GenomeNet

Database: Pfam
Entry: RNPP_C
LinkDB: RNPP_C
Original site: RNPP_C 
#=GF ID   RNPP_C
#=GF AC   PF18768.3
#=GF DE   RNPP family C-terminal domain
#=GF PI   HTH_Bact;
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU   Paladin L;0000-0003-0011-9397
#=GF AU   Piovesan D;0000-0001-8210-2390
#=GF SE   RepeatsDB
#=GF GA   26.50 26.50;
#=GF TC   26.50 26.50;
#=GF NC   26.40 26.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Repeat
#=GF CL   CL0020
#=GF RN   [1]
#=GF RM   23277548
#=GF RT   Structural basis for the activation mechanism of the PlcR
#=GF RT   virulence regulator by  the quorum-sensing signal peptide PapR.
#=GF RA   Grenha R, Slamti L, Nicaise M, Refes Y, Lereclus D, Nessler S;
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A. 2013;110:1047-1052.
#=GF DR   INTERPRO; IPR041315;
#=GF DR   SO; 0001068; polypeptide_repeat;
#=GF CC   The bacterial PIcR helix-turn-helix transcription factor
#=GF CC   includes five TPR units of different lengths [1]. This entry
#=GF CC   represents the TPR containing domain as a whole. This family is
#=GF CC   called RNPP after (Rapm NprR, PrgX, and PlcR).
#=GF SQ   275
#=GS A0A511ARS7_9LACT/73-281   AC A0A511ARS7.1
#=GS W4EM28_9BACL/70-277       AC W4EM28.1
#=GS A0A248TIQ0_9BACI/83-291   AC A0A248TIQ0.1
#=GS A0A3S0KTF7_9BACI/79-292   AC A0A3S0KTF7.1
#=GS A0A544TUX7_9BACI/79-293   AC A0A544TUX7.1
#=GS A0A0M0L604_9BACI/82-291   AC A0A0M0L604.1
#=GS A0A1H0HTQ2_9BACI/79-297   AC A0A1H0HTQ2.1
#=GS A0A0Q3S605_9BACI/79-212   AC A0A0Q3S605.1
#=GS A0A109QBV3_9BACL/80-286   AC A0A109QBV3.1
#=GS A0A268I8L4_9BACI/79-291   AC A0A268I8L4.1
#=GS A0A0R1JRZ7_9LACO/81-283   AC A0A0R1JRZ7.1
#=GS A0A1E3KXD5_9BACL/84-278   AC A0A1E3KXD5.1
#=GS A0A0J1IJF0_BACCI/63-270   AC A0A0J1IJF0.1
#=GS A0A0U1KKP4_9BACI/77-285   AC A0A0U1KKP4.1
#=GS A0A1J6WN69_9BACI/79-291   AC A0A1J6WN69.1
#=GS F3YB58_MELPT/59-276       AC F3YB58.1
#=GS A0A1I0BC76_9BACI/80-290   AC A0A1I0BC76.1
#=GS F3APC0_9FIRM/78-272       AC F3APC0.1
#=GS A0A1H9WA70_9BACI/79-286   AC A0A1H9WA70.1
#=GS A0A2W0H2D1_9BACI/80-301   AC A0A2W0H2D1.1
#=GS U5LFB9_9BACI/81-292       AC U5LFB9.1
#=GS D3G1X9_ALKPO/79-291       AC D3G1X9.1
#=GS A0A0B4RF84_9BACL/80-290   AC A0A0B4RF84.1
#=GS A0A223KW04_9BACI/79-292   AC A0A223KW04.1
#=GS A0A1L4BX36_9LACT/75-277   AC A0A1L4BX36.1
#=GS A0A0M0GJN2_SPOGL/76-291   AC A0A0M0GJN2.1
#=GS A0A2N5MBK6_9BACI/83-295   AC A0A2N5MBK6.1
#=GS R6GUQ2_9FIRM/69-290       AC R6GUQ2.1
#=GS A0A1M4WCU7_9LACT/77-284   AC A0A1M4WCU7.1
#=GS A0A1E5KWH0_9ENTE/60-279   AC A0A1E5KWH0.1
#=GS A0A2T4U9D9_9BACI/83-301   AC A0A2T4U9D9.1
#=GS V9W5A4_9BACL/79-278       AC V9W5A4.1
#=GS A0A0M0FZM3_9BACI/79-290   AC A0A0M0FZM3.1
#=GS A0A1I5BRE4_9FIRM/379-604  AC A0A1I5BRE4.1
#=GS A0A0M2SHE6_9BACI/78-296   AC A0A0M2SHE6.1
#=GS R6SAE2_9FIRM/78-282       AC R6SAE2.1
#=GS A0A2N0ZFS8_9BACI/81-292   AC A0A2N0ZFS8.1
#=GS A0A0D1XL80_ANEMI/80-287   AC A0A0D1XL80.1
#=GS A0A1I1YG94_9BACI/58-172   AC A0A1I1YG94.1
#=GS A0A074LTG6_9BACL/79-290   AC A0A074LTG6.1
#=GS A0A031IKH0_9BACL/82-291   AC A0A031IKH0.1
#=GS E6TT09_BACCJ/79-294       AC E6TT09.1
#=GS A0A1H1FHX6_9BACI/20-173   AC A0A1H1FHX6.1
#=GS A0A2N5GV79_9BACI/81-293   AC A0A2N5GV79.1
#=GS A0A372LU31_9BACI/80-291   AC A0A372LU31.1
#=GS A0A3M7TX44_9BACI/79-296   AC A0A3M7TX44.1
#=GS R6BBK9_9CLOT/78-292       AC R6BBK9.1
#=GS A0A383XR01_9GAMM/40-171   AC A0A383XR01.1
#=GS G8LXS5_HUNCD/151-302      AC G8LXS5.1
#=GS A0A094XCA6_ALKAL/82-293   AC A0A094XCA6.1
#=GS A0A0N0VNG1_9BACI/80-290   AC A0A0N0VNG1.1
#=GS A0A1G9WNP7_9BACI/80-291   AC A0A1G9WNP7.1
#=GS A0A398BEN4_9BACI/76-282   AC A0A398BEN4.1
#=GS A0A0P6W0T2_9BACI/79-288   AC A0A0P6W0T2.1
#=GS D5DRW6_BACMQ/80-292       AC D5DRW6.1
#=GS A0A4Y8P3E7_9RHOB/3-202    AC A0A4Y8P3E7.1
#=GS A0A3S2TTP6_9BACI/86-297   AC A0A3S2TTP6.1
#=GS Q834P3_ENTFA/58-277       AC Q834P3.1
#=GS A0A662Z0K5_9STAP/88-308   AC A0A662Z0K5.1
#=GS A0A1X1QLK0_9GAMM/99-221   AC A0A1X1QLK0.1
#=GS A0A3S0U0E0_9BACI/79-290   AC A0A3S0U0E0.1
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#=GS B9EC66_MACCJ/77-278       AC B9EC66.1
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#=GS A0A223KT34_9BACI/80-291   AC A0A223KT34.1
#=GS A0A1I5XS43_9FIRM/133-276  AC A0A1I5XS43.1
#=GS R6CRD4_9CLOT/138-303      AC R6CRD4.1
#=GS A0A1H3QZB7_9BACI/81-287   AC A0A1H3QZB7.1
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#=GS A0A0P6WPL5_9BACI/80-290   AC A0A0P6WPL5.1
#=GS D6XZW8_BACIE/78-289       AC D6XZW8.1
#=GS A0A1E5KWY6_9ENTE/74-279   AC A0A1E5KWY6.1
#=GS R9IZ15_9FIRM/77-299       AC R9IZ15.1
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#=GS A0A031IHF9_9BACL/76-288   AC A0A031IHF9.1
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#=GS A0A1S2ME06_9BACI/78-287   AC A0A1S2ME06.1
#=GS A0A6C0QRX3_9BACL/79-278   AC A0A6C0QRX3.1
#=GS A0A0M0X9G8_9BACI/82-294   AC A0A0M0X9G8.1
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#=GS A0A0K9H088_9BACI/79-290   AC A0A0K9H088.1
#=GS A0A1Y4M5K2_9FIRM/179-322  AC A0A1Y4M5K2.1
#=GS K8E2B2_CARML/82-294       AC K8E2B2.2
#=GS A0A3E2J661_9BACI/79-290   AC A0A3E2J661.1
#=GS R6CV35_9CLOT/78-296       AC R6CV35.1
#=GS A0A1L8PPL7_9LACT/50-262   AC A0A1L8PPL7.1
#=GS A0A5B8Z6Q5_9BACI/79-292   AC A0A5B8Z6Q5.1
#=GS D3FRW2_ALKPO/79-289       AC D3FRW2.1
#=GS A0A372LKD5_9BACI/79-290   AC A0A372LKD5.1
#=GS A0A3S0IF21_9BACI/76-287   AC A0A3S0IF21.1
#=GS A0A094WMV8_ALKAL/81-294   AC A0A094WMV8.1
#=GS A0A2I0QSH0_9BACI/85-292   AC A0A2I0QSH0.1
#=GS A0A0M0G8K6_SPOGL/79-288   AC A0A0M0G8K6.1
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#=GS A0A553ZXY8_9BACI/85-299   AC A0A553ZXY8.1
#=GS A0A132ZDD5_ENTFC/80-266   AC A0A132ZDD5.1
#=GS A0A1J6VWX3_9BACI/79-290   AC A0A1J6VWX3.1
#=GS A0A4V2RCU9_9BACI/82-295   AC A0A4V2RCU9.1
#=GS Q5WC17_BACSK/78-294       AC Q5WC17.1
#=GS A0A1E5KWC1_9ENTE/74-279   AC A0A1E5KWC1.1
#=GS A0A419SF16_9BACL/79-271   AC A0A419SF16.1
#=GS A0A0U5BFL8_9BACL/1-127    AC A0A0U5BFL8.1
#=GS A0A1H9U723_9BACI/78-288   AC A0A1H9U723.1
#=GS A0A0X9W936_9BACL/78-291   AC A0A0X9W936.1
#=GS K8EFG6_CARML/77-255       AC K8EFG6.1
#=GS A0A1G8R2Q6_9BACI/75-284   AC A0A1G8R2Q6.1
#=GS A0A3S0KJ62_9BACI/78-285   AC A0A3S0KJ62.1
#=GS A0A384KRE5_BACAN/79-291   AC A0A384KRE5.1
#=GS A0A2N5MNB2_9BACI/79-291   AC A0A2N5MNB2.1
#=GS A0A1H9VJX6_9BACI/78-284   AC A0A1H9VJX6.1
#=GS A0A1Y4S5E1_9FIRM/2-127    AC A0A1Y4S5E1.1
#=GS A0A0V8JQT7_9BACI/80-289   AC A0A0V8JQT7.1
#=GS Q5WKH2_BACSK/79-288       AC Q5WKH2.1
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#=GS A0A060LWZ9_9BACI/88-297   AC A0A060LWZ9.1
#=GS V2Y354_9FIRM/393-595      AC V2Y354.1
#=GS A0A0M0G2L8_9BACI/63-277   AC A0A0M0G2L8.1
#=GS A0A0A2TGA0_9BACI/79-287   AC A0A0A2TGA0.1
#=GS A0A0J6D2P2_9BACI/79-287   AC A0A0J6D2P2.1
#=GS A0A511W527_9BACI/78-287   AC A0A511W527.1
#=GS Q81DC5_BACCR/79-289       AC Q81DC5.1
#=GS A0A074LS00_9BACL/70-281   AC A0A074LS00.1
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#=GS A0A4Q1B3B9_9STAP/76-275   AC A0A4Q1B3B9.1
#=GS A0A2N6R805_9BACI/92-240   AC A0A2N6R805.1
#=GS R6CBY1_9CLOT/78-303       AC R6CBY1.1
#=GS A0A011RNC4_9LACT/77-282   AC A0A011RNC4.1
#=GS A0A511V8Q1_9BACL/80-287   AC A0A511V8Q1.1
#=GS A0A0M0G1E4_9BACI/80-290   AC A0A0M0G1E4.1
#=GS F7PWZ6_9BACT/86-297       AC F7PWZ6.1
#=GS A0A4R3KZ47_9FIRM/153-303  AC A0A4R3KZ47.1
#=GS K2GCP4_9BACI/78-288       AC K2GCP4.1
#=GS X0R6L5_9BACI/82-292       AC X0R6L5.1
#=GS X0RS13_9BACI/79-288       AC X0RS13.1
#=GS A0A1J6WPD9_9BACI/79-289   AC A0A1J6WPD9.1
#=GS A0A2P8HYI2_9BACI/78-298   AC A0A2P8HYI2.1
#=GS A0A268I8M3_9BACI/79-290   AC A0A268I8M3.1
#=GS A0A2P8H8C1_9BACI/81-301   AC A0A2P8H8C1.1
#=GS A0A1L3MMI7_9BACI/81-291   AC A0A1L3MMI7.1
#=GS Q8R7P3_CALS4/98-257       AC Q8R7P3.1
#=GS A0A0M1NLS1_9BACI/78-176   AC A0A0M1NLS1.1
#=GS D3G1N8_ALKPO/82-289       AC D3G1N8.1
#=GS A0A031IGQ5_9BACL/80-292   AC A0A031IGQ5.1
#=GS U5LGD2_9BACI/79-291       AC U5LGD2.1
#=GS A0A4Q0VWE8_9BACI/79-293   AC A0A4Q0VWE8.1
#=GS A0A1G8KD58_9BACI/79-287   AC A0A1G8KD58.1
#=GS A0A031IIA8_9BACL/79-288   AC A0A031IIA8.1
#=GS A0A1B9ALJ0_9BACI/80-291   AC A0A1B9ALJ0.1
#=GS Q9KBW0_BACHD/78-289       AC Q9KBW0.1
#=GS A0A2T4U257_9BACI/79-289   AC A0A2T4U257.1
#=GS A0A090Y3Z3_PAEMA/78-287   AC A0A090Y3Z3.1
#=GS R6CVV0_9CLOT/96-304       AC R6CVV0.1
#=GS A0A0A8X6A4_9BACI/80-293   AC A0A0A8X6A4.1
#=GS A0A1I6APB5_9BACI/171-383  AC A0A1I6APB5.1
#=GS A0A2C1L0V0_9BACI/81-291   AC A0A2C1L0V0.1
#=GS R6CSI4_9CLOT/79-290       AC R6CSI4.1
#=GS A0A268I7Y5_9BACI/94-302   AC A0A268I7Y5.1
#=GS Q81GN3_BACCR/79-290       AC Q81GN3.1
#=GS A0A1S2QV93_9BACI/79-290   AC A0A1S2QV93.1
#=GS A0A2N0YWU0_9BACI/79-288   AC A0A2N0YWU0.1
#=GS A0A1H9FXX5_9BACI/80-291   AC A0A1H9FXX5.1
#=GS U5LI37_9BACI/79-288       AC U5LI37.1
#=GS A0A0Q3TQ74_9BACI/67-277   AC A0A0Q3TQ74.1
#=GS A0A0M9GSS1_9BACI/79-290   AC A0A0M9GSS1.1
#=GS A0A3E2J4H1_9BACI/81-292   AC A0A3E2J4H1.1
#=GS R6PPA9_9FIRM/138-285      AC R6PPA9.1
#=GS A0A1J6VZK0_9BACI/79-298   AC A0A1J6VZK0.1
#=GS A0A0M0G1F2_9BACI/80-288   AC A0A0M0G1F2.1
#=GS A0A1G8FX96_9BACI/79-291   AC A0A1G8FX96.1
#=GS A0A1S2LIH4_9BACI/79-290   AC A0A1S2LIH4.1
#=GS A0A0B0IFL3_9BACI/80-286   AC A0A0B0IFL3.1
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