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Database: Pfam
Entry: Roc
LinkDB: Roc
Original site: Roc 
#=GF ID   Roc
#=GF AC   PF08477.15
#=GF DE   Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
#=GF PI   Miro;
#=GF AU   Fenech M;0000-0001-7933-4617
#=GF SE   Pfam-B_1154 (release 17.0)
#=GF GA   27.00 27.00;
#=GF TC   27.00 27.00;
#=GF NC   26.90 26.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0023
#=GF RN   [1]
#=GF RM   14654223
#=GF RT   Roc, a Ras/GTPase domain in complex proteins.
#=GF RA   Bosgraaf L, Van Haastert PJ;
#=GF RL   Biochim Biophys Acta. 2003;1643:5-10.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   12482879
#=GF RT   Atypical Rho GTPases have roles in mitochondrial homeostasis and
#=GF RT   apoptosis. 
#=GF RA   Fransson A, Ruusala A, Aspenstrom P; 
#=GF RL   J Biol Chem 2003;278:6495-6502.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   15479738
#=GF RT   Yeast Miro GTPase, Gem1p, regulates mitochondrial morphology via
#=GF RT   a novel pathway. 
#=GF RA   Frederick RL, McCaffery JM, Cunningham KW, Okamoto K, Shaw JM; 
#=GF RL   J Cell Biol. 2004;167:87-98.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   18650931
#=GF RT   Structure of the Roc-COR domain tandem of C. tepidum, a
#=GF RT   prokaryotic homologue of  the human LRRK2 Parkinson kinase.
#=GF RA   Gotthardt K, Weyand M, Kortholt A, Van Haastert PJ, Wittinghofer
#=GF RA   A;
#=GF RL   EMBO J. 2008;27:2239-2249.
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Roc, or Ras of Complex, proteins are mitochondrial Rho proteins
#=GF CC   (Miro-1, Swiss:Q8IXI2, and Miro-2, Swiss:Q8IXI1) and atypical
#=GF CC   Rho GTPases. Full-length proteins have a unique domain
#=GF CC   organisation, with tandem GTP-binding domains and two EF hand
#=GF CC   domains (Pfam:PF00036) that may bind calcium. They are also
#=GF CC   larger than classical small GTPases. It has been proposed that
#=GF CC   they are involved in mitochondrial homeostasis and apoptosis
#=GF CC   [1,2,3,4].
#=GF SQ   4235
#=GS A0A401NR77_SCYTO/8-131      AC A0A401NR77.1
#=GS Q3AT94_CHLCH/170-288        AC Q3AT94.1
#=GS A0A2W1JM60_9CYAN/272-388    AC A0A2W1JM60.1
#=GS A0A0K0G4P0_STRVS/39-161     AC A0A0K0G4P0.1
#=GS A0A423T052_PENVA/46-113     AC A0A423T052.1
#=GS E2BXL8_HARSA/44-109         AC E2BXL8.1
#=GS A0A2K6USE4_SAIBB/9-42       AC A0A2K6USE4.1
#=GS A0A2Y9Q642_DELLE/641-761    AC A0A2Y9Q642.1
#=GS A0A2B4SVF7_STYPI/331-428    AC A0A2B4SVF7.1
#=GS A0A0D9RWB9_CHLSB/640-760    AC A0A0D9RWB9.1
#=GS A0A670J549_PODMU/1314-1433  AC A0A670J549.1
#=GS G3UH46_LOXAF/45-111         AC G3UH46.1
#=GS A0A672Z3Z9_9TELE/1183-1300  AC A0A672Z3Z9.1
#=GS A0A1S3J553_LINUN/1832-1947  AC A0A1S3J553.1
#=GS A0A553Q2X1_9TELE/636-740    AC A0A553Q2X1.1
#=GS G3RUQ1_GORGO/7-73           AC G3RUQ1.2
#=GS A0A3Q1MET6_BOVIN/9-62       AC A0A3Q1MET6.1
#=GS A0A2Y9N4Y8_DELLE/1336-1455  AC A0A2Y9N4Y8.1
#=GS B7KEE8_GLOC7/347-462        AC B7KEE8.1
#=GS A0A2K5P489_CERAT/411-540    AC A0A2K5P489.1
#=GS A0A6J3QZM5_TURTR/392-512    AC A0A6J3QZM5.1
#=GS A0A1X7UKB9_AMPQE/1598-1714  AC A0A1X7UKB9.1
#=GS A0A2Y9HE51_NEOSC/411-540    AC A0A2Y9HE51.1
#=GS A0A251VIV3_HELAN/24-146     AC A0A251VIV3.1
#=GS A0A5F5PKC9_HORSE/15-67      AC A0A5F5PKC9.1
#=GS A0A176WAE1_MARPO/395-519    AC A0A176WAE1.1
#=GS A2FXZ3_TRIVA/12-126         AC A2FXZ3.1
#=GS A0A3P8ZAI4_ESOLU/613-732    AC A0A3P8ZAI4.2
#=GS A0A1Y3MKT5_PIRSE/8-66       AC A0A1Y3MKT5.1
#=GS A0A6A4X9F9_AMPAM/427-557    AC A0A6A4X9F9.1
#=GS D8LGP2_ECTSI/15-125         AC D8LGP2.1
#=GS A0A5F8A5V3_MACMU/1291-1410  AC A0A5F8A5V3.1
#=GS A0L4U3_MAGMM/247-361        AC A0L4U3.1
#=GS G3W7Q4_SARHA/586-706        AC G3W7Q4.1
#=GS F1Q098_CANLF/640-760        AC F1Q098.2
#=GS B4MVS7_DROWI/15-130         AC B4MVS7.1
#=GS A0A0N0VH34_9TRYP/7-132      AC A0A0N0VH34.1
#=GS A0A0V0W9A1_9BILA/1083-1191  AC A0A0V0W9A1.1
#=GS A0A1S3I667_LINUN/117-214    AC A0A1S3I667.1
#=GS A0A6I8Q9H9_XENTR/1223-1342  AC A0A6I8Q9H9.1
#=GS A0A4W5QYH5_9TELE/10-88      AC A0A4W5QYH5.1
#=GS A0A1X7SB53_MOUSE/59-101     AC A0A1X7SB53.1
#=GS A0A226NAW7_CALSU/5-125      AC A0A226NAW7.1
#=GS A0A0D2U4T5_GOSRA/90-184     AC A0A0D2U4T5.1
#=GS W2YD67_PHYPR/370-485        AC W2YD67.1
#=GS G8Y8J1_PICSO/14-130         AC G8Y8J1.1
#=GS A0A077ZFQ7_TRITR/895-1002   AC A0A077ZFQ7.1
#=GS A0A4U5VZU9_COLLU/9-84       AC A0A4U5VZU9.1
#=GS A0A0L7LBT5_9NEOP/14-67      AC A0A0L7LBT5.1
#=GS A0A2F0BDS8_ESCRO/65-185     AC A0A2F0BDS8.1
#=GS A0A1S3IVZ6_LINUN/78-188     AC A0A1S3IVZ6.1
#=GS A0A195EFP9_9HYME/973-1099   AC A0A195EFP9.1
#=GS A0A498LJG8_LABRO/45-110     AC A0A498LJG8.1
#=GS A0A094IIH4_9PEZI/377-422    AC A0A094IIH4.1
#=GS W2QVG9_PHYPN/285-400        AC W2QVG9.1
#=GS F1SHN7_PIG/1310-1429        AC F1SHN7.4
#=GS A0A2K5LWJ6_CERAT/8-128      AC A0A2K5LWJ6.1
#=GS A0A2U3VBF1_ODORO/15-67      AC A0A2U3VBF1.1
#=GS G1M6Y1_AILME/608-728        AC G1M6Y1.1
#=GS A0A3M6UC40_9CNID/572-695    AC A0A3M6UC40.1
#=GS A0A2R5GY09_9STRA/383-490    AC A0A2R5GY09.1
#=GS A0A151M948_ALLMI/613-733    AC A0A151M948.1
#=GS A0A2R5GJ23_9STRA/319-433    AC A0A2R5GJ23.1
#=GS A0A3P8SVV1_AMPPE/8-130      AC A0A3P8SVV1.1
#=GS A0A452GHV8_9SAUR/45-111     AC A0A452GHV8.1
#=GS A0A3Q3F2D3_9LABR/8-129      AC A0A3Q3F2D3.1
#=GS W9RSK8_9ROSA/496-641        AC W9RSK8.1
#=GS A0A1S3PGD0_SALSA/45-112     AC A0A1S3PGD0.1
#=GS A0A2K5P0J4_CERAT/640-760    AC A0A2K5P0J4.1
#=GS A0A665UZ16_ECHNA/8-129      AC A0A665UZ16.1
#=GS A0A2K5Y6R9_MANLE/18-60      AC A0A2K5Y6R9.1
#=GS B4VY01_9CYAN/384-499        AC B4VY01.1
#=GS C3Y6U4_BRAFL/397-512        AC C3Y6U4.1
#=GS A0A2R5GTV0_9STRA/23-117     AC A0A2R5GTV0.1
#=GS A0A3B6IRF0_WHEAT/28-149     AC A0A3B6IRF0.1
#=GS A0A091E6G7_FUKDA/156-285    AC A0A091E6G7.1
#=GS A0A0M0KA94_9EUKA/910-1034   AC A0A0M0KA94.1
#=GS A0A1Y1HKZ1_KLENI/6-124      AC A0A1Y1HKZ1.1
#=GS A0A2I3HHR7_NOMLE/14-95      AC A0A2I3HHR7.1
#=GS A0A2B4SIZ1_STYPI/1435-1556  AC A0A2B4SIZ1.1
#=GS C3XQ15_BRAFL/61-135         AC C3XQ15.1
#=GS C3Y057_BRAFL/23-139         AC C3Y057.1
#=GS G1SWC0_RABIT/37-157         AC G1SWC0.2
#=GS A0A1D1VQK6_RAMVA/45-115     AC A0A1D1VQK6.1
#=GS A0A091W4N3_OPIHO/1259-1378  AC A0A091W4N3.1
#=GS L8GIF8_ACACA/1517-1640      AC L8GIF8.1
#=GS D8RY21_SELML/18-131         AC D8RY21.1
#=GS F6UXV3_ORNAN/7-130          AC F6UXV3.3
#=GS E9CBQ0_CAPO3/193-296        AC E9CBQ0.2
#=GS A0A337SN32_FELCA/5-124      AC A0A337SN32.1
#=GS H2YY41_CIOSA/16-129         AC H2YY41.1
#=GS A0A091EPQ1_CORBR/45-111     AC A0A091EPQ1.1
#=GS A0A5F4WC52_CALJA/411-540    AC A0A5F4WC52.1
#=GS A7SHA4_NEMVE/44-112         AC A7SHA4.1
#=GS A0A2K5WXB6_MACFA/9-42       AC A0A2K5WXB6.1
#=GS A0A218YX91_9HELO/8-82       AC A0A218YX91.1
#=GS K1PTH6_CRAGI/2494-2612      AC K1PTH6.1
#=GS A0A3Q7S8N5_VULVU/1336-1455  AC A0A3Q7S8N5.1
#=GS A0A1X7VE12_AMPQE/9-135      AC A0A1X7VE12.1
#=GS L5KBQ8_PTEAL/411-539        AC L5KBQ8.1
#=GS A0A2B4RYW6_STYPI/286-395    AC A0A2B4RYW6.1
#=GS A0A183XA13_TRIRE/98-140     AC A0A183XA13.1
#=GS D3BLJ5_POLPP/1315-1445      AC D3BLJ5.1
#=GS A0A101MKH3_9EURO/10-55      AC A0A101MKH3.1
#=GS A0A287BTI7_PIG/8-128        AC A0A287BTI7.1
#=GS A7AN74_BABBO/22-136         AC A7AN74.1
#=GS A0A6G0TKR4_APHGL/15-66      AC A0A6G0TKR4.1
#=GS F2TX77_SALR5/20-75          AC F2TX77.1
#=GS A0A3P8WCZ5_CYNSE/45-109     AC A0A3P8WCZ5.1
#=GS L8HAV9_ACACA/1166-1298      AC L8HAV9.1
#=GS A0A091CP54_FUKDA/36-94      AC A0A091CP54.1
#=GS A0A3Q3EPL9_KRYMA/5-124      AC A0A3Q3EPL9.1
#=GS A0A1Z4C282_9GAMM/75-197     AC A0A1Z4C282.1
#=GS A0A0U3BLC8_9FLAO/446-584    AC A0A0U3BLC8.1
#=GS G3QCV8_GORGO/640-760        AC G3QCV8.1
#=GS A0A1G9MIF1_9ACTN/337-452    AC A0A1G9MIF1.1
#=GS A0A2K6BDZ3_MACNE/15-67      AC A0A2K6BDZ3.1
#=GS A0A672TIU9_STRHB/239-318    AC A0A672TIU9.1
#=GS A0A094J668_9PEZI/9-54       AC A0A094J668.1
#=GS D8T252_SELML/397-524        AC D8T252.1
#=GS A0A0L8G2Q9_OCTBM/445-562    AC A0A0L8G2Q9.1
#=GS A0A2K5VPS5_MACFA/23-99      AC A0A2K5VPS5.1
#=GS A0A6J3S7I7_TURTR/1335-1454  AC A0A6J3S7I7.1
#=GS A0A370EWC1_9FLAO/471-595    AC A0A370EWC1.1
#=GS A0A1L8HBZ9_XENLA/8-129      AC A0A1L8HBZ9.1
#=GS A0A4W2E6F9_BOBOX/641-761    AC A0A4W2E6F9.1
#=GS A0A672IMH6_SALFA/8-124      AC A0A672IMH6.1
#=GS A0A1X7TXK8_AMPQE/1145-1266  AC A0A1X7TXK8.1
#=GS A0A6I8QRM9_XENTR/979-1098   AC A0A6I8QRM9.1
#=GS A0A4W3HV97_CALMI/14-107     AC A0A4W3HV97.1
#=GS A0A0C3DAH4_9PEZI/11-60      AC A0A0C3DAH4.1
#=GS A0A673XXX6_SALTR/8-130      AC A0A673XXX6.1
#=GS A0A1S2ZQY9_ERIEU/9-42       AC A0A1S2ZQY9.1
#=GS A0A2A8CUI0_9BACT/5-123      AC A0A2A8CUI0.1
#=GS A0A074Z204_9TREM/5-126      AC A0A074Z204.1
#=GS E2AKZ5_CAMFO/1070-1179      AC E2AKZ5.1
#=GS C3Z9P6_BRAFL/13-116         AC C3Z9P6.1
#=GS A0A1X0NRS7_9TRYP/7-132      AC A0A1X0NRS7.1
#=GS A0A4S4D1D6_CAMSI/11-48      AC A0A4S4D1D6.1
#=GS A0A6A3FE80_9STRA/396-552    AC A0A6A3FE80.1
#=GS A0A3Q3BB71_KRYMA/414-530    AC A0A3Q3BB71.1
#=GS A0A176VDR8_MARPO/502-640    AC A0A176VDR8.1
#=GS F2UAD6_SALR5/754-881        AC F2UAD6.1
#=GS A0A3Q7VYR1_URSAR/1336-1455  AC A0A3Q7VYR1.1
#=GS A0A024GT29_9STRA/447-567    AC A0A024GT29.1
#=GS A0A0G3A6G4_9DELT/218-331    AC A0A0G3A6G4.1
#=GS U6JWW7_9EIME/21-78          AC U6JWW7.1
#=GS G3S0B9_GORGO/15-67          AC G3S0B9.2
#=GS A0A2B4R9U3_STYPI/440-540    AC A0A2B4R9U3.1
#=GS A0A1A6GX58_NEOLE/14-87      AC A0A1A6GX58.1
#=GS A0A194R311_PAPMA/26-146     AC A0A194R311.1
#=GS A0A3Q3LRG6_9TELE/598-717    AC A0A3Q3LRG6.1
#=GS A0A6Q2Z2D0_ESOLU/530-649    AC A0A6Q2Z2D0.1
#=GS H7C533_HUMAN/8-53           AC H7C533.1
#=GS A0A667WS48_9TELE/612-733    AC A0A667WS48.1
#=GS K1QWV6_CRAGI/370-487        AC K1QWV6.1
#=GS A0A1S3Z3D0_TOBAC/511-656    AC A0A1S3Z3D0.1
#=GS F1PHH4_CANLF/1336-1455      AC F1PHH4.2
#=GS A0A369RS38_9METZ/686-801    AC A0A369RS38.1
#=GS A0A6I8QAF2_XENTR/635-755    AC A0A6I8QAF2.1
#=GS A0A2K5M421_CERAT/7-73       AC A0A2K5M421.1
#=GS A0A5C6P354_9TELE/5-123      AC A0A5C6P354.1
#=GS A0A670J6B5_PODMU/634-754    AC A0A670J6B5.1
#=GS Q8Z0H2_NOSS1/475-588        AC Q8Z0H2.1
#=GS A0A3A9GF79_9FIRM/707-824    AC A0A3A9GF79.1
#=GS A0A6H5K9A9_9PHAE/62-190     AC A0A6H5K9A9.1
#=GS C3Y057_BRAFL/2672-2788      AC C3Y057.1
#=GS A0A091FW79_9AVES/1-115      AC A0A091FW79.1
#=GS A0A485P6N8_LYNPA/45-111     AC A0A485P6N8.1
#=GS Q38AB6_TRYB2/11-126         AC Q38AB6.1
#=GS A0A2R5GBL0_9STRA/479-586    AC A0A2R5GBL0.1
#=GS A0A210PTK2_MIZYE/349-455    AC A0A210PTK2.1
#=GS A0A521G3I8_9DELT/176-286    AC A0A521G3I8.1
#=GS A0A091CMH4_FUKDA/1334-1453  AC A0A091CMH4.1
#=GS A0A3P8RJX0_AMPPE/623-743    AC A0A3P8RJX0.1
#=GS A0A3P6UIA8_LITSI/14-136     AC A0A3P6UIA8.1
#=GS A0A218XLR4_PUNGR/495-640    AC A0A218XLR4.1
#=GS A0A482W837_9CUCU/8-126      AC A0A482W837.1
#=GS A0A0E3L6D7_9EURY/323-433    AC A0A0E3L6D7.1
#=GS A0A6I8T155_XENTR/45-112     AC A0A6I8T155.1
#=GS A0A1Q3GX57_9BACT/298-420    AC A0A1Q3GX57.1
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#=GS A0A177WTM7_BATDL/8-134      AC A0A177WTM7.1
#=GS F0ZBR8_DICPU/1144-1272      AC F0ZBR8.1
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#=GS A0A3Q2FQN8_CYPVA/8-129      AC A0A3Q2FQN8.1
#=GS L1IP31_GUITC/195-325        AC L1IP31.1
#=GS A0A2P4SVU8_BAMTH/12-86      AC A0A2P4SVU8.1
#=GS A7S718_NEMVE/14-128         AC A7S718.1
#=GS D6RFT6_MOUSE/7-67           AC D6RFT6.1
#=GS A0A0V1M649_9BILA/1038-1146  AC A0A0V1M649.1
#=GS A0A5F8GC97_MONDO/8-131      AC A0A5F8GC97.1
#=GS A0A183SRY9_SCHSO/5-112      AC A0A183SRY9.1
#=GS A0A3L6TRR7_PANMI/25-136     AC A0A3L6TRR7.1
#=GS A0A6I8N2X3_ORNAN/1290-1409  AC A0A6I8N2X3.1
#=GS R7ULG2_CAPTE/2-89           AC R7ULG2.1
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#=GS LRRK2_HUMAN/1336-1455       DR PDB; 2ZEJ B; 1336-1455;
#=GS A0A671DYM5_RHIFE/411-539    AC A0A671DYM5.1
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