#=GF ID Sec39
#=GF AC PF08314.15
#=GF DE Secretory pathway protein Sec39
#=GF AU Mistry J;0000-0003-2479-5322
#=GF AU Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU Schmitt HD;0000-0001-6152-2716
#=GF SE manual
#=GF GA 22.00 22.00;
#=GF TC 22.00 22.00;
#=GF NC 21.90 21.80;
#=GF BM hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM hmmsearch --cpu 4 -E 1000 -Z 75585367 HMM pfamseq
#=GF TP Family
#=GF CL CL0020
#=GF RN [1]
#=GF RM 15242642
#=GF RT Exploration of essential gene functions via titratable promoter
#=GF RT alleles.
#=GF RA Mnaimneh S, Davierwala AP, Haynes J, Moffat J, Peng WT, Zhang W,
#=GF RA Yang X, Pootoolal J, Chua G, Lopez A, Trochesset M, Morse D,
#=GF RA Krogan NJ, Hiley SL, Li Z, Morris Q, Grigull J, Mitsakakis N,
#=GF RA Roberts CJ, Greenblatt JF, Boone C, Kaiser CA, Andrews BJ,
#=GF RA Hughes T
#=GF RL Cell. 2004;118:31-44.
#=GF RN [2]
#=GF RM 15958492
#=GF RT Dsl1p, Tip20p, and the Novel Dsl3(Sec39) Protein Are Required
#=GF RT for the Stability of the Q/t-SNARE Complex at the Endoplasmic
#=GF RT Reticulum in Yeast.
#=GF RA Kraynack BA, Chan A, Rosenthal E, Essid M, Umansky B, Waters MG,
#=GF RA Schmitt HD;
#=GF RL Mol Biol Cell 2005;16:3963-3977.
#=GF RN [3]
#=GF RM 16429126
#=GF RT Proteome survey reveals modularity of the yeast cell machinery.
#=GF RA Gavin AC, Aloy P, Grandi P, Krause R, Boesche M, Marzioch M, Rau
#=GF RA C, Jensen LJ, Bastuck S, Dumpelfeld B, Edelmann A, Heurtier MA,
#=GF RA Hoffman V, Hoefert C, Klein K, Hudak M, Michon AM, Schelder M,
#=GF RA Schirle M, Remor M, Rudi T, Hooper S, Bauer A, Bouwmeester T, C
#=GF RL Nature. 2006;440:631-636.
#=GF RN [4]
#=GF RM 14562095
#=GF RT Global analysis of protein localization in budding yeast.
#=GF RA Huh WK, Falvo JV, Gerke LC, Carroll AS, Howson RW, Weissman JS,
#=GF RA O'Shea EK;
#=GF RL Nature 2003;425:686-691.
#=GF DR INTERPRO; IPR013244;
#=GF DR SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC Mnaimneh et al [1] identified Sec39p as a protein involved in
#=GF CC ER-Golgi transport in a large scale promoter shut down analysis
#=GF CC of essential yeast genes. Kraynack et al. (2005) [2] showed
#=GF CC that Sec39p (Dsl3p) is required for Golgi-ER retrograde
#=GF CC transport and is part of a very stable protein complex that also
#=GF CC includes Dsl1p (in mammals ZW10), Tip20p (Rint-1) and the ER
#=GF CC localized Q-SNARE proteins Ufe1p (syntaxin-18), Sec20p and
#=GF CC Use1p. This was confirmed in a genome-wide analysis of protein
#=GF CC complexes by Gavin et al (2006) [3].
#=GF SQ 3063
#=GS A0A814HJF8_9BILA/151-369 AC A0A814HJF8.1
#=GS A0A2T6ZW65_TUBBO/18-702 AC A0A2T6ZW65.1
#=GS A0A5A7PLC1_STRAF/917-1232 AC A0A5A7PLC1.1
#=GS A0A4C2E7D0_9SACH/28-260 AC A0A4C2E7D0.1
#=GS A0A7L1VYM7_9PASS/720-1364 AC A0A7L1VYM7.1
#=GS A0A7J8XRH4_GOSAI/3-233 AC A0A7J8XRH4.1
#=GS A0A7L0D618_9CHAR/597-929 AC A0A7L0D618.1
#=GS A0A074XA41_AURPU/15-825 AC A0A074XA41.1
#=GS A0A2V1CGH0_9HELO/12-819 AC A0A2V1CGH0.1
#=GS A0A8C4GVV6_DICLA/693-989 AC A0A8C4GVV6.2
#=GS A0A0C3Q711_9AGAM/19-732 AC A0A0C3Q711.1
#=GS A0A8I3VX99_CALJA/726-1030 AC A0A8I3VX99.1
#=GS A0A2K6RHW1_RHIRO/861-1255 AC A0A2K6RHW1.1
#=GS A0A1V6XHS4_PENNA/12-802 AC A0A1V6XHS4.1
#=GS A0A2V1DDU2_9PLEO/16-812 AC A0A2V1DDU2.1
#=GS A0A3Q2LCW2_HORSE/726-1376 AC A0A3Q2LCW2.1
#=GS A0A804HTN9_MUSAM/596-1273 AC A0A804HTN9.1
#=GS A0A8C5WJY4_9ANUR/932-1293 AC A0A8C5WJY4.1
#=GS A0A251QQJ8_PRUPE/621-947 AC A0A251QQJ8.1
#=GS A0A8B9ZSS3_9AVES/735-1379 AC A0A8B9ZSS3.1
#=GS A0A804QUQ1_MAIZE/592-1264 AC A0A804QUQ1.1
#=GS A0A319CAD8_9EURO/13-800 AC A0A319CAD8.1
#=GS A0A8B8N757_9MYRT/305-567 AC A0A8B8N757.1
#=GS A0A5Q4C739_9PEZI/11-766 AC A0A5Q4C739.1
#=GS A0A3Q3EWV6_9LABR/986-1345 AC A0A3Q3EWV6.1
#=GS A0A674I8F3_TERCA/986-1344 AC A0A674I8F3.1
#=GS A0A6P5CL65_BOSIN/725-1371 AC A0A6P5CL65.1
#=GS A0A8C8Z507_PROSS/704-1353 AC A0A8C8Z507.1
#=GS A0A090CJT3_PODAN/11-779 AC A0A090CJT3.1
#=GS A0A1X2GSP1_9FUNG/163-852 AC A0A1X2GSP1.1
#=GS A2RAN3_ASPNC/104-736 AC A2RAN3.1
#=GS A0A8C4LKL9_EQUAS/897-1204 AC A0A8C4LKL9.1
#=GS U5HGV4_USTV1/238-977 AC U5HGV4.1
#=GS A0A7J6J7M6_COLFN/11-398 AC A0A7J6J7M6.1
#=GS A0A074S5Y6_9AGAM/211-921 AC A0A074S5Y6.1
#=GS A0A452IME2_9SAUR/679-994 AC A0A452IME2.1
#=GS E3RTT2_PYRTT/16-815 AC E3RTT2.1
#=GS A0A2V1ANI3_9ASCO/258-772 AC A0A2V1ANI3.1
#=GS A0A0D3DD44_BRAOL/566-878 AC A0A0D3DD44.1
#=GS A0A316UXM5_9BASI/393-871 AC A0A316UXM5.1
#=GS A0A0D2T7J0_GOSRA/919-1231 AC A0A0D2T7J0.1
#=GS A0A059CD61_EUCGR/2-216 AC A0A059CD61.1
#=GS A0A8U0V7K4_MUSPF/1012-1372 AC A0A8U0V7K4.1
#=GS A0A8I3WKB6_CALJA/1014-1372 AC A0A8I3WKB6.1
#=GS A0A673JYD9_9TELE/665-972 AC A0A673JYD9.1
#=GS A0A3Q1MP03_BOVIN/8-367 AC A0A3Q1MP03.1
#=GS A0A8C0LS60_CANLU/692-1334 AC A0A8C0LS60.1
#=GS A0A8V0XBZ7_CHICK/1019-1373 AC A0A8V0XBZ7.1
#=GS A0A074VU62_9PEZI/15-819 AC A0A074VU62.1
#=GS A0A6Q2Z520_ESOLU/659-1017 AC A0A6Q2Z520.1
#=GS A0A1Y1Z7C0_9PLEO/13-812 AC A0A1Y1Z7C0.1
#=GS A0A3P9P615_POERE/722-1013 AC A0A3P9P615.1
#=GS G0RR66_HYPJQ/11-795 AC G0RR66.1
#=GS H3DFW0_TETNG/1011-1374 AC H3DFW0.1
#=GS A0A671NLM7_9TELE/1001-1341 AC A0A671NLM7.1
#=GS A0A445L458_GLYSO/578-898 AC A0A445L458.1
#=GS A5E710_LODEL/34-796 AC A5E710.1
#=GS A0A3M2SWK3_9EURO/13-795 AC A0A3M2SWK3.1
#=GS A0A448YG95_BRENA/29-748 AC A0A448YG95.1
#=GS A0A4Q4YFR9_9PEZI/11-776 AC A0A4Q4YFR9.1
#=GS A0A8C2ZVB9_CYCLU/962-1313 AC A0A8C2ZVB9.1
#=GS A0A7L3SJR1_RISTR/883-1236 AC A0A7L3SJR1.1
#=GS A0A7K5SVA8_9FRIN/685-1329 AC A0A7K5SVA8.1
#=GS H6BRC7_EXODN/13-756 AC H6BRC7.1
#=GS A0A8J4UBJ5_CLAMG/731-1130 AC A0A8J4UBJ5.1
#=GS A0A2R6RSI0_ACTCC/731-1064 AC A0A2R6RSI0.1
#=GS A0A8C6MLY0_NOTFU/670-902 AC A0A8C6MLY0.1
#=GS G3R1H8_GORGO/1010-1375 AC G3R1H8.1
#=GS A0A372QXG9_9GLOM/816-1531 AC A0A372QXG9.1
#=GS A0A671WDC9_SPAAU/1010-1371 AC A0A671WDC9.1
#=GS A0A1E4TJS3_9ASCO/14-294 AC A0A1E4TJS3.1
#=GS A0A2Y9KIP5_ENHLU/726-1372 AC A0A2Y9KIP5.1
#=GS A0A6A5EKJ0_PERFL/721-1006 AC A0A6A5EKJ0.1
#=GS A0A1G4M6E0_LACFM/299-655 AC A0A1G4M6E0.1
#=GS A0A1S7HZ54_9SACH/265-659 AC A0A1S7HZ54.1
#=GS A0A8C2ZVB4_CYCLU/997-1343 AC A0A8C2ZVB4.1
#=GS A0A498KJ73_MALDO/581-894 AC A0A498KJ73.1
#=GS A0A7J7VVC9_PIPKU/1012-1375 AC A0A7J7VVC9.1
#=GS F7G1Z9_ORNAN/695-1338 AC F7G1Z9.2
#=GS A0A8V5FN51_MELUD/1021-1361 AC A0A8V5FN51.1
#=GS A0A8C3B8T0_CAIMO/953-1308 AC A0A8C3B8T0.1
#=GS A0A094FL80_9PEZI/14-824 AC A0A094FL80.1
#=GS A0A672QJE5_SINGR/265-552 AC A0A672QJE5.1
#=GS A0A8C2ZUW6_CYCLU/693-1078 AC A0A8C2ZUW6.1
#=GS A0A835JEG9_9ROSI/646-943 AC A0A835JEG9.1
#=GS A0A8C5NA09_9TELE/990-1206 AC A0A8C5NA09.1
#=GS A0A1E4RIX6_9ASCO/115-798 AC A0A1E4RIX6.1
#=GS A0A7L0G8E4_HERCA/732-1376 AC A0A7L0G8E4.1
#=GS A0A8I3WKB6_CALJA/726-1030 AC A0A8I3WKB6.1
#=GS A0A2I3MX93_PAPAN/996-1353 AC A0A2I3MX93.2
#=GS A0A674NFX6_TAKRU/711-1040 AC A0A674NFX6.1
#=GS K2S3R5_MACPH/13-829 AC K2S3R5.1
#=GS A0A665VUY1_ECHNA/984-1346 AC A0A665VUY1.1
#=GS A0A7K9PMG6_9CORV/905-1245 AC A0A7K9PMG6.1
#=GS A0A498LDL9_LABRO/663-1015 AC A0A498LDL9.1
#=GS A0A093ZV97_9PEZI/12-705 AC A0A093ZV97.1
#=GS A0A194SFE0_RHOGW/487-992 AC A0A194SFE0.1
#=GS A0A7K7MNW5_9PASS/732-1376 AC A0A7K7MNW5.1
#=GS F1M0U5_RAT/725-1060 AC F1M0U5.3
#=GS A0A3Q0FEY6_VIGRR/231-563 AC A0A3Q0FEY6.1
#=GS A0A7J7CB21_TRIWF/894-1232 AC A0A7J7CB21.1
#=GS A0A5A9NI33_9TELE/647-955 AC A0A5A9NI33.1
#=GS A0A8H6TN72_9AGAR/161-868 AC A0A8H6TN72.1
#=GS A0A4W4GYJ8_ELEEL/907-1261 AC A0A4W4GYJ8.1
#=GS A0A2G3AR70_CAPCH/552-864 AC A0A2G3AR70.1
#=GS A0A7L3QYF7_9SYLV/1032-1376 AC A0A7L3QYF7.1
#=GS G7J7I6_MEDTR/577-904 AC G7J7I6.2
#=GS A0A674I5U7_TERCA/721-1366 AC A0A674I5U7.1
#=GS A0A443I1Z9_BYSSP/13-799 AC A0A443I1Z9.1
#=GS A0A2K6EC12_MACNE/983-1342 AC A0A2K6EC12.1
#=GS A0A8R2QRG4_BOMMO/651-888 AC A0A8R2QRG4.1
#=GS A0A7L0KYD0_9SYLV/1036-1379 AC A0A7L0KYD0.1
#=GS A0A1Q5T0R5_9EURO/13-802 AC A0A1Q5T0R5.1
#=GS A0A2K6EC19_MACNE/726-1057 AC A0A2K6EC19.1
#=GS A0A8J6FVS6_ELECQ/973-1199 AC A0A8J6FVS6.1
#=GS A0A8B9ULW8_9AVES/735-1379 AC A0A8B9ULW8.1
#=GS A0A2K6RHX7_RHIRO/988-1339 AC A0A2K6RHX7.1
#=GS A0A2I0RHX2_9PEZI/312-1126 AC A0A2I0RHX2.1
#=GS A0A670I368_PODMU/933-1287 AC A0A670I368.1
#=GS A0A2T4BTE8_TRILO/11-756 AC A0A2T4BTE8.1
#=GS A0A8H3FRM6_9LECA/9-759 AC A0A8H3FRM6.1
#=GS A0A7L2ANP2_9GRUI/1029-1368 AC A0A7L2ANP2.1
#=GS A0A0L0N371_TOLOC/11-793 AC A0A0L0N371.1
#=GS A0A8M2B7L1_DANRE/716-1009 AC A0A8M2B7L1.1
#=GS A0A2Y9K6A5_ENHLU/726-1372 AC A0A2Y9K6A5.1
#=GS A0A8B7JIG5_9AVES/861-1206 AC A0A8B7JIG5.1
#=GS A0A8C3TNQ5_CATUS/716-1056 AC A0A8C3TNQ5.1
#=GS A0A8H6QQ78_9EURO/13-801 AC A0A8H6QQ78.1
#=GS A0A7L0EKZ8_TROML/362-1005 AC A0A7L0EKZ8.1
#=GS A0A670ZB86_PSETE/733-1370 AC A0A670ZB86.1
#=GS A0A200RD50_9MAGN/610-924 AC A0A200RD50.1
#=GS A0A8C6MH96_NOTFU/1084-1299 AC A0A8C6MH96.1
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#=GS A0A674I681_TERCA/705-999 AC A0A674I681.1
#=GS A0A2C9WHG3_MANES/600-907 AC A0A2C9WHG3.1
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#=GS A0A671WBJ8_SPAAU/691-1002 AC A0A671WBJ8.1
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#=GS A0A8C6NZ23_NOTFU/661-893 AC A0A8C6NZ23.1
#=GS A0A1E3PB04_WICAA/7-216 AC A0A1E3PB04.1
#=GS A0A673GLC1_9TELE/494-764 AC A0A673GLC1.1
#=GS A0A1D5RIU4_MACMU/1005-1364 AC A0A1D5RIU4.2
#=GS A0A6P4BRL9_ARADU/850-1182 AC A0A6P4BRL9.1
#=GS A0A8D0D6X4_SANLU/624-917 AC A0A8D0D6X4.1
#=GS A0A7K6AF67_UPUEP/709-1026 AC A0A7K6AF67.1
#=GS A0A8C9ZBS6_SANLU/639-932 AC A0A8C9ZBS6.1
#=GS A0A8C3G3Q5_CYCLU/663-972 AC A0A8C3G3Q5.1
#=GS A0A2K5Y8Z1_MANLE/976-1338 AC A0A2K5Y8Z1.1
#=GS A0A669R3Z9_PHACC/726-1060 AC A0A669R3Z9.1
#=GS A0A8B8LAL6_ABRPR/575-894 AC A0A8B8LAL6.1
#=GS A0A3Q2H360_HORSE/726-1372 AC A0A3Q2H360.1
#=GS A0A167D8Q2_9ASCO/4-703 AC A0A167D8Q2.1
#=GS A0A7L3VY14_MOLAT/731-1062 AC A0A7L3VY14.1
#=GS A0A5M6BW33_9TREE/234-839 AC A0A5M6BW33.1
#=GS X0CJW1_FUSOX/13-797 AC X0CJW1.1
#=GS A0A8D0HP89_SPHPU/1013-1206 AC A0A8D0HP89.1
#=GS A0A2T4B2L9_9HYPO/11-790 AC A0A2T4B2L9.1
#=GS A0A7N4P480_SARHA/682-1245 AC A0A7N4P480.1
#=GS A0A803XUK0_MELGA/644-976 AC A0A803XUK0.1
#=GS A0A8J1KQ99_XENLA/720-1368 AC A0A8J1KQ99.1
#=GS A3LYZ2_PICST/42-694 AC A3LYZ2.2
#=GS A0A7K9YLW4_9GALL/1-323 AC A0A7K9YLW4.1
#=GS A0A0C3EDA3_9AGAM/174-881 AC A0A0C3EDA3.1
#=GS A0A8H5AW82_9AGAR/183-896 AC A0A8H5AW82.1
#=GS A0A7N0ZST8_KALFE/870-1153 AC A0A7N0ZST8.1
#=GS F0U962_AJEC8/13-802 AC F0U962.1
#=GS K7G088_PELSI/823-1210 AC K7G088.1
#=GS A0A7K6JIW0_9CORV/732-1063 AC A0A7K6JIW0.1
#=GS A0A803T6E0_ANOCA/1014-1239 AC A0A803T6E0.1
#=GS A0A8H7N5J0_BIOOC/11-448 AC A0A8H7N5J0.1
#=GS A0A392M2X7_9FABA/6-338 AC A0A392M2X7.1
#=GS A0A4W4GSC5_ELEEL/608-941 AC A0A4W4GSC5.1
#=GS A0A2R8ND94_CALJA/1016-1372 AC A0A2R8ND94.2
#=GS A0A0A2JF27_PENEN/12-802 AC A0A0A2JF27.1
#=GS A0A7K9B2M0_DRONO/597-890 AC A0A7K9B2M0.1
#=GS A0A5B8ML85_9CHLO/564-805 AC A0A5B8ML85.1
#=GS A0A286URX8_9AGAM/510-1222 AC A0A286URX8.1
#=GS A0A6I9SZQ2_SESIN/589-914 AC A0A6I9SZQ2.1
#=GS A0A452ILY0_9SAUR/960-1318 AC A0A452ILY0.1
#=GS A0A453PQZ4_AEGTS/321-1001 AC A0A453PQZ4.1
#=GS A0A665VV65_ECHNA/957-1342 AC A0A665VV65.1
#=GS A0A7L0WUM2_ALELA/681-976 AC A0A7L0WUM2.1
#=GS A0A8C3BA30_CAIMO/656-951 AC A0A8C3BA30.1
#=GS A0A7L1GYH6_9PICI/896-1241 AC A0A7L1GYH6.1
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