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Database: Pfam
Entry: OprD
LinkDB: OprD
Original site: OprD 
#=GF ID   OprD
#=GF AC   PF03573.16
#=GF DE   outer membrane porin, OprD family
#=GF PI   Peptidase_S43; 
#=GF AU   Griffiths-Jones SR;0000-0001-6043-807X
#=GF SE   MEROPS
#=GF GA   25.00 25.00;
#=GF TC   25.00 25.00;
#=GF NC   24.90 24.90;
#=GF BM   hmmbuild --amino HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Outer_membrane_porin_D
#=GF CL   CL0193
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9636669
#=GF RT   Identification of the catalytic triad of the protein D2 protease
#=GF RT   in Pseudomonas aeruginosa. 
#=GF RA   Yoshihara E, Yoneyama H, Ono T, Nakae T; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 1998;247:142-145.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   10858367
#=GF RT   Role of putative loops 2 and 3 in imipenem passage through the
#=GF RT   specific porin OprD of Pseudomonas aeruginosa. 
#=GF RA   Ochs MM, Bains M, Hancock RE; 
#=GF RL   Antimicrob Agents Chemother 2000;44:1983-1985.
#=GF DR   INTERPRO; IPR005318;
#=GF DR   MEROPS; S43;
#=GF DR   TC; 1.B.25;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family includes outer membrane proteins related to OprD.
#=GF CC   OprD has been described as a serine type peptidase [1]. However
#=GF CC   the proposed catalytic residues are not conserved suggesting
#=GF CC   that many of these proteins are not peptidases.
#=GF SQ   1386
#=GS N2JCQ2_9PSED/30-432       AC N2JCQ2.1
#=GS A0A1D9IQ20_9PSED/30-426   AC A0A1D9IQ20.1
#=GS A0A2D2M363_9PSED/44-458   AC A0A2D2M363.1
#=GS Q4K435_PSEF5/22-440       AC Q4K435.1
#=GS Q88L77_PSEPK/24-416       AC Q88L77.1
#=GS Q6FFF1_ACIAD/30-432       AC Q6FFF1.1
#=GS A0A2I7N2V9_9NEIS/189-423  AC A0A2I7N2V9.1
#=GS A0A562I0E6_9GAMM/25-446   AC A0A562I0E6.1
#=GS C3KBW4_PSEFS/28-438       AC C3KBW4.1
#=GS A0A1V4LLV2_9PSED/30-416   AC A0A1V4LLV2.1
#=GS A0A095VBX0_9GAMM/23-425   AC A0A095VBX0.1
#=GS A0A1H0FLM9_9PSED/37-427   AC A0A1H0FLM9.1
#=GS A0A1I3F542_9PSED/25-426   AC A0A1I3F542.1
#=GS A0A2S2DUC9_9BACT/124-354  AC A0A2S2DUC9.1
#=GS A0A2A4ASU2_9PSED/18-420   AC A0A2A4ASU2.1
#=GS A0A1I4M1H8_9PSED/53-446   AC A0A1I4M1H8.1
#=GS A0A519JD37_ACISP/30-439   AC A0A519JD37.1
#=GS A4XUF8_PSEMY/29-439       AC A4XUF8.1
#=GS A0A1E4UZU9_9PSED/30-437   AC A0A1E4UZU9.1
#=GS U3BEL2_PSEA4/20-443       AC U3BEL2.1
#=GS A0A145WLE2_9GAMM/30-437   AC A0A145WLE2.1
#=GS F9ZNN7_ACICS/35-327       AC F9ZNN7.1
#=GS B4ETI9_PROMH/33-309       AC B4ETI9.1
#=GS A0A077LLX1_9PSED/32-424   AC A0A077LLX1.1
#=GS L1M850_PSEPU/27-411       AC L1M850.1
#=GS I2IVK4_9BURK/119-525      AC I2IVK4.1
#=GS Q9HZH0_PSEAE/27-420       AC Q9HZH0.1
#=GS Q9HZH0_PSEAE/27-420       DR PDB; 3T24 A; 1-393;
#=GS Q9HZH0_PSEAE/27-420       DR PDB; 3T24 B; 3-393;
#=GS Q9HZH0_PSEAE/27-420       DR PDB; 3T24 C; 1-393;
#=GS A0A1I5PPX7_9PROT/71-502   AC A0A1I5PPX7.1
#=GS Q4KB06_PSEF5/31-418       AC Q4KB06.1
#=GS A0A1X7AH88_9GAMM/29-415   AC A0A1X7AH88.1
#=GS F6ADY9_PSEF1/22-437       AC F6ADY9.1
#=GS A0A1V4LTZ4_9PSED/22-445   AC A0A1V4LTZ4.1
#=GS A0A1X7ARG4_9GAMM/46-447   AC A0A1X7ARG4.1
#=GS J2GJA1_9SPHN/81-462       AC J2GJA1.1
#=GS A0A1N6SIL8_9GAMM/25-435   AC A0A1N6SIL8.1
#=GS A0A1H2GWH7_9PSED/25-437   AC A0A1H2GWH7.1
#=GS A0A0K1XCQ8_9GAMM/30-430   AC A0A0K1XCQ8.1
#=GS A0A1Y0KSZ0_9PSED/27-412   AC A0A1Y0KSZ0.1
#=GS A0A2S5KSY5_9PROT/31-338   AC A0A2S5KSY5.1
#=GS Q881E7_PSESM/41-439       AC Q881E7.1
#=GS A0A2N8GDM2_9PSED/27-440   AC A0A2N8GDM2.1
#=GS A0A562I0Y0_9GAMM/25-447   AC A0A562I0Y0.1
#=GS A0A6B3NQX4_9PSED/10-62    AC A0A6B3NQX4.1
#=GS A0A1Y3P397_9PSED/22-447   AC A0A1Y3P397.1
#=GS A4XRY8_PSEMY/28-421       AC A4XRY8.1
#=GS A0A077LFX1_9PSED/23-412   AC A0A077LFX1.1
#=GS A0A1H0A6I6_9PSED/34-440   AC A0A1H0A6I6.1
#=GS A0A1S8DM72_9PSED/23-404   AC A0A1S8DM72.1
#=GS A0A2P7TSV0_9SPHI/41-375   AC A0A2P7TSV0.1
#=GS A0A0D6RVU3_9PSED/30-456   AC A0A0D6RVU3.1
#=GS A0A3G3GQ56_9BACT/94-341   AC A0A3G3GQ56.1
#=GS A0A1A9F1Z3_9GAMM/27-410   AC A0A1A9F1Z3.1
#=GS A0A1T1IES1_9PSED/30-417   AC A0A1T1IES1.1
#=GS A0A285P6U3_9PSED/25-424   AC A0A285P6U3.1
#=GS W9T7U7_9PSED/22-437       AC W9T7U7.1
#=GS A0A2T5HKS1_9PSED/34-424   AC A0A2T5HKS1.1
#=GS A0A1H0CA67_9PSED/23-411   AC A0A1H0CA67.1
#=GS A0A0J8YBQ4_9GAMM/1-362    AC A0A0J8YBQ4.1
#=GS A0A1Q3H3D3_9BACT/38-308   AC A0A1Q3H3D3.1
#=GS A0A6G8C4M5_9BURK/42-453   AC A0A6G8C4M5.1
#=GS A0A1Y3P3J2_9PSED/27-410   AC A0A1Y3P3J2.1
#=GS A0A432C3Y2_9FLAO/116-369  AC A0A432C3Y2.1
#=GS W9SX42_9PSED/27-210       AC W9SX42.1
#=GS A0A089WQT2_9PSED/30-442   AC A0A089WQT2.1
#=GS A0A2A2J059_9PSED/30-440   AC A0A2A2J059.1
#=GS W9TI49_9PSED/1-139        AC W9TI49.1
#=GS A0KH45_AERHH/40-459       AC A0KH45.1
#=GS A0A1I3CDX9_9PSED/30-417   AC A0A1I3CDX9.1
#=GS G0AH39_COLFT/80-486       AC G0AH39.1
#=GS A0A5R9QK09_9PSED/61-480   AC A0A5R9QK09.1
#=GS A0A1S8DFM7_9PSED/30-420   AC A0A1S8DFM7.1
#=GS A0A1I4QB73_9PSED/26-410   AC A0A1I4QB73.1
#=GS V2UAF4_9GAMM/30-441       AC V2UAF4.1
#=GS A0A0T6UHY0_9PSED/33-453   AC A0A0T6UHY0.1
#=GS W9TJC2_9PSED/27-422       AC W9TJC2.1
#=GS A0A068Z123_9GAMM/33-457   AC A0A068Z123.1
#=GS A0A427DKS2_9PSED/22-454   AC A0A427DKS2.1
#=GS A0A1L7I950_9FLAO/111-383  AC A0A1L7I950.1
#=GS A0A3R5X256_9BACT/88-415   AC A0A3R5X256.1
#=GS A0A0D6SUH7_9PSED/26-419   AC A0A0D6SUH7.1
#=GS A0A6P1B3A6_9BACT/1-80     AC A0A6P1B3A6.1
#=GS A8AJD3_CITK8/33-442       AC A8AJD3.1
#=GS A0A663B327_9ENTR/3-386    AC A0A663B327.1
#=GS A0A370DUU1_9GAMM/76-352   AC A0A370DUU1.1
#=GS Q32IP4_SHIDS/2-223        AC Q32IP4.1
#=GS A0A0U4VN97_9PSED/46-449   AC A0A0U4VN97.1
#=GS A0A418XRG3_9BURK/54-457   AC A0A418XRG3.1
#=GS A0A1X7ARW9_9GAMM/43-448   AC A0A1X7ARW9.1
#=GS Q4K7C9_PSEF5/30-445       AC Q4K7C9.1
#=GS A6Q2D1_NITSB/27-454       AC A6Q2D1.1
#=GS A0A1I4PRK5_9PSED/44-476   AC A0A1I4PRK5.1
#=GS A0A5P8NZP6_9PROT/28-455   AC A0A5P8NZP6.1
#=GS A0A5J6Q8D5_9PSED/28-431   AC A0A5J6Q8D5.1
#=GS A8APF7_CITK8/27-421       AC A8APF7.1
#=GS A0A2D3WX05_9PROT/73-322   AC A0A2D3WX05.1
#=GS A9MKA6_SALAR/33-442       AC A9MKA6.1
#=GS S6BE62_PSERE/25-411       AC S6BE62.1
#=GS A0A1E4UYV4_9PSED/27-431   AC A0A1E4UYV4.1
#=GS A0A2V1H6Q5_9GAMM/1-104    AC A0A2V1H6Q5.1
#=GS Q30QZ3_SULDN/74-450       AC Q30QZ3.1
#=GS A0A519JGH5_ACISP/21-412   AC A0A519JGH5.1
#=GS A0A1E7RCY5_9GAMM/30-423   AC A0A1E7RCY5.1
#=GS I4N0Y6_9PSED/44-457       AC I4N0Y6.1
#=GS A0A0F0EDF2_9PSED/24-416   AC A0A0F0EDF2.1
#=GS C6RIB7_9PROT/120-203      AC C6RIB7.1
#=GS A0A658G1K4_9PSED/1-214    AC A0A658G1K4.1
#=GS A0A1G8Z6W0_9PSED/27-431   AC A0A1G8Z6W0.1
#=GS A0A6L6Q9K4_9BURK/64-466   AC A0A6L6Q9K4.1
#=GS A0A6M8U9Z1_9GAMM/33-440   AC A0A6M8U9Z1.1
#=GS A0A080KPX4_9GAMM/38-464   AC A0A080KPX4.1
#=GS A0A133XM74_9RHOO/190-470  AC A0A133XM74.1
#=GS A0A2D3WFX0_9PROT/82-418   AC A0A2D3WFX0.1
#=GS A0A3N9TI21_9VIBR/26-409   AC A0A3N9TI21.1
#=GS A0A6P1AWQ5_9BACT/1-118    AC A0A6P1AWQ5.1
#=GS A0A1V0B3V9_9PSED/25-434   AC A0A1V0B3V9.1
#=GS A0A658GCN8_9PSED/26-417   AC A0A658GCN8.1
#=GS A0A2D2M2T9_9PSED/30-445   AC A0A2D2M2T9.1
#=GS Q4KI04_PSEF5/28-423       AC Q4KI04.1
#=GS A0A4P8YGZ3_9ENTR/126-441  AC A0A4P8YGZ3.1
#=GS Q9I6P8_PSEAE/31-420       AC Q9I6P8.1
#=GS Q9I6P8_PSEAE/31-420       DR PDB; 4FMS A; 7-396;
#=GS Q9I6P8_PSEAE/31-420       DR PDB; 3SZD B; 7-396;
#=GS Q9I6P8_PSEAE/31-420       DR PDB; 4FMS B; 7-396;
#=GS Q9I6P8_PSEAE/31-420       DR PDB; 3SZD A; 7-396;
#=GS A0A6C0TUC9_9PSED/28-414   AC A0A6C0TUC9.1
#=GS A0A658GFQ1_9PSED/30-427   AC A0A658GFQ1.1
#=GS A0A2P6UMJ1_9PROT/20-381   AC A0A2P6UMJ1.1
#=GS Q9I1Q4_PSEAE/29-415       AC Q9I1Q4.1
#=GS Q9I1Q4_PSEAE/29-415       DR PDB; 4FT6 A; 1-387;
#=GS A0A6C0TSB0_9PSED/29-409   AC A0A6C0TSB0.1
#=GS A0A2N5EQB8_9GAMM/33-461   AC A0A2N5EQB8.1
#=GS A0A0A8K571_9RHIZ/70-459   AC A0A0A8K571.1
#=GS Q9I0X7_PSEAE/35-447       AC Q9I0X7.1
#=GS A0A1H0AHK6_9PSED/27-423   AC A0A1H0AHK6.1
#=GS W1DJ31_KLEPN/33-442       AC W1DJ31.1
#=GS W9TPU9_9PSED/1-308        AC W9TPU9.1
#=GS S3P140_9GAMM/22-414       AC S3P140.1
#=GS A0A024HEG6_PSEKB/26-419   AC A0A024HEG6.1
#=GS A0A5M8FQ67_9GAMM/194-345  AC A0A5M8FQ67.1
#=GS CHIP_SALTY/33-442         AC Q7CQY4.1
#=GS A0A2P8VPI4_9ENTR/33-444   AC A0A2P8VPI4.1
#=GS A0A562IZ11_9GAMM/23-443   AC A0A562IZ11.1
#=GS A0A0F0EG61_9PSED/30-441   AC A0A0F0EG61.1
#=GS A0A4P9VL09_9GAMM/36-442   AC A0A4P9VL09.1
#=GS A0A1V9FL72_9BACT/51-364   AC A0A1V9FL72.1
#=GS A0A1G9HRE9_9PSED/26-420   AC A0A1G9HRE9.1
#=GS A0A1B7YZ32_9FLAO/100-357  AC A0A1B7YZ32.1
#=GS A0A0A7LRE5_9BACT/90-374   AC A0A0A7LRE5.1
#=GS A0A069P293_9BURK/62-464   AC A0A069P293.1
#=GS U2ZJH6_PSEA4/30-420       AC U2ZJH6.1
#=GS A0A2I8Q6Z8_9ENTR/33-463   AC A0A2I8Q6Z8.1
#=GS A0A0A1YFC8_9PSED/31-440   AC A0A0A1YFC8.1
#=GS A0A1I4VV99_9PSED/30-434   AC A0A1I4VV99.1
#=GS A0A1Z5HBM7_9GAMM/110-410  AC A0A1Z5HBM7.1
#=GS A0A6B3NVI4_9PSED/11-423   AC A0A6B3NVI4.1
#=GS L0M524_ENTBF/28-337       AC L0M524.1
#=GS S6GKR2_9GAMM/27-405       AC S6GKR2.1
#=GS A0A1X1EK66_PANCY/7-190    AC A0A1X1EK66.1
#=GS A0A1I3EQT5_9BURK/91-496   AC A0A1I3EQT5.1
#=GS E4TYI2_SULKY/18-382       AC E4TYI2.1
#=GS A0A089WJW6_9PSED/30-446   AC A0A089WJW6.1
#=GS A0A1T1HYD3_9PSED/30-418   AC A0A1T1HYD3.1
#=GS A0A0J1HHD5_9GAMM/32-455   AC A0A0J1HHD5.1
#=GS A0A378FBS0_KLEVA/27-421   AC A0A378FBS0.1
#=GS A0A1M7XXZ7_9DELT/82-426   AC A0A1M7XXZ7.1
#=GS A0A385Z4A2_9PSED/30-424   AC A0A385Z4A2.1
#=GS A0A1G9ZA33_9PSED/28-420   AC A0A1G9ZA33.1
#=GS A0A381DHG2_9PROT/109-431  AC A0A381DHG2.1
#=GS A0A0D6SYQ6_9PSED/31-419   AC A0A0D6SYQ6.1
#=GS A0A1T1HME7_9PSED/37-429   AC A0A1T1HME7.1
#=GS A0A0D6SQF3_9PSED/58-478   AC A0A0D6SQF3.1
#=GS A0A0X1T408_PSEAA/44-465   AC A0A0X1T408.1
#=GS A4VPE4_PSEU5/28-423       AC A4VPE4.1
#=GS A0A1H0CU20_9PSED/27-417   AC A0A1H0CU20.1
#=GS A0A0F0EN12_9PSED/22-443   AC A0A0F0EN12.1
#=GS A0A1D9IK66_9PSED/25-416   AC A0A1D9IK66.1
#=GS A0A1D9IJB5_9PSED/31-438   AC A0A1D9IJB5.1
#=GS A0A0R0CV54_9GAMM/16-408   AC A0A0R0CV54.1
#=GS A0A0M2KM86_9GAMM/33-466   AC A0A0M2KM86.1
#=GS S6AIH6_PSERE/31-442       AC S6AIH6.1
#=GS A0A4R6EYH6_9ENTR/33-449   AC A0A4R6EYH6.1
#=GS C0QEB2_DESAH/33-415       AC C0QEB2.1
#=GS A0A1V4LS24_9PSED/25-416   AC A0A1V4LS24.1
#=GS A0A2A7UWE6_COMTR/30-441   AC A0A2A7UWE6.1
#=GS A0A443I9N6_9GAMM/28-340   AC A0A443I9N6.1
#=GS A0A0A1YJS3_9PSED/32-428   AC A0A0A1YJS3.1
#=GS A0A1V4LJ89_9PSED/28-427   AC A0A1V4LJ89.1
#=GS A0A6C2USY6_9BACT/2-341    AC A0A6C2USY6.1
#=GS G3XDA5_PSEAE/30-459       AC G3XDA5.1
#=GS G3XDA5_PSEAE/30-459       DR PDB; 4FRX A; 1-430;
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#=GS I2B5B7_SHIBC/27-422       AC I2B5B7.1
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