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Database: Pfam
Entry: Sina
LinkDB: Sina
Original site: Sina 
#=GF ID   Sina
#=GF AC   PF03145.19
#=GF DE   Seven in absentia protein family
#=GF AU   Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF SE   Pfam-B_1854 (release 6.5)
#=GF GA   31.50 31.50;
#=GF TC   31.50 31.50;
#=GF NC   31.40 31.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0389
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9403064
#=GF RT   Characterization of human homologs of the Drosophila seven in
#=GF RT   absentia (sina) gene. 
#=GF RA   Hu G, Chung YL, Glover T, Valentine V, Look AT, Fearon ER; 
#=GF RL   Genomics 1997;46:103-111.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9267026
#=GF RT   PHYL acts to down-regulate TTK88, a transcriptional repressor of
#=GF RT   neuronal cell fates, by a SINA-dependent mechanism. 
#=GF RA   Tang AH, Neufeld TP, Kwan E, Rubin GM; 
#=GF RL   Cell 1997;90:459-467.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   11389839
#=GF RT   Siah-1, SIP, and Ebi collaborate in a novel pathway for
#=GF RT   beta-catenin degradation linked to p53 responses. 
#=GF RA   Matsuzawa SI, Reed JC; 
#=GF RL   Mol Cell 2001;7:915-926.
#=GF DR   INTERPRO; IPR018121;
#=GF DR   SCOP; 1k2f; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   The seven in absentia (sina) gene was first identified in
#=GF CC   Drosophila. The Drosophila Sina protein is essential for the
#=GF CC   determination of the R7 pathway in photoreceptor cell
#=GF CC   development: the loss of functional Sina results in the
#=GF CC   transformation of the R7 precursor cell to a non- neuronal cell
#=GF CC   type. The Sina protein contains an N-terminal RING finger domain
#=GF CC   Pfam:PF00097. Through this domain, Sina binds E2
#=GF CC   ubiquitin-conjugating enzymes (UbcD1) Sina also interacts with
#=GF CC   Tramtrack (TTK88) via PHYL. Tramtrack is a transcriptional
#=GF CC   repressor that blocks photoreceptor determination, while PHYL
#=GF CC   down-regulates the activity of TTK88. In turn, the activity of
#=GF CC   PHYL requires the activation of the Sevenless receptor tyrosine
#=GF CC   kinase, a process essential for R7 determination. It is thought
#=GF CC   that thus Sina targets TTK88 for degradation, therefore
#=GF CC   promoting the R7 pathway. Murine and human homologues of Sina
#=GF CC   have also been identified. The human homologue Siah-1 [1] also
#=GF CC   binds E2 enzymes (UbcH5) and through a series of physical
#=GF CC   interactions, targets beta-catenin for ubiquitin degradation.
#=GF CC   Siah-1 expression is enhanced by p53, itself promoted by DNA
#=GF CC   damage. Thus this pathway links DNA damage to beta-catenin
#=GF CC   degradation [2,3]. Sina proteins, therefore, physically interact
#=GF CC   with a variety of proteins. The N-terminal RING finger domain
#=GF CC   that binds ubiquitin conjugating enzymes is described in
#=GF CC   Pfam:PF00097, and does not form part of the alignment for this
#=GF CC   family. The remainder C-terminal part is involved in
#=GF CC   interactions with other proteins, and is included in this
#=GF CC   alignment. In addition to the Drosophila protein and mammalian
#=GF CC   homologues, whose similarity was noted previously, this family
#=GF CC   also includes putative homologues from Caenorhabditis elegans,
#=GF CC   Arabidopsis thaliana.
#=GF SQ   4491
#=GS A0A2G9HJ68_9LAMI/102-301    AC A0A2G9HJ68.1
#=GS A0A2J6M6D9_LACSA/104-303    AC A0A2J6M6D9.1
#=GS A0A446XKD5_TRITD/84-283     AC A0A446XKD5.1
#=GS W9S0Z7_9ROSA/167-297        AC W9S0Z7.1
#=GS A0A6S7PNL0_LACSI/97-296     AC A0A6S7PNL0.1
#=GS N6TJM7_DENPD/312-419        AC N6TJM7.1
#=GS A0A673URA4_SURSU/312-508    AC A0A673URA4.1
#=GS A0A3L6RA66_PANMI/104-187    AC A0A3L6RA66.1
#=GS M1D5F7_SOLTU/1-126          AC M1D5F7.1
#=GS A0A0V1LSI6_9BILA/95-292     AC A0A0V1LSI6.1
#=GS A0A6P8Y029_DROAB/317-512    AC A0A6P8Y029.1
#=GS H2MEL0_ORYLA/86-282         AC H2MEL0.2
#=GS A0A0P0UXQ7_ORYSJ/10-90      AC A0A0P0UXQ7.1
#=GS A0A3B6FJD9_WHEAT/104-207    AC A0A3B6FJD9.1
#=GS A0A5N5HMR4_9ROSA/99-298     AC A0A5N5HMR4.1
#=GS A0A2K6EUC9_PROCO/122-318    AC A0A2K6EUC9.1
#=GS A0A2K5I7G1_COLAP/113-309    AC A0A2K5I7G1.1
#=GS A0A4P1R0H7_LUPAN/30-200     AC A0A4P1R0H7.1
#=GS A0A6J0RRS5_BACDO/101-297    AC A0A6J0RRS5.1
#=GS A0A4S4CWA5_CAMSI/98-158     AC A0A4S4CWA5.1
#=GS A0A103Y6P8_CYNCS/96-295     AC A0A103Y6P8.1
#=GS A0A2G5DCG5_AQUCA/61-122     AC A0A2G5DCG5.1
#=GS A0A498IGI7_MALDO/81-280     AC A0A498IGI7.1
#=GS A0A6P6W529_COFAR/111-310    AC A0A6P6W529.1
#=GS A0A6A2ZTE2_HIBSY/4-116      AC A0A6A2ZTE2.1
#=GS A0A3B6E9D1_WHEAT/99-218     AC A0A3B6E9D1.1
#=GS A0A453QKU5_AEGTS/58-192     AC A0A453QKU5.1
#=GS A0A5N6P7R3_9ASTR/89-288     AC A0A5N6P7R3.1
#=GS A0A0Q3IQD9_BRADI/80-169     AC A0A0Q3IQD9.1
#=GS A0A3P7L8B4_DIBLA/1-112      AC A0A3P7L8B4.1
#=GS A0A446Q8X1_TRITD/110-268    AC A0A446Q8X1.1
#=GS A0A2P8XKI3_BLAGE/59-247     AC A0A2P8XKI3.1
#=GS A0A0A0KWV9_CUCSA/120-319    AC A0A0A0KWV9.1
#=GS I1K2W5_SOYBN/135-302        AC I1K2W5.1
#=GS V4S8S0_CITCL/97-262         AC V4S8S0.1
#=GS A0A1A6GZK6_NEOLE/149-344    AC A0A1A6GZK6.1
#=GS A0A3Q0D5T2_MESAU/98-294     AC A0A3Q0D5T2.1
#=GS A0A2P8YDE4_BLAGE/104-240    AC A0A2P8YDE4.1
#=GS A0A2P8XTK8_BLAGE/213-361    AC A0A2P8XTK8.1
#=GS A0A2A4K3N6_HELVI/69-262     AC A0A2A4K3N6.1
#=GS A5CAJ5_VITVI/99-298         AC A5CAJ5.1
#=GS A0A6J1Y7B6_ACIJB/82-278     AC A0A6J1Y7B6.1
#=GS I1NCM1_SOYBN/94-216         AC I1NCM1.1
#=GS A0A1U8H864_CAPAN/99-298     AC A0A1U8H864.1
#=GS A0A5E4PTC3_9NEOP/251-437    AC A0A5E4PTC3.1
#=GS A0A4U5PXY9_POPAL/110-300    AC A0A4U5PXY9.1
#=GS A0A2G2XN79_CAPBA/39-144     AC A0A2G2XN79.1
#=GS A0A0N4UKP6_DRAME/132-329    AC A0A0N4UKP6.1
#=GS A0A5N5K3V3_9ROSI/777-976    AC A0A5N5K3V3.1
#=GS A0A6P3HS71_BISBI/95-291     AC A0A6P3HS71.1
#=GS A0A6J0WG98_ODOVR/82-278     AC A0A6J0WG98.1
#=GS C5Z074_SORBI/228-310        AC C5Z074.1
#=GS A0A392RR92_9FABA/1-80       AC A0A392RR92.1
#=GS A0A067D462_CITSI/101-272    AC A0A067D462.1
#=GS A0A6P4AJA8_ZIZJJ/94-293     AC A0A6P4AJA8.1
#=GS A0A3Q3MC28_9TELE/86-282     AC A0A3Q3MC28.1
#=GS I1JS02_SOYBN/91-283         AC I1JS02.1
#=GS A0A093HKA1_STRCA/82-278     AC A0A093HKA1.1
#=GS Q7XAM5_ORYSJ/96-295         AC Q7XAM5.1
#=GS A0A0E0FFL4_ORYNI/342-430    AC A0A0E0FFL4.1
#=GS A0A2Y9NZQ9_DELLE/121-317    AC A0A2Y9NZQ9.1
#=GS D6WMY7_TRICA/53-247         AC D6WMY7.2
#=GS A0A6I9KEW2_CHRAS/82-278     AC A0A6I9KEW2.1
#=GS A0A3P8X5X9_CYNSE/86-282     AC A0A3P8X5X9.1
#=GS A0A1U7W384_NICSY/101-300    AC A0A1U7W384.1
#=GS A0A314ZQD3_PRUYE/113-312    AC A0A314ZQD3.1
#=GS K3ZCE2_SETIT/32-152         AC K3ZCE2.1
#=GS T1HLQ0_RHOPR/92-271         AC T1HLQ0.1
#=GS A0A2P8XDE7_BLAGE/65-253     AC A0A2P8XDE7.1
#=GS A0A1J6J8A0_NICAT/110-309    AC A0A1J6J8A0.1
#=GS A0A6D2KF50_9BRAS/166-266    AC A0A6D2KF50.1
#=GS A0A3Q4HL54_NEOBR/132-328    AC A0A3Q4HL54.1
#=GS K3XQS3_SETIT/90-185         AC K3XQS3.1
#=GS A0A0D3BWE0_BRAOL/102-301    AC A0A0D3BWE0.1
#=GS A0A1W4XCS1_AGRPL/323-512    AC A0A1W4XCS1.1
#=GS A0A446P9A5_TRITD/104-195    AC A0A446P9A5.1
#=GS A0A1S3MNR6_SALSA/86-282     AC A0A1S3MNR6.1
#=GS A0A1S3T8F1_VIGRR/131-293    AC A0A1S3T8F1.1
#=GS F6SK11_CALJA/113-309        AC F6SK11.1
#=GS A0A0V0WZ00_9BILA/95-292     AC A0A0V0WZ00.1
#=GS A0A0D3CZC2_BRAOL/270-358    AC A0A0D3CZC2.1
#=GS A0A452QHP4_URSAM/82-278     AC A0A452QHP4.1
#=GS A0A0K9PS33_ZOSMR/121-210    AC A0A0K9PS33.1
#=GS A0A2G2WYW6_CAPBA/241-414    AC A0A2G2WYW6.1
#=GS A0A2P5XPC0_GOSBA/144-304    AC A0A2P5XPC0.1
#=GS M7ZRI3_TRIUA/111-232        AC M7ZRI3.1
#=GS A0A4D9EC15_9SAUR/55-231     AC A0A4D9EC15.1
#=GS A0A2U1MG25_ARTAN/255-424    AC A0A2U1MG25.1
#=GS A0A0D3EJ23_9ORYZ/97-181     AC A0A0D3EJ23.1
#=GS A0A2P5DVY2_PARAD/422-576    AC A0A2P5DVY2.1
#=GS U3KN60_RABIT/82-253         AC U3KN60.1
#=GS A0A232EPE6_9HYME/78-274     AC A0A232EPE6.1
#=GS A0A1V4J4F4_PATFA/41-229     AC A0A1V4J4F4.1
#=GS A0A194YIF2_SORBI/3-93       AC A0A194YIF2.1
#=GS A0A1V9XUP1_9ACAR/1-192      AC A0A1V9XUP1.1
#=GS A0A5C7GWF8_9ROSI/202-259    AC A0A5C7GWF8.1
#=GS A0A5A7NZG8_STRAF/84-279     AC A0A5A7NZG8.1
#=GS A0A077RUG6_WHEAT/93-225     AC A0A077RUG6.1
#=GS A0A286ZUL1_PIG/113-309      AC A0A286ZUL1.1
#=GS A0A1S4H8V4_ANOGA/31-178     AC A0A1S4H8V4.1
#=GS A0A5N5KMM7_9ROSI/726-925    AC A0A5N5KMM7.1
#=GS A0A540LTK4_MALBA/242-399    AC A0A540LTK4.1
#=GS A0A0E0FFL3_ORYNI/85-171     AC A0A0E0FFL3.1
#=GS D6WEL1_TRICA/330-476        AC D6WEL1.2
#=GS A0A287Q0D0_HORVV/44-200     AC A0A287Q0D0.1
#=GS A0A6I9NRC7_9TELE/2-132      AC A0A6I9NRC7.1
#=GS A0A6P6WLH2_COFAR/119-318    AC A0A6P6WLH2.1
#=GS A0A6A2WG22_HIBSY/144-225    AC A0A6A2WG22.1
#=GS A0A0V1LSN8_9BILA/95-292     AC A0A0V1LSN8.1
#=GS A0A2G9GGC1_9LAMI/102-301    AC A0A2G9GGC1.1
#=GS A0A6I9UFK7_SESIN/210-392    AC A0A6I9UFK7.1
#=GS A0A0E0PHN6_ORYRU/181-286    AC A0A0E0PHN6.1
#=GS A0A2P8Y4Z2_BLAGE/68-222     AC A0A2P8Y4Z2.1
#=GS A0A6P7FN51_DIAVI/57-230     AC A0A6P7FN51.1
#=GS A0A5E4N737_9HEMI/79-213     AC A0A5E4N737.1
#=GS A0A103XKK0_CYNCS/222-390    AC A0A103XKK0.1
#=GS A0A453DSA0_AEGTS/52-172     AC A0A453DSA0.1
#=GS A0A2P8ZCX0_BLAGE/35-199     AC A0A2P8ZCX0.1
#=GS A0A226E3E0_FOLCA/91-292     AC A0A226E3E0.1
#=GS W9RLM0_9ROSA/119-318        AC W9RLM0.1
#=GS A0A5J9UEK3_9POAL/85-201     AC A0A5J9UEK3.1
#=GS A0A182GQ17_AEDAL/51-252     AC A0A182GQ17.1
#=GS M0T9A8_MUSAM/95-294         AC M0T9A8.1
#=GS A0A068UY02_COFCA/28-142     AC A0A068UY02.1
#=GS A0A5C7IUW2_9ROSI/100-299    AC A0A5C7IUW2.1
#=GS A0A5E4BZL1_MARMO/1-109      AC A0A5E4BZL1.1
#=GS A0A287F3E8_HORVV/33-232     AC A0A287F3E8.1
#=GS H0W0F5_CAVPO/82-278         AC H0W0F5.1
#=GS A0A5A7QN51_STRAF/99-298     AC A0A5A7QN51.1
#=GS A0A0E0LPB8_ORYPU/185-384    AC A0A0E0LPB8.1
#=GS M1C6R3_SOLTU/1-137          AC M1C6R3.1
#=GS A0A3B6IW36_WHEAT/135-293    AC A0A3B6IW36.1
#=GS A0A7E5VA21_TRINI/63-209     AC A0A7E5VA21.1
#=GS A0A0D9Y2M1_9ORYZ/108-195    AC A0A0D9Y2M1.1
#=GS A0A5J9U3H2_9POAL/96-240     AC A0A5J9U3H2.1
#=GS A0A6A3BUZ5_HIBSY/87-286     AC A0A6A3BUZ5.1
#=GS A0A310SIX3_9HYME/79-275     AC A0A310SIX3.1
#=GS A0A5E4E7A1_PRUDU/113-312    AC A0A5E4E7A1.1
#=GS A0A5D3E075_CUCME/112-311    AC A0A5D3E075.1
#=GS A0A0D2TSS0_GOSRA/41-240     AC A0A0D2TSS0.1
#=GS V4LA72_EUTSA/82-264         AC V4LA72.1
#=GS A0A0E0JDI8_ORYPU/562-686    AC A0A0E0JDI8.1
#=GS A0A3Q1BE15_AMPOC/109-305    AC A0A3Q1BE15.1
#=GS A0A2K5EE04_AOTNA/107-297    AC A0A2K5EE04.1
#=GS A0A1D2MIB4_ORCCI/50-255     AC A0A1D2MIB4.1
#=GS D7KUA4_ARALL/116-244        AC D7KUA4.1
#=GS A0A4C1YMV1_EUMVA/45-238     AC A0A4C1YMV1.1
#=GS A0A2R6Q7V3_ACTCC/96-295     AC A0A2R6Q7V3.1
#=GS A0A0P7UF77_SCLFO/82-278     AC A0A0P7UF77.1
#=GS F6Q610_HORSE/101-291        AC F6Q610.2
#=GS H0XKC1_OTOGA/82-278         AC H0XKC1.1
#=GS A0A4S4DK84_CAMSI/234-384    AC A0A4S4DK84.1
#=GS A0A2U1Q385_ARTAN/10-196     AC A0A2U1Q385.1
#=GS A0A6A4W7N6_AMPAM/72-254     AC A0A6A4W7N6.1
#=GS A0A0L0SCS7_ALLM3/146-243    AC A0A0L0SCS7.1
#=GS A0A540MTA1_MALBA/82-281     AC A0A540MTA1.1
#=GS A0A453DSB1_AEGTS/57-134     AC A0A453DSB1.1
#=GS A0A0R0EYW7_SOYBN/136-335    AC A0A0R0EYW7.1
#=GS A0A5J9U158_9POAL/42-241     AC A0A5J9U158.1
#=GS A0A251K3R0_MANES/101-300    AC A0A251K3R0.1
#=GS A0A2P8Z6F5_BLAGE/55-245     AC A0A2P8Z6F5.1
#=GS A0A2P8YDD1_BLAGE/61-258     AC A0A2P8YDD1.1
#=GS A0A6P5K797_PHACI/113-309    AC A0A6P5K797.1
#=GS A0A6I9HI08_GEOFO/42-229     AC A0A6I9HI08.1
#=GS A0A6D2HUY1_9BRAS/112-228    AC A0A6D2HUY1.1
#=GS A0A2J7RJE8_9NEOP/898-1091   AC A0A2J7RJE8.1
#=GS K3XTE3_SETIT/33-187         AC K3XTE3.1
#=GS A0A0R3VWD2_TAEAS/178-381    AC A0A0R3VWD2.1
#=GS A0A1S3Y9I3_TOBAC/103-302    AC A0A1S3Y9I3.1
#=GS A0A6G1DHE0_9ORYZ/193-272    AC A0A6G1DHE0.1
#=GS A0A3N6R886_BRACR/101-300    AC A0A3N6R886.1
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#=GS A0A2J7RB84_9NEOP/59-254     AC A0A2J7RB84.1
#=GS A0A444E4W6_ENSVE/135-340    AC A0A444E4W6.1
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#=GS SINL2_ARATH/86-204          AC Q9C6H3.1
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#=GS D7UCT9_VITVI/64-178         AC D7UCT9.1
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#=GS A0A5J9UG10_9POAL/127-202    AC A0A5J9UG10.1
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#=GS SINL8_ARATH/63-256          AC Q9FKD6.2
#=GS A0A2Z7DB21_9LAMI/112-270    AC A0A2Z7DB21.1
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#=GS A0A3Q7Y8W4_CICAR/89-288     AC A0A3Q7Y8W4.1
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#=GS A0A2K3N717_TRIPR/88-188     AC A0A2K3N717.1
#=GS B4LE73_DROVI/110-305        AC B4LE73.1
#=GS A0A0R0I694_SOYBN/397-570    AC A0A0R0I694.1
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