GenomeNet

Database: Pfam
Entry: PAS_2
LinkDB: PAS_2
Original site: PAS_2 
#=GF ID   PAS_2
#=GF AC   PF08446.13
#=GF DE   PAS fold
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_437 (Release 18.0)
#=GF GA   21.40 14.00;
#=GF TC   21.40 14.00;
#=GF NC   21.30 13.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF WK   PAS domain
#=GF CL   CL0183
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9301332
#=GF RT   PAS domain S-boxes in archaea, bacteria and sensors for oxygen
#=GF RT   and redox. 
#=GF RA   Zhulin IB, Taylor BL, Dixon R; 
#=GF RL   Trends Biochem Sci 1997;22:331-333.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   7756254
#=GF RT   1.4 A structure of photoactive yellow protein, a cytosolic
#=GF RT   photoreceptor: unusual fold, active site, and chromophore. 
#=GF RA   Borgstahl GE, Williams DR, Getzoff ED; 
#=GF RL   Biochemistry 1995;34:6278-6287.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   9382818
#=GF RT   PAS: a multifunctional domain family comes to light. 
#=GF RA   Ponting CP, Aravind L; 
#=GF RL   Curr Biol 1997;7:674-677.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   15009198
#=GF RT   The PAS fold: a redefination of the PAS domain based upon
#=GF RT   structural prediction. 
#=GF RA   Hefti MH, Francoijs KJ, de Vries SC, Dixon R, Vervoort J; 
#=GF RL   Eur J Biochem 2004;271:1198-1208.
#=GF DR   INTERPRO; IPR013654;
#=GF DR   SCOP; 2phy; fa;
#=GF DR   SMART; PAS;
#=GF DR   HOMSTRAD; PAS;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   The PAS fold corresponds to the structural domain that has
#=GF CC   previously been defined as PAS and PAC motifs [4]. The PAS fold
#=GF CC   appears in archaea, eubacteria and eukarya.
#=GF SQ   3108
#=GS A0A4Q9PSF7_9APHY/120-214    AC A0A4Q9PSF7.1
#=GS K9V7Y6_9CYAN/13-120         AC K9V7Y6.1
#=GS A0A512IM19_9RHIZ/159-268    AC A0A512IM19.1
#=GS A0A061GL48_THECC/82-197     AC A0A061GL48.1
#=GS K2RPB5_MACPH/47-129         AC K2RPB5.1
#=GS A0A437M8Q8_9SPHN/13-120     AC A0A437M8Q8.1
#=GS A0A1Q3GQA7_9BACT/12-126     AC A0A1Q3GQA7.1
#=GS A0A2M9B4R9_9BACT/23-130     AC A0A2M9B4R9.1
#=GS A0A3E2NKE6_9SPHI/6-116      AC A0A3E2NKE6.1
#=GS A0A3M7LDX6_9FLAO/6-116      AC A0A3M7LDX6.1
#=GS V5XGW9_MYCNE/13-123         AC V5XGW9.1
#=GS A0A653W6Q1_9FLAO/17-120     AC A0A653W6Q1.1
#=GS PHYB_ORYSJ/105-226          AC Q10MG9.1
#=GS A0A446RSD2_TRITD/69-185     AC A0A446RSD2.1
#=GS A0A2H5N484_CITUN/82-197     AC A0A2H5N484.1
#=GS A0A2U0ZUK4_9BACT/12-115     AC A0A2U0ZUK4.1
#=GS Q2HRN2_MEDTR/75-185         AC Q2HRN2.1
#=GS A0A3Q0EWV1_VIGRR/73-186     AC A0A3Q0EWV1.1
#=GS A0A4Q7Y8R4_9ACTN/14-114     AC A0A4Q7Y8R4.1
#=GS N4U229_FUSC1/301-422        AC N4U229.1
#=GS A0A370GAA5_GLULI/19-123     AC A0A370GAA5.1
#=GS A0A1Y2ENF5_9BASI/141-251    AC A0A1Y2ENF5.1
#=GS A0A2N5UHN3_9BASI/602-668    AC A0A2N5UHN3.1
#=GS A0A1L9S4V0_9EURO/63-186     AC A0A1L9S4V0.1
#=GS A0A564G0S2_9RHIZ/152-259    AC A0A564G0S2.1
#=GS C1D2Z0_DEIDV/26-136         AC C1D2Z0.1
#=GS A0A2S7R1G4_9HELO/178-301    AC A0A2S7R1G4.1
#=GS A0A2G9GHP8_9LAMI/76-189     AC A0A2G9GHP8.1
#=GS A0A1H9FYH9_9BACT/11-111     AC A0A1H9FYH9.1
#=GS A0A1M4YIV9_9BACT/14-121     AC A0A1M4YIV9.1
#=GS A0A5N6YWW0_9EURO/175-255    AC A0A5N6YWW0.1
#=GS A0A364XZ45_9BACT/12-115     AC A0A364XZ45.1
#=GS A0A1V6PF44_PENDC/221-344    AC A0A1V6PF44.1
#=GS K9PEU5_9CYAN/17-116         AC K9PEU5.1
#=GS A0A1U7I4E0_9CYAN/16-126     AC A0A1U7I4E0.1
#=GS A0A1H2D6X9_9ACTN/29-136     AC A0A1H2D6X9.1
#=GS A0A369VYH2_9SPHN/12-119     AC A0A369VYH2.1
#=GS B7KIT7_GLOC7/14-122         AC B7KIT7.1
#=GS A0A1U8K0U7_GOSHI/70-186     AC A0A1U8K0U7.1
#=GS A0A640Q7E1_9FLAO/15-130     AC A0A640Q7E1.1
#=GS A0A074KYK4_9BACT/12-116     AC A0A074KYK4.1
#=GS A0A103TJB1_CYNCS/84-200     AC A0A103TJB1.1
#=GS A0A2S7R4J2_9HELO/256-378    AC A0A2S7R4J2.1
#=GS A0A0G2ZLJ8_9DELT/13-115     AC A0A0G2ZLJ8.1
#=GS A0A1J1LJ31_9CYAN/16-124     AC A0A1J1LJ31.1
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#=GS A0A433X446_9RHIZ/20-116     AC A0A433X446.1
#=GS A0A2K8UJK0_9GAMM/17-125     AC A0A2K8UJK0.1
#=GS PHYB1_SOLLC/80-196          AC Q9ZS62.1
#=GS A0A248K2T0_9PROT/12-116     AC A0A248K2T0.1
#=GS A0A4Q5L0G6_9GAMM/28-136     AC A0A4Q5L0G6.1
#=GS B2J2D1_NOSP7/15-125         AC B2J2D1.1
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         AC F7RW09.1
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#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAW G; 17-120;
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#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 5LLY C; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6ET7 B; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAW E; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAW B; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 5LLY D; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAX A; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAW A; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAW H; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAW F; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 5LLY B; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 5LLX A; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 5LLW B; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 6SAW C; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 5LLY A; 17-120;
#=GS F7RW09_9GAMM/17-120         DR PDB; 5LLW A; 17-120;
#=GS A0A5A7TVH9_CUCME/69-185     AC A0A5A7TVH9.1
#=GS A0A1Z4S8B2_9NOSO/17-123     AC A0A1Z4S8B2.1
#=GS A0A446S5P0_TRITD/100-221    AC A0A446S5P0.1
#=GS A0A1Y2LTP3_EPING/258-352    AC A0A1Y2LTP3.1
#=GS A0A2T4ADX9_TRIHA/680-755    AC A0A2T4ADX9.1
#=GS A0A4Z1NXD0_9PEZI/220-341    AC A0A4Z1NXD0.1
#=GS A0A1X7RUE7_ZYMTR/249-371    AC A0A1X7RUE7.1
#=GS A0A0Q5R920_9SPHN/12-119     AC A0A0Q5R920.1
#=GS A0A502FAW4_9PROT/157-266    AC A0A502FAW4.1
#=GS A0A443PU58_9MAGN/74-190     AC A0A443PU58.1
#=GS A0A316ZCW7_9BASI/346-434    AC A0A316ZCW7.1
#=GS A0A0C1MYH2_9CYAN/2-108      AC A0A0C1MYH2.1
#=GS A0A4Q2DRM5_9AGAR/266-339    AC A0A4Q2DRM5.1
#=GS B7JUJ6_RIPO1/12-118         AC B7JUJ6.1
#=GS A0A2P6R7Z8_ROSCH/69-185     AC A0A2P6R7Z8.1
#=GS A0A218QLM5_9CYAN/10-117     AC A0A218QLM5.1
#=GS F6H723_VITVI/77-193         AC F6H723.1
#=GS G6EE31_9SPHN/1-106          AC G6EE31.1
#=GS A0A0M1JGS3_9GAMM/17-119     AC A0A0M1JGS3.1
#=GS A0A2X4AUH1_PAULE/21-125     AC A0A2X4AUH1.1
#=GS A0A543EQ21_9MICO/26-115     AC A0A543EQ21.1
#=GS E0UKC7_GLOV7/15-122         AC E0UKC7.1
#=GS A0A2Z6AI11_9SPHN/18-125     AC A0A2Z6AI11.1
#=GS A0A3M7M2Q6_9PLEO/32-154     AC A0A3M7M2Q6.1
#=GS A0A6A4NSH8_LUPAL/69-185     AC A0A6A4NSH8.1
#=GS A0A074WFZ8_9PEZI/168-291    AC A0A074WFZ8.1
#=GS C1PHB8_SOYBN/75-191         AC C1PHB8.1
#=GS Q0BS12_GRABC/24-133         AC Q0BS12.1
#=GS A0A367QPE6_9NOSO/4-110      AC A0A367QPE6.1
#=GS A0A446QUG0_TRITD/100-221    AC A0A446QUG0.1
#=GS A0A067JKI6_JATCU/70-186     AC A0A067JKI6.1
#=GS A0A142HP68_9SPHI/11-121     AC A0A142HP68.1
#=GS A0A2J6LQZ1_LACSA/81-189     AC A0A2J6LQZ1.1
#=GS A0A059D230_EUCGR/69-185     AC A0A059D230.1
#=GS A0A2S6IV69_9ACTN/22-126     AC A0A2S6IV69.1
#=GS A0A327KBI1_9RHIZ/20-127     AC A0A327KBI1.1
#=GS A0A1M6BTF0_9RHOB/16-123     AC A0A1M6BTF0.1
#=GS A0A2G3CW08_CAPCH/1-41       AC A0A2G3CW08.1
#=GS A0A318Z1X5_9EURO/181-304    AC A0A318Z1X5.1
#=GS E6WXH5_PSEUU/14-120         AC E6WXH5.1
#=GS A0A1Y6EU83_9SPHN/13-120     AC A0A1Y6EU83.1
#=GS W9CG51_SCLBF/132-253        AC W9CG51.1
#=GS A0A2T6AJF4_9RHOB/17-124     AC A0A2T6AJF4.1
#=GS A0A5D2X7D8_GOSMU/70-186     AC A0A5D2X7D8.1
#=GS A0A2W4D0V5_9RHIZ/13-120     AC A0A2W4D0V5.1
#=GS A0A0J0XI47_9TREE/386-461    AC A0A0J0XI47.1
#=GS A0A222XA85_9CELL/22-135     AC A0A222XA85.1
#=GS A0A2R4CDL3_9BURK/17-121     AC A0A2R4CDL3.1
#=GS A0A1L9UZA7_ASPBC/193-315    AC A0A1L9UZA7.1
#=GS A0A540KL60_MALBA/80-196     AC A0A540KL60.1
#=GS A0A4D9AQ38_SALSN/68-177     AC A0A4D9AQ38.1
#=GS A0A2R6QAF5_ACTCC/50-163     AC A0A2R6QAF5.1
#=GS A0A401ZPI3_9CHLR/15-122     AC A0A401ZPI3.1
#=GS A0A0G9MVB6_9SPHN/13-120     AC A0A0G9MVB6.1
#=GS A0A4R5UME3_9RHIZ/11-108     AC A0A4R5UME3.1
#=GS V4U025_9ROSI/85-201         AC V4U025.1
#=GS A0A287P2I4_HORVV/102-223    AC A0A287P2I4.1
#=GS A0A317FGI8_9PROT/17-121     AC A0A317FGI8.1
#=GS A0A395M775_9HYPO/306-427    AC A0A395M775.1
#=GS A0A1N6RLT2_9GAMM/16-121     AC A0A1N6RLT2.1
#=GS A0A3B6JG50_WHEAT/73-189     AC A0A3B6JG50.1
#=GS A0A1Z4R100_9CYAN/22-130     AC A0A1Z4R100.1
#=GS A0A1S3YXR1_TOBAC/84-200     AC A0A1S3YXR1.1
#=GS A0A6A3C9J1_HIBSY/94-210     AC A0A6A3C9J1.1
#=GS A4YMN8_BRASO/18-123         AC A4YMN8.1
#=GS K9Y146_STAC7/16-126         AC K9Y146.1
#=GS A0A2J6LEJ3_LACSA/79-195     AC A0A2J6LEJ3.1
#=GS A0A6I3JG54_9ACTN/20-130     AC A0A6I3JG54.1
#=GS A0A433NN69_CHLFR/17-127     AC A0A433NN69.1
#=GS A0A0D2SSX1_GOSRA/65-181     AC A0A0D2SSX1.1
#=GS A0A0D9PC38_METAN/259-368    AC A0A0D9PC38.1
#=GS A0A1H6T7H2_9BACT/17-121     AC A0A1H6T7H2.1
#=GS A0A1G5P4Y3_AFIMA/14-122     AC A0A1G5P4Y3.1
#=GS U1GRG7_ENDPU/265-386        AC U1GRG7.1
#=GS A0A1I7FHA9_9BACT/20-128     AC A0A1I7FHA9.1
#=GS A0A1W6E312_9BACT/11-121     AC A0A1W6E312.1
#=GS A0A1H7U597_9SPHN/22-118     AC A0A1H7U597.1
#=GS A0A162HMW5_9SPHN/11-118     AC A0A162HMW5.1
#=GS L0NK43_9RHIZ/11-107         AC L0NK43.1
#=GS A0A446R7Y4_TRITD/69-185     AC A0A446R7Y4.1
#=GS A0A166VFV4_9PEZI/249-371    AC A0A166VFV4.1
#=GS A0A6A3C6M1_HIBSY/86-202     AC A0A6A3C6M1.1
#=GS A0A6B3H7G2_9ACTN/29-106     AC A0A6B3H7G2.1
#=GS A0A3B6JKM2_WHEAT/98-219     AC A0A3B6JKM2.1
#=GS A0A196M8Z7_9SPHN/19-126     AC A0A196M8Z7.1
#=GS A0A3N4IH80_ASCIM/159-240    AC A0A3N4IH80.1
#=GS A0A395IBV7_ASPHC/181-304    AC A0A395IBV7.1
#=GS A0A545V7M8_9HYPO/234-356    AC A0A545V7M8.1
#=GS U5N7F9_9BURK/16-125         AC U5N7F9.1
#=GS A0A3D8QSA7_9EURO/196-279    AC A0A3D8QSA7.1
#=GS A0A2R6P477_ACTCC/76-192     AC A0A2R6P477.1
#=GS A0A367GQW2_9SPHI/9-120      AC A0A367GQW2.1
#=GS A0A199V931_ANACO/81-197     AC A0A199V931.1
#=GS A0A0E0D5T3_9ORYZ/70-186     AC A0A0E0D5T3.1
#=GS J6J6M5_9RHOB/1-98           AC J6J6M5.1
#=GS PHYC_ARATH/64-180           AC P14714.1
#=GS A0A453H8S9_AEGTS/4-57       AC A0A453H8S9.1
#=GS A0A0A0KHC2_CUCSA/74-190     AC A0A0A0KHC2.1
#=GS A0A3B6JL02_WHEAT/98-219     AC A0A3B6JL02.1
#=GS A0A3L6SF43_PANMI/68-184     AC A0A3L6SF43.1
#=GS A0A398AKB0_BRACM/66-184     AC A0A398AKB0.1
#=GS A0A086P9V7_SPHHM/19-126     AC A0A086P9V7.1
#=GS A0A328ACJ5_9CAUL/17-118     AC A0A328ACJ5.1
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