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Database: Pfam
Entry: Nup88
LinkDB: Nup88
Original site: Nup88 
#=GF ID   Nup88
#=GF AC   PF10168.12
#=GF DE   Nuclear pore component
#=GF AU   KOGs;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   KOGs (KOG4460)
#=GF GA   24.40 24.40;
#=GF TC   24.40 24.40;
#=GF NC   24.30 24.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0186
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9049309
#=GF RT   The human homologue of yeast CRM1 is in a dynamic subcomplex
#=GF RT   with CAN/Nup214 and a novel nuclear pore component Nup88. 
#=GF RA   Fornerod M, van Deursen J, van Baal S, Reynolds A, Davis D,
#=GF RA   Murti KG, Fransen J, Grosveld G; 
#=GF RL   EMBO J. 1997;16:807-816.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12589057
#=GF RT   Nup98 localizes to both nuclear and cytoplasmic sides of the
#=GF RT   nuclear pore and binds to two distinct nucleoporin subcomplexes. 
#=GF RA   Griffis ER, Xu S, Powers MA; 
#=GF RL   Mol Biol Cell. 2003;14:600-610.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019321;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Nup88 can be divided into two structural domains; the N-terminal
#=GF CC   two-thirds of the protein has no obvious structural motifs but
#=GF CC   is the region for binding to Nup98, one of the components of the
#=GF CC   nuclear pore. the C-terminal end is a predicted coiled-coil
#=GF CC   domain [1]. Nup88 is overexpressed in tumour cells [2].
#=GF SQ   1550
#=GS G1SMJ0_RABIT/13-739         AC G1SMJ0.1
#=GS J3M183_ORYBR/1-128          AC J3M183.1
#=GS A0A3B1JBP6_ASTMX/8-701      AC A0A3B1JBP6.1
#=GS A0A7N9CY42_MACFA/42-286     AC A0A7N9CY42.1
#=GS A0A673L8K3_9TELE/8-723      AC A0A673L8K3.1
#=GS W1PHV3_AMBTC/11-149         AC W1PHV3.1
#=GS NPP24_CAEEL/18-216          AC Q09372.2
#=GS G5BW82_HETGA/13-742         AC G5BW82.1
#=GS A0A1Q3CZU1_CEPFO/441-796    AC A0A1Q3CZU1.1
#=GS A0A091KVE7_COLST/1-642      AC A0A091KVE7.1
#=GS A0A238BQ87_9BILA/56-331     AC A0A238BQ87.1
#=GS A0A4S2MF60_OPIFE/195-506    AC A0A4S2MF60.1
#=GS A0A507EFP1_9FUNG/354-819    AC A0A507EFP1.1
#=GS A0A444X2L1_ARAHY/438-795    AC A0A444X2L1.1
#=GS A0A2K6DEK0_MACNE/1-406      AC A0A2K6DEK0.1
#=GS A0A5C2T4M8_9APHY/50-251     AC A0A5C2T4M8.1
#=GS A0A0N4TZT8_BRUPA/57-281     AC A0A0N4TZT8.1
#=GS A0A6P3VJK2_CLUHA/8-717      AC A0A6P3VJK2.1
#=GS A0A0D9W971_9ORYZ/105-281    AC A0A0D9W971.1
#=GS A0A2R6RTG3_ACTCC/447-803    AC A0A2R6RTG3.1
#=GS A0A6P4FD01_DRORH/4-702      AC A0A6P4FD01.1
#=GS A0A162Q881_PHYB8/451-846    AC A0A162Q881.1
#=GS A0A091M9F2_CARIC/1-643      AC A0A091M9F2.1
#=GS U4U0E4_DENPD/10-618         AC U4U0E4.1
#=GS A0A210PUU6_MIZYE/518-579    AC A0A210PUU6.1
#=GS A0A401TQB5_CHIPU/1-207      AC A0A401TQB5.1
#=GS A0A6I8NFR0_ORNAN/13-604     AC A0A6I8NFR0.1
#=GS A0A3B5KMA8_TAKRU/8-713      AC A0A3B5KMA8.2
#=GS A0A2Y9EJJ7_PHYMC/1-609      AC A0A2Y9EJJ7.1
#=GS A0A673L166_9TELE/1-408      AC A0A673L166.1
#=GS F6PLL3_HORSE/13-742         AC F6PLL3.1
#=GS A0A667XJA2_9TELE/8-713      AC A0A667XJA2.1
#=GS A0A0L6WE48_9AGAR/36-250     AC A0A0L6WE48.1
#=GS A0A2U3V3T9_TURTR/99-822     AC A0A2U3V3T9.2
#=GS L9KLM7_TUPCH/13-668         AC L9KLM7.1
#=GS A0A673IMF5_9TELE/1-653      AC A0A673IMF5.1
#=GS A0A0J7KYQ0_LASNI/12-77      AC A0A0J7KYQ0.1
#=GS A0A7F5R5U2_AGRPL/4-735      AC A0A7F5R5U2.1
#=GS A0A0V0WM75_9BILA/356-549    AC A0A0V0WM75.1
#=GS A0A176VH37_MARPO/487-847    AC A0A176VH37.1
#=GS E2QXG1_CANLF/13-738         AC E2QXG1.2
#=GS A0A067TUI1_GALM3/31-247     AC A0A067TUI1.1
#=GS A0A2Z6R8V2_9GLOM/102-246    AC A0A2Z6R8V2.1
#=GS A0A1V2L9D7_CYBFA/4-232      AC A0A1V2L9D7.1
#=GS A0A0C2XFD9_AMAMU/385-794    AC A0A0C2XFD9.1
#=GS A0A401Q3L2_SCYTO/1-547      AC A0A401Q3L2.1
#=GS A0A194PSL8_PAPXU/1-59       AC A0A194PSL8.1
#=GS G7DSS0_MIXOS/444-853        AC G7DSS0.1
#=GS A0A1U7TJ72_CARSF/13-742     AC A0A1U7TJ72.1
#=GS A0A446MN21_TRITD/94-270     AC A0A446MN21.1
#=GS A0A2T6ZET0_TUBBO/46-196     AC A0A2T6ZET0.1
#=GS T1GBE7_MEGSC/1-74           AC T1GBE7.1
#=GS A0A1S4GB46_ANOGA/5-193      AC A0A1S4GB46.1
#=GS E0VH49_PEDHC/4-87           AC E0VH49.1
#=GS A0A6P3WRI6_DINQU/5-704      AC A0A6P3WRI6.1
#=GS A0A2K5W4E4_MACFA/396-461    AC A0A2K5W4E4.2
#=GS A0A165QZS0_EXIGL/2-163      AC A0A165QZS0.1
#=GS A0A401GC59_9APHY/35-250     AC A0A401GC59.1
#=GS A0A1B6PMX0_SORBI/1-129      AC A0A1B6PMX0.2
#=GS A0A251QPH8_PRUPE/26-229     AC A0A251QPH8.1
#=GS A0A6P6G0U0_ZIZJJ/29-150     AC A0A6P6G0U0.1
#=GS A0A1E3I0K9_9TREE/37-231     AC A0A1E3I0K9.1
#=GS A0A1U8LXL1_GOSHI/447-808    AC A0A1U8LXL1.1
#=GS A0A6I9Z1M5_9SAUR/13-637     AC A0A6I9Z1M5.1
#=GS A0A0V0UKL2_9BILA/68-660     AC A0A0V0UKL2.1
#=GS W5J193_ANODA/5-440          AC W5J193.1
#=GS A0A6P5MW75_ARADU/29-230     AC A0A6P5MW75.1
#=GS A0A443SVW8_9ACAR/26-585     AC A0A443SVW8.1
#=GS A0A166LY83_9AGAM/7-239      AC A0A166LY83.1
#=GS A0A3Q7TI74_VULVU/13-738     AC A0A3Q7TI74.1
#=GS A0A286UNX3_9AGAM/7-245      AC A0A286UNX3.1
#=GS T1L081_TETUR/16-380         AC T1L081.1
#=GS NUP88_HUMAN/13-740          AC Q99567.2
#=GS A0A369RV58_9METZ/16-696     AC A0A369RV58.1
#=GS A0A653DW13_CALMS/3-617      AC A0A653DW13.1
#=GS A0A6J2HR50_9PASS/10-720     AC A0A6J2HR50.1
#=GS A0A0P0WEN1_ORYSJ/126-302    AC A0A0P0WEN1.1
#=GS A0A5N5JTD8_PANHP/8-720      AC A0A5N5JTD8.1
#=GS A0A4S2MJV8_OPIFE/565-830    AC A0A4S2MJV8.1
#=GS A0A124SHM1_CYNCS/385-731    AC A0A124SHM1.1
#=GS A0A5E4ERN2_PRUDU/443-799    AC A0A5E4ERN2.1
#=GS F6PLI1_CALJA/13-740         AC F6PLI1.1
#=GS A0A2K1ZD17_POPTR/27-227     AC A0A2K1ZD17.1
#=GS A8NY76_COPC7/420-878        AC A8NY76.2
#=GS A0A2K5MCD5_CERAT/403-457    AC A0A2K5MCD5.1
#=GS A0A0L0VBF7_9BASI/434-650    AC A0A0L0VBF7.1
#=GS F8PNT2_SERL3/391-763        AC F8PNT2.1
#=GS A0A1U8AKM4_NELNU/449-800    AC A0A1U8AKM4.1
#=GS A0A6P3I4A4_BISBI/13-741     AC A0A6P3I4A4.1
#=GS A0A0V0WM03_9BILA/370-668    AC A0A0V0WM03.1
#=GS A0A1U7TJ82_CARSF/399-709    AC A0A1U7TJ82.1
#=GS A0A197JIY3_9FUNG/117-287    AC A0A197JIY3.1
#=GS A0A167JAB5_PHYB8/4-228      AC A0A167JAB5.1
#=GS K7MPK3_SOYBN/25-224         AC K7MPK3.1
#=GS A0A6A6N1H2_HEVBR/60-277     AC A0A6A6N1H2.1
#=GS A0A7N6BUQ0_ANATE/8-718      AC A0A7N6BUQ0.1
#=GS M7CJ66_CHEMY/1-335          AC M7CJ66.1
#=GS A0A0E0KUY7_ORYPU/100-276    AC A0A0E0KUY7.1
#=GS A0A232FBT6_9HYME/5-77       AC A0A232FBT6.1
#=GS A0A0V1NF05_9BILA/12-195     AC A0A0V1NF05.1
#=GS A0A671NP88_9TELE/8-718      AC A0A671NP88.1
#=GS A0A6P4YX71_BRABE/489-684    AC A0A6P4YX71.1
#=GS A0A6A5CXL0_SCHHA/198-400    AC A0A6A5CXL0.1
#=GS A0A077ZBV8_TRITR/3-644      AC A0A077ZBV8.1
#=GS A0A6G0XT24_9STRA/37-311     AC A0A6G0XT24.1
#=GS A0A4U1F029_MONMO/53-761     AC A0A4U1F029.1
#=GS A0A452R984_URSAM/13-434     AC A0A452R984.1
#=GS A0A6P6XTZ3_DERPT/2-746      AC A0A6P6XTZ3.1
#=GS A0A0D2U2B9_CAPO3/574-934    AC A0A0D2U2B9.1
#=GS B4GZB9_DROPE/3-697          AC B4GZB9.1
#=GS A0A0D2VSW8_GOSRA/447-808    AC A0A0D2VSW8.1
#=GS B4K764_DROMO/4-700          AC B4K764.1
#=GS A0A4V4M3J3_WALIC/20-203     AC A0A4V4M3J3.1
#=GS A0A2J7PF85_9NEOP/1-493      AC A0A2J7PF85.1
#=GS A0A5N3Y0K3_MUNRE/163-425    AC A0A5N3Y0K3.1
#=GS A0A1U7U2I6_CARSF/223-683    AC A0A1U7U2I6.1
#=GS A0A445B7U1_ARAHY/29-230     AC A0A445B7U1.1
#=GS A0A6A4KUT4_9ERIC/417-771    AC A0A6A4KUT4.1
#=GS A0A154PIZ5_DUFNO/1-570      AC A0A154PIZ5.1
#=GS U5H995_USTV1/155-326        AC U5H995.1
#=GS A0A1V9ZY54_9STRA/627-810    AC A0A1V9ZY54.1
#=GS A0A6I8NFR0_ORNAN/601-648    AC A0A6I8NFR0.1
#=GS A0A1Y1XZE5_9FUNG/333-812    AC A0A1Y1XZE5.1
#=GS A0A367KTY1_RHIST/351-824    AC A0A367KTY1.1
#=GS A0A6Q2XLE9_ESOLU/8-274      AC A0A6Q2XLE9.1
#=GS A0A670JNI4_PODMU/12-726     AC A0A670JNI4.1
#=GS Q54XC9_DICDI/7-245          AC Q54XC9.1
#=GS A0A183MLN7_9TREM/530-833    AC A0A183MLN7.1
#=GS A0A166LY83_9AGAM/374-810    AC A0A166LY83.1
#=GS J4GU80_9APHY/400-762        AC J4GU80.1
#=GS A0A6J2YS31_SITOR/6-743      AC A0A6J2YS31.1
#=GS A0A672PBV1_SINGR/8-196      AC A0A672PBV1.1
#=GS A0A084W0G1_ANOSI/5-196      AC A0A084W0G1.1
#=GS G7DSS0_MIXOS/81-310         AC G7DSS0.1
#=GS A0A0D0DT93_9AGAM/43-256     AC A0A0D0DT93.1
#=GS A0A2R9A5T4_PANPA/13-740     AC A0A2R9A5T4.1
#=GS A0A5J4NU02_9TREM/572-843    AC A0A5J4NU02.1
#=GS A0A6Q2X7G2_ESOLU/8-719      AC A0A6Q2X7G2.1
#=GS A0A1J1IGS3_9DIPT/360-618    AC A0A1J1IGS3.1
#=GS A0A6P6CFX0_PTEVA/221-679    AC A0A6P6CFX0.1
#=GS A0A0K3C3T2_RHOTO/80-299     AC A0A0K3C3T2.1
#=GS A0A7D8V2W8_9TREE/536-825    AC A0A7D8V2W8.1
#=GS A0A059AA21_EUCGR/101-289    AC A0A059AA21.1
#=GS A0A5M6BX93_9TREE/35-250     AC A0A5M6BX93.1
#=GS A0A120E8K2_9BASI/92-341     AC A0A120E8K2.1
#=GS A0A5D2XRL0_GOSMU/447-805    AC A0A5D2XRL0.1
#=GS A0A1D6JDW1_MAIZE/123-458    AC A0A1D6JDW1.1
#=GS A0A5J9SJ13_9POAL/125-299    AC A0A5J9SJ13.1
#=GS A0A2V3J6S6_9FLOR/88-163     AC A0A2V3J6S6.1
#=GS A0A2I3NAB3_PAPAN/387-441    AC A0A2I3NAB3.1
#=GS A0A1D2MIX7_ORCCI/6-653      AC A0A1D2MIX7.1
#=GS A0A663ETF1_AQUCH/10-720     AC A0A663ETF1.1
#=GS A0A673Z978_SALTR/8-698      AC A0A673Z978.1
#=GS A0A238FL44_9BASI/458-944    AC A0A238FL44.1
#=GS A0A2H3EIM9_ARMGA/34-246     AC A0A2H3EIM9.1
#=GS A0A091JKJ7_EGRGA/1-643      AC A0A091JKJ7.1
#=GS A0A453CSW8_AEGTS/1-124      AC A0A453CSW8.1
#=GS A0A0D0AEN3_9AGAM/379-794    AC A0A0D0AEN3.1
#=GS A0A6F8ZZK8_9TELE/596-655    AC A0A6F8ZZK8.1
#=GS A0A067M8V2_9AGAM/383-807    AC A0A067M8V2.1
#=GS A0A6J1J9F4_CUCMA/27-229     AC A0A6J1J9F4.1
#=GS A0A482VU54_9CUCU/1-241      AC A0A482VU54.1
#=GS A0A4P6XKV7_9ASCO/18-194     AC A0A4P6XKV7.1
#=GS A0A367J034_RHIAZ/163-543    AC A0A367J034.1
#=GS A0A5N6Q8Q4_9ASTR/446-799    AC A0A5N6Q8Q4.1
#=GS F1A2R1_DICPU/7-245          AC F1A2R1.1
#=GS A0A484BMM6_DRONA/948-1644   AC A0A484BMM6.1
#=GS A0A672PBL9_SINGR/186-646    AC A0A672PBL9.1
#=GS B9T865_RICCO/20-164         AC B9T865.1
#=GS A0A1D1V6Z7_RAMVA/52-709     AC A0A1D1V6Z7.1
#=GS A0A059A8T7_EUCGR/502-854    AC A0A059A8T7.1
#=GS M5XM35_PRUPE/26-229         AC M5XM35.1
#=GS A0A0M9A488_9HYME/5-70       AC A0A0M9A488.1
#=GS A0A2R6X118_MARPO/46-264     AC A0A2R6X118.1
#=GS G7JB78_MEDTR/434-789        AC G7JB78.2
#=GS G7NI51_MACMU/13-740         AC G7NI51.1
#=GS A0A670JNF4_PODMU/12-734     AC A0A670JNF4.1
#=GS A0A5B8MJI0_9CHLO/547-745    AC A0A5B8MJI0.1
#=GS A0A672QWU8_SINGR/21-724     AC A0A672QWU8.1
#=GS A0A4S4N3J8_9APHY/4-206      AC A0A4S4N3J8.1
#=GS E4XDW9_OIKDI/19-375         AC E4XDW9.1
#=GS A0A1S3RK33_SALSA/8-698      AC A0A1S3RK33.1
#=GS A0A6J5U3V5_PRUAR/26-229     AC A0A6J5U3V5.1
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