Furlow
#=GF RA   JA, Spahn CMT, Joazeiro CAP;
#=GF RL   Cell. 2019;178:76-90.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family contains the N-terminal and middle domains of NFACT
#=GF CC   (NEMF, FbpA, Caliban, and Tae2) proteins from eukaryotes,
#=GF CC   archaea and bacteria. Many members of this family act in
#=GF CC   ribosome quality control (RQC), including RqcH, which are
#=GF CC   involved in the addition of a poly-Ala tail to defective
#=GF CC   translated proteins to tag them for degradation. This process is
#=GF CC   analogous to the ssrA/tmRNA bacterial system. However, some
#=GF CC   other NFACT family members, such as bacterial proteins FbpA in
#=GF CC   Listeria or PavA in Streptococcus, are exported (despite lack of
#=GF CC   a classical signal peptide) and behave as fibronectin-binding
#=GF CC   adhesins associated with virulence [1,2].
#=GF SQ   4547
#=GS S0FNC8_RUMCE/4-460          AC S0FNC8.1
#=GS A0A133U5R6_9EURY/6-449      AC A0A133U5R6.1
#=GS A0A0A2V2J5_PARBA/6-186      AC A0A0A2V2J5.1
#=GS A0A1M5NR79_9FIRM/4-458      AC A0A1M5NR79.1
#=GS M4B7J3_HYAAE/8-582          AC M4B7J3.1
#=GS I4C8A5_DESTA/2-179          AC I4C8A5.1
#=GS R9N4D0_9FIRM/4-461          AC R9N4D0.1
#=GS A0A135UVK8_9PEZI/6-544      AC A0A135UVK8.1
#=GS R8BQX5_TOGMI/6-556          AC R8BQX5.1
#=GS A0A1Y4H807_9FIRM/4-456      AC A0A1Y4H807.1
#=GS A0A3M7TYD5_9BACI/7-448      AC A0A3M7TYD5.1
#=GS I7HGB1_9HELI/159-344        AC I7HGB1.1
#=GS A0A1J9R977_9PEZI/6-542      AC A0A1J9R977.1
#=GS A0A060HSU3_9ARCH/4-435      AC A0A060HSU3.1
#=GS A0A1Y3Y4D4_9FIRM/4-457      AC A0A1Y3Y4D4.1
#=GS C7H056_9FIRM/7-515          AC C7H056.1
#=GS D2Z3H8_9BACT/7-233          AC D2Z3H8.1
#=GS A0A176VWA8_MARPO/7-195      AC A0A176VWA8.1
#=GS R5PQ01_9CLOT/4-419          AC R5PQ01.1
#=GS I1MGB2_SOYBN/194-535        AC I1MGB2.2
#=GS F2F679_SOLSS/4-438          AC F2F679.1
#=GS Q5V3G3_HALMA/8-496          AC Q5V3G3.1
#=GS R6XIX4_9CLOT/4-441          AC R6XIX4.1
#=GS A0A1T4JZC8_9FIRM/4-461      AC A0A1T4JZC8.1
#=GS A0A1H9L0F8_9BACI/5-445      AC A0A1H9L0F8.1
#=GS A0A2K1ZEW1_POPTR/190-528    AC A0A2K1ZEW1.1
#=GS A0A1M6L671_9CLOT/4-452      AC A0A1M6L671.1
#=GS A0A4P7ZY71_9SYNE/352-439    AC A0A4P7ZY71.1
#=GS C1N9V6_MICPC/235-535        AC C1N9V6.1
#=GS S3K5Y5_TREMA/5-196          AC S3K5Y5.1
#=GS A0A081NXY7_9BACL/4-464      AC A0A081NXY7.1
#=GS A0A665WB21_ECHNA/6-520      AC A0A665WB21.1
#=GS M1ZKU2_9FIRM/4-461          AC M1ZKU2.1
#=GS A0A0U5EUG6_9BACT/7-147      AC A0A0U5EUG6.1
#=GS A0A2R4ZNE7_9CREN/6-437      AC A0A2R4ZNE7.1
#=GS A0A328VGG2_9CHLR/236-541    AC A0A328VGG2.1
#=GS A0A364K7C1_9BACL/4-446      AC A0A364K7C1.1
#=GS W9ZEN4_9EURO/6-539          AC W9ZEN4.1
#=GS A0A0D5NMQ9_9BACL/259-498    AC A0A0D5NMQ9.1
#=GS A0A2H5W3E6_9BACT/3-99       AC A0A2H5W3E6.1
#=GS M1WAT9_CLAP2/6-561          AC M1WAT9.1
#=GS A0A3A9IU48_9FIRM/4-461      AC A0A3A9IU48.1
#=GS A0A540VDS9_9CHLR/4-454      AC A0A540VDS9.1
#=GS B7XMH8_ENTBH/6-141          AC B7XMH8.1
#=GS R7FGI1_9CLOT/4-470          AC R7FGI1.1
#=GS A0A4Y1Z605_9BACL/1-119      AC A0A4Y1Z605.1
#=GS F4XSG7_9CYAN/5-513          AC F4XSG7.1
#=GS A0A4Q0YC61_9PROT/154-338    AC A0A4Q0YC61.1
#=GS A0A444ZEB1_ARAHY/196-535    AC A0A444ZEB1.1
#=GS A0A175VPA2_9PEZI/6-548      AC A0A175VPA2.1
#=GS Q2RK36_MOOTA/4-460          AC Q2RK36.1
#=GS M1E5Q1_9FIRM/7-209          AC M1E5Q1.1
#=GS A0A0P1LGL0_9BACT/4-422      AC A0A0P1LGL0.1
#=GS A0A401ZI05_9CHLR/4-517      AC A0A401ZI05.1
#=GS A0A4S2MFJ2_OPIFE/224-538    AC A0A4S2MFJ2.1
#=GS A0A0C2QRR7_9CYAN/5-451      AC A0A0C2QRR7.1
#=GS A0A2A8S5R5_9BACI/4-446      AC A0A2A8S5R5.1
#=GS A0A452G8Z9_CAPHI/6-525      AC A0A452G8Z9.1
#=GS E6N9B8_CALS0/8-414          AC E6N9B8.1
#=GS D7GX04_9FIRM/4-458          AC D7GX04.1
#=GS A0A0K0DK33_ANGCA/6-152      AC A0A0K0DK33.1
#=GS A0A1W1VME1_9THEO/4-460      AC A0A1W1VME1.1
#=GS A0A2P6U0D0_CHLSO/389-841    AC A0A2P6U0D0.1
#=GS G2KTP0_LACSM/30-470         AC G2KTP0.1
#=GS E4TW89_SULKY/6-181          AC E4TW89.1
#=GS S0E6I3_GIBF5/6-547          AC S0E6I3.1
#=GS A0A068NWE2_9BACT/198-391    AC A0A068NWE2.1
#=GS D1Z1T0_METPS/6-445          AC D1Z1T0.1
#=GS Q8RFL3_FUSNN/5-201          AC Q8RFL3.1
#=GS A0A061NXV0_9BACL/4-445      AC A0A061NXV0.1
#=GS A0A4Y9FL46_9STRE/4-431      AC A0A4Y9FL46.1
#=GS A0A673ZE00_SALTR/8-500      AC A0A673ZE00.1
#=GS R5UIY3_9FIRM/4-456          AC R5UIY3.1
#=GS S2E1H4_9ARCH/4-430          AC S2E1H4.1
#=GS A0A131ZZV2_SARSC/6-491      AC A0A131ZZV2.1
#=GS Q4D136_TRYCC/7-544          AC Q4D136.1
#=GS A0A0R2FYS7_9LACT/4-440      AC A0A0R2FYS7.1
#=GS G4D724_9FIRM/1-91           AC G4D724.1
#=GS F5YGV7_TREPZ/8-158          AC F5YGV7.1
#=GS A0A4Q4IPV6_9BACL/11-452     AC A0A4Q4IPV6.1
#=GS A0A1A8W6A5_9APIC/137-732    AC A0A1A8W6A5.1
#=GS A0A1Y2W565_9PEZI/6-552      AC A0A1Y2W565.1
#=GS A0A5J4Z3S9_PORPP/70-544     AC A0A5J4Z3S9.1
#=GS R6HUQ6_9FIRM/4-458          AC R6HUQ6.1
#=GS M1WRW4_9NOST/5-452          AC M1WRW4.1
#=GS I0XBG5_9SPIO/7-166          AC I0XBG5.1
#=GS A0A221SUE3_9DEIO/239-399    AC A0A221SUE3.1
#=GS A0A2B7ZTL8_9EURO/6-189      AC A0A2B7ZTL8.1
#=GS A0A1J9QXL8_9EURO/259-547    AC A0A1J9QXL8.1
#=GS A0A1E5G5U1_9BACL/4-455      AC A0A1E5G5U1.1
#=GS A4S6P0_OSTLU/47-508         AC A4S6P0.1
#=GS A0A1M4ZG61_9CLOT/4-455      AC A0A1M4ZG61.1
#=GS A0A6G0USY9_9BILA/265-745    AC A0A6G0USY9.1
#=GS A0A2C6LHS8_9FIRM/4-462      AC A0A2C6LHS8.1
#=GS T0MH17_9MICR/74-174         AC T0MH17.1
#=GS A0A2G5EYW0_AQUCA/7-194      AC A0A2G5EYW0.1
#=GS K0SIH3_THAOC/77-183         AC K0SIH3.1
#=GS A0A2Z6R5X6_9GLOM/6-515      AC A0A2Z6R5X6.1
#=GS A0A0P0CLH4_9BACT/168-394    AC A0A0P0CLH4.1
#=GS A0A0R1RDL0_9LACO/1-432      AC A0A0R1RDL0.1
#=GS A0A3D8YYV5_9BACL/4-441      AC A0A3D8YYV5.1
#=GS A0A542AGL8_9CLOT/4-461      AC A0A542AGL8.1
#=GS I5AQQ0_EUBCE/4-457          AC I5AQQ0.1
#=GS A0A4D8ZZF4_SALSN/207-541    AC A0A4D8ZZF4.1
#=GS A0A067G967_CITSI/7-189      AC A0A067G967.1
#=GS A0A1V6YBL0_PENNA/6-539      AC A0A1V6YBL0.1
#=GS W7TLK7_9STRA/64-134         AC W7TLK7.1
#=GS A0A4S4BIC4_9BACL/4-453      AC A0A4S4BIC4.1
#=GS H9UIZ0_SPIAZ/7-167          AC H9UIZ0.1
#=GS M4YQ04_THEXX/6-437          AC M4YQ04.1
#=GS A0A1R1EUL4_9BACL/4-459      AC A0A1R1EUL4.1
#=GS A0A1T4KKE0_9FUSO/5-423      AC A0A1T4KKE0.1
#=GS A0Q075_CLONN/4-456          AC A0Q075.1
#=GS Q6KZP2_PICTO/7-409          AC Q6KZP2.1
#=GS A0A1Y2D4W8_9FUNG/6-193      AC A0A1Y2D4W8.1
#=GS R4VW64_9EURY/8-493          AC R4VW64.1
#=GS A0A6A2Z3X4_HIBSY/7-177      AC A0A6A2Z3X4.1
#=GS G9WMS4_9FIRM/4-475          AC G9WMS4.1
#=GS A0A1M4SRC1_9FIRM/4-463      AC A0A1M4SRC1.1
#=GS A0A367Y188_9ASCO/6-564      AC A0A367Y188.1
#=GS V4S1E0_9ROSI/93-219         AC V4S1E0.1
#=GS A0A340WG72_LIPVE/6-525      AC A0A340WG72.1
#=GS U5QC87_9CYAN/5-449          AC U5QC87.1
#=GS A0A402AMU0_9CHLR/202-518    AC A0A402AMU0.1
#=GS A0A172Q825_9STRE/4-428      AC A0A172Q825.1
#=GS A0A4R4BMV5_9SPIO/159-357    AC A0A4R4BMV5.1
#=GS A0A310SN66_9HYME/6-489      AC A0A310SN66.1
#=GS B9RZW2_RICCO/7-208          AC B9RZW2.1
#=GS A0A1H6SSN8_9EURY/8-479      AC A0A1H6SSN8.1
#=GS A0A372LBL4_9BACI/4-445      AC A0A372LBL4.1
#=GS C3Z3R8_BRAFL/6-163          AC C3Z3R8.1
#=GS A0A453JYJ7_AEGTS/128-474    AC A0A453JYJ7.1
#=GS A0A0D8ZXB0_9CYAN/5-452      AC A0A0D8ZXB0.1
#=GS A0A2R5HKK1_9LACT/4-414      AC A0A2R5HKK1.1
#=GS A0A1G9QDJ1_9FIRM/4-463      AC A0A1G9QDJ1.1
#=GS A0A256KLL6_9EURY/1-258      AC A0A256KLL6.1
#=GS T0LY75_9EURY/7-414          AC T0LY75.1
#=GS A0A1I0QR24_9EURY/8-478      AC A0A1I0QR24.1
#=GS C6HJH1_AJECH/42-196         AC C6HJH1.1
#=GS L8LY03_9CYAN/5-451          AC L8LY03.1
#=GS C4M7C7_ENTHI/14-489         AC C4M7C7.1
#=GS A0A1J7JMX2_9PEZI/6-548      AC A0A1J7JMX2.1
#=GS A0A4Y6PYT5_9DELT/185-376    AC A0A4Y6PYT5.1
#=GS C0D0N7_9FIRM/4-459          AC C0D0N7.1
#=GS A0A498SMT2_ACAVI/6-482      AC A0A498SMT2.1
#=GS A0A326URR6_9CHLR/55-246     AC A0A326URR6.1
#=GS A0A0R2EUB6_9LACO/1-163      AC A0A0R2EUB6.1
#=GS A0A346PTD9_9EURY/8-493      AC A0A346PTD9.1
#=GS A0A167GQY8_METRR/6-553      AC A0A167GQY8.1
#=GS A0A5D2VTM6_GOSMU/7-181      AC A0A5D2VTM6.1
#=GS A0A0F7CL65_9CREN/62-394     AC A0A0F7CL65.1
#=GS A0A1I2J9V9_9CLOT/4-441      AC A0A1I2J9V9.1
#=GS H6LBI7_ACEWD/4-459          AC H6LBI7.1
#=GS A0A069CRG1_WEIOS/4-441      AC A0A069CRG1.1
#=GS A0A074KVS5_9BACT/186-394    AC A0A074KVS5.1
#=GS A0A2Y9DBA7_TRIMA/6-541      AC A0A2Y9DBA7.1
#=GS A0A5Q0UFU4_9ARCH/4-438      AC A0A5Q0UFU4.1
#=GS A0A3M7BBQ9_HORWE/6-551      AC A0A3M7BBQ9.1
#=GS A0A0N4UHE3_DRAME/6-154      AC A0A0N4UHE3.1
#=GS A0A428NBS6_9HYPO/6-550      AC A0A428NBS6.1
#=GS A0A0R1RVT8_9LACO/4-444      AC A0A0R1RVT8.1
#=GS Q8RFL3_FUSNN/197-423        AC Q8RFL3.1
#=GS G4RL03_THETK/6-411          AC G4RL03.1
#=GS A0A4V5N7K0_9PEZI/6-539      AC A0A4V5N7K0.1
#=GS A0A0H4P1G1_9BACI/4-445      AC A0A0H4P1G1.1
#=GS A0A1H9EJ33_9SPIO/179-381    AC A0A1H9EJ33.1
#=GS A0A0A3J521_9BACI/4-438      AC A0A0A3J521.1
#=GS W1QCZ6_OGAPD/6-530          AC W1QCZ6.1
#=GS Q12W70_METBU/6-453          AC Q12W70.1
#=GS A0A073CKM9_PLAAG/1-426      AC A0A073CKM9.1
#=GS A0A2Z6AUR6_9DELT/3-110      AC A0A2Z6AUR6.1
#=GS A0A1M7YLY1_9FIRM/4-454      AC A0A1M7YLY1.1
#=GS A0A179UNT2_BLAGS/238-546    AC A0A179UNT2.1
#=GS A0A544TTV9_9BACI/4-439      AC A0A544TTV9.1
#=GS A0A0J8TGP2_COCIT/90-438     AC A0A0J8TGP2.1
#=GS R6DMK9_9CLOT/4-467          AC R6DMK9.1
#=GS A0A507FL53_9FUNG/357-665    AC A0A507FL53.1
#=GS A0A1T4KUS5_9FIRM/4-434      AC A0A1T4KUS5.1
#=GS A0A074ZVC3_9TREM/4-125      AC A0A074ZVC3.1
#=GS R5VWU4_9DELT/4-443          AC R5VWU4.1
#=GS M2N904_BAUPA/6-547          AC M2N904.1
#=GS A0A383VBP0_TETOB/291-577    AC A0A383VBP0.1
#=GS W3ATJ4_9FIRM/4-467          AC W3ATJ4.1
#=GS C9R802_AMMDK/4-454          AC C9R802.1
#=GS Q9HPR4_HALSA/8-476          AC Q9HPR4.1
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