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Database: Pfam
Entry: SID-1_RNA_chan
LinkDB: SID-1_RNA_chan
Original site: SID-1_RNA_chan 
#=GF ID   SID-1_RNA_chan
#=GF AC   PF13965.9
#=GF DE   dsRNA-gated channel SID-1
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE   Jackhmmer:Q9GZC8
#=GF GA   28.70 28.70;
#=GF TC   29.10 29.80;
#=GF NC   28.60 28.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0192
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12970568
#=GF RT   Transport of dsRNA into cells by the transmembrane protein
#=GF RT   SID-1.
#=GF RA   Feinberg EH, Hunter CP;
#=GF RL   Science. 2003;301:1545-1547.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11834782
#=GF RT   Systemic RNAi in C. elegans requires the putative transmembrane
#=GF RT   protein SID-1.
#=GF RA   Winston WM, Molodowitch C, Hunter CP;
#=GF RL   Science. 2002;295:2456-2459.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   16202143
#=GF RT   Nymphal RNAi: systemic RNAi mediated gene knockdown in juvenile
#=GF RT   grasshopper.
#=GF RA   Dong Y, Friedrich M;
#=GF RL   BMC Biotechnol. 2005;5:25.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   21733186
#=GF RT   CREST--a large and diverse superfamily of putative transmembrane
#=GF RT   hydrolases.
#=GF RA   Pei J, Millay DP, Olson EN, Grishin NV;
#=GF RL   Biol Direct. 2011;6:37.
#=GF DR   INTERPRO; IPR025958;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This is a family of proteins that are transmembrane dsRNA-gated
#=GF CC   channels. They passively transport dsRNA into cells and do not
#=GF CC   act as ATP-dependent pumps [1]. They are required for systemic
#=GF CC   RNA interference [2,3]. This family of proteins belong to the
#=GF CC   CREST superfamily [4], which are distantly related to GPCRs.
#=GF SQ   1759
#=GS A0A1D5PIG5_CHICK/173-357    AC A0A1D5PIG5.2
#=GS E9HYQ2_DAPPU/1-67           AC E9HYQ2.1
#=GS A0A2G5SLW7_9PELO/165-320    AC A0A2G5SLW7.1
#=GS A0A1D1VNI7_RAMVA/460-968    AC A0A1D1VNI7.1
#=GS A0A1W0X3Q5_HYPDU/1-81       AC A0A1W0X3Q5.1
#=GS A0A6P9CMH7_PANGU/172-861    AC A0A6P9CMH7.1
#=GS A0A672IQU7_SALFA/224-851    AC A0A672IQU7.1
#=GS A0A2A4IUB4_HELVI/216-869    AC A0A2A4IUB4.1
#=GS A0A5N5TKP1_9CRUS/230-806    AC A0A5N5TKP1.1
#=GS A0A670ZAI3_PSETE/108-216    AC A0A670ZAI3.1
#=GS A0A4W5Q3M7_9TELE/228-842    AC A0A4W5Q3M7.1
#=GS A0A1L8FLK7_XENLA/169-836    AC A0A1L8FLK7.1
#=GS A0A2P4SBJ2_BAMTH/1-62       AC A0A2P4SBJ2.1
#=GS A0A093ILD9_FULGA/111-763    AC A0A093ILD9.1
#=GS A0A6F9CJT3_9TELE/168-281    AC A0A6F9CJT3.1
#=GS A0A2K6C251_MACNE/169-836    AC A0A2K6C251.1
#=GS A0A194PYX2_PAPXU/174-791    AC A0A194PYX2.1
#=GS A0A2T7P1R7_POMCA/612-653    AC A0A2T7P1R7.1
#=GS A0A452IJX9_9SAUR/176-855    AC A0A452IJX9.1
#=GS I3KIS1_ORENI/191-876        AC I3KIS1.2
#=GS A0A2A4JCH4_HELVI/216-398    AC A0A2A4JCH4.1
#=GS A0A5N4C7T9_CAMDR/318-538    AC A0A5N4C7T9.1
#=GS A0A674GDK5_TAEGU/176-850    AC A0A674GDK5.1
#=GS E9GL72_DAPPU/1-430          AC E9GL72.1
#=GS A0A6H5I7W9_9HYME/201-424    AC A0A6H5I7W9.1
#=GS A0A6G0IWD0_LARCR/190-844    AC A0A6G0IWD0.1
#=GS A0A6G1ANC7_CROCR/180-819    AC A0A6G1ANC7.1
#=GS A0A1W0X3J4_HYPDU/186-840    AC A0A1W0X3J4.1
#=GS A0A674HSV7_TAEGU/176-846    AC A0A674HSV7.1
#=GS F6SV01_MOUSE/1-137          AC F6SV01.1
#=GS A0A2Y9FA82_PHYMC/169-835    AC A0A2Y9FA82.1
#=GS F7AAY2_XENTR/172-816        AC F7AAY2.4
#=GS A0A671S0G5_9TELE/547-677    AC A0A671S0G5.1
#=GS A0A1D2MVQ8_ORCCI/354-779    AC A0A1D2MVQ8.1
#=GS M7B6M7_CHEMY/111-782        AC M7B6M7.1
#=GS H3E6H0_PRIPA/383-1016       AC H3E6H0.2
#=GS A0A060ZAZ7_ONCMY/1-141      AC A0A060ZAZ7.1
#=GS A0A2Y9M1A8_DELLE/169-839    AC A0A2Y9M1A8.1
#=GS A0A4W5M8M6_9TELE/183-736    AC A0A4W5M8M6.1
#=GS A0A6P5KID4_PHACI/169-849    AC A0A6P5KID4.1
#=GS A0A3Q3BRB9_KRYMA/192-855    AC A0A3Q3BRB9.1
#=GS A0A1S2ZAG7_ERIEU/180-823    AC A0A1S2ZAG7.1
#=GS A0A2R9A7R5_PANPA/169-820    AC A0A2R9A7R5.1
#=GS A0A2T7P1R7_POMCA/756-977    AC A0A2T7P1R7.1
#=GS A0A673MMD1_9TELE/551-698    AC A0A673MMD1.1
#=GS A0A6P7JHW3_9TELE/191-847    AC A0A6P7JHW3.1
#=GS E9FVT5_DAPPU/1-421          AC E9FVT5.1
#=GS A0A2A4JHF6_HELVI/1941-2005  AC A0A2A4JHF6.1
#=GS A0A6A4WFN9_AMPAM/109-730    AC A0A6A4WFN9.1
#=GS A0A238BK11_9BILA/29-296     AC A0A238BK11.1
#=GS A0A5E4MJY2_9HEMI/174-649    AC A0A5E4MJY2.1
#=GS A0A369SBA6_9METZ/1232-1491  AC A0A369SBA6.1
#=GS A0A2R9ACY0_PANPA/10-185     AC A0A2R9ACY0.1
#=GS A0A663FJ05_AQUCH/172-823    AC A0A663FJ05.1
#=GS A0A0P7ULT8_SCLFO/185-826    AC A0A0P7ULT8.1
#=GS A0A093BJP4_CHAPE/1-357      AC A0A093BJP4.1
#=GS A0A3B1JSV6_ASTMX/197-877    AC A0A3B1JSV6.1
#=GS A0A6Q2XMK8_ESOLU/188-827    AC A0A6Q2XMK8.1
#=GS A0A3N0Z8B7_ANAGA/434-497    AC A0A3N0Z8B7.1
#=GS A0A341C0U3_NEOAA/169-835    AC A0A341C0U3.1
#=GS A0A654I4I4_9CEST/412-584    AC A0A654I4I4.1
#=GS A0A1S3SYP6_SALSA/183-862    AC A0A1S3SYP6.1
#=GS A0A5E4Q663_9NEOP/152-542    AC A0A5E4Q663.1
#=GS A0A6I9Q391_9TELE/187-862    AC A0A6I9Q391.1
#=GS A0A419Q4I9_CLOSI/611-1085   AC A0A419Q4I9.1
#=GS A0A158QG75_HYMDI/363-587    AC A0A158QG75.1
#=GS A0A3P9BDF5_9CICH/190-845    AC A0A3P9BDF5.1
#=GS A0A4C2A0B4_EUMVA/349-435    AC A0A4C2A0B4.1
#=GS H2NFE3_PONAB/169-238        AC H2NFE3.1
#=GS A0A1D1UGX0_RAMVA/192-839    AC A0A1D1UGX0.1
#=GS A0A2Y9JI45_ENHLU/180-218    AC A0A2Y9JI45.1
#=GS H9JNQ6_BOMMO/1-310          AC H9JNQ6.1
#=GS A0A1A6H2J3_NEOLE/83-153     AC A0A1A6H2J3.1
#=GS A0A6J2KZY3_9CHIR/184-832    AC A0A6J2KZY3.2
#=GS A0A669CJY3_ORENI/193-741    AC A0A669CJY3.1
#=GS A0A267E765_9PLAT/216-940    AC A0A267E765.1
#=GS A7T8S0_NEMVE/7-54           AC A7T8S0.1
#=GS A0A1W4XF31_AGRPL/1-341      AC A0A1W4XF31.1
#=GS A0A2Y9LIZ0_DELLE/614-792    AC A0A2Y9LIZ0.1
#=GS A0A452IJN9_9SAUR/176-763    AC A0A452IJN9.1
#=GS A0A287D3V4_ICTTR/188-836    AC A0A287D3V4.1
#=GS A0A1V4J7Q8_PATFA/183-856    AC A0A1V4J7Q8.1
#=GS A0A267GWI1_9PLAT/181-743    AC A0A267GWI1.1
#=GS A0A1X7VVV3_AMPQE/177-809    AC A0A1X7VVV3.1
#=GS G1P210_MYOLU/112-795        AC G1P210.1
#=GS A0A6J3RTY7_TURTR/169-835    AC A0A6J3RTY7.1
#=GS A0A6J0TQA2_9SAUR/1-649      AC A0A6J0TQA2.1
#=GS A0A6J0TCD1_9SAUR/143-783    AC A0A6J0TCD1.1
#=GS A0A6J3E7Q8_AYTFU/174-869    AC A0A6J3E7Q8.1
#=GS A0A218UPZ7_9PASE/176-846    AC A0A218UPZ7.1
#=GS E2B9B2_HARSA/111-720        AC E2B9B2.1
#=GS A0A1V4J7S2_PATFA/183-852    AC A0A1V4J7S2.1
#=GS A0A6J0AN12_VICPA/169-839    AC A0A6J0AN12.1
#=GS A0A5K4FBR5_SCHMA/157-461    AC A0A5K4FBR5.1
#=GS A0A7E5WGR4_TRINI/178-795    AC A0A7E5WGR4.1
#=GS B3S1A3_TRIAD/1-380          AC B3S1A3.1
#=GS A0A5J5DKK9_9PERO/188-625    AC A0A5J5DKK9.1
#=GS A0A437AXR2_CHISP/2-101      AC A0A437AXR2.1
#=GS A0A2Y9LFA2_DELLE/177-620    AC A0A2Y9LFA2.1
#=GS A0A671S1S0_9TELE/239-343    AC A0A671S1S0.1
#=GS A0A2F0B6F2_ESCRO/108-260    AC A0A2F0B6F2.1
#=GS A0A671XQP6_SPAAU/190-805    AC A0A671XQP6.1
#=GS A0A0N4V8H0_ENTVE/65-185     AC A0A0N4V8H0.1
#=GS L8H6V2_ACACA/34-490         AC L8H6V2.1
#=GS A0A665TWV9_ECHNA/191-851    AC A0A665TWV9.1
#=GS A0A261CNB4_9PELO/145-323    AC A0A261CNB4.1
#=GS A0A7N6ALF3_ANATE/189-828    AC A0A7N6ALF3.1
#=GS A0A1S3SYP3_SALSA/183-845    AC A0A1S3SYP3.1
#=GS U3ESA1_CALJA/169-836        AC U3ESA1.1
#=GS A0A6P6C004_PTEVA/169-694    AC A0A6P6C004.1
#=GS A0A6F9CJT3_9TELE/552-648    AC A0A6F9CJT3.1
#=GS A0A3Q3L5H9_9TELE/203-867    AC A0A3Q3L5H9.1
#=GS A0A1D1VQP2_RAMVA/459-965    AC A0A1D1VQP2.1
#=GS SIDT2_RAT/169-832           AC D3ZEH5.2
#=GS A0A151LZP7_ALLMI/167-835    AC A0A151LZP7.1
#=GS A0A3Q4FZ86_NEOBR/358-597    AC A0A3Q4FZ86.1
#=GS A0A6J3IGM1_SAPAP/169-836    AC A0A6J3IGM1.1
#=GS A0A668T0T8_OREAU/191-851    AC A0A668T0T8.1
#=GS A0A670JY30_PODMU/99-714     AC A0A670JY30.1
#=GS A0A0V0ZEK1_9BILA/994-1610   AC A0A0V0ZEK1.1
#=GS A0A7N5P8Q3_AILME/180-732    AC A0A7N5P8Q3.1
#=GS A0A671S134_9TELE/472-588    AC A0A671S134.1
#=GS A0A5N5SJM2_9CRUS/13-97      AC A0A5N5SJM2.1
#=GS A0A1S3G6S4_DIPOR/717-878    AC A0A1S3G6S4.1
#=GS D4A117_RAT/33-681           AC D4A117.3
#=GS A0A337S4T5_FELCA/169-753    AC A0A337S4T5.2
#=GS A0A2K6R0R9_RHIRO/169-836    AC A0A2K6R0R9.1
#=GS A0A1A6GSW6_NEOLE/151-538    AC A0A1A6GSW6.1
#=GS I3L776_PIG/180-828          AC I3L776.2
#=GS A0A672JU41_SINGR/143-424    AC A0A672JU41.1
#=GS A0A672JYB0_SINGR/482-839    AC A0A672JYB0.1
#=GS A0A226DUP2_FOLCA/71-243     AC A0A226DUP2.1
#=GS A0A0Q3LWE8_AMAAE/1-179      AC A0A0Q3LWE8.1
#=GS A0A671S125_9TELE/153-585    AC A0A671S125.1
#=GS A0A261CLL1_9PELO/405-579    AC A0A261CLL1.1
#=GS A0A7F8RAS1_LEPWE/330-563    AC A0A7F8RAS1.1
#=GS A0A2J7RDJ2_9NEOP/183-804    AC A0A2J7RDJ2.1
#=GS A0A4D9DZT8_9SAUR/171-841    AC A0A4D9DZT8.1
#=GS A0A6I8Q169_XENTR/169-837    AC A0A6I8Q169.2
#=GS A8XNC4_CAEBR/161-314        AC A8XNC4.1
#=GS A0A1U8BMI5_MESAU/169-857    AC A0A1U8BMI5.1
#=GS A0A2Y9H8P7_NEOSC/215-800    AC A0A2Y9H8P7.1
#=GS A0A3P8UEJ8_AMPPE/191-854    AC A0A3P8UEJ8.1
#=GS A0A7N5JX79_AILME/169-812    AC A0A7N5JX79.1
#=GS A0A4W6DS49_LATCA/162-815    AC A0A4W6DS49.1
#=GS E9PPN9_HUMAN/19-170         AC E9PPN9.2
#=GS A0A2I3SXW2_PANTR/169-818    AC A0A2I3SXW2.1
#=GS A0A5K4FBR5_SCHMA/538-1058   AC A0A5K4FBR5.1
#=GS A0A672IM83_SALFA/191-867    AC A0A672IM83.1
#=GS F7B6N2_MOUSE/1-221          AC F7B6N2.1
#=GS A0A504YFD6_FASGI/151-290    AC A0A504YFD6.1
#=GS H2KYK1_CAEEL/157-739        AC H2KYK1.1
#=GS A0A5N5SIE5_9CRUS/532-829    AC A0A5N5SIE5.1
#=GS A0A6L2PYY7_COPFO/187-694    AC A0A6L2PYY7.1
#=GS A0A674JPK4_TERCA/132-762    AC A0A674JPK4.1
#=GS A0A6F9CJT3_9TELE/415-555    AC A0A6F9CJT3.1
#=GS H0X497_OTOGA/110-758        AC H0X497.1
#=GS A0A7F8PZP3_LEPWE/13-640     AC A0A7F8PZP3.1
#=GS A0A1D2M3H9_ORCCI/23-140     AC A0A1D2M3H9.1
#=GS A0A7E5VXG1_TRINI/191-427    AC A0A7E5VXG1.1
#=GS A0A2Y9HFH4_NEOSC/180-823    AC A0A2Y9HFH4.1
#=GS A0A091SRS8_PELCR/16-668     AC A0A091SRS8.1
#=GS G3NRW7_GASAC/168-832        AC G3NRW7.1
#=GS A0A6G1BFH7_CROCR/169-832    AC A0A6G1BFH7.1
#=GS A0A077ZFN8_TRITR/146-746    AC A0A077ZFN8.1
#=GS A0A2K5JXG8_COLAP/184-827    AC A0A2K5JXG8.1
#=GS A9UPD0_MONBE/1-334          AC A9UPD0.1
#=GS A0A671XQG4_SPAAU/190-823    AC A0A671XQG4.1
#=GS A0A0R3X3R6_HYDTA/35-157     AC A0A0R3X3R6.1
#=GS A0A0L7L423_9NEOP/80-177     AC A0A0L7L423.1
#=GS A0A3B5QLT8_XIPMA/215-890    AC A0A3B5QLT8.1
#=GS A0A2K5MUV4_CERAT/114-762    AC A0A2K5MUV4.1
#=GS A0A212F5T8_DANPL/415-720    AC A0A212F5T8.1
#=GS A0A674CCQ6_SALTR/180-838    AC A0A674CCQ6.1
#=GS A0A6J3LGQ0_9HYME/170-778    AC A0A6J3LGQ0.1
#=GS A0A654I4I4_9CEST/712-813    AC A0A654I4I4.1
#=GS A0A182EDN5_ONCOC/200-764    AC A0A182EDN5.1
#=GS A0A3Q7P8T0_CALUR/21-690     AC A0A3Q7P8T0.1
#=GS A0A1Q9CDT0_SYMMI/1858-2190  AC A0A1Q9CDT0.1
#=GS A0A671T339_9TELE/185-673    AC A0A671T339.1
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