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Database: Pfam
Entry: Raffinose_syn
LinkDB: Raffinose_syn
Original site: Raffinose_syn 
#=GF ID   Raffinose_syn
#=GF AC   PF05691.14
#=GF DE   Raffinose synthase or seed imbibition protein Sip1
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE   Pfam-B_3204 (release 8.0)
#=GF GA   20.00 20.00;
#=GF TC   20.00 20.00;
#=GF NC   19.90 19.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF WK   Glycoside_hydrolase_family_36
#=GF CL   CL0058
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12244450
#=GF RT   Functional expression of a cDNA encoding pea (Pisum sativum L.)
#=GF RT   raffinose synthase, partial purification of the enzyme from
#=GF RT   maturing seeds, and steady-state kinetic analysis of raffinose
#=GF RT   synthesis. 
#=GF RA   Peterbauer T, Mach L, Mucha J, Richter A; 
#=GF RL   Planta 2002;215:839-846.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   18335235
#=GF RT   Enzymatic breakdown of raffinose oligosaccharides in pea seeds.
#=GF RA   Blochl A, Peterbauer T, Hofmann J, Richter A;
#=GF RL   Planta. 2008;228:99-110.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   21639842
#=GF RT   Hierarchical classification of glycoside hydrolases.
#=GF RA   Naumoff DG;
#=GF RL   Biochemistry (Mosc). 2011;76:622-635.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008811;
#=GF DR   CAZY; GH36;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several raffinose synthase proteins,
#=GF CC   also known as seed imbibition (Sip1) proteins. Raffinose
#=GF CC   (O-alpha- D-galactopyranosyl- (1-->6)- O-alpha-
#=GF CC   D-glucopyranosyl-(1<-->2)- O-beta- D-fructofuranoside) is a
#=GF CC   widespread oligosaccharide in plant seeds and other tissues.
#=GF CC   Raffinose synthase (EC:2.4.1.82) is the key enzyme that channels
#=GF CC   sucrose into the raffinose oligosaccharide pathway [1].
#=GF CC   Raffinose family oligosaccharides (RFOs) are ubiquitous in plant
#=GF CC   seeds and are thought to play critical roles in the acquisition
#=GF CC   of tolerance to desiccation and seed longevity. Raffinose
#=GF CC   synthases are alkaline alpha-galactosidases and are solely
#=GF CC   responsible for RFO breakdown in germinating maize seeds,
#=GF CC   whereas acidic galactosidases appear to have other functions
#=GF CC   [2].                  Glycoside hydrolase family 36 can be split
#=GF CC   into 11 families, GH36A to GH36K [3]. This family includes
#=GF CC   enzymes from GH36C.
#=GF SQ   3128
#=GS B9IF13_POPTR/8-739          AC B9IF13.1
#=GS A0A395MU41_9HYPO/409-668    AC A0A395MU41.1
#=GS M4EPW8_BRARP/7-738          AC M4EPW8.1
#=GS A0A2P5FPX2_TREOI/7-747      AC A0A2P5FPX2.1
#=GS G7JFC4_MEDTR/82-778         AC G7JFC4.2
#=GS A0A2P5YWG0_GOSBA/40-80      AC A0A2P5YWG0.1
#=GS A0A165ZLM9_DAUCS/1-54       AC A0A165ZLM9.1
#=GS A0A3B6ED39_WHEAT/574-774    AC A0A3B6ED39.1
#=GS A0A446MG76_TRITD/139-596    AC A0A446MG76.1
#=GS A0A1B8GSE0_9PEZI/150-322    AC A0A1B8GSE0.2
#=GS A0A287WEL4_HORVV/1-669      AC A0A287WEL4.1
#=GS A0A3N7G0L9_POPTR/1-574      AC A0A3N7G0L9.1
#=GS A0A2K2BLC3_POPTR/24-850     AC A0A2K2BLC3.1
#=GS C5FSQ0_ARTOC/304-369        AC C5FSQ0.1
#=GS A0A4D9ASN3_SALSN/24-770     AC A0A4D9ASN3.1
#=GS A0A2G5CH34_AQUCA/1-77       AC A0A2G5CH34.1
#=GS A0A5N6PMB2_9ASTR/86-799     AC A0A5N6PMB2.1
#=GS A0A3B6TEW9_WHEAT/88-825     AC A0A3B6TEW9.1
#=GS A0A1R3FVN4_COCAP/25-740     AC A0A1R3FVN4.1
#=GS A0A2G9HDJ8_9LAMI/439-527    AC A0A2G9HDJ8.1
#=GS A0A151U2I3_CAJCA/7-737      AC A0A151U2I3.1
#=GS A0A364KX48_9EURO/3144-3638  AC A0A364KX48.1
#=GS A0A1E7F7R8_9STRA/2-355      AC A0A1E7F7R8.1
#=GS U5HG39_USTV1/249-703        AC U5HG39.1
#=GS A0A392TDS9_9FABA/1-67       AC A0A392TDS9.1
#=GS A0A3Q0FGM6_VIGRR/173-278    AC A0A3Q0FGM6.1
#=GS F6HHB0_VITVI/7-765          AC F6HHB0.1
#=GS A0A1Y3NNP3_PIRSE/53-350     AC A0A1Y3NNP3.1
#=GS A0A5N6UP14_9EURO/376-748    AC A0A5N6UP14.1
#=GS A0A444YZ27_ARAHY/31-771     AC A0A444YZ27.1
#=GS A0A1E3BSP8_9EURO/456-835    AC A0A1E3BSP8.1
#=GS M1C4W2_SOLTU/2-184          AC M1C4W2.1
#=GS A0A1Q3AP17_CEPFO/7-759      AC A0A1Q3AP17.1
#=GS A0A2P6THE3_CHLSO/493-906    AC A0A2P6THE3.1
#=GS K9G6Z6_PEND2/378-762        AC K9G6Z6.1
#=GS Q2HEI9_CHAGB/319-391        AC Q2HEI9.1
#=GS A0A068UQA6_COFCA/89-852     AC A0A068UQA6.1
#=GS A0A3L6PG95_PANMI/656-1492   AC A0A3L6PG95.1
#=GS F0XZ72_AURAN/524-873        AC F0XZ72.1
#=GS W1SDM3_9BACI/293-699        AC W1SDM3.1
#=GS A0A179I6Q2_CORDF/382-668    AC A0A179I6Q2.1
#=GS A0A2I0HN63_PUNGR/1-433      AC A0A2I0HN63.1
#=GS A0A0D9P4E3_METAN/132-434    AC A0A0D9P4E3.1
#=GS A0A2G2ZZB4_CAPAN/1-217      AC A0A2G2ZZB4.1
#=GS A0A1S3E8J0_CICAR/1-658      AC A0A1S3E8J0.1
#=GS A0A5P1ETF3_ASPOF/73-176     AC A0A5P1ETF3.1
#=GS M8AN98_TRIUA/1-58           AC M8AN98.1
#=GS A6KZ74_BACV8/150-278        AC A6KZ74.1
#=GS A0A015L7K1_RHIIW/664-816    AC A0A015L7K1.1
#=GS W9QCR6_9ROSA/24-848         AC W9QCR6.1
#=GS A0A445D3G5_ARAHY/31-771     AC A0A445D3G5.1
#=GS A0A1D6L8T2_MAIZE/7-465      AC A0A1D6L8T2.1
#=GS A0A1V6TXV7_9EURO/378-757    AC A0A1V6TXV7.1
#=GS D7UAQ2_VITVI/7-742          AC D7UAQ2.1
#=GS A0A0E0HPY5_ORYNI/141-907    AC A0A0E0HPY5.1
#=GS C1GYM3_PARBA/393-526        AC C1GYM3.1
#=GS J3MJE3_ORYBR/1-545          AC J3MJE3.1
#=GS A0A022RXI9_ERYGU/24-771     AC A0A022RXI9.1
#=GS A0A0P0CGR9_9FLAO/121-274    AC A0A0P0CGR9.1
#=GS A0A2P5XCR8_GOSBA/72-691     AC A0A2P5XCR8.1
#=GS A7EBB1_SCLS1/303-880        AC A7EBB1.1
#=GS A0A5D2W7C3_GOSMU/7-755      AC A0A5D2W7C3.1
#=GS A0A2T7CMP8_9POAL/11-88      AC A0A2T7CMP8.1
#=GS Q2HEI9_CHAGB/382-708        AC Q2HEI9.1
#=GS A0A084QNL3_STAC4/82-419     AC A0A084QNL3.1
#=GS W1Q0K4_AMBTC/261-328        AC W1Q0K4.1
#=GS A0A3N4JJH1_9PEZI/311-377    AC A0A3N4JJH1.1
#=GS A0A0E0L8G4_ORYPU/68-819     AC A0A0E0L8G4.1
#=GS M7YEL0_TRIUA/190-273        AC M7YEL0.1
#=GS A0A1L9UHZ9_ASPBC/435-749    AC A0A1L9UHZ9.1
#=GS A0A6A3CBF0_HIBSY/15-105     AC A0A6A3CBF0.1
#=GS A0A0E0QHU4_ORYRU/76-135     AC A0A0E0QHU4.1
#=GS K1VW99_TRIAC/225-553        AC K1VW99.1
#=GS A0A4S8KFH4_MUSBA/610-826    AC A0A4S8KFH4.1
#=GS A0A287WEI4_HORVV/1-251      AC A0A287WEI4.1
#=GS A0A5J5APS4_9ASTE/13-131     AC A0A5J5APS4.1
#=GS A0A6A5MK46_LUPAL/27-758     AC A0A6A5MK46.1
#=GS L1INA2_GUITC/1-334          AC L1INA2.1
#=GS A0A5N5KY04_9ROSI/7-738      AC A0A5N5KY04.1
#=GS A0A453C7U7_AEGTS/1-601      AC A0A453C7U7.1
#=GS A0A0D2U6I0_GOSRA/8-731      AC A0A0D2U6I0.1
#=GS W9IKX7_FUSOX/331-405        AC W9IKX7.1
#=GS A0A1B8B2S0_FUSPO/403-678    AC A0A1B8B2S0.1
#=GS A0A367JUX8_RHIST/351-802    AC A0A367JUX8.1
#=GS A0A314XYR5_PRUYE/7-726      AC A0A314XYR5.1
#=GS B2UNY5_AKKM8/100-242        AC B2UNY5.1
#=GS A0A5N7BMC6_9EURO/375-720    AC A0A5N7BMC6.1
#=GS A0A2J6R4D4_9HELO/245-809    AC A0A2J6R4D4.1
#=GS A0A2T7D8Z8_9POAL/1-669      AC A0A2T7D8Z8.1
#=GS A0A4U6TP39_SETVI/31-875     AC A0A4U6TP39.1
#=GS A0A5J9URU5_9POAL/1-205      AC A0A5J9URU5.1
#=GS A0A2R6QCZ1_ACTCC/7-740      AC A0A2R6QCZ1.1
#=GS A0A5D2VWD3_GOSMU/451-529    AC A0A5D2VWD3.1
#=GS A0A0D2Q6L7_GOSRA/7-756      AC A0A0D2Q6L7.1
#=GS A0A0F5JK52_9BACT/9-432      AC A0A0F5JK52.1
#=GS A0A2H3ZZQ9_PHODC/11-776     AC A0A2H3ZZQ9.1
#=GS T0L5P5_COLGC/413-717        AC T0L5P5.1
#=GS A0A0N1HC93_9EURO/306-685    AC A0A0N1HC93.1
#=GS A0A4R3VF19_PELSC/29-240     AC A0A4R3VF19.1
#=GS A0A4D8YEH1_SALSN/24-841     AC A0A4D8YEH1.1
#=GS A0A5N6QQ88_9ROSI/68-127     AC A0A5N6QQ88.1
#=GS A0A1D6E8C7_MAIZE/1-255      AC A0A1D6E8C7.1
#=GS A0A5M9JKD4_MONFR/234-724    AC A0A5M9JKD4.1
#=GS A0A446L760_TRITD/27-748     AC A0A446L760.1
#=GS A0A2V0P9V4_9CHLO/949-1124   AC A0A2V0P9V4.1
#=GS A0A1J6JUU1_NICAT/7-740      AC A0A1J6JUU1.1
#=GS A0A565CI63_9BRAS/21-848     AC A0A565CI63.1
#=GS A0A3R8IUK6_9BACT/181-669    AC A0A3R8IUK6.1
#=GS F0XZ72_AURAN/53-527         AC F0XZ72.1
#=GS A0A2R6PVC7_ACTCC/24-762     AC A0A2R6PVC7.1
#=GS A0A0P0WBF3_ORYSJ/3-258      AC A0A0P0WBF3.1
#=GS A0A540M0J6_MALBA/24-850     AC A0A540M0J6.1
#=GS A0A3L6Q7P2_PANMI/21-746     AC A0A3L6Q7P2.1
#=GS M4DUA1_BRARP/88-799         AC M4DUA1.1
#=GS AGAL_SACS2/275-570          AC Q97U94.2
#=GS A0A1Y2BFY6_9TREE/213-518    AC A0A1Y2BFY6.1
#=GS A0A1B8D2Z1_9PEZI/287-378    AC A0A1B8D2Z1.1
#=GS B9SF88_RICCO/30-770         AC B9SF88.1
#=GS A0A194UZS0_9PEZI/328-704    AC A0A194UZS0.1
#=GS A0A395HG18_9EURO/434-743    AC A0A395HG18.1
#=GS A0A1V8UZE3_9PEZI/368-738    AC A0A1V8UZE3.1
#=GS A0A2S4PX83_9PEZI/182-692    AC A0A2S4PX83.1
#=GS A0A2G2X641_CAPBA/7-740      AC A0A2G2X641.1
#=GS A0A200RDJ1_9MAGN/24-770     AC A0A200RDJ1.1
#=GS A0A087FWJ5_ARAAL/1-87       AC A0A087FWJ5.1
#=GS A0A0B0MSZ0_GOSAR/25-765     AC A0A0B0MSZ0.1
#=GS A0A6A6M8Y2_HEVBR/1-315      AC A0A6A6M8Y2.1
#=GS A0A1S2YQS1_CICAR/7-727      AC A0A1S2YQS1.1
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#=GS A0A445A1M7_ARAHY/21-760     AC A0A445A1M7.1
#=GS A0A2P5DGD8_PARAD/213-489    AC A0A2P5DGD8.1
#=GS A0A392Q0X2_9FABA/1-60       AC A0A392Q0X2.1
#=GS A0A319C2B1_9EURO/364-876    AC A0A319C2B1.1
#=GS A0A6A6MHG9_HEVBR/70-758     AC A0A6A6MHG9.1
#=GS A0A453RHT0_AEGTS/180-472    AC A0A453RHT0.1
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#=GS Q27J84_CUCSA/7-756          AC Q27J84.2
#=GS D5GGC9_TUBMM/142-529        AC D5GGC9.1
#=GS A0A0P7BYH4_9HYPO/302-676    AC A0A0P7BYH4.1
#=GS A0A0E0HYT6_ORYNI/1-78       AC A0A0E0HYT6.1
#=GS G2X9P6_VERDV/319-420        AC G2X9P6.1
#=GS A0A388K2M8_CHABU/677-796    AC A0A388K2M8.1
#=GS A0A2G2ZZB5_CAPAN/1-80       AC A0A2G2ZZB5.1
#=GS A0A5R9GB01_9BACL/294-585    AC A0A5R9GB01.1
#=GS A0A372R1R0_9GLOM/159-373    AC A0A372R1R0.1
#=GS A0A2P6THE8_CHLSO/493-1036   AC A0A2P6THE8.1
#=GS A0A5N5M4K8_9PEZI/204-275    AC A0A5N5M4K8.1
#=GS A9RI62_PHYPA/7-726          AC A9RI62.1
#=GS A0A5J5F8A0_9PEZI/358-658    AC A0A5J5F8A0.1
#=GS A0A2S7NVF8_9HELO/423-723    AC A0A2S7NVF8.1
#=GS A0A139AFF4_GONPJ/264-475    AC A0A139AFF4.1
#=GS A0A1S4A8T5_TOBAC/8-90       AC A0A1S4A8T5.1
#=GS A0A2G7FLZ7_9EURO/315-389    AC A0A2G7FLZ7.1
#=GS A0A2I4GEQ8_JUGRE/24-764     AC A0A2I4GEQ8.1
#=GS A0A453C7U2_AEGTS/1-425      AC A0A453C7U2.1
#=GS A0A0D2T9G5_GOSRA/8-229      AC A0A0D2T9G5.1
#=GS A0A251SNJ6_HELAN/88-822     AC A0A251SNJ6.1
#=GS A0A2K1ZX59_POPTR/7-760      AC A0A2K1ZX59.1
#=GS A0A090CNA9_PODAN/305-528    AC A0A090CNA9.1
#=GS B2ZF65_SOYBN/21-743         AC B2ZF65.1
#=GS A0A0D9W6A7_9ORYZ/276-746    AC A0A0D9W6A7.1
#=GS M7YGB8_TRIUA/24-122         AC M7YGB8.1
#=GS A0A2G2WFR5_CAPBA/7-740      AC A0A2G2WFR5.1
#=GS A0A5A7TXN2_CUCME/24-848     AC A0A5A7TXN2.1
#=GS A0A3B6GRZ2_WHEAT/565-771    AC A0A3B6GRZ2.1
#=GS A0A3B6EFU9_WHEAT/7-736      AC A0A3B6EFU9.1
#=GS A0A2T7E2D4_9POAL/7-749      AC A0A2T7E2D4.1
#=GS A0A081KCQ1_9GAMM/268-561    AC A0A081KCQ1.1
#=GS B6QEX2_TALMQ/386-836        AC B6QEX2.1
#=GS A0A078HV37_BRANA/7-738      AC A0A078HV37.1
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