#=GF ID NINJA_B
#=GF AC PF16136.8
#=GF DE Putative nuclear localisation signal
#=GF AU Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE PF07897
#=GF GA 30.10 30.10;
#=GF TC 30.10 30.10;
#=GF NC 29.90 30.00;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF RN [1]
#=GF RM 20360743
#=GF RT NINJA connects the co-repressor TOPLESS to jasmonate signalling.
#=GF RA Pauwels L, Barbero GF, Geerinck J, Tilleman S, Grunewald W,
#=GF RA Perez AC, Chico JM, Bossche RV, Sewell J, Gil E, Garcia-Casado
#=GF RA G, Witters E, Inze D, Long JA, De Jaeger G, Solano R, Goossens
#=GF RA A;
#=GF RL Nature. 2010;464:788-791.
#=GF RN [2]
#=GF RM 18484180
#=GF RT A small plant-specific protein family of ABI five binding
#=GF RT proteins (AFPs) regulates stress response in germinating
#=GF RT Arabidopsis seeds and seedlings.
#=GF RA Garcia ME, Lynch T, Peeters J, Snowden C, Finkelstein R;
#=GF RL Plant Mol Biol. 2008;67:643-658.
#=GF DR INTERPRO; IPR032310;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC NINJA proteins are Novel INteractor of JAZ proteins found in
#=GF CC plants. NINJA proteins act as a transcriptional repressor, the
#=GF CC activity of which is mediated by a functional TPL-binding EAR
#=GF CC repression motif upstream from this domain [1,2].
#=GF SQ 541
#=GS A0A3Q7FWU6_SOLLC/127-261 AC A0A3Q7FWU6.1
#=GS A0A2K1YUQ1_POPTR/109-210 AC A0A2K1YUQ1.1
#=GS A0A4U5QDE3_POPAL/155-264 AC A0A4U5QDE3.1
#=GS A0A444F5B7_ENSVE/84-189 AC A0A444F5B7.1
#=GS M4EDN1_BRARP/102-188 AC M4EDN1.1
#=GS V4TD28_CITCL/115-240 AC V4TD28.1
#=GS A0A0D3AWM3_BRAOL/126-186 AC A0A0D3AWM3.1
#=GS A0A2T7CFS8_9POAL/137-289 AC A0A2T7CFS8.1
#=GS A0A1Z5SAQ3_SORBI/1-143 AC A0A1Z5SAQ3.1
#=GS A0A446M2H0_TRITD/86-141 AC A0A446M2H0.1
#=GS A0A4Y7JMM9_PAPSO/112-238 AC A0A4Y7JMM9.1
#=GS A0A6J0L3R2_RAPSA/78-129 AC A0A6J0L3R2.1
#=GS A0A1S3ZDV7_TOBAC/127-254 AC A0A1S3ZDV7.1
#=GS A0A2P5XAY4_GOSBA/85-184 AC A0A2P5XAY4.1
#=GS A0A4P1RSH3_LUPAN/45-109 AC A0A4P1RSH3.1
#=GS A0A6D2JHJ5_9BRAS/117-215 AC A0A6D2JHJ5.1
#=GS A0A0P0VUP5_ORYSJ/145-259 AC A0A0P0VUP5.1
#=GS A2XI24_ORYSI/86-137 AC A2XI24.1
#=GS A0A6A5NXV4_LUPAL/120-252 AC A0A6A5NXV4.1
#=GS A0A6P3ZQJ7_ZIZJJ/122-229 AC A0A6P3ZQJ7.1
#=GS A0A6A4P8G2_LUPAL/135-270 AC A0A6A4P8G2.1
#=GS A0A3Q7GCD3_SOLLC/153-203 AC A0A3Q7GCD3.1
#=GS A0A022QMN7_ERYGU/95-247 AC A0A022QMN7.1
#=GS A0A6P6T6C7_COFAR/110-235 AC A0A6P6T6C7.1
#=GS A0A5J9VQI7_9POAL/87-201 AC A0A5J9VQI7.1
#=GS A0A1U7YFP3_NICSY/106-206 AC A0A1U7YFP3.1
#=GS A0A444GDI9_ENSVE/96-232 AC A0A444GDI9.1
#=GS A0A2I4EBB1_JUGRE/101-244 AC A0A2I4EBB1.1
#=GS A0A397YWF2_BRACM/95-186 AC A0A397YWF2.1
#=GS A0A6P5Y0M4_DURZI/109-237 AC A0A6P5Y0M4.1
#=GS A0A5D2TDW0_GOSMU/105-200 AC A0A5D2TDW0.1
#=GS A0A6S7N1Z3_LACSI/95-198 AC A0A6S7N1Z3.1
#=GS A0A2R6PRS8_ACTCC/61-169 AC A0A2R6PRS8.1
#=GS A0A2P5D8W0_TREOI/102-223 AC A0A2P5D8W0.1
#=GS A0A0D3E0N5_BRAOL/78-128 AC A0A0D3E0N5.1
#=GS A0A2K3PNT8_TRIPR/138-268 AC A0A2K3PNT8.1
#=GS A0A6P3ZTW3_ZIZJJ/122-235 AC A0A6P3ZTW3.1
#=GS A0A0S3RRT6_PHAAN/116-238 AC A0A0S3RRT6.1
#=GS A0A540LST0_MALBA/94-237 AC A0A540LST0.1
#=GS A0A0E0NWL6_ORYRU/86-138 AC A0A0E0NWL6.1
#=GS S8EIY1_9LAMI/106-144 AC S8EIY1.1
#=GS A0A4S8JSW4_MUSBA/80-188 AC A0A4S8JSW4.1
#=GS A0A3B6AU44_WHEAT/86-139 AC A0A3B6AU44.1
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#=GS A0A2R6PUB0_ACTCC/61-160 AC A0A2R6PUB0.1
#=GS A0A2C9WH88_MANES/110-222 AC A0A2C9WH88.1
#=GS A0A328DNG7_9ASTE/92-155 AC A0A328DNG7.1
#=GS A0A1D6K5R7_MAIZE/78-122 AC A0A1D6K5R7.1
#=GS A0A0E0QAW2_ORYRU/92-138 AC A0A0E0QAW2.1
#=GS A0A078HQL5_BRANA/97-203 AC A0A078HQL5.1
#=GS A0A5N6R2A3_9ROSI/100-235 AC A0A5N6R2A3.1
#=GS A0A444FUC5_ENSVE/96-210 AC A0A444FUC5.1
#=GS A0A0E0NRJ5_ORYRU/145-259 AC A0A0E0NRJ5.1
#=GS A0A453B5G9_AEGTS/86-132 AC A0A453B5G9.1
#=GS A0A2C9VV83_MANES/112-225 AC A0A2C9VV83.1
#=GS NNJA3_ORYSJ/86-137 AC Q10JI3.1
#=GS A0A5N5JD03_9ROSI/104-214 AC A0A5N5JD03.1
#=GS A0A2T7CBD6_9POAL/91-151 AC A0A2T7CBD6.1
#=GS A0A6J5TMB2_PRUAR/106-254 AC A0A6J5TMB2.1
#=GS M0SNV2_MUSAM/95-218 AC M0SNV2.1
#=GS A0A2R6QHE3_ACTCC/83-187 AC A0A2R6QHE3.1
#=GS A0A2I0HMS2_PUNGR/102-230 AC A0A2I0HMS2.1
#=GS A0A446KS67_TRITD/76-131 AC A0A446KS67.1
#=GS A0A6I9S807_ELAGV/93-222 AC A0A6I9S807.1
#=GS A0A1U8NRP0_GOSHI/102-208 AC A0A1U8NRP0.1
#=GS M0TAN8_MUSAM/98-170 AC M0TAN8.1
#=GS I1JEF6_SOYBN/144-267 AC I1JEF6.2
#=GS A0A1S3Z6S5_TOBAC/113-211 AC A0A1S3Z6S5.1
#=GS A0A0P0X8E0_ORYSJ/25-71 AC A0A0P0X8E0.1
#=GS AFP1_ARATH/110-224 AC Q9LQ98.1
#=GS A0A6A2YU76_HIBSY/109-200 AC A0A6A2YU76.1
#=GS A0A4U6T4C1_SETVI/93-177 AC A0A4U6T4C1.1
#=GS A0A2P6QRF6_ROSCH/58-87 AC A0A2P6QRF6.1
#=GS A0A2P5DK15_TREOI/116-253 AC A0A2P5DK15.1
#=GS A0A6P4DC14_ARADU/120-230 AC A0A6P4DC14.1
#=GS A0A2U1M6U3_ARTAN/109-246 AC A0A2U1M6U3.1
#=GS A0A2P5BBN1_PARAD/116-253 AC A0A2P5BBN1.1
#=GS AFP2_ARATH/107-206 AC Q9LMX5.1
#=GS A0A1R3HNL0_9ROSI/75-199 AC A0A1R3HNL0.1
#=GS A0A4S8JEJ2_MUSBA/96-232 AC A0A4S8JEJ2.1
#=GS A0A022RUK9_ERYGU/98-129 AC A0A022RUK9.1
#=GS A0A444Y7K4_ARAHY/9-96 AC A0A444Y7K4.1
#=GS A0A446M2R5_TRITD/63-117 AC A0A446M2R5.1
#=GS W9R4R8_9ROSA/110-211 AC W9R4R8.1
#=GS A0A6J1D5N7_MOMCH/102-250 AC A0A6J1D5N7.1
#=GS A0A2Z7CI87_9LAMI/130-248 AC A0A2Z7CI87.1
#=GS A0A2G3CYF6_CAPCH/173-294 AC A0A2G3CYF6.1
#=GS A0A540KL43_MALBA/108-241 AC A0A540KL43.1
#=GS A0A6A3B4E2_HIBSY/109-205 AC A0A6A3B4E2.1
#=GS A0A565BSU4_9BRAS/84-138 AC A0A565BSU4.1
#=GS A0A3B6ITR1_WHEAT/159-309 AC A0A3B6ITR1.1
#=GS A0A6I9UCI5_SESIN/105-234 AC A0A6I9UCI5.1
#=GS A0A6A4L0W0_9ERIC/95-220 AC A0A6A4L0W0.1
#=GS A0A453B521_AEGTS/86-141 AC A0A453B521.1
#=GS A0A199V6N7_ANACO/102-229 AC A0A199V6N7.1
#=GS A0A1Z5S9H6_SORBI/89-172 AC A0A1Z5S9H6.1
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#=GS A0A3B6HP56_WHEAT/274-424 AC A0A3B6HP56.1
#=GS D7KWZ8_ARALL/112-231 AC D7KWZ8.1
#=GS A0A061FYE6_THECC/334-444 AC A0A061FYE6.1
#=GS V4MU57_EUTSA/114-207 AC V4MU57.1
#=GS A0A0D3DBJ7_BRAOL/87-142 AC A0A0D3DBJ7.1
#=GS A0A1U8KRI7_GOSHI/110-222 AC A0A1U8KRI7.1
#=GS A0A2G9HS37_9LAMI/95-144 AC A0A2G9HS37.1
#=GS A0A0K9RJ95_SPIOL/168-241 AC A0A0K9RJ95.1
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#=GS A0A6G1ECI2_9ORYZ/84-138 AC A0A6G1ECI2.1
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#=GS A0A5N5G9F1_9ROSA/105-231 AC A0A5N5G9F1.1
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#=GS A0A4S8JJF8_MUSBA/80-209 AC A0A4S8JJF8.1
#=GS V7C5N8_PHAVU/137-264 AC V7C5N8.1
#=GS A0A1D6P8E7_MAIZE/17-66 AC A0A1D6P8E7.1
#=GS A0A6J1BKT2_9ROSI/113-244 AC A0A6J1BKT2.1
#=GS A0A2P5CUD2_TREOI/123-248 AC A0A2P5CUD2.1
#=GS A0A5D2XTA2_GOSMU/105-200 AC A0A5D2XTA2.1
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#=GS A0A067FZH3_CITSI/6-134 AC A0A067FZH3.1
#=GS NNJA4_MAIZE/9-151 AC B6UGG4.1
#=GS A0A6P5YFV2_DURZI/58-160 AC A0A6P5YFV2.1
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#=GS A0A3L6QN41_PANMI/89-139 AC A0A3L6QN41.1
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#=GS A0A0A0LTI0_CUCSA/85-199 AC A0A0A0LTI0.1
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#=GS M4F554_BRARP/78-129 AC M4F554.1
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#=GS A0A6P6BBX5_DURZI/91-195 AC A0A6P6BBX5.1
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#=GS A0A1J6J6Z3_NICAT/122-249 AC A0A1J6J6Z3.1
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#=GS A0A1U8A1P2_NELNU/100-214 AC A0A1U8A1P2.1
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#=GS NNJA2_MAIZE/9-151 AC B4FM28.1
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#=GS A0A2U1KPS4_ARTAN/95-225 AC A0A2U1KPS4.1
#=GS A0A6S7MLL1_LACSI/147-254 AC A0A6S7MLL1.1
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#=GS A0A6A6K336_HEVBR/69-189 AC A0A6A6K336.1
#=GS A0A1D6PGY0_MAIZE/140-282 AC A0A1D6PGY0.1
#=GS A0A2G5EPH6_AQUCA/87-146 AC A0A2G5EPH6.1
#=GS A0A6J5WU75_PRUAR/105-231 AC A0A6J5WU75.1
#=GS NNJA1_WHEAT/86-139 AC B1B5D3.1
#=GS A0A2J6L6D9_LACSA/106-238 AC A0A2J6L6D9.1
#=GS A0A2G3B747_CAPCH/124-270 AC A0A2G3B747.1
#=GS A0A2P5E2E3_PARAD/120-245 AC A0A2P5E2E3.1
#=GS A0A0D3CXQ6_BRAOL/104-222 AC A0A0D3CXQ6.1
#=GS A0A103XVL8_CYNCS/107-230 AC A0A103XVL8.1
#=GS A0A446KSD6_TRITD/86-139 AC A0A446KSD6.1
#=GS A0A0E0KAI0_ORYPU/144-282 AC A0A0E0KAI0.1
#=GS A0A6I9QBX3_ELAGV/94-229 AC A0A6I9QBX3.1
#=GS A0A078HF43_BRANA/98-147 AC A0A078HF43.1
#=GS NNJA3_MAIZE/9-154 AC B6SLJ0.1
#=GS A0A5D2SFC2_GOSMU/112-211 AC A0A5D2SFC2.1
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