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Database: Pfam
Entry: PKD_channel
LinkDB: PKD_channel
Original site: PKD_channel 
#=GF ID   PKD_channel
#=GF AC   PF08016.15
#=GF DE   Polycystin cation channel
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU   Chuguransky S;0000-0002-0520-0736
#=GF SE   Bateman A
#=GF GA   22.40 22.40;
#=GF TC   22.40 22.40;
#=GF NC   22.30 22.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Polycystin_cation_channel_family
#=GF CL   CL0030
#=GF RN   [1]
#=GF RM   10517637
#=GF RT   Polycystin-L is a calcium-regulated cation channel permeable to
#=GF RT   calcium ions. 
#=GF RA   Chen XZ, Vassilev PM, Basora N, Peng JB, Nomura H, Segal Y,
#=GF RA   Brown EM, Reeders ST, Hediger MA, Zhou J; 
#=GF RL   Nature 1999;401:383-386.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11264013
#=GF RT   Polycystin-2 is a novel cation channel implicated in defective
#=GF RT   intracellular Ca(2+) homeostasis in polycystic kidney disease. 
#=GF RA   Vassilev PM, Guo L, Chen XZ, Segal Y, Peng JB, Basora N,
#=GF RA   Babakhanlou H, Cruger G, Kanazirska M, Ye Cp, Brown EM, Hediger
#=GF RA   MA, Zhou J; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 2001;282:341-350.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   29567962
#=GF RT   Cryo-EM structure of the polycystic kidney disease-like channel
#=GF RT   PKD2L1.
#=GF RA   Su Q, Hu F, Liu Y, Ge X, Mei C, Yu S, Shen A, Zhou Q, Yan C, Lei
#=GF RA   J, Zhang Y, Liu X, Wang T;
#=GF RL   Nat Commun. 2018;9:1192.
#=GF DR   INTERPRO; IPR013122;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family contains the cation channel region from group II of
#=GF CC   Transient receptor potential (TRP) channels, the TRPP subfamily,
#=GF CC   including PKD1, PKD2, PKD2L and mucolipin proteins [1,2,3].
#=GF SQ   5617
#=GS A0A7M7PNN4_STRPU/2537-2759  AC A0A7M7PNN4.1
#=GS A0A2K5MDN8_CERAT/273-497    AC A0A2K5MDN8.1
#=GS A0A4X2M246_VOMUR/1816-2038  AC A0A4X2M246.1
#=GS A0A6P8HIM9_ACTTE/2197-2416  AC A0A6P8HIM9.1
#=GS W4GSN6_9STRA/20-164         AC W4GSN6.1
#=GS A0A2I0U929_LIMLA/2292-2513  AC A0A2I0U929.1
#=GS A0A5J5MZ59_MUNRE/363-508    AC A0A5J5MZ59.1
#=GS H3AQZ1_LATCH/1866-2088      AC H3AQZ1.1
#=GS A0A2Y9EAN5_TRIMA/441-664    AC A0A2Y9EAN5.1
#=GS A0A653CJE7_CALMS/262-486    AC A0A653CJE7.1
#=GS A0A6J2QMV8_COTGO/4071-4295  AC A0A6J2QMV8.1
#=GS A0A0A1TKJ8_9HYPO/246-449    AC A0A0A1TKJ8.1
#=GS A7RJ08_NEMVE/1-115          AC A7RJ08.1
#=GS A0A384APF5_BALAS/1183-1405  AC A0A384APF5.1
#=GS A0A7E6DTZ6_9CHIR/390-534    AC A0A7E6DTZ6.1
#=GS A0A3N4JW36_9PEZI/261-461    AC A0A3N4JW36.1
#=GS A0A1R2B2I2_9CILI/314-451    AC A0A1R2B2I2.1
#=GS A0A401SBA6_CHIPU/490-636    AC A0A401SBA6.1
#=GS A0A1U7QPD3_MESAU/466-689    AC A0A1U7QPD3.1
#=GS A0A6P4YS77_BRABE/1233-1456  AC A0A6P4YS77.1
#=GS A0A6P9DKA9_PANGU/2328-2548  AC A0A6P9DKA9.1
#=GS A0A672NW49_SINGR/310-455    AC A0A672NW49.1
#=GS L1IPP5_GUITC/304-530        AC L1IPP5.1
#=GS A0A4W6G9S8_LATCA/1558-1781  AC A0A4W6G9S8.1
#=GS A0A2K5K034_COLAP/273-497    AC A0A2K5K034.1
#=GS A0A1S3R325_SALSA/367-508    AC A0A1S3R325.1
#=GS A0A672GXT0_SALFA/396-628    AC A0A672GXT0.1
#=GS A0A6P6PC75_CARAU/3986-4210  AC A0A6P6PC75.1
#=GS A0A329RYS4_9STRA/267-512    AC A0A329RYS4.1
#=GS A0A671W489_SPAAU/380-523    AC A0A671W489.1
#=GS A0A3Q3S5S8_9TELE/3962-4188  AC A0A3Q3S5S8.1
#=GS A0A671NN25_9TELE/367-512    AC A0A671NN25.1
#=GS L8HX60_9CETA/1818-2040      AC L8HX60.1
#=GS H2PZB2_PANTR/363-508        AC H2PZB2.1
#=GS J9IY50_9SPIT/667-893        AC J9IY50.1
#=GS A0A671WJC4_SPAAU/382-606    AC A0A671WJC4.1
#=GS A0A2Y9H931_NEOSC/261-452    AC A0A2Y9H931.1
#=GS A0A3M6TAH4_POCDA/2254-2479  AC A0A3M6TAH4.1
#=GS A0A3M6V5K2_POCDA/1779-2004  AC A0A3M6V5K2.1
#=GS W5PEX8_SHEEP/2181-2405      AC W5PEX8.1
#=GS A0A3B1KJ71_ASTMX/381-524    AC A0A3B1KJ71.1
#=GS A0A2B4STH1_STYPI/3556-3780  AC A0A2B4STH1.1
#=GS A0A662YZB7_ACIRT/4340-4562  AC A0A662YZB7.1
#=GS A0A4W6BM36_LATCA/359-503    AC A0A4W6BM36.1
#=GS H0W5T2_CAVPO/1732-1954      AC H0W5T2.2
#=GS A0A3Q7WGT7_URSAR/362-508    AC A0A3Q7WGT7.1
#=GS A0A556VBL7_BAGYA/888-1047   AC A0A556VBL7.1
#=GS A0A3Q2CXK3_CYPVA/338-485    AC A0A3Q2CXK3.1
#=GS A0A099ZH92_TINGU/266-490    AC A0A099ZH92.1
#=GS A0A6P5JQC2_PHACI/299-486    AC A0A6P5JQC2.1
#=GS A0A087VHJ2_BALRE/3815-4037  AC A0A087VHJ2.1
#=GS A0A0M0KNB4_9EUKA/546-767    AC A0A0M0KNB4.1
#=GS A0A6C0PN66_OCTVU/339-563    AC A0A6C0PN66.1
#=GS A0A5N4BZA1_CAMDR/3868-4089  AC A0A5N4BZA1.1
#=GS A0A663EQ64_AQUCH/364-588    AC A0A663EQ64.1
#=GS A0A3Q7WFT4_URSAR/273-497    AC A0A3Q7WFT4.1
#=GS A0A7M7TFY0_APIME/408-553    AC A0A7M7TFY0.1
#=GS A0A3M6U391_POCDA/1492-1719  AC A0A3M6U391.1
#=GS A0A452SBE6_URSAM/466-689    AC A0A452SBE6.1
#=GS L5MAM0_MYODS/340-562        AC L5MAM0.1
#=GS A0A662XGS9_9STRA/293-514    AC A0A662XGS9.1
#=GS C3YUX4_BRAFL/62-290         AC C3YUX4.1
#=GS A0A6P4JHD1_DROKI/366-593    AC A0A6P4JHD1.1
#=GS A0A3P8U3P9_AMPPE/1997-2218  AC A0A3P8U3P9.1
#=GS L8IZ62_9CETA/316-508        AC L8IZ62.1
#=GS A0A671PWP8_9TELE/290-498    AC A0A671PWP8.1
#=GS A0A315V0Q2_GAMAF/83-309     AC A0A315V0Q2.1
#=GS A0A2K5NFA2_CERAT/301-447    AC A0A2K5NFA2.1
#=GS A0A3M6T4G8_POCDA/1630-1856  AC A0A3M6T4G8.1
#=GS A0A1S3HIV6_LINUN/905-1130   AC A0A1S3HIV6.1
#=GS E1Z8F2_CHLVA/1151-1305      AC E1Z8F2.1
#=GS H1VLU4_COLHI/248-456        AC H1VLU4.1
#=GS A0A6P8VVD1_GYMAC/3998-4223  AC A0A6P8VVD1.1
#=GS K8EQY2_9CHLO/331-465        AC K8EQY2.1
#=GS A0A0P7UN57_SCLFO/360-506    AC A0A0P7UN57.1
#=GS A0A2P6TDW7_CHLSO/2193-2352  AC A0A2P6TDW7.1
#=GS J9KWP9_ACYPI/293-522        AC J9KWP9.2
#=GS A0A6P6JIA5_CARAU/389-613    AC A0A6P6JIA5.1
#=GS R0KNZ2_ANAPL/253-476        AC R0KNZ2.1
#=GS I3NG27_ICTTR/1737-1959      AC I3NG27.2
#=GS A0A6J8B5E1_MYTCO/635-859    AC A0A6J8B5E1.1
#=GS A0A6P3HK55_BISBI/273-497    AC A0A6P3HK55.1
#=GS A0A437DI61_ORYJA/2130-2353  AC A0A437DI61.1
#=GS B4HKR0_DROSE/369-596        AC B4HKR0.1
#=GS A0A553R430_9TELE/337-483    AC A0A553R430.1
#=GS A0A493U2T7_ANAPP/271-438    AC A0A493U2T7.1
#=GS W5KFY4_ASTMX/1444-1667      AC W5KFY4.2
#=GS F1PGE3_CANLF/370-593        AC F1PGE3.3
#=GS M4AE76_XIPMA/3984-4209      AC M4AE76.2
#=GS J9I3V8_9SPIT/263-485        AC J9I3V8.1
#=GS A0A5N3VWA6_MUNRE/1963-2185  AC A0A5N3VWA6.1
#=GS A0A6H5GRA4_9HEMI/190-419    AC A0A6H5GRA4.1
#=GS A0A672VBQ3_STRHB/3811-4034  AC A0A672VBQ3.1
#=GS A0A6P7F1D4_DIAVI/353-451    AC A0A6P7F1D4.1
#=GS I7LV23_TETTS/354-496        AC I7LV23.2
#=GS A0A0D9S6V9_CHLSB/345-488    AC A0A0D9S6V9.1
#=GS A0A0W8CGS8_PHYNI/390-533    AC A0A0W8CGS8.1
#=GS Q6C4S0_YARLI/245-461        AC Q6C4S0.1
#=GS A0A5C3KZ27_9AGAR/254-333    AC A0A5C3KZ27.1
#=GS A0A6Q2XZP5_ESOLU/361-505    AC A0A6Q2XZP5.1
#=GS A0A3Q3KVW2_9LABR/2653-2737  AC A0A3Q3KVW2.1
#=GS A0A1S3K9X5_LINUN/375-599    AC A0A1S3K9X5.1
#=GS A0A5F4W3F6_CALJA/2343-2492  AC A0A5F4W3F6.1
#=GS A0A6J2UNM0_CHACN/1962-2185  AC A0A6J2UNM0.1
#=GS A0A6G0TZZ6_APHGL/402-542    AC A0A6G0TZZ6.1
#=GS F4WWQ3_ACREC/350-494        AC F4WWQ3.1
#=GS M3YDV1_MUSPF/2181-2405      AC M3YDV1.1
#=GS C3Y976_BRAFL/3101-3320      AC C3Y976.1
#=GS D8U1D4_VOLCA/273-384        AC D8U1D4.1
#=GS A0A671PF37_9TELE/372-516    AC A0A671PF37.1
#=GS A0A6A4E0P8_9STRA/649-866    AC A0A6A4E0P8.1
#=GS G1T7D4_RABIT/225-449        AC G1T7D4.2
#=GS A0A1Y1IK17_KLENI/670-822    AC A0A1Y1IK17.1
#=GS A0A674DR28_SALTR/1741-1938  AC A0A674DR28.1
#=GS A0A6P4YXV4_BRABE/1804-2035  AC A0A6P4YXV4.1
#=GS F6YGX7_HORSE/444-590        AC F6YGX7.2
#=GS S9XZ15_CAMFR/362-506        AC S9XZ15.1
#=GS A0A7N8Y1M9_9TELE/224-448    AC A0A7N8Y1M9.1
#=GS MCLN2_HUMAN/371-513         AC Q8IZK6.2
#=GS A0A7R5KCC2_9PASS/431-545    AC A0A7R5KCC2.1
#=GS A0A4W6EDL4_LATCA/375-518    AC A0A4W6EDL4.1
#=GS A0A0N5D878_THECL/314-552    AC A0A0N5D878.1
#=GS A0A287A0W7_PIG/461-607      AC A0A287A0W7.1
#=GS A0A4E0RN37_FASHE/3172-3396  AC A0A4E0RN37.1
#=GS A0A131ZWG5_SARSC/2721-2946  AC A0A131ZWG5.1
#=GS A0A672TKN8_STRHB/364-588    AC A0A672TKN8.1
#=GS A0A1L8GF59_XENLA/356-507    AC A0A1L8GF59.1
#=GS A0A553NDX6_TIGCA/457-596    AC A0A553NDX6.1
#=GS A0A673TX47_SURSU/3821-4042  AC A0A673TX47.1
#=GS A0A091VA67_NIPNI/299-442    AC A0A091VA67.1
#=GS A0A0W8CBP7_PHYNI/335-503    AC A0A0W8CBP7.1
#=GS A0A5C6PQ65_9TELE/1413-1525  AC A0A5C6PQ65.1
#=GS A0A6P8IP29_ACTTE/1626-1850  AC A0A6P8IP29.1
#=GS A0A016TKU7_9BILA/307-469    AC A0A016TKU7.1
#=GS Q8T666_CAEEL/334-556        AC Q8T666.1
#=GS A0A6P5AK14_BRABE/4045-4266  AC A0A6P5AK14.1
#=GS A0A2Y9PCF6_DELLE/273-497    AC A0A2Y9PCF6.1
#=GS A0A3N0YX57_ANAGA/384-528    AC A0A3N0YX57.1
#=GS A0A6P4YFZ8_BRABE/1002-1233  AC A0A6P4YFZ8.1
#=GS A0A6A5C5G5_NAEFO/555-692    AC A0A6A5C5G5.1
#=GS A0A674C9I8_SALTR/346-488    AC A0A674C9I8.1
#=GS A0A6J3H1L7_SAPAP/2932-3153  AC A0A6J3H1L7.1
#=GS L1J8Y9_GUITC/240-479        AC L1J8Y9.1
#=GS X6N353_RETFI/220-350        AC X6N353.1
#=GS A0A402EQS0_9SAUR/1457-1678  AC A0A402EQS0.1
#=GS I3JK73_ORENI/356-499        AC I3JK73.1
#=GS A0A093S1H9_9PASS/266-490    AC A0A093S1H9.1
#=GS A0A672YF55_9TELE/344-487    AC A0A672YF55.1
#=GS A0A6J0VRX6_ODOVR/343-567    AC A0A6J0VRX6.1
#=GS A0A3Q1MII0_BOVIN/1792-2014  AC A0A3Q1MII0.1
#=GS U3JAI2_DANRE/3324-3543      AC U3JAI2.1
#=GS G1LNY6_AILME/412-558        AC G1LNY6.2
#=GS A0A3Q2ZBJ5_KRYMA/394-538    AC A0A3Q2ZBJ5.1
#=GS A0A485NVS8_LYNPA/416-639    AC A0A485NVS8.1
#=GS A0A1Q9D7J0_SYMMI/1135-1324  AC A0A1Q9D7J0.1
#=GS A0A7F8RL81_LEPWE/1188-1409  AC A0A7F8RL81.1
#=GS L5JVH6_PTEAL/273-327        AC L5JVH6.1
#=GS A0A6P7KJ00_9TELE/2261-2483  AC A0A6P7KJ00.1
#=GS A0A7N9IDX6_MACFA/378-524    AC A0A7N9IDX6.1
#=GS A8XIK6_CAEBR/315-539        AC A8XIK6.1
#=GS A0A091T8X4_PHALP/252-476    AC A0A091T8X4.1
#=GS A0A662XN34_9STRA/384-533    AC A0A662XN34.1
#=GS H3A0G5_LATCH/2166-2389      AC H3A0G5.1
#=GS A0A6J0DE87_PERMB/3882-4103  AC A0A6J0DE87.1
#=GS A0A1S3FCL8_DIPOR/257-422    AC A0A1S3FCL8.1
#=GS A0A452EVA6_CAPHI/3861-4082  AC A0A452EVA6.1
#=GS A0A6P4YMZ9_BRABE/1311-1533  AC A0A6P4YMZ9.1
#=GS A0A3P8UYG4_CYNSE/382-525    AC A0A3P8UYG4.1
#=GS A0A2I3MLQ2_PAPAN/273-497    AC A0A2I3MLQ2.1
#=GS A0A2U3WVM4_ODORO/367-510    AC A0A2U3WVM4.1
#=GS K3WH69_GLOUD/395-634        AC K3WH69.1
#=GS A0A2K5I207_COLAP/399-545    AC A0A2K5I207.1
#=GS I7MHL0_TETTS/729-887        AC I7MHL0.1
#=GS A0A668AJH7_9TELE/335-480    AC A0A668AJH7.1
#=GS A0A3Q7PG38_CALUR/3898-4119  AC A0A3Q7PG38.1
#=GS A0A1S3A6X3_ERIEU/343-567    AC A0A1S3A6X3.1
#=GS A0A452EV73_CAPHI/3891-4112  AC A0A452EV73.1
#=GS A0A5F4CN59_CANLF/273-382    AC A0A5F4CN59.1
#=GS G0P3K6_CAEBE/755-821        AC G0P3K6.1
#=GS M3W5X4_FELCA/343-567        AC M3W5X4.4
#=GS A0A091HU02_CALAN/307-484    AC A0A091HU02.1
#=GS A0A6I9WYP7_9SAUR/338-510    AC A0A6I9WYP7.1
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