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Database: Pfam
Entry: SMODS
LinkDB: SMODS
Original site: SMODS 
#=GF ID   SMODS
#=GF AC   PF18144.3
#=GF DE   Second Messenger Oligonucleotide or Dinucleotide Synthetase domain
#=GF AU   Iyer LM;0000-0002-4844-2022
#=GF AU   Aravind L;0000-0003-0771-253X
#=GF AU   Burroughs AM;0000-0002-2229-8771
#=GF AU   El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE   Laks
#=GF GA   26.50 30.00;
#=GF TC   26.50 30.00;
#=GF NC   26.40 29.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0260
#=GF RN   [1]
#=GF RM   26590262
#=GF RT   Comparative genomic analyses reveal a vast, novel network of
#=GF RT   nucleotide-centric systems in biological conflicts, immunity and
#=GF RT   signaling.
#=GF RA   Burroughs AM, Zhang D, Schaffer DE, Iyer LM, Aravind L;
#=GF RL   Nucleic Acids Res. 2015;43:10633-10654.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   22500802
#=GF RT   Coordinated regulation of accessory genetic elements produces
#=GF RT   cyclic di-nucleotides for V. cholerae virulence.
#=GF RA   Davies BW, Bogard RW, Young TS, Mekalanos JJ;
#=GF RL   Cell. 2012;149:358-370.
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Nucleotide synthetase enzyme of the DNA polymerase beta
#=GF CC   superfamily. Experimental studies have demonstrated cGAMP
#=GF CC   synthetase activity in the Vibrio cholerae DncV protein, a
#=GF CC   member of the SMODS family. The diversity inherent to the SMODS
#=GF CC   family suggests members of the family could generate a range of
#=GF CC   nucleotides, cyclic and/or linear. The nucleotide second
#=GF CC   messengers generated by the SMODS domains are predicted to
#=GF CC   activate effectors in a class of conflict systems reliant on the
#=GF CC   production and sensing of the nucleotide second messengers [1]
#=GF CC   [2].
#=GF SQ   870
#=GS F6B750_DESCC/1-113          AC F6B750.1
#=GS A0A1I3RKI4_9RHIZ/11-178     AC A0A1I3RKI4.1
#=GS W1W3K1_9STAP/4-181          AC W1W3K1.1
#=GS A0A0E3UIU9_9BACT/3-158      AC A0A0E3UIU9.1
#=GS A0A073J7I3_9RHOB/1-160      AC A0A073J7I3.1
#=GS A0A509E5L4_9RHIZ/3-160      AC A0A509E5L4.1
#=GS A0A2T5ZZJ4_9RHOB/10-153     AC A0A2T5ZZJ4.1
#=GS A0A4Y3TSI1_9PROT/1-163      AC A0A4Y3TSI1.1
#=GS V2GDC8_9BURK/12-176         AC V2GDC8.1
#=GS I4C984_DESTA/1-160          AC I4C984.1
#=GS A0A421BLA6_9RHOB/11-176     AC A0A421BLA6.1
#=GS A0A238XMS2_9FLAO/1-163      AC A0A238XMS2.1
#=GS A0A285GQ58_9ACTN/1-160      AC A0A285GQ58.1
#=GS A0A2S6NH81_RHOGL/1-163      AC A0A2S6NH81.1
#=GS K9Q822_9NOSO/3-162          AC K9Q822.1
#=GS A0A4Y9S9Y3_9BURK/1-171      AC A0A4Y9S9Y3.1
#=GS W5TCL0_9NOCA/1-147          AC W5TCL0.1
#=GS D0GMX3_9FUSO/3-131          AC D0GMX3.1
#=GS A0A1W7M8G5_9SPHN/1-164      AC A0A1W7M8G5.1
#=GS A0A364K8X0_9BACL/1-160      AC A0A364K8X0.1
#=GS J3HR99_9RHIZ/2-165          AC J3HR99.1
#=GS A0A2N6RCI8_9BACI/1-164      AC A0A2N6RCI8.1
#=GS A0A1V2ZVP0_9GAMM/1-160      AC A0A1V2ZVP0.1
#=GS L0FZQ3_ECHVK/9-174          AC L0FZQ3.1
#=GS A0A1M5S0B4_9ACTN/3-159      AC A0A1M5S0B4.1
#=GS A0A5C6TWC9_9SPHN/2-164      AC A0A5C6TWC9.1
#=GS A0A419S5W2_9SPHI/8-162      AC A0A419S5W2.1
#=GS A0A5C6AK73_9BACT/1-151      AC A0A5C6AK73.1
#=GS A0A4T3EXS9_9SPHN/17-178     AC A0A4T3EXS9.1
#=GS C6J726_9BACL/9-174          AC C6J726.1
#=GS A0A495KSM4_9FLAO/2-159      AC A0A495KSM4.1
#=GS A0A1Z4JPG7_LEPBY/1-164      AC A0A1Z4JPG7.1
#=GS A0A1I4H8P9_9RHOB/1-168      AC A0A1I4H8P9.1
#=GS R5P2Q6_9FIRM/7-175          AC R5P2Q6.1
#=GS H0WPE7_OTOGA/11-159         AC H0WPE7.1
#=GS A0A250IL41_9DELT/9-173      AC A0A250IL41.1
#=GS A0A085WRI1_9DELT/1-161      AC A0A085WRI1.1
#=GS A0A2S7WL66_9FLAO/13-176     AC A0A2S7WL66.1
#=GS A0A5C6TX93_9SPHN/4-158      AC A0A5C6TX93.1
#=GS A0A1I4ABN3_9FIRM/6-189      AC A0A1I4ABN3.1
#=GS A0A4P6KE53_9MICO/2-165      AC A0A4P6KE53.1
#=GS A0A0T5NT56_9RHOB/20-181     AC A0A0T5NT56.1
#=GS A0A2N3S9U3_9ACTN/1-164      AC A0A2N3S9U3.1
#=GS A0A6I1QNC3_9CHLR/8-168      AC A0A6I1QNC3.1
#=GS A0A147F895_MICTE/1-165      AC A0A147F895.1
#=GS A0A502FIS9_9PROT/37-190     AC A0A502FIS9.1
#=GS A0A2G8LHY3_STIJA/1-134      AC A0A2G8LHY3.1
#=GS A0A419XPV1_9ACTN/1-156      AC A0A419XPV1.1
#=GS A0A518GBQ8_9BACT/1-170      AC A0A518GBQ8.1
#=GS A0A2P6MJM7_9BACI/2-126      AC A0A2P6MJM7.1
#=GS A0A4D7QKM7_9PROT/1-163      AC A0A4D7QKM7.1
#=GS A0A2A5RPW3_9LACT/3-151      AC A0A2A5RPW3.1
#=GS A0A1D9FFF1_9MICC/13-180     AC A0A1D9FFF1.1
#=GS A0A1I4RJH1_9PSED/4-165      AC A0A1I4RJH1.1
#=GS A0A2N1F611_9FLAO/93-201     AC A0A2N1F611.1
#=GS X8FHK1_MYCUL/2-125          AC X8FHK1.1
#=GS G1PT56_MYOLU/10-161         AC G1PT56.1
#=GS E3J605_FRAIE/68-227         AC E3J605.1
#=GS A0A074TTU9_9MICO/1-62       AC A0A074TTU9.1
#=GS A0A430B6M1_9ENTE/1-163      AC A0A430B6M1.1
#=GS A0A1K1NL91_9PROT/5-178      AC A0A1K1NL91.1
#=GS A0A0B4X9H1_9RHIZ/1-160      AC A0A0B4X9H1.1
#=GS A0A4W3JPB3_CALMI/6-129      AC A0A4W3JPB3.1
#=GS A0A369TJ10_9RHOB/2-166      AC A0A369TJ10.1
#=GS Q12DA7_POLSJ/25-193         AC Q12DA7.1
#=GS A0A372K6A7_9BURK/14-189     AC A0A372K6A7.1
#=GS A0A4Q1CGD2_9BACT/4-165      AC A0A4Q1CGD2.1
#=GS A0A2U8QVW6_9FLAO/13-170     AC A0A2U8QVW6.1
#=GS A0A4Q3YU79_9RHOB/1-157      AC A0A4Q3YU79.1
#=GS A0A2N3YFY3_9MICO/1-163      AC A0A2N3YFY3.1
#=GS A0A514WIE0_9SPHN/1-170      AC A0A514WIE0.1
#=GS A0A0A0E9L7_9RHOB/15-174     AC A0A0A0E9L7.1
#=GS A0A2R7L0X5_9SPHI/8-174      AC A0A2R7L0X5.1
#=GS A0A231V0K5_9RHIZ/19-181     AC A0A231V0K5.1
#=GS A3U001_PSEBH/19-181         AC A3U001.1
#=GS A0A2U8QX89_9FLAO/11-175     AC A0A2U8QX89.1
#=GS A0A0M3BSD3_9RHIZ/1-160      AC A0A0M3BSD3.1
#=GS A0A2T4V0V5_9DELT/2-161      AC A0A2T4V0V5.1
#=GS A0A0B3RR71_9RHOB/3-169      AC A0A0B3RR71.1
#=GS A0A344LE17_9PSEU/1-163      AC A0A344LE17.1
#=GS A0A1G6EBX1_9FIRM/6-173      AC A0A1G6EBX1.1
#=GS A5EWE7_DICNV/1-130          AC A5EWE7.1
#=GS A0A2A2SDR8_9SPHN/1-165      AC A0A2A2SDR8.1
#=GS J7ITK3_DESMD/28-185         AC J7ITK3.1
#=GS A0A0S2K9B9_9GAMM/4-162      AC A0A0S2K9B9.1
#=GS A0A6I7LW52_9BACT/1-175      AC A0A6I7LW52.1
#=GS A0A5D0RPR2_9RHOB/11-160     AC A0A5D0RPR2.1
#=GS A0A0B4REU4_9BACL/1-161      AC A0A0B4REU4.1
#=GS A0A328Z002_9FLAO/86-195     AC A0A328Z002.1
#=GS A3VLJ5_9RHOB/13-176         AC A3VLJ5.1
#=GS A0A4P7UE45_9ACTN/1-176      AC A0A4P7UE45.1
#=GS A0A553G8L3_9BACT/1-163      AC A0A553G8L3.1
#=GS A0A4R5PPF5_9RHIZ/1-166      AC A0A4R5PPF5.1
#=GS A0A1G7YKZ2_9RHIZ/1-163      AC A0A1G7YKZ2.1
#=GS A1ZW67_9BACT/9-180          AC A1ZW67.1
#=GS A0A0Q8DF51_9ACTN/1-159      AC A0A0Q8DF51.1
#=GS A0A4R6SG22_9PSEU/1-161      AC A0A4R6SG22.1
#=GS T0GN38_9SPHN/1-170          AC T0GN38.1
#=GS A0A1Y2RCM6_9BACT/2-162      AC A0A1Y2RCM6.1
#=GS S0LD19_ENTAV/1-159          AC S0LD19.1
#=GS A0A1T4KLJ1_9ACTN/1-159      AC A0A1T4KLJ1.1
#=GS A0A1G4UG52_9SPHN/1-169      AC A0A1G4UG52.1
#=GS A0A1H9AZT5_9RHIZ/34-188     AC A0A1H9AZT5.1
#=GS A0A3P3DJM6_9RHOB/2-165      AC A0A3P3DJM6.1
#=GS A0A1I2QKX0_9CORY/1-161      AC A0A1I2QKX0.1
#=GS A0A5M6CH84_9BACT/30-188     AC A0A5M6CH84.1
#=GS E8V4E2_TERSS/1-168          AC E8V4E2.1
#=GS A0A1H0JU21_9BRAD/1-167      AC A0A1H0JU21.1
#=GS A0A023D4F9_ACIMT/1-167      AC A0A023D4F9.1
#=GS M0CGQ3_9EURY/1-136          AC M0CGQ3.1
#=GS A0A261U2G5_9BORD/1-166      AC A0A261U2G5.1
#=GS A0A5J5FSA9_9BACL/24-153     AC A0A5J5FSA9.1
#=GS U4KEM4_9VIBR/1-159          AC U4KEM4.1
#=GS A0A1H7SVU6_9RHOB/1-188      AC A0A1H7SVU6.1
#=GS A9G7F7_SORC5/9-176          AC A9G7F7.1
#=GS C7MLB9_CRYCD/1-165          AC C7MLB9.1
#=GS A0A5N3P5W6_9RHIZ/5-167      AC A0A5N3P5W6.1
#=GS A0A257JM18_9PROT/1-156      AC A0A257JM18.1
#=GS A0A2Z6AK67_9SPHN/1-171      AC A0A2Z6AK67.1
#=GS L7F534_9ACTN/1-165          AC L7F534.1
#=GS A8LDS4_FRASN/80-239         AC A8LDS4.1
#=GS V7I2G6_9CLOT/9-167          AC V7I2G6.1
#=GS A0A1H6M2G9_9GAMM/1-164      AC A0A1H6M2G9.1
#=GS A0A4V1XZM8_9ACTN/1-161      AC A0A4V1XZM8.1
#=GS A0A261F263_9BIFI/1-164      AC A0A261F263.1
#=GS I4VJP7_9GAMM/4-158          AC I4VJP7.1
#=GS A0A1S2VFV3_9BACT/12-178     AC A0A1S2VFV3.1
#=GS A0A5C8WYT1_9RHIZ/14-175     AC A0A5C8WYT1.1
#=GS A0A4W2E5R9_BOBOX/11-160     AC A0A4W2E5R9.1
#=GS A0A541BLY4_9NOCA/1-157      AC A0A541BLY4.1
#=GS A0A4R3UBW5_PELSC/1-166      AC A0A4R3UBW5.1
#=GS A0A316DW60_9FLAO/1-176      AC A0A316DW60.1
#=GS A0A0F7M5U5_9GAMM/7-160      AC A0A0F7M5U5.1
#=GS A0A4R3VJU4_PELSC/1-163      AC A0A4R3VJU4.1
#=GS I1YLE8_METFJ/34-201         AC I1YLE8.1
#=GS A0A2K6GBA2_PROCO/11-165     AC A0A2K6GBA2.1
#=GS A0A5B9D814_9ARCH/3-166      AC A0A5B9D814.1
#=GS F8AUU5_9ACTN/89-248         AC F8AUU5.1
#=GS L7LC83_9ACTN/1-164          AC L7LC83.1
#=GS A0A2S7K133_9PROT/1-166      AC A0A2S7K133.1
#=GS A0A5C5XF41_9PLAN/12-175     AC A0A5C5XF41.1
#=GS A0A2A3K0R6_9RHOB/8-168      AC A0A2A3K0R6.1
#=GS A0A2Z2NWJ4_9GAMM/1-168      AC A0A2Z2NWJ4.1
#=GS D7BKL3_ARCHD/1-162          AC D7BKL3.1
#=GS C8NC91_CARH6/1-156          AC C8NC91.1
#=GS A0A5E4A3D2_MARMO/342-492    AC A0A5E4A3D2.1
#=GS A0A4R2LMM1_9GAMM/14-164     AC A0A4R2LMM1.1
#=GS A0A286IKU6_9BACT/7-162      AC A0A286IKU6.1
#=GS K9XAA5_9NOST/3-172          AC K9XAA5.1
#=GS F0GWA8_9FIRM/1-170          AC F0GWA8.1
#=GS A0A327NDJ3_9BACT/9-174      AC A0A327NDJ3.1
#=GS U2AWT2_9CLOT/1-170          AC U2AWT2.1
#=GS A0A0U1QNZ8_9BACL/2-169      AC A0A0U1QNZ8.1
#=GS A0A1Z5HCS5_9GAMM/1-161      AC A0A1Z5HCS5.1
#=GS K7S4Y7_ACIA4/5-169          AC K7S4Y7.1
#=GS A0A087A0K4_9BIFI/1-160      AC A0A087A0K4.1
#=GS A0A6I7LV00_9BACT/2-154      AC A0A6I7LV00.1
#=GS A0A160KVT4_9MICO/5-158      AC A0A160KVT4.1
#=GS A0A2V1IV08_9BACT/1-162      AC A0A2V1IV08.1
#=GS A0A2R5F7N9_9PROT/25-192     AC A0A2R5F7N9.1
#=GS A0A0N9UGE4_SPHMC/17-179     AC A0A0N9UGE4.1
#=GS F4GRJ2_PUSST/5-162          AC F4GRJ2.1
#=GS A0A1Y0GZE5_9BACT/1-109      AC A0A1Y0GZE5.1
#=GS A0A4P6EDW4_9MICO/1-163      AC A0A4P6EDW4.1
#=GS A0A495VYA0_9PSEU/2-164      AC A0A495VYA0.1
#=GS A0A418YKA2_9GAMM/1-167      AC A0A418YKA2.1
#=GS A0A1Q2L4A8_9BACL/1-159      AC A0A1Q2L4A8.1
#=GS G7M987_9CLOT/1-163          AC G7M987.1
#=GS A0A285BFA2_9FIRM/1-50       AC A0A285BFA2.1
#=GS A0A1X0DGB0_9MYCO/1-165      AC A0A1X0DGB0.1
#=GS D0LHT3_HALO1/1-169          AC D0LHT3.1
#=GS A0A4R1UAM0_9SPHN/9-160      AC A0A4R1UAM0.1
#=GS A0A4V3Z808_9ACTN/74-233     AC A0A4V3Z808.1
#=GS A0A494W0D3_9SPHN/1-93       AC A0A494W0D3.1
#=GS Q07GQ6_ROSDO/8-167          AC Q07GQ6.1
#=GS A0A0U3EVK9_9BURK/1-164      AC A0A0U3EVK9.1
#=GS A0A1U7DDK1_9RHOB/18-188     AC A0A1U7DDK1.1
#=GS A0A0U3P2S8_9MOLU/7-152      AC A0A0U3P2S8.1
#=GS F8A0J2_CELGA/2-163          AC F8A0J2.1
#=GS X8BK86_MYCXE/1-87           AC X8BK86.1
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#=GS A0A0Q1A468_9SPHI/1-162      AC A0A0Q1A468.1
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