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Database: Pfam
Entry: SAE2
LinkDB: SAE2
Original site: SAE2 
#=GF ID   SAE2
#=GF AC   PF08573.13
#=GF DE   DNA endonuclease activator SAE2/CtIP C-terminus
#=GF AU   Mistry J;0000-0003-2479-5322
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF SE   manual
#=GF GA   19.80 17.10;
#=GF TC   19.80 17.10;
#=GF NC   19.70 17.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   16374511
#=GF RT   The Saccharomyces cerevisiae Sae2 protein negatively regulates
#=GF RT   DNA damage checkpoint signalling. 
#=GF RA   Clerici M, Mantiero D, Lucchini G, Longhese MP; 
#=GF RL   EMBO Rep. 2005; [Epub ahead of print]
#=GF RN   [2]
#=GF RM   16162495
#=GF RT   The Saccharomyces cerevisiae Sae2 protein promotes resection and
#=GF RT   bridging of double strand break ends. 
#=GF RA   Clerici M, Mantiero D, Lucchini G, Longhese MP; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2005;280:38631-38638.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   17936710
#=GF RT   Ctp1 is a cell-cycle-regulated protein that functions with Mre11
#=GF RT   complex to control double-strand break repair by homologous
#=GF RT   recombination. 
#=GF RA   Limbo O, Chahwan C, Yamada Y, de Bruin RA, Wittenberg C, Russell
#=GF RA   P; 
#=GF RL   Mol Cell. 2007;28:134-146.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   18007596
#=GF RT   A conserved function for a Caenorhabditis elegans Com1/Sae2/CtIP
#=GF RT   protein homolog in meiotic recombination. 
#=GF RA   Penkner A, Portik-Dobos Z, Tang L, Schnabel R, Novatchkova M,
#=GF RA   Jantsch V, Loidl J; 
#=GF RL   EMBO J. 2007;26:5071-5082.
#=GF RN   [5]
#=GF RM   18007598
#=GF RT   A novel plant gene essential for meiosis is related to the human
#=GF RT   CtIP and the yeast COM1/SAE2 gene. 
#=GF RA   Uanschou C, Siwiec T, Pedrosa-Harand A, Kerzendorfer C,
#=GF RA   Sanchez-Moran E, Novatchkova M, Akimcheva S, Woglar A, Klein F,
#=GF RA   Schlogelhofer P; 
#=GF RL   EMBO J. 2007; [Epub ahead of print]
#=GF RN   [6]
#=GF RM   18042458
#=GF RT   Sae2 is an endonuclease that processes hairpin DNA cooperatively
#=GF RT   with the Mre11/Rad50/Xrs2 complex. 
#=GF RA   Lengsfeld BM, Rattray AJ, Bhaskara V, Ghirlando R, Paull TT; 
#=GF RL   Mol Cell. 2007;28:638-651.
#=GF RN   [7]
#=GF RM   33836577
#=GF RT   A conserved Ctp1/CtIP C-terminal peptide stimulates Mre11
#=GF RT   endonuclease activity.
#=GF RA   Zdravkovic A, Daley JM, Dutta A, Niwa T, Murayama Y, Kanamaru S,
#=GF RA   Ito K, Maki T, Argunhan B, Takahashi M, Tsubouchi H, Sung P,
#=GF RA   Iwasaki H;
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A. 2021; [Epub ahead of print]
#=GF DR   INTERPRO; IPR013882;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   SAE2 is a protein involved in repairing meiotic and mitotic
#=GF CC   double-strand breaks in DNA. It has been shown to negatively
#=GF CC   regulate DNA damage checkpoint signalling [1,2]. SAE2 is
#=GF CC   homologous to the CtIP proteins in mammals and an homologous
#=GF CC   protein in plants. Crucial sequence motifs that are highly
#=GF CC   conserved are the CxxC and the RHR motifs in this C-terminal
#=GF CC   part of the protein [3]. In budding yeast, genetic evidence
#=GF CC   suggests that the SAE2 protein is essential for the processing
#=GF CC   of hairpin DNA intermediates and meiotic double-strand breaks by
#=GF CC   Mre11/Rad50 complexes. SAE2 binds DNA and exhibits endonuclease
#=GF CC   activity on single-stranded DNA independently of Mre11/Rad50
#=GF CC   complexes, but hairpin DNA structures are cleaved cooperatively
#=GF CC   in the presence of Mre11/Rad50 or Mre11/Rad50/Xrs2. Hairpin
#=GF CC   structures are not processed at the tip by SAE2 but rather at
#=GF CC   single-stranded DNA regions adjacent to the hairpin. The
#=GF CC   catalytic activities of SAE2 are important for its biological
#=GF CC   functions [6]. Although proteins containing this domain were
#=GF CC   described as endonucleases, it is now known that they actually
#=GF CC   function as endonuclease activators [7]. This domain contains
#=GF CC   highly conserved residues at its 15-residue extreme that are
#=GF CC   indispensable for MRN (Mre11-Rad50-Nbs1) complex activation,
#=GF CC   through the stimulation of Mre11 endonuclease activity [7].
#=GF SQ   1703
#=GS A0A0L0D6T6_THETB/246-285    AC A0A0L0D6T6.1
#=GS A0A4D9BTR1_SALSN/512-544    AC A0A4D9BTR1.1
#=GS M3Y2S1_MUSPF/824-861        AC M3Y2S1.1
#=GS A0A6J3J3Y7_SAPAP/807-846    AC A0A6J3J3Y7.1
#=GS F1A689_DICPU/325-361        AC F1A689.1
#=GS A0A3P4SA95_GULGU/825-862    AC A0A3P4SA95.1
#=GS I1LVE7_SOYBN/423-468        AC I1LVE7.1
#=GS A0A094I8N3_9PEZI/664-778    AC A0A094I8N3.1
#=GS A0A5P1F0Y3_ASPOF/396-444    AC A0A5P1F0Y3.1
#=GS CTIP_HUMAN/825-861          AC Q99708.2
#=GS A0A165LHS3_9APHY/521-642    AC A0A165LHS3.1
#=GS A0A2G8S611_9APHY/548-651    AC A0A2G8S611.1
#=GS A0A372RE82_9GLOM/401-447    AC A0A372RE82.1
#=GS D8SCT6_SELML/408-445        AC D8SCT6.1
#=GS A0A0L8FXI9_OCTBM/294-336    AC A0A0L8FXI9.1
#=GS A0A6J1U5M9_9SAUR/679-719    AC A0A6J1U5M9.1
#=GS A0A5C3E2A5_9BASI/454-490    AC A0A5C3E2A5.1
#=GS A0A091PSQ9_LEPDC/799-838    AC A0A091PSQ9.1
#=GS A0A1B9FW82_9TREE/770-860    AC A0A1B9FW82.1
#=GS A0A6P8TUF7_GYMAC/629-669    AC A0A6P8TUF7.1
#=GS F6HBA9_VITVI/572-622        AC F6HBA9.1
#=GS A0A5C3QP47_9AGAR/630-763    AC A0A5C3QP47.1
#=GS A0A5A7URX2_CUCME/588-639    AC A0A5A7URX2.1
#=GS A0A2P5EL60_TREOI/603-648    AC A0A2P5EL60.1
#=GS A0A6J1PCT9_9HYME/62-102     AC A0A6J1PCT9.1
#=GS A0A091IW52_CALAN/832-872    AC A0A091IW52.1
#=GS A0A0M3KE91_ANISI/72-110     AC A0A0M3KE91.1
#=GS A0A6P8QQH7_GEOSA/726-766    AC A0A6P8QQH7.1
#=GS A0A1R1X082_9FUNG/6-108      AC A0A1R1X082.1
#=GS A0A3M7AWG0_HORWE/558-667    AC A0A3M7AWG0.1
#=GS A0A423VFW4_9PEZI/605-720    AC A0A423VFW4.1
#=GS A0A2P7ZAF4_9PEZI/488-606    AC A0A2P7ZAF4.1
#=GS A0A5N3XXP3_MUNRE/816-854    AC A0A5N3XXP3.1
#=GS A0A284S5Q1_ARMOS/508-565    AC A0A284S5Q1.1
#=GS A0A2K6U510_SAIBB/775-814    AC A0A2K6U510.1
#=GS A0A091HMS5_BUCRH/834-873    AC A0A091HMS5.1
#=GS A0A6J1SNG3_FRAOC/36-70      AC A0A6J1SNG3.1
#=GS A0A194X7C9_9HELO/739-850    AC A0A194X7C9.1
#=GS A0A3S0ZD51_ELYCH/191-233    AC A0A3S0ZD51.1
#=GS V8P1M4_OPHHA/552-662        AC V8P1M4.1
#=GS A0A4X2MA90_VOMUR/826-866    AC A0A4X2MA90.1
#=GS A0A0D9NR73_METAN/543-656    AC A0A0D9NR73.1
#=GS J5J821_BEAB2/543-656        AC J5J821.1
#=GS A0A1S3CDW1_CUCME/583-634    AC A0A1S3CDW1.1
#=GS A0A0S6XD99_9FUNG/479-581    AC A0A0S6XD99.1
#=GS A0A446N841_TRITD/302-337    AC A0A446N841.1
#=GS M7Z227_TRIUA/546-585        AC M7Z227.1
#=GS A0A1Y2U8X1_9PEZI/651-759    AC A0A1Y2U8X1.1
#=GS A0A2R2MQT4_LINUN/1255-1296  AC A0A2R2MQT4.1
#=GS A0A3Q7QJX5_CALUR/789-826    AC A0A3Q7QJX5.1
#=GS A0A665X2S3_ECHNA/1-39       AC A0A665X2S3.1
#=GS N4TVL1_FUSC1/544-657        AC N4TVL1.1
#=GS A0A2T9YDD5_9FUNG/232-362    AC A0A2T9YDD5.1
#=GS A0A0D3BYK7_BRAOL/537-577    AC A0A0D3BYK7.1
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#=GS A0A545A5D0_9PEZI/619-731    AC A0A545A5D0.1
#=GS R7TEJ1_CAPTE/533-569        AC R7TEJ1.1
#=GS J6EN76_SACK1/198-279        AC J6EN76.1
#=GS A0A1B8EJV0_9PEZI/663-777    AC A0A1B8EJV0.1
#=GS A0A5N4CHS8_CAMDR/813-852    AC A0A5N4CHS8.1
#=GS A0A6P3QIW3_PTEVA/826-863    AC A0A6P3QIW3.1
#=GS A0A6P4C371_ARADU/533-579    AC A0A6P4C371.1
#=GS A0A077Z9P0_TRITR/152-193    AC A0A077Z9P0.1
#=GS A0A0D2EFY3_9EURO/367-475    AC A0A0D2EFY3.1
#=GS A0A1C1CAN2_9EURO/260-369    AC A0A1C1CAN2.1
#=GS G2Q8E9_MYCTT/524-637        AC G2Q8E9.1
#=GS A0A1F5LUY4_9EURO/527-640    AC A0A1F5LUY4.1
#=GS A0A2N5VH55_9BASI/676-720    AC A0A2N5VH55.1
#=GS A0A250X8E2_9CHLO/513-696    AC A0A250X8E2.1
#=GS M7BKH6_CHEMY/615-654        AC M7BKH6.1
#=GS A0A093LKE8_EURHL/792-832    AC A0A093LKE8.1
#=GS A0A2S6CBI8_9PEZI/558-667    AC A0A2S6CBI8.1
#=GS J4I1I0_9APHY/535-653        AC J4I1I0.1
#=GS S7ZFJ1_PENO1/538-651        AC S7ZFJ1.1
#=GS A0A671F0M9_RHIFE/2-37       AC A0A671F0M9.1
#=GS A0A2K5CC56_AOTNA/823-862    AC A0A2K5CC56.1
#=GS A0A5B0M8Y5_PUCGR/404-451    AC A0A5B0M8Y5.1
#=GS A0A0L0HRU1_SPIPD/718-753    AC A0A0L0HRU1.1
#=GS A0A2K0WEH6_GIBNY/544-657    AC A0A2K0WEH6.1
#=GS A0A094LG39_ANTCR/850-889    AC A0A094LG39.1
#=GS A0A364N4H6_9PLEO/560-669    AC A0A364N4H6.1
#=GS A0A397UNJ3_9GLOM/2-93       AC A0A397UNJ3.1
#=GS K3Y3P7_SETIT/311-355        AC K3Y3P7.1
#=GS A0A0V1ABQ2_9BILA/22-121     AC A0A0V1ABQ2.1
#=GS A0A319BY57_9EURO/591-707    AC A0A319BY57.1
#=GS A0A5E4GCM5_PRUDU/576-617    AC A0A5E4GCM5.1
#=GS C1MUQ6_MICPC/336-377        AC C1MUQ6.1
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#=GS A0A3Q7VSB2_URSAR/823-861    AC A0A3Q7VSB2.1
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#=GS A0A1Y1ZJZ7_9PLEO/686-795    AC A0A1Y1ZJZ7.1
#=GS A0A3N4LU01_9PEZI/700-811    AC A0A3N4LU01.1
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#=GS A0A5N4CHM5_CAMDR/112-151    AC A0A5N4CHM5.1
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#=GS A0A4W5K1A7_9TELE/603-642    AC A0A4W5K1A7.1
#=GS A0A2P6N708_9EUKA/2466-2506  AC A0A2P6N708.1
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#=GS A0A5N5LE47_9ROSI/536-579    AC A0A5N5LE47.1
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#=GS A0A6I9QRK0_ELAGV/412-465    AC A0A6I9QRK0.1
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