#=GF ID Polysacc_lyase_14
#=GF AC PF21294.5
#=GF DE Polysaccharide lyase 14
#=GF AU Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU Lazaro Pinto Beatriz;0000-0001-6837-2941
#=GF SE ECOD:EF20492
#=GF GA 27.00 27.00;
#=GF TC 27.00 27.00;
#=GF NC 26.40 26.60;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch -E 1000 -Z 90746521 --cpu 8 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF CL CL0004
#=GF RC Paper describing PDB structure 3a0n
#=GF RN [1]
#=GF RM 19846561
#=GF RT Crystal structure of family 14 polysaccharide lyase with
#=GF RT pH-dependent modes of action.
#=GF RA Ogura K, Yamasaki M, Yamada T, Mikami B, Hashimoto W, Murata K;
#=GF RL J Biol Chem. 2009;284:35572-35579.
#=GF RC Paper describing PDB structure 5gmt
#=GF RN [2]
#=GF RM 28011642
#=GF RT Structure and Polymannuronate Specificity of a Eukaryotic Member
#=GF RT of Polysaccharide Lyase Family 14.
#=GF RA Qin HM, Miyakawa T, Inoue A, Nishiyama R, Nakamura A, Asano A,
#=GF RA Sawano Y, Ojima T, Tanokura M;
#=GF RL J Biol Chem. 2017;292:2182-2190.
#=GF RC Paper describing PDB structure 6kcv
#=GF RN [3]
#=GF RM 31682837
#=GF RT Alginate Lyase Aly36B is a New Bacterial Member of the
#=GF RT Polysaccharide Lyase Family 36 and Catalyzes by a Novel
#=GF RT Mechanism With Lysine as Both the Catalytic Base and Catalytic
#=GF RT Acid.
#=GF RA Dong F, Xu F, Chen XL, Li PY, Li CY, Li FC, Chen Y, Wang P,
#=GF RA Zhang YZ;
#=GF RL J Mol Biol. 2019;431:4897-4909.
#=GF DR INTERPRO; IPR048958;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC This protein family includes Alginate lyase from the mollusc
#=GF CC Aplysia kurodai (AkAly30) and similar proteins from prokaryotes,
#=GF CC eukaryotes and some viral species. AkAly30 degrades alginate by
#=GF CC cleaving the glycosidic bond through a beta-elimination
#=GF CC reaction. This enzyme adopts a beta-jelly roll fold comprising
#=GF CC two antiparallel beta- sheets. Some beta strands of the first
#=GF CC sheet twist to form an electropositive-rich cavity where the
#=GF CC substrates are believed to be located [1-3].
#=GF SQ 1866
#=GS A0A427XH52_9TREE/259-476 AC A0A427XH52.1
#=GS S8E0U4_FOMSC/465-512 AC S8E0U4.1
#=GS A0A813RNN2_9BILA/19-215 AC A0A813RNN2.1
#=GS A0A2G8SGU8_9APHY/57-135 AC A0A2G8SGU8.1
#=GS D6RKS5_COPC7/190-410 AC D6RKS5.1
#=GS A0A939L264_9ACTN/84-289 AC A0A939L264.1
#=GS A0AAD4D2P8_9FUNG/171-305 AC A0AAD4D2P8.1
#=GS A0A8H5I1N0_9AGAR/83-294 AC A0A8H5I1N0.1
#=GS M5GCY5_DACPD/142-352 AC M5GCY5.1
#=GS A0AA39PYR7_9AGAR/42-240 AC A0AA39PYR7.1
#=GS A0A8H5D4E7_9AGAR/458-536 AC A0A8H5D4E7.1
#=GS A0A9P5XLL9_9AGAR/33-253 AC A0A9P5XLL9.1
#=GS F3KHH9_9GAMM/14-214 AC F3KHH9.1
#=GS A0A5B1R8K1_9AGAM/276-312 AC A0A5B1R8K1.1
#=GS A0AAD4BQF5_BOLED/44-262 AC A0AAD4BQF5.1
#=GS A0AAD5U404_9FUNG/93-222 AC A0AAD5U404.1
#=GS A0A9W8J472_9AGAR/44-102 AC A0A9W8J472.1
#=GS A0AA39PRF5_9AGAR/67-287 AC A0AA39PRF5.1
#=GS A0A5B1CNR6_9BACT/311-515 AC A0A5B1CNR6.1
#=GS K5WL05_AGABU/62-286 AC K5WL05.1
#=GS A0A9P6HJF5_9AGAM/78-301 AC A0A9P6HJF5.1
#=GS A0A8H6HT66_9AGAR/62-286 AC A0A8H6HT66.1
#=GS A0A0P1BT23_9BASI/256-464 AC A0A0P1BT23.1
#=GS A0A1S2SYS8_9GAMM/81-250 AC A0A1S2SYS8.1
#=GS A0A9P7KCS4_9AGAR/74-296 AC A0A9P7KCS4.1
#=GS A0A818J5A6_9BILA/117-318 AC A0A818J5A6.1
#=GS A0A8H7A3Z8_PLEOS/182-406 AC A0A8H7A3Z8.1
#=GS A0A5B9PK08_9BACT/98-310 AC A0A5B9PK08.1
#=GS A0A1M2VZL4_TRAPU/520-574 AC A0A1M2VZL4.1
#=GS A0A4Y7TVF6_COPMI/65-287 AC A0A4Y7TVF6.1
#=GS A0A8H5GT64_9AGAR/80-291 AC A0A8H5GT64.1
#=GS A0A4Q7L2Y1_9PSEU/73-275 AC A0A4Q7L2Y1.1
#=GS A0A284QMG3_ARMOS/65-276 AC A0A284QMG3.1
#=GS R7SJF6_DICSQ/77-297 AC R7SJF6.1
#=GS A0A9P8AE59_9AGAR/88-246 AC A0A9P8AE59.1
#=GS A0AA48I698_9TREE/262-477 AC A0AA48I698.1
#=GS A0A1Y2IN64_TRAC3/74-294 AC A0A1Y2IN64.1
#=GS A0A8H6I4L5_9AGAR/198-404 AC A0A8H6I4L5.1
#=GS S7RW66_GLOTA/95-306 AC S7RW66.1
#=GS A0A9W8J1J4_9AGAR/3-219 AC A0A9W8J1J4.1
#=GS A0A164QPP1_9AGAM/135-324 AC A0A164QPP1.1
#=GS A0A364Y3E9_9BACT/91-285 AC A0A364Y3E9.1
#=GS A0A179DMF4_9SPHI/103-297 AC A0A179DMF4.1
#=GS A0A2H3BZI8_9AGAR/67-287 AC A0A2H3BZI8.1
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#=GS A0A8H8DHR6_9FUNG/199-268 AC A0A8H8DHR6.1
#=GS A0A0C3DCR1_9AGAM/180-261 AC A0A0C3DCR1.1
#=GS A0A167R5T4_PHYB8/84-300 AC A0A167R5T4.1
#=GS A0A9W8JA02_9AGAR/61-182 AC A0A9W8JA02.1
#=GS S7Q5V5_GLOTA/39-169 AC S7Q5V5.1
#=GS A0AAE0FHS8_9CHLO/35-134 AC A0AAE0FHS8.1
#=GS A0A5C3MWX9_9AGAM/35-247 AC A0A5C3MWX9.1
#=GS A0A0D2PMG5_HYPSF/148-372 AC A0A0D2PMG5.1
#=GS A0A8B6H395_MYTGA/72-307 AC A0A8B6H395.1
#=GS A8P9Z6_COPC7/457-500 AC A8P9Z6.2
#=GS A0A2P6MW71_9EUKA/199-406 AC A0A2P6MW71.1
#=GS S7PTE5_GLOTA/171-391 AC S7PTE5.1
#=GS A0A1Y2IN50_TRAC3/239-423 AC A0A1Y2IN50.1
#=GS A0A550BWQ6_9AGAR/50-272 AC A0A550BWQ6.1
#=GS A0A507EBY6_9FUNG/100-311 AC A0A507EBY6.1
#=GS A0A9W7ZZK0_9FUNG/170-320 AC A0A9W7ZZK0.1
#=GS A0A4Y9YNG4_9AGAM/70-293 AC A0A4Y9YNG4.1
#=GS A0A9W8JFJ5_9AGAR/151-376 AC A0A9W8JFJ5.1
#=GS A0A926X2T6_9CYAN/88-288 AC A0A926X2T6.1
#=GS A0A9P5T1E1_9FUNG/248-387 AC A0A9P5T1E1.1
#=GS A0AAD5JWL9_9FUNG/62-280 AC A0AAD5JWL9.1
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#=GS A0A1H4DWG1_9GAMM/167-360 AC A0A1H4DWG1.1
#=GS A0A9P8AX37_9AGAR/86-297 AC A0A9P8AX37.1
#=GS A0A5C3PIQ1_9APHY/92-304 AC A0A5C3PIQ1.1
#=GS A0A4Y7TD43_COPMI/70-251 AC A0A4Y7TD43.1
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#=GS A0A8H5AZF2_9AGAR/85-307 AC A0A8H5AZF2.1
#=GS A0A2X0M5M8_9BASI/262-319 AC A0A2X0M5M8.1
#=GS A0A409WV42_PSICY/209-394 AC A0A409WV42.1
#=GS A0A0A1NZM2_RHIZD/73-291 AC A0A0A1NZM2.1
#=GS A0A3D8LAQ5_9BACT/58-260 AC A0A3D8LAQ5.1
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#=GS A0A168M3Y0_MUCCL/77-288 AC A0A168M3Y0.1
#=GS A0A8H5CNT1_9AGAR/681-731 AC A0A8H5CNT1.1
#=GS A0A1Y0FZU9_9GAMM/182-375 AC A0A1Y0FZU9.1
#=GS A0A8S0VTS2_CYCAE/406-455 AC A0A8S0VTS2.1
#=GS A0A819BDH7_9BILA/85-257 AC A0A819BDH7.1
#=GS A0A4Y9YP43_9APHY/54-253 AC A0A4Y9YP43.1
#=GS A0A1X6MIQ6_9APHY/657-841 AC A0A1X6MIQ6.1
#=GS W4JNT8_HETIT/573-651 AC W4JNT8.1
#=GS A0A8S3UQ48_MYTED/70-306 AC A0A8S3UQ48.1
#=GS A0A813Q0E1_9BILA/24-213 AC A0A813Q0E1.1
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#=GS A0A2I0F803_9GAMM/98-295 AC A0A2I0F803.1
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#=GS A0A8H7FTP2_9AGAM/66-285 AC A0A8H7FTP2.1
#=GS A0AAD2K4F6_9AGAR/113-337 AC A0AAD2K4F6.1
#=GS A0A1X6NCP2_9APHY/86-298 AC A0A1X6NCP2.1
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#=GS A0A1Y5KCD0_9BACL/66-270 AC A0A1Y5KCD0.1
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#=GS A0AAD7NX97_9AGAR/217-399 AC A0AAD7NX97.1
#=GS A0A9P3G4D8_9APHY/255-438 AC A0A9P3G4D8.1
#=GS A0A4S8MVA3_DENBC/94-278 AC A0A4S8MVA3.1
#=GS A0A972GI19_9CHLR/56-255 AC A0A972GI19.1
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#=GS I1C5M4_RHIO9/37-249 AC I1C5M4.1
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#=GS A0A0F2TIF5_STRR3/1-198 AC A0A0F2TIF5.1
#=GS A0A4R0RAM0_9APHY/116-336 AC A0A4R0RAM0.1
#=GS E4Y022_OIKDI/378-439 AC E4Y022.1
#=GS A0A9P3HAI6_9FUNG/148-282 AC A0A9P3HAI6.1
#=GS A0A8H6M9U0_9AGAR/29-251 AC A0A8H6M9U0.1
#=GS A0A0C3GJM2_PILCF/100-311 AC A0A0C3GJM2.1
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