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Database: Pfam
Entry: Peptidase_C3
LinkDB: Peptidase_C3
Original site: Peptidase_C3 
#=GF ID   Peptidase_C3
#=GF AC   PF00548.23
#=GF DE   3C cysteine protease (picornain 3C)
#=GF PI   Cys-protease-3C; 
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   SCOP
#=GF GA   22.00 22.00;
#=GF TC   22.10 22.00;
#=GF NC   21.90 21.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0124
#=GF RN   [1]
#=GF RM   7515772
#=GF RT   Structure of human rhinovirus 3C protease reveals a trypsin-
#=GF RT   like polypeptide fold, RNA-binding site, and means for cleaving
#=GF RT   precursor polyprotein. 
#=GF RA   Matthews DA, Smith WW, Ferre RA, Condon B, Budahazi G, Sisson W,
#=GF RA   Villafranca JE, Janson CA, McElroy HE, Gribskov CL, et al; 
#=GF RL   Cell 1994;77:761-771.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8164744
#=GF RT   Picornaviral 3C cysteine proteinases have a fold similar to
#=GF RT   chymotrypsin-like serine proteinases. 
#=GF RA   Allaire M, Chernaia MM, Malcolm BA, James MN; 
#=GF RL   Nature 1994;369:72-76.
#=GF DR   INTERPRO; IPR000199;
#=GF DR   MEROPS; C3;
#=GF DR   SCOP; 1hav; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Picornaviral proteins are expressed as a single polyprotein
#=GF CC   which is cleaved by the viral 3C cysteine protease.
#=GF SQ   111
#=GS A0A1L3KGX9_9VIRU/1256-1307  AC A0A1L3KGX9.1
#=GS A0A1L3KMD5_9VIRU/879-996    AC A0A1L3KMD5.1
#=GS POL1_CRLVP/1452-1518        AC Q6EWG9.1
#=GS A0A1L3KHS7_9VIRU/1211-1400  AC A0A1L3KHS7.1
#=GS A0A1L3KHQ8_9VIRU/1247-1299  AC A0A1L3KHQ8.1
#=GS A0A1L3KJH1_9VIRU/1132-1295  AC A0A1L3KJH1.1
#=GS A0A0E3XT08_9PICO/1671-1796  AC A0A0E3XT08.1
#=GS A0A0V0SSF0_9BILA/1-55       AC A0A0V0SSF0.1
#=GS F4YYF3_HUNVO/1590-1773      AC F4YYF3.1
#=GS Q2HWK3_RSET1/822-999        AC Q2HWK3.1
#=GS A0A1L3KMP1_9VIRU/841-1020   AC A0A1L3KMP1.1
#=GS Q9DLK1_FMDVP/1642-1826      AC Q9DLK1.1
#=GS D9YV26_OSCV1/1631-1760      AC D9YV26.1
#=GS A0A1L3KME5_9VIRU/918-1093   AC A0A1L3KME5.1
#=GS A0A1L3KMG1_9VIRU/1479-1642  AC A0A1L3KMG1.1
#=GS A0A1L3KHB7_9VIRU/874-942    AC A0A1L3KHB7.1
#=GS A0A1L3KKQ8_9VIRU/2048-2244  AC A0A1L3KKQ8.1
#=GS X2L6K2_MOVA2/1878-2056      AC X2L6K2.1
#=GS POLG_COSAA/1459-1635        AC B8XTP8.1
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#=GS POLG_HPE2W/1517-1692        AC O73556.1
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#=GS A0A1L3KHA6_9VIRU/1166-1220  AC A0A1L3KHA6.1
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#=GS POLG_AEVCA/1435-1627        AC Q9YLS4.1
#=GS POLG_SVV1/1512-1691         AC Q155Z9.1
#=GS POLG_SVV1/1512-1691         DR PDB; 6L0T B; 4-183;
#=GS POLG_SVV1/1512-1691         DR PDB; 6L0T A; 4-183;
#=GS POL1_BBWVS/1076-1123        AC Q76L40.1
#=GS A0A0V1KK42_9BILA/432-597    AC A0A0V1KK42.1
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#=GS Q9WJ28_PTV1F/1584-1760      AC Q9WJ28.1
#=GS A0A1L3KKW7_9VIRU/1246-1313  AC A0A1L3KKW7.1
#=GS A0A1L3KM56_9VIRU/2103-2296  AC A0A1L3KM56.1
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        AC P08617.1
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 1QA7 D; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 2H6M A; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 2H9H A; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 1HAV A; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 1HAV B; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 1QA7 B; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 2HAL A; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 1QA7 C; 5-197;
#=GS POLG_HAVHM/1524-1716        DR PDB; 1QA7 A; 5-197;
#=GS A0A1L3KKU5_9VIRU/2303-2395  AC A0A1L3KKU5.1
#=GS A0A1L3KGX4_9VIRU/2333-2483  AC A0A1L3KGX4.1
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#=GS A0A1L3KKN0_9VIRU/2272-2388  AC A0A1L3KKN0.1
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#=GS POL1_CPMVS/1071-1136        AC P03600.1
#=GS A0A1L3KNL7_9VIRU/888-1078   AC A0A1L3KNL7.1
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#=GS A0A1L3KKJ0_9VIRU/741-934    AC A0A1L3KKJ0.1
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#=GS A0A1L3KNN1_9VIRU/897-1064   AC A0A1L3KNN1.1
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#=GS Q8JJT0_PSV13/1680-1844      AC Q8JJT0.1
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#=GS POLG_POL1M/1566-1731        DR PDB; 4DCD A; 1-166;
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#=GS POLG_EMCVR/1630-1809        AC Q66765.1
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