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Database: Pfam
Entry: Sde2_N_Ubi
LinkDB: Sde2_N_Ubi
Original site: Sde2_N_Ubi 
#=GF ID   Sde2_N_Ubi
#=GF AC   PF13019.9
#=GF DE   Silencing defective 2 N-terminal ubiquitin domain
#=GF PI   Ubiquitin-like; Telomere_Sde2;
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF AU   El-Gebali S;0000-0003-1378-5495
#=GF SE   Pfam-B_2457 (release 24.0)
#=GF GA   26.40 16.00;
#=GF TC   26.40 19.60;
#=GF NC   26.30 15.90;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0072
#=GF RN   [1]
#=GF RM   28947618
#=GF RT   Sde2 is an intron-specific pre-mRNA splicing regulator activated
#=GF RT   by ubiquitin-like processing.
#=GF RA   Thakran P, Pandit PA, Datta S, Kolathur KK, Pleiss JA, Mishra
#=GF RA   SK;
#=GF RL   EMBO J. 2018;37:89-101.
#=GF DR   INTERPRO; IPR024974;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Sde2 (silencing defective 2) is a ubiquitin-fold-containing
#=GF CC   splicing regulator that supports splicing of selected pre-mRNAs
#=GF CC   in an intron-specific manner in Schizosaccharomyces pombe. Both
#=GF CC   fission yeast and human Sde2 are translated as inactive
#=GF CC   precursor proteins harbouring the ubiquitin-fold domain linked
#=GF CC   through an invariant GGKGG motif to a C-terminal domain. The
#=GF CC   Sde2 protein has a ubiquitin-fold at its N-terminus, which must
#=GF CC   be cleaved by the ubiquitin-specific proteases (USPs) Ubp5 and
#=GF CC   Ubp15. After cleavage, the C-terminal domain of Sde2, which
#=GF CC   starts with a lysine, gets incorporated into the spliceosome
#=GF CC   [1]. This entry represents the ubiquitin fold N-terminal domain
#=GF CC   found in Sde2 proteins.
#=GF SQ   1536
#=GS A0A137P2J0_CONC2/4-154      AC A0A137P2J0.1
#=GS A0A4Q2DQW8_9AGAR/3-167      AC A0A4Q2DQW8.1
#=GS R9PDC1_PSEHS/2-158          AC R9PDC1.1
#=GS A0A0A2K036_PENEN/6-174      AC A0A0A2K036.1
#=GS A0A2T3ZF15_9HYPO/5-169      AC A0A2T3ZF15.1
#=GS A0A6P6B0K6_DURZI/19-189     AC A0A6P6B0K6.1
#=GS A0A1S3F9K1_DIPOR/114-182    AC A0A1S3F9K1.1
#=GS K0RYG9_THAOC/106-206        AC K0RYG9.1
#=GS A0A3Q2ZZK2_KRYMA/31-173     AC A0A3Q2ZZK2.1
#=GS A0A1Y2W6H4_9PEZI/6-168      AC A0A1Y2W6H4.1
#=GS A0A139IEK4_9PEZI/8-172      AC A0A139IEK4.1
#=GS A0A383V2K9_TETOB/1-176      AC A0A383V2K9.1
#=GS A0A2Y9NV52_DELLE/1-83       AC A0A2Y9NV52.1
#=GS A0A2D3V7S3_9PEZI/7-169      AC A0A2D3V7S3.1
#=GS J4GHN3_9APHY/3-165          AC J4GHN3.1
#=GS A0A0D1Z055_9PEZI/6-168      AC A0A0D1Z055.1
#=GS A0A2S4PR32_9PEZI/6-168      AC A0A2S4PR32.1
#=GS A0A194XDK6_9HELO/6-169      AC A0A194XDK6.1
#=GS M4F8I1_BRARP/10-184         AC M4F8I1.1
#=GS A0A1R3S115_ASPC5/6-167      AC A0A1R3S115.1
#=GS A0A196SFW3_BLAHN/12-134     AC A0A196SFW3.1
#=GS A0A6A3P1D7_9STRA/11-144     AC A0A6A3P1D7.1
#=GS A0A0C4EDN4_MAGP6/4-165      AC A0A0C4EDN4.1
#=GS A0A179I169_CORDF/6-168      AC A0A179I169.1
#=GS A0CX15_PARTE/45-217         AC A0CX15.1
#=GS S8AQB4_DACHA/4-167          AC S8AQB4.1
#=GS A0A6P6I4B3_PUMCO/34-152     AC A0A6P6I4B3.1
#=GS A0A2A9NQ67_9AGAR/3-164      AC A0A2A9NQ67.1
#=GS A0A4V3WL43_CAMSI/54-120     AC A0A4V3WL43.1
#=GS A0A3Q4HYN3_NEOBR/46-157     AC A0A3Q4HYN3.1
#=GS C6KSN0_PLAF7/364-475        AC C6KSN0.1
#=GS A0A0V0VCX0_9BILA/13-129     AC A0A0V0VCX0.1
#=GS A0A364KZC9_9EURO/5-177      AC A0A364KZC9.1
#=GS A0A0B1P1H2_UNCNE/6-168      AC A0A0B1P1H2.1
#=GS F2SFC6_TRIRC/6-181          AC F2SFC6.2
#=GS A0A1D1UU70_RAMVA/87-181     AC A0A1D1UU70.1
#=GS A0A250XKD3_9CHLO/2-177      AC A0A250XKD3.1
#=GS A0A453FD24_AEGTS/7-183      AC A0A453FD24.1
#=GS A0A4Z2DV80_SCHJA/35-137     AC A0A4Z2DV80.1
#=GS A0A091NV62_HALAL/9-126      AC A0A091NV62.1
#=GS A0A2P4ZNU3_9HYPO/5-169      AC A0A2P4ZNU3.1
#=GS A0A4Z2E7W8_9TELE/6-168      AC A0A4Z2E7W8.1
#=GS A0A4U0VIX7_9PEZI/6-168      AC A0A4U0VIX7.1
#=GS Q8LHF3_ORYSJ/7-183          AC Q8LHF3.1
#=GS A0A316ZGV9_9BASI/2-171      AC A0A316ZGV9.1
#=GS A0A5N6JNS0_9HELO/6-169      AC A0A5N6JNS0.1
#=GS A0A1A5ZTK7_9TREE/3-157      AC A0A1A5ZTK7.1
#=GS A0A090MAA5_OSTTA/4-183      AC A0A090MAA5.1
#=GS U6N3T3_9EIME/126-315        AC U6N3T3.1
#=GS T0LYY1_COLGC/6-168          AC T0LYY1.1
#=GS M2V867_COCH5/9-167          AC M2V867.1
#=GS A0A316U9Y7_9BASI/33-196     AC A0A316U9Y7.1
#=GS A0A2K6F3Y5_PROCO/49-166     AC A0A2K6F3Y5.1
#=GS A0A1D2VFE5_9ASCO/6-168      AC A0A1D2VFE5.1
#=GS A0A5B6VKQ7_9ROSI/21-191     AC A0A5B6VKQ7.1
#=GS A0A317WPQ8_9EURO/6-172      AC A0A317WPQ8.1
#=GS A0A087SQV4_AUXPR/1-158      AC A0A087SQV4.1
#=GS A0A4S4LW22_9APHY/75-144     AC A0A4S4LW22.1
#=GS A0A0C2JYM1_THEKT/26-177     AC A0A0C2JYM1.1
#=GS A0A284RJ95_ARMOS/3-92       AC A0A284RJ95.1
#=GS G7NTV7_MACFA/35-166         AC G7NTV7.2
#=GS B2W6C3_PYRTR/9-167          AC B2W6C3.1
#=GS A0A132A455_SARSC/7-152      AC A0A132A455.1
#=GS A0A4U0XLX6_9PEZI/6-168      AC A0A4U0XLX6.1
#=GS A0A5B6UW13_9ROSI/23-193     AC A0A5B6UW13.1
#=GS U6K6R4_9EIME/155-333        AC U6K6R4.1
#=GS A0A0M8P1Z4_9EURO/6-174      AC A0A0M8P1Z4.1
#=GS A0A1U7REM5_ALLSI/39-164     AC A0A1U7REM5.1
#=GS A0A2T4AIB2_TRIHA/5-169      AC A0A2T4AIB2.1
#=GS A0A1Y2WV30_9PEZI/6-168      AC A0A1Y2WV30.1
#=GS A0A024TG47_9STRA/15-160     AC A0A024TG47.1
#=GS G0R8A2_HYPJQ/5-169          AC G0R8A2.1
#=GS A0A176VG64_MARPO/4-156      AC A0A176VG64.1
#=GS A0A6I9Y6L3_9SAUR/56-164     AC A0A6I9Y6L3.1
#=GS V5FMA6_BYSSN/5-174          AC V5FMA6.1
#=GS A0A2Y9G892_NEOSC/32-149     AC A0A2Y9G892.1
#=GS I7MKS8_TETTS/25-205         AC I7MKS8.1
#=GS A0A2K5IES4_COLAP/36-166     AC A0A2K5IES4.1
#=GS A0A084QRM7_STAC4/6-169      AC A0A084QRM7.1
#=GS A0A0C2CUB4_9BILA/33-98      AC A0A0C2CUB4.1
#=GS A0A0J8QV11_COCIT/6-176      AC A0A0J8QV11.1
#=GS A0A4Q4ZP20_9PEZI/6-170      AC A0A4Q4ZP20.1
#=GS A0A0L0SQJ7_ALLM3/25-178     AC A0A0L0SQJ7.1
#=GS A0A369K5J2_HYPMA/15-177     AC A0A369K5J2.1
#=GS M5BSS6_THACB/4-157          AC M5BSS6.1
#=GS A0A5C3F396_9BASI/31-193     AC A0A5C3F396.1
#=GS A0A0P1AAW7_PLAHL/6-146      AC A0A0P1AAW7.1
#=GS A0A0M9A7E2_9HYME/46-138     AC A0A0M9A7E2.1
#=GS A0A162PBI4_9PEZI/6-169      AC A0A162PBI4.1
#=GS T1J5X2_STRMM/31-148         AC T1J5X2.1
#=GS A0A1B6Q5C6_SORBI/7-184      AC A0A1B6Q5C6.1
#=GS A0A439D9C7_9PEZI/6-152      AC A0A439D9C7.1
#=GS U6MJN0_EIMMA/61-236         AC U6MJN0.1
#=GS A0A2U3YF26_LEPWE/31-149     AC A0A2U3YF26.1
#=GS A0A0N4V055_ENTVE/33-126     AC A0A0N4V055.1
#=GS A0A2L2TFP7_9HYPO/6-168      AC A0A2L2TFP7.1
#=GS A0A4Y9XUU6_9APHY/3-158      AC A0A4Y9XUU6.1
#=GS A0A151WIF7_9HYME/5-140      AC A0A151WIF7.1
#=GS A0A662WQ04_9STRA/12-147     AC A0A662WQ04.1
#=GS A0A2T6ZHV0_TUBBO/10-167     AC A0A2T6ZHV0.1
#=GS A0A3F3PYT3_9EURO/6-175      AC A0A3F3PYT3.1
#=GS A0A485PKJ2_LYNPA/27-151     AC A0A485PKJ2.1
#=GS E4XAI9_OIKDI/8-128          AC E4XAI9.1
#=GS A0A2K2BK57_POPTR/3-176      AC A0A2K2BK57.1
#=GS A0A067QSG9_ZOONE/8-79       AC A0A067QSG9.1
#=GS A0A5B0Q023_PUCGR/6-129      AC A0A5B0Q023.1
#=GS A0A0R3QKH5_9BILA/19-118     AC A0A0R3QKH5.1
#=GS A0A4U5QUV4_POPAL/10-183     AC A0A4U5QUV4.1
#=GS D8Q5E3_SCHCM/2-153          AC D8Q5E3.1
#=GS L5KJD4_PTEAL/38-165         AC L5KJD4.1
#=GS A0A4Q4X6I8_9PEZI/6-170      AC A0A4Q4X6I8.1
#=GS V7BQG7_PHAVU/10-189         AC V7BQG7.1
#=GS G0PLI3_CAEBE/123-261        AC G0PLI3.1
#=GS A0A0R3W6A9_TAEAS/34-134     AC A0A0R3W6A9.1
#=GS A0A5N5K6T9_9ROSI/10-183     AC A0A5N5K6T9.1
#=GS A0A1D6G249_MAIZE/7-184      AC A0A1D6G249.1
#=GS A0A0B1PG92_9BILA/7-120      AC A0A0B1PG92.1
#=GS A0A6P4ARH1_ZIZJJ/13-199     AC A0A6P4ARH1.1
#=GS A0A183PID0_9TREM/32-130     AC A0A183PID0.1
#=GS A0A251UG72_HELAN/10-186     AC A0A251UG72.1
#=GS A0A498JBJ6_MALDO/12-187     AC A0A498JBJ6.1
#=GS A0A0D1D1D2_USTMA/2-158      AC A0A0D1D1D2.1
#=GS A0A452SX07_URSAM/50-166     AC A0A452SX07.1
#=GS M7T2Y5_EUTLA/6-169          AC M7T2Y5.1
#=GS A0A4V2EPA1_METCM/58-220     AC A0A4V2EPA1.1
#=GS B4QSF1_DROSI/21-137         AC B4QSF1.1
#=GS A0A6P7IV38_9TELE/46-157     AC A0A6P7IV38.1
#=GS D5GN69_TUBMM/10-167         AC D5GN69.1
#=GS A0A1B9GHV7_9TREE/4-158      AC A0A1B9GHV7.1
#=GS A0A5J4NUC5_9TREM/46-137     AC A0A5J4NUC5.1
#=GS A0A5N7AY62_9EURO/6-176      AC A0A5N7AY62.1
#=GS A0A250XRS3_9CHLO/2-180      AC A0A250XRS3.1
#=GS A0A6J1PP89_9HYME/46-140     AC A0A6J1PP89.1
#=GS A0A5C6MXS6_9TELE/47-166     AC A0A5C6MXS6.1
#=GS A0A2Y9JXQ3_ENHLU/47-166     AC A0A2Y9JXQ3.1
#=GS B0D9V7_LACBS/1-152          AC B0D9V7.1
#=GS A0A6J0T0X3_9SAUR/50-164     AC A0A6J0T0X3.1
#=GS A0A671RGY4_9TELE/10-143     AC A0A671RGY4.1
#=GS A0A068S610_9FUNG/5-157      AC A0A068S610.1
#=GS A0A4P9Y6J5_9FUNG/15-169     AC A0A4P9Y6J5.1
#=GS A0A1L8G6M9_XENLA/32-166     AC A0A1L8G6M9.1
#=GS A0A6P8AUK1_MAGGR/5-167      AC A0A6P8AUK1.1
#=GS A0A4Z1HX32_9HELO/8-171      AC A0A4Z1HX32.1
#=GS A0A507CKG7_9FUNG/8-181      AC A0A507CKG7.1
#=GS A0A0A1P6P1_RHIZD/2-152      AC A0A0A1P6P1.1
#=GS R0J1T3_SETT2/9-167          AC R0J1T3.1
#=GS A0A093NPK2_PYGAD/1-93       AC A0A093NPK2.1
#=GS A0A163A2A0_DIDRA/9-168      AC A0A163A2A0.1
#=GS A0A6D2JKW9_9BRAS/11-159     AC A0A6D2JKW9.1
#=GS A0A5N6UY48_9EURO/6-176      AC A0A5N6UY48.1
#=GS A0A2K6T1L6_SAIBB/47-166     AC A0A2K6T1L6.1
#=GS A0A0P7TPH1_SCLFO/9-159      AC A0A0P7TPH1.1
#=GS A0A178EU44_TRIRU/6-181      AC A0A178EU44.1
#=GS A0A178E2V2_9PLEO/9-166      AC A0A178E2V2.1
#=GS A0A0N7KDI5_ORYSJ/43-219     AC A0A0N7KDI5.1
#=GS A0A444F6W0_ENSVE/4-178      AC A0A444F6W0.1
#=GS A0A238BU63_9BILA/25-119     AC A0A238BU63.1
#=GS A0A2T7PFV6_POMCA/20-138     AC A0A2T7PFV6.1
#=GS A0A485LBZ4_9STRA/21-147     AC A0A485LBZ4.1
#=GS A0A5E4AQI8_MARMO/50-166     AC A0A5E4AQI8.1
#=GS V5GKS5_KALBG/1-61           AC V5GKS5.1
#=GS A0A1D3SPN7_PLAMA/266-385    AC A0A1D3SPN7.1
#=GS E4Y1P4_OIKDI/28-121         AC E4Y1P4.1
#=GS A0A2I2GBD4_9EURO/6-176      AC A0A2I2GBD4.1
#=GS A0A1B8EU38_9PEZI/6-169      AC A0A1B8EU38.1
#=GS A0A2Z6QPR0_9GLOM/37-188     AC A0A2Z6QPR0.1
#=GS A0A3Q0INJ8_DIACI/7-140      AC A0A3Q0INJ8.1
#=GS A0A093GFG2_DRYPU/10-123     AC A0A093GFG2.1
#=GS A0A5C3DSU3_9BASI/2-158      AC A0A5C3DSU3.1
#=GS A0A0D2GW87_9EURO/5-185      AC A0A0D2GW87.1
#=GS A0A177AV72_9BILA/16-156     AC A0A177AV72.1
#=GS A0A446NM83_TRITD/7-183      AC A0A446NM83.1
#=GS A0A093Z087_9PEZI/6-169      AC A0A093Z087.1
#=GS A0A4S2MZC0_9PEZI/4-159      AC A0A4S2MZC0.1
#=GS J5JJC9_BEAB2/6-168          AC J5JJC9.1
#=GS A0A507BE25_9PEZI/2-165      AC A0A507BE25.1
#=GS A0A3Q1IS20_ANATE/35-145     AC A0A3Q1IS20.1
#=GS T5A914_OPHSC/6-168          AC T5A914.1
#=GS A0A7N4P179_SARHA/53-165     AC A0A7N4P179.1
#=GS A0A0C9TXE7_PAXIN/3-128      AC A0A0C9TXE7.1
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