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Database: Pfam
Entry: Rab5-bind
LinkDB: Rab5-bind
Original site: Rab5-bind 
#=GF ID   Rab5-bind
#=GF AC   PF09311.13
#=GF DE   Rabaptin-like protein
#=GF AU   Mistry J;0000-0003-2479-5322
#=GF AU   Sammut SJ;0000-0003-4472-904X
#=GF SE   pdb_1tu3
#=GF GA   33.60 33.60;
#=GF TC   33.90 33.70;
#=GF NC   32.90 33.50;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Coiled-coil
#=GF RN   [1]
#=GF RM   15378032
#=GF RT   Structural basis of Rab5-Rabaptin5 interaction in endocytosis. 
#=GF RA   Zhu G, Zhai P, Liu J, Terzyan S, Li G, Zhang XC; 
#=GF RL   Nat Struct Mol Biol. 2004;11:975-983.
#=GF DR   INTERPRO; IPR015390;
#=GF DR   SO; 0001080; coiled_coil;
#=GF CC   Members of this family are predominantly found in Rabaptin and
#=GF CC   allow for binding to the GTPase Rab5. This interaction is
#=GF CC   necessary and sufficient for Rab5-dependent recruitment of
#=GF CC   Rabaptin5 to early endosomal membranes [1].
#=GF SQ   1282
#=GS W2TWD2_NECAM/36-354       AC W2TWD2.1
#=GS A0A2K5K2H2_COLAP/421-474  AC A0A2K5K2H2.1
#=GS A0A2Y9L7Z5_ENHLU/490-544  AC A0A2Y9L7Z5.1
#=GS A0A674MHD5_TAKRU/517-737  AC A0A674MHD5.1
#=GS G3S6Y1_GORGO/268-480      AC G3S6Y1.2
#=GS A0A0N4TRG7_BRUPA/94-393   AC A0A0N4TRG7.1
#=GS A0A3Q1HDR4_ANATE/207-318  AC A0A3Q1HDR4.1
#=GS A0A341BDD0_NEOAA/234-454  AC A0A341BDD0.1
#=GS A0A6J3Q2U3_TURTR/286-562  AC A0A6J3Q2U3.1
#=GS A0A3Q4H590_NEOBR/529-670  AC A0A3Q4H590.1
#=GS H9JK64_BOMMO/383-454      AC H9JK64.1
#=GS A0A3P8WD33_CYNSE/526-836  AC A0A3P8WD33.1
#=GS A0A2G8L8A6_STIJA/526-815  AC A0A2G8L8A6.1
#=GS A0A2I0M1N7_COLLI/453-759  AC A0A2I0M1N7.1
#=GS A0A672YPR6_9TELE/307-432  AC A0A672YPR6.1
#=GS A0A2K5X727_MACFA/422-474  AC A0A2K5X727.1
#=GS A0A2K5EUH7_AOTNA/218-435  AC A0A2K5EUH7.1
#=GS A0A5N5JTS6_PANHP/515-821  AC A0A5N5JTS6.1
#=GS A0A6J3Q334_TURTR/286-367  AC A0A6J3Q334.1
#=GS A0A060XIU6_ONCMY/319-451  AC A0A060XIU6.1
#=GS H9GSM6_ANOCA/180-401      AC H9GSM6.2
#=GS A0A340WTN5_LIPVE/286-562  AC A0A340WTN5.1
#=GS A0A4W5NM74_9TELE/579-885  AC A0A4W5NM74.1
#=GS A0A4W2GNQ2_BOBOX/287-464  AC A0A4W2GNQ2.1
#=GS A0A091DTE2_FUKDA/282-413  AC A0A091DTE2.1
#=GS F6V0S5_MONDO/34-293       AC F6V0S5.3
#=GS A0A2K5X727_MACFA/218-438  AC A0A2K5X727.1
#=GS A0A5F4D3F2_CANLF/537-764  AC A0A5F4D3F2.1
#=GS A0A452SK10_URSAM/577-622  AC A0A452SK10.1
#=GS A0A3Q3GSG2_9LABR/440-731  AC A0A3Q3GSG2.1
#=GS A0A3Q3KWZ2_9TELE/492-704  AC A0A3Q3KWZ2.1
#=GS A0A3Q2HZ13_HORSE/490-796  AC A0A3Q2HZ13.1
#=GS A0A384AGD5_BALAS/508-593  AC A0A384AGD5.1
#=GS A0A673VHJ5_SURSU/704-754  AC A0A673VHJ5.1
#=GS A0A6G0V4S5_9BILA/7-293    AC A0A6G0V4S5.1
#=GS A0A1S3ETB0_DIPOR/287-504  AC A0A1S3ETB0.1
#=GS A0A2K5JRJ6_COLAP/481-633  AC A0A2K5JRJ6.1
#=GS A0A672ZSY8_9TELE/726-782  AC A0A672ZSY8.1
#=GS A0A4Z2D4P0_SCHJA/358-650  AC A0A4Z2D4P0.1
#=GS A0A3B0JNF3_DROGU/268-537  AC A0A3B0JNF3.1
#=GS M4AA81_XIPMA/527-833      AC M4AA81.2
#=GS A0A0Q3M209_AMAAE/367-673  AC A0A0Q3M209.1
#=GS A0A091VD43_NIPNI/519-825  AC A0A091VD43.1
#=GS A0A2I2ZNI6_GORGO/533-839  AC A0A2I2ZNI6.1
#=GS A0A674MHD5_TAKRU/738-791  AC A0A674MHD5.1
#=GS A0A6H5IA85_9HYME/258-458  AC A0A6H5IA85.1
#=GS A0A674NE77_TAKRU/505-802  AC A0A674NE77.1
#=GS A0A674BKP8_SALTR/725-778  AC A0A674BKP8.1
#=GS A0A2K5K2G7_COLAP/289-508  AC A0A2K5K2G7.1
#=GS A0A2K5LYB6_CERAT/289-506  AC A0A2K5LYB6.1
#=GS A0A5F4CU03_CANLF/501-574  AC A0A5F4CU03.1
#=GS A0A452RLK9_URSAM/257-466  AC A0A452RLK9.1
#=GS A0A232EF78_9HYME/262-471  AC A0A232EF78.1
#=GS A0A337SWA0_FELCA/213-428  AC A0A337SWA0.1
#=GS A0A430QC74_SCHBO/392-557  AC A0A430QC74.1
#=GS A0A044VBY7_ONCVO/79-378   AC A0A044VBY7.2
#=GS M3WIR2_FELCA/535-760      AC M3WIR2.3
#=GS A0A3Q2D2D4_CYPVA/237-351  AC A0A3Q2D2D4.1
#=GS A0A671TZV4_SPAAU/179-276  AC A0A671TZV4.1
#=GS A0A183IZ19_9BILA/46-229   AC A0A183IZ19.1
#=GS A0A2K5RIL2_CEBCA/430-474  AC A0A2K5RIL2.1
#=GS J9K0X8_ACYPI/278-496      AC J9K0X8.2
#=GS A0A671VM90_SPAAU/694-801  AC A0A671VM90.1
#=GS A0A6Q2X360_ESOLU/227-334  AC A0A6Q2X360.1
#=GS A0A1S3ES02_DIPOR/287-474  AC A0A1S3ES02.1
#=GS H0WV44_OTOGA/482-537      AC H0WV44.1
#=GS A0A340X0M8_LIPVE/286-504  AC A0A340X0M8.1
#=GS A0A674BK58_SALTR/674-842  AC A0A674BK58.1
#=GS K7FJ56_PELSI/531-837      AC K7FJ56.1
#=GS A0A667Y0F1_9TELE/676-731  AC A0A667Y0F1.1
#=GS A0A5F4CU03_CANLF/286-484  AC A0A5F4CU03.1
#=GS A0A091KWK6_9GRUI/297-603  AC A0A091KWK6.1
#=GS A0A4U5VTW2_COLLU/334-464  AC A0A4U5VTW2.1
#=GS A0A2K5LYE8_CERAT/179-399  AC A0A2K5LYE8.1
#=GS A0A4W5JUN7_9TELE/500-798  AC A0A4W5JUN7.1
#=GS A0A672F1K6_SALFA/283-412  AC A0A672F1K6.1
#=GS C0HB57_SALSA/323-455      AC C0HB57.1
#=GS A0A267G9Q8_9PLAT/91-388   AC A0A267G9Q8.1
#=GS A0A669B9Y7_ORENI/514-804  AC A0A669B9Y7.1
#=GS A0A3P8WG24_CYNSE/483-789  AC A0A3P8WG24.1
#=GS A0A2Y9EIV7_PHYMC/449-755  AC A0A2Y9EIV7.1
#=GS A0A671FY96_RHIFE/217-421  AC A0A671FY96.1
#=GS A0A4W6D6P4_LATCA/479-783  AC A0A4W6D6P4.1
#=GS A0A670JN57_PODMU/528-732  AC A0A670JN57.1
#=GS A0A5F4D3F2_CANLF/760-810  AC A0A5F4D3F2.1
#=GS W5M342_LEPOC/523-829      AC W5M342.1
#=GS A0A194RCV4_PAPMA/1-283    AC A0A194RCV4.1
#=GS A0A4W2H5I0_BOBOX/533-760  AC A0A4W2H5I0.1
#=GS A0A5F5Q2G4_HORSE/289-471  AC A0A5F5Q2G4.1
#=GS A0A4W2BU00_BOBOX/329-522  AC A0A4W2BU00.1
#=GS A0A2G5URI6_9PELO/34-333   AC A0A2G5URI6.1
#=GS A0A3M6UEH5_9CNID/445-740  AC A0A3M6UEH5.1
#=GS H0Z1N1_TAEGU/529-833      AC H0Z1N1.2
#=GS A0A2G5USE3_9PELO/1-298    AC A0A2G5USE3.1
#=GS H3CEX1_TETNG/528-834      AC H3CEX1.1
#=GS A0A2H2IHK3_CAEJA/37-157   AC A0A2H2IHK3.1
#=GS A0A5F9CTY7_RABIT/534-760  AC A0A5F9CTY7.1
#=GS A0A673ZGB2_SALTR/526-832  AC A0A673ZGB2.1
#=GS A0A1D5R8Y3_MACMU/533-839  AC A0A1D5R8Y3.2
#=GS A0A2K5ZSD8_MANLE/484-532  AC A0A2K5ZSD8.1
#=GS A0A2I3M5R2_PAPAN/456-509  AC A0A2I3M5R2.1
#=GS A0A2K6T0S0_SAIBB/561-807  AC A0A2K6T0S0.1
#=GS A0A1S3AGH5_ERIEU/453-506  AC A0A1S3AGH5.1
#=GS A0A3Q1GB70_9TELE/659-710  AC A0A3Q1GB70.1
#=GS A0A671U451_SPAAU/187-284  AC A0A671U451.1
#=GS A0A183NXT1_9TREM/112-372  AC A0A183NXT1.1
#=GS S9X4W9_CAMFR/262-538      AC S9X4W9.1
#=GS A0A6G1B3M9_CROCR/432-528  AC A0A6G1B3M9.1
#=GS A0A3Q2D2D4_CYPVA/350-477  AC A0A3Q2D2D4.1
#=GS A0A315VLG3_GAMAF/535-841  AC A0A315VLG3.1
#=GS A0A4W5PBY8_9TELE/324-451  AC A0A4W5PBY8.1
#=GS A0A087QWL5_APTFO/489-795  AC A0A087QWL5.1
#=GS W5KJA2_ASTMX/440-742      AC W5KJA2.2
#=GS G3WGC5_SARHA/258-551      AC G3WGC5.1
#=GS A0A5E4N6P6_9HEMI/435-553  AC A0A5E4N6P6.1
#=GS A0A2I3GVK2_NOMLE/534-851  AC A0A2I3GVK2.1
#=GS A0A2K5RIH1_CEBCA/501-545  AC A0A2K5RIH1.1
#=GS A0A673WI32_SALTR/209-313  AC A0A673WI32.1
#=GS A0A6A5EBL6_PERFL/528-834  AC A0A6A5EBL6.1
#=GS A0A3B5KEP4_TAKRU/309-432  AC A0A3B5KEP4.2
#=GS A0A4W5P794_9TELE/304-432  AC A0A4W5P794.1
#=GS A0A452FRS3_CAPHI/287-500  AC A0A452FRS3.1
#=GS I3KTJ1_ORENI/183-282      AC I3KTJ1.2
#=GS F7DWT5_MACMU/440-492      AC F7DWT5.3
#=GS B4J9D9_DROGR/267-567      AC B4J9D9.1
#=GS A0A402G3C3_9SAUR/1-49     AC A0A402G3C3.1
#=GS F7DWW4_MACMU/289-506      AC F7DWW4.3
#=GS A0A287AR53_PIG/381-598    AC A0A287AR53.1
#=GS A0A2K5RIL3_CEBCA/466-509  AC A0A2K5RIL3.1
#=GS A0A672ZT14_9TELE/735-791  AC A0A672ZT14.1
#=GS A0A671VN24_SPAAU/437-652  AC A0A671VN24.1
#=GS A0A2K5DJ12_AOTNA/533-839  AC A0A2K5DJ12.1
#=GS A0A5F4CGV8_CANLF/286-503  AC A0A5F4CGV8.1
#=GS A0A3Q1HDR4_ANATE/302-445  AC A0A3Q1HDR4.1
#=GS A0A6Q2X360_ESOLU/335-471  AC A0A6Q2X360.1
#=GS A0A671VKN7_SPAAU/527-833  AC A0A671VKN7.1
#=GS A0A6J3Q334_TURTR/403-605  AC A0A6J3Q334.1
#=GS F7BNP9_MACMU/527-833      AC F7BNP9.2
#=GS A0A1W4X0P4_AGRPL/276-571  AC A0A1W4X0P4.1
#=GS H0V1E5_CAVPO/480-786      AC H0V1E5.2
#=GS A0A5C6P6N5_9TELE/528-834  AC A0A5C6P6N5.1
#=GS A0A0N4XUN3_NIPBR/40-330   AC A0A0N4XUN3.1
#=GS A0A3P9BQJ7_9CICH/201-306  AC A0A3P9BQJ7.1
#=GS A0A437D2P3_ORYJA/207-315  AC A0A437D2P3.1
#=GS A0A267GM69_9PLAT/437-735  AC A0A267GM69.1
#=GS A0A0V0XP49_TRIPS/45-344   AC A0A0V0XP49.1
#=GS A0A671VLU3_SPAAU/527-737  AC A0A671VLU3.1
#=GS G3THI8_LOXAF/477-532      AC G3THI8.1
#=GS V4C831_LOTGI/579-889      AC V4C831.1
#=GS A0A671TZV4_SPAAU/285-418  AC A0A671TZV4.1
#=GS A0A2K5YV67_MANLE/533-758  AC A0A2K5YV67.1
#=GS A0A672ZTJ7_9TELE/521-746  AC A0A672ZTJ7.1
#=GS A0A3Q1GB70_9TELE/437-664  AC A0A3Q1GB70.1
#=GS S9XEQ4_CAMFR/461-513      AC S9XEQ4.1
#=GS K7ENJ9_HUMAN/1-133        AC K7ENJ9.1
#=GS A0A340WQ74_LIPVE/543-849  AC A0A340WQ74.1
#=GS A0A1S2ZR38_ERIEU/554-799  AC A0A1S2ZR38.1
#=GS G3I7M6_CRIGR/276-494      AC G3I7M6.1
#=GS A0A6A1QK13_BALPH/533-839  AC A0A6A1QK13.1
#=GS A0A3P9PIB4_POERE/539-753  AC A0A3P9PIB4.1
#=GS A0A3Q1GPS2_9TELE/184-287  AC A0A3Q1GPS2.1
#=GS A0A2G9USN0_TELCI/203-272  AC A0A2G9USN0.1
#=GS A0A0N4UF23_DRAME/67-366   AC A0A0N4UF23.1
#=GS A0A2K5S2Y4_CEBCA/533-839  AC A0A2K5S2Y4.1
#=GS G3WGC6_SARHA/261-538      AC G3WGC6.1
#=GS A0A2K6MJ86_RHIBE/533-839  AC A0A2K6MJ86.1
#=GS G1MB06_AILME/287-500      AC G1MB06.1
#=GS A0A6I8U331_AEDAE/286-585  AC A0A6I8U331.1
#=GS A0A2K5EUE9_AOTNA/289-506  AC A0A2K5EUE9.1
#=GS A0A067QHR0_ZOONE/215-523  AC A0A067QHR0.1
#=GS A0A0L0CLL8_LUCCU/247-546  AC A0A0L0CLL8.1
#=GS L8ILT4_9CETA/425-533      AC L8ILT4.1
#=GS A0A286XGB0_CAVPO/231-444  AC A0A286XGB0.1
#=GS A0A672ZQV0_9TELE/530-739  AC A0A672ZQV0.1
#=GS A0A671G3U1_RHIFE/447-502  AC A0A671G3U1.1
#=GS A0A238BLE8_9BILA/3-138    AC A0A238BLE8.1
#=GS G3GYD2_CRIGR/442-748      AC G3GYD2.1
#=GS A0A3Q1HNR5_ANATE/187-285  AC A0A3Q1HNR5.1
#=GS A0A340X187_LIPVE/442-508  AC A0A340X187.1
#=GS A0A2K6RA40_RHIRO/289-506  AC A0A2K6RA40.1
#=GS A0A060XIU6_ONCMY/205-309  AC A0A060XIU6.1
#=GS A0A091PQN5_HALAL/520-826  AC A0A091PQN5.1
#=GS G3I7M6_CRIGR/474-534      AC G3I7M6.1
#=GS A0A485P5H8_LYNPA/146-335  AC A0A485P5H8.1
#=GS A0A212FGK4_DANPL/217-501  AC A0A212FGK4.1
#=GS A0A5E4AQ33_MARMO/533-839  AC A0A5E4AQ33.1
#=GS A0A5F5Q0E9_HORSE/218-436  AC A0A5F5Q0E9.1
#=GS A0A2Y9LFD8_ENHLU/533-839  AC A0A2Y9LFD8.1
#=GS B4DHR0_HUMAN/421-475      AC B4DHR0.1
#=GS A0A3Q3WMS8_MOLML/189-286  AC A0A3Q3WMS8.1
#=GS A0A667Y0F1_9TELE/453-683  AC A0A667Y0F1.1
#=GS A0A6I8R8N6_XENTR/488-794  AC A0A6I8R8N6.1
#=GS H2XUT4_CIOIN/1-234        AC H2XUT4.1
#=GS A0A3Q3WMS8_MOLML/280-392  AC A0A3Q3WMS8.1
#=GS A0A226NB41_CALSU/526-832  AC A0A226NB41.1
#=GS E9HGP6_DAPPU/416-711      AC E9HGP6.1
#=GS U4U100_DENPD/467-555      AC U4U100.1
#=GS A0A2I2Z6D7_GORGO/268-444  AC A0A2I2Z6D7.1
#=GS A0A673ZH97_SALTR/526-779  AC A0A673ZH97.1
#=GS M7BT32_CHEMY/565-777      AC M7BT32.1
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