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Database: Pfam
Entry: TFIIA
LinkDB: TFIIA
Original site: TFIIA 
#=GF ID   TFIIA
#=GF AC   PF03153.16
#=GF DE   Transcription factor IIA, alpha/beta subunit
#=GF AU   Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF SE   Pfam-B_3542 (release 6.5)
#=GF GA   36.20 36.20;
#=GF TC   36.20 36.20;
#=GF NC   36.10 36.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11089979
#=GF RT   A transcription reinitiation intermediate that is stabilized by
#=GF RT   activator. 
#=GF RA   Yudkovsky N, Ranish JA, Hahn S; 
#=GF RL   Nature 2000;408:225-229.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8224848
#=GF RT   A single cDNA, hTFIIA/alpha, encodes both the p35 and p19
#=GF RT   subunits of human TFIIA. 
#=GF RA   DeJong J, Roeder RG; 
#=GF RL   Genes Dev 1993;7:2220-2234.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   8610010
#=GF RT   Crystal structure of a yeast TFIIA/TBP/DNA complex. 
#=GF RA   Tan S, Hunziker Y, Sargent DF, Richmond TJ; 
#=GF RL   Nature 1996;381:127-151.
#=GF DR   INTERPRO; IPR004855;
#=GF DR   SCOP; 1nh2; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Transcription initiation factor IIA (TFIIA) is a heterotrimer,
#=GF CC   the three subunits being known as alpha, beta, and gamma, in
#=GF CC   order of molecular weight. The N and C-terminal domains of the
#=GF CC   gamma subunit are represented in Pfam:PF02268 and Pfam:PF02751,
#=GF CC   respectively. This family represents the precursor that yields
#=GF CC   both the alpha and beta subunits. The TFIIA heterotrimer is an
#=GF CC   essential general transcription initiation factor for the
#=GF CC   expression of genes transcribed by RNA polymerase II. Together
#=GF CC   with TFIID, TFIIA binds to the promoter region; this is the
#=GF CC   first step in the formation of a pre-initiation complex (PIC).
#=GF CC   Binding of the rest of the transcription machinery follows this
#=GF CC   step [1]. After initiation, the PIC does not completely
#=GF CC   dissociate from the promoter. Some components, including TFIIA,
#=GF CC   remain attached and re-initiate a subsequent round of
#=GF CC   transcription.
#=GF SQ   3521
#=GS A0A5E4FS92_PRUDU/8-210      AC A0A5E4FS92.1
#=GS A0A0M4F5Q9_DROBS/255-376    AC A0A0M4F5Q9.1
#=GS A0A287F3Z2_HORVV/9-308      AC A0A287F3Z2.1
#=GS C4R067_KOMPG/122-240        AC C4R067.1
#=GS A0A1Y2D870_9PEZI/2-341      AC A0A1Y2D870.1
#=GS B7Q5G2_IXOSC/37-303         AC B7Q5G2.1
#=GS A0A0M8MX36_9BASI/9-120      AC A0A0M8MX36.1
#=GS A0A6J0ZSY8_9ROSI/9-218      AC A0A6J0ZSY8.1
#=GS A0A091PYJ8_LEPDC/2-453      AC A0A091PYJ8.1
#=GS A0A166X4V7_9AGAM/9-142      AC A0A166X4V7.1
#=GS A0A3B5YW06_WHEAT/220-400    AC A0A3B5YW06.1
#=GS F1PJI5_CANLF/258-368        AC F1PJI5.3
#=GS A0A6P7HYQ8_9TELE/270-395    AC A0A6P7HYQ8.1
#=GS A0A4Q2D8Z6_9AGAR/159-313    AC A0A4Q2D8Z6.1
#=GS A0A4S3JR95_9EURO/9-41       AC A0A4S3JR95.1
#=GS A0A0D3G5K0_9ORYZ/215-394    AC A0A0D3G5K0.1
#=GS A0A6J3K5A1_9HYME/11-271     AC A0A6J3K5A1.1
#=GS A0A6I9LZZ1_PERMB/13-272     AC A0A6I9LZZ1.1
#=GS A0A078AMR6_STYLE/249-334    AC A0A078AMR6.1
#=GS S8FU20_FOMPI/23-209         AC S8FU20.1
#=GS A0A2I1FYB3_9GLOM/199-293    AC A0A2I1FYB3.1
#=GS A0A6J2XY00_SITOR/150-364    AC A0A6J2XY00.1
#=GS A0A1E3PY78_LIPST/149-310    AC A0A1E3PY78.1
#=GS A0A093BS97_TAUER/258-368    AC A0A093BS97.1
#=GS A0A674BMG1_SALTR/11-520     AC A0A674BMG1.1
#=GS A0A0J8RBD3_COCIT/9-388      AC A0A0J8RBD3.1
#=GS A0A2B7XBF2_9EURO/9-438      AC A0A2B7XBF2.1
#=GS A0A1X7RCN3_ZYMTR/9-422      AC A0A1X7RCN3.1
#=GS A0A4V2JU96_9MICR/72-156     AC A0A4V2JU96.1
#=GS A0A4Q2D8Z6_9AGAR/9-194      AC A0A4Q2D8Z6.1
#=GS K7M9C9_SOYBN/9-217          AC K7M9C9.1
#=GS A0A372R206_9GLOM/9-199      AC A0A372R206.1
#=GS A0A0D0E1K5_9AGAM/178-320    AC A0A0D0E1K5.1
#=GS A0A674GPA6_TAEGU/264-374    AC A0A674GPA6.1
#=GS W5KQ78_ASTMX/265-385        AC W5KQ78.2
#=GS D4B0C8_ARTBC/60-448         AC D4B0C8.1
#=GS W6MFN9_9ASCO/112-250        AC W6MFN9.1
#=GS A0A0V1A1R3_9BILA/153-289    AC A0A0V1A1R3.1
#=GS A0A4P1RDT5_LUPAN/230-387    AC A0A4P1RDT5.1
#=GS A0A1B7MZA7_9AGAM/231-380    AC A0A1B7MZA7.1
#=GS A0A673MI32_9TELE/13-262     AC A0A673MI32.1
#=GS A0A5N5XFN1_9EURO/9-48       AC A0A5N5XFN1.1
#=GS A0A5N5XFN5_9EURO/2-309      AC A0A5N5XFN5.1
#=GS A0A131ZV42_SARSC/135-441    AC A0A131ZV42.1
#=GS A0A094C7C2_9PEZI/227-474    AC A0A094C7C2.1
#=GS A0A1V6PSG1_9EURO/9-370      AC A0A1V6PSG1.1
#=GS A0A1R1Y9K6_9FUNG/46-334     AC A0A1R1Y9K6.1
#=GS A0A1B9I8F2_9TREE/86-201     AC A0A1B9I8F2.1
#=GS A0A6J2Y8M5_SITOR/180-330    AC A0A6J2Y8M5.1
#=GS A0A2K6Q5K7_RHIRO/257-370    AC A0A2K6Q5K7.1
#=GS A0A1V8SBV1_9PEZI/9-417      AC A0A1V8SBV1.1
#=GS A0A663M8Y0_ATHCN/16-273     AC A0A663M8Y0.1
#=GS A0A1D5QTP5_MACMU/13-270     AC A0A1D5QTP5.2
#=GS A0A091LUI6_CARIC/108-218    AC A0A091LUI6.1
#=GS A0A6P4FJ12_DRORH/11-254     AC A0A6P4FJ12.1
#=GS A0A6A4M885_9ERIC/9-233      AC A0A6A4M885.1
#=GS A0A151JQC4_9HYME/3-253      AC A0A151JQC4.1
#=GS A0A139IRU7_9PEZI/9-413      AC A0A139IRU7.1
#=GS A0A7E4VV58_PANRE/12-157     AC A0A7E4VV58.1
#=GS A0A445IDX3_GLYSO/181-408    AC A0A445IDX3.1
#=GS M5EAH0_MALS4/9-128          AC M5EAH0.1
#=GS E3RRM2_PYRTT/9-383          AC E3RRM2.1
#=GS A0A022S0X4_ERYGU/9-240      AC A0A022S0X4.1
#=GS A0A669PD90_PHACC/13-270     AC A0A669PD90.1
#=GS A0A094K497_9PEZI/9-240      AC A0A094K497.1
#=GS A0A6J3D277_AYTFU/268-377    AC A0A6J3D277.1
#=GS G4TGV1_SERID/228-477        AC G4TGV1.1
#=GS A0A2I0MNB0_COLLI/228-338    AC A0A2I0MNB0.1
#=GS S4RL05_PETMA/255-368        AC S4RL05.1
#=GS A0A3P8WS59_CYNSE/14-286     AC A0A3P8WS59.1
#=GS A0A314KL92_NICAT/9-244      AC A0A314KL92.1
#=GS A0A2S5BB31_9BASI/9-109      AC A0A2S5BB31.1
#=GS X0CY17_FUSOX/9-397          AC X0CY17.1
#=GS A0A0F9ZYI2_TRIHA/9-374      AC A0A0F9ZYI2.1
#=GS V7C0T8_PHAVU/9-218          AC V7C0T8.1
#=GS Q2UL91_ASPOR/9-411          AC Q2UL91.1
#=GS A0A226P437_COLVI/224-337    AC A0A226P437.1
#=GS A0A3Q0D285_MESAU/1-386      AC A0A3Q0D285.1
#=GS A0A2I4C8Q1_9TELE/268-389    AC A0A2I4C8Q1.1
#=GS D3B937_POLPP/6-217          AC D3B937.1
#=GS A0A4P1R1Q3_LUPAN/79-284     AC A0A4P1R1Q3.1
#=GS A0A0C3PME0_PISTI/13-255     AC A0A0C3PME0.1
#=GS S4R6Q8_PETMA/190-371        AC S4R6Q8.1
#=GS S9VSQ7_SCHCR/9-187          AC S9VSQ7.1
#=GS A0A5B6UMI5_9ROSI/9-200      AC A0A5B6UMI5.1
#=GS A0A1Z5RP71_SORBI/266-440    AC A0A1Z5RP71.1
#=GS A0A4S2L359_9HYME/11-115     AC A0A4S2L359.1
#=GS A0A2G7FIH7_9EURO/9-412      AC A0A2G7FIH7.1
#=GS A0A673TCW6_SURSU/191-302    AC A0A673TCW6.1
#=GS A0A183E089_9BILA/1-250      AC A0A183E089.1
#=GS A0A673MTF5_9TELE/8-251      AC A0A673MTF5.1
#=GS A0A2K5EW71_AOTNA/263-376    AC A0A2K5EW71.1
#=GS A0A067L1A3_JATCU/208-407    AC A0A067L1A3.1
#=GS G7DVJ2_MIXOS/124-217        AC G7DVJ2.1
#=GS A0A6I9HQ85_GEOFO/10-493     AC A0A6I9HQ85.1
#=GS A0A803J786_XENTR/249-358    AC A0A803J786.1
#=GS A0A4V3XHY5_9APHY/131-267    AC A0A4V3XHY5.1
#=GS A0A6P3IQB9_BISBI/766-1001   AC A0A6P3IQB9.1
#=GS A0A3B5ZRL5_WHEAT/9-226      AC A0A3B5ZRL5.1
#=GS A0A1Y2F6S1_9FUNG/9-127      AC A0A1Y2F6S1.1
#=GS A0A060Y4G3_ONCMY/9-461      AC A0A060Y4G3.1
#=GS A0A161HKR6_9ASCO/9-130      AC A0A161HKR6.1
#=GS A0A4D9BXJ0_SALSN/195-409    AC A0A4D9BXJ0.1
#=GS R0J2X7_SETT2/9-392          AC R0J2X7.1
#=GS A0A2K6LLF1_RHIBE/263-376    AC A0A2K6LLF1.1
#=GS K7FYS8_PELSI/13-261         AC K7FYS8.1
#=GS A0A3N6TSF4_BRACR/135-322    AC A0A3N6TSF4.1
#=GS D5GD47_TUBMM/9-373          AC D5GD47.1
#=GS A0A0N4X7X2_HAEPC/57-198     AC A0A0N4X7X2.1
#=GS H0Y076_OTOGA/13-271         AC H0Y076.1
#=GS A0A2K6Q5M0_RHIRO/226-339    AC A0A2K6Q5M0.1
#=GS L7JYV2_TRAHO/45-122         AC L7JYV2.1
#=GS C9SQY7_VERA1/9-416          AC C9SQY7.1
#=GS A0A7E5VUA8_TRINI/11-201     AC A0A7E5VUA8.1
#=GS Q5K753_CRYNJ/140-240        AC Q5K753.2
#=GS A0A7N4UZW4_SARHA/20-496     AC A0A7N4UZW4.1
#=GS A0A2H5TY78_RHIID/198-278    AC A0A2H5TY78.1
#=GS A0A1Y1I1E4_KLENI/8-152      AC A0A1Y1I1E4.1
#=GS A0A371DQT7_9APHY/150-285    AC A0A371DQT7.1
#=GS A0A315VWX1_GAMAF/358-481    AC A0A315VWX1.1
#=GS A0A2I2UZB4_FELCA/13-270     AC A0A2I2UZB4.2
#=GS A0A0C9ZFU4_9AGAM/13-256     AC A0A0C9ZFU4.1
#=GS A0A484C8B9_PERFV/13-271     AC A0A484C8B9.1
#=GS A0A3B0JF26_DROGU/11-251     AC A0A3B0JF26.1
#=GS A0A091KQR8_9GRUI/70-146     AC A0A091KQR8.1
#=GS A0A4W2CGS1_BOBOX/10-251     AC A0A4W2CGS1.1
#=GS U1GFG5_ENDPU/40-418         AC U1GFG5.1
#=GS D8TDN9_SELML/8-148          AC D8TDN9.1
#=GS G8BIA0_CANPC/9-155          AC G8BIA0.1
#=GS A0A5D2U6Y5_GOSMU/9-232      AC A0A5D2U6Y5.1
#=GS A0A178ZYF3_9EURO/9-366      AC A0A178ZYF3.1
#=GS A0A674F2V7_SALTR/231-354    AC A0A674F2V7.1
#=GS T1F3V4_HELRO/18-538         AC T1F3V4.1
#=GS G1L572_AILME/13-269         AC G1L572.2
#=GS A0A1L0GMS1_9ASCO/9-127      AC A0A1L0GMS1.1
#=GS U3I481_ANAPP/268-377        AC U3I481.2
#=GS A0A093IW96_DRYPU/255-366    AC A0A093IW96.1
#=GS A0A6I8SLK7_XENTR/89-458     AC A0A6I8SLK7.2
#=GS A0A445IDX3_GLYSO/9-243      AC A0A445IDX3.1
#=GS A0A1E3QT10_9ASCO/9-125      AC A0A1E3QT10.1
#=GS A0A1S3NIK8_SALSA/11-520     AC A0A1S3NIK8.1
#=GS W9S509_9ROSA/8-224          AC W9S509.1
#=GS A0A6P6RPF4_CARAU/248-365    AC A0A6P6RPF4.1
#=GS A0A015JS43_RHIIW/200-293    AC A0A015JS43.1
#=GS W6MFN9_9ASCO/9-126          AC W6MFN9.1
#=GS G5AJS0_HETGA/281-393        AC G5AJS0.1
#=GS A0A7N4V2V6_SARHA/10-481     AC A0A7N4V2V6.1
#=GS A0A6P3XYY3_DINQU/11-89      AC A0A6P3XYY3.1
#=GS R0GQ36_9BRAS/176-375        AC R0GQ36.1
#=GS A0A673N0A1_9TELE/13-257     AC A0A673N0A1.1
#=GS A0A3N4JRZ7_9PEZI/9-369      AC A0A3N4JRZ7.1
#=GS A0A0J1B9J2_9TREE/87-197     AC A0A0J1B9J2.1
#=GS A0A6J2R6W9_COTGO/688-1140   AC A0A6J2R6W9.1
#=GS A0A6A1Q1M0_BALPH/246-358    AC A0A6A1Q1M0.1
#=GS A0A5E4MDJ2_9HEMI/70-338     AC A0A5E4MDJ2.1
#=GS A0A672K7E8_SINGR/140-250    AC A0A672K7E8.1
#=GS A0A0D9RGW3_CHLSB/13-270     AC A0A0D9RGW3.1
#=GS A0A6I8V5S6_DROPS/11-250     AC A0A6I8V5S6.1
#=GS A0A2G5EFY9_AQUCA/201-354    AC A0A2G5EFY9.1
#=GS A0A090D3R8_PODAN/522-548    AC A0A090D3R8.1
#=GS A0A423XE20_9PEZI/134-469    AC A0A423XE20.1
#=GS J9K8X1_ACYPI/11-90          AC J9K8X1.1
#=GS A8N7A3_COPC7/180-305        AC A8N7A3.2
#=GS A0A1Y2XCK1_9PEZI/9-379      AC A0A1Y2XCK1.1
#=GS A0A1E4SZ94_9ASCO/105-269    AC A0A1E4SZ94.1
#=GS A0A4W3GN83_CALMI/9-518      AC A0A4W3GN83.1
#=GS A0A485NBP5_LYNPA/1-169      AC A0A485NBP5.1
#=GS A0A3P9PZX5_POERE/13-286     AC A0A3P9PZX5.1
#=GS A0A6P8G5M3_CLUHA/703-1197   AC A0A6P8G5M3.1
#=GS F0XAM5_GROCL/9-429          AC F0XAM5.1
#=GS A0A1S3U702_VIGRR/224-384    AC A0A1S3U702.1
#=GS A0A341AS76_NEOAA/226-336    AC A0A341AS76.1
#=GS A0A6J0E3V4_PERMB/228-338    AC A0A6J0E3V4.1
#=GS A0A158NUK7_ATTCE/11-262     AC A0A158NUK7.1
#=GS A0A3P8WXZ5_CYNSE/288-415    AC A0A3P8WXZ5.1
#=GS A0A0K6GDL4_9AGAM/357-576    AC A0A0K6GDL4.1
#=GS V4UFR3_CITCL/211-406        AC V4UFR3.1
#=GS A0A151GAL8_9HYPO/9-359      AC A0A151GAL8.1
#=GS A0A669F4V3_ORENI/179-312    AC A0A669F4V3.1
#=GS I0Z712_COCSC/9-155          AC I0Z712.1
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