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Database: Pfam
Entry: TFIIF_alpha
LinkDB: TFIIF_alpha
Original site: TFIIF_alpha 
#=GF ID   TFIIF_alpha
#=GF AC   PF05793.15
#=GF DE   Transcription initiation factor IIF, alpha subunit (TFIIF-alpha)
#=GF PI   TFIIF-alpha; 
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_7586 (release 8.0)
#=GF GA   27.10 27.10;
#=GF TC   27.10 27.10;
#=GF NC   27.00 27.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 61295632 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0123
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12354769
#=GF RT   A key role for the alpha 1 helix of human RAP74 in the
#=GF RT   initiation and elongation of RNA chains. 
#=GF RA   Funk JD, Nedialkov YA, Xu D, Burton ZF; 
#=GF RL   J Biol Chem 2002;277:46998-47003.
#=GF DR   INTERPRO; IPR008851;
#=GF DR   SCOP; 1i27; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Transcription initiation factor IIF, alpha subunit (TFIIF-alpha)
#=GF CC   or RNA polymerase II-associating protein 74 (RAP74) is the large
#=GF CC   subunit of transcription factor IIF (TFIIF), which is essential
#=GF CC   for accurate initiation and stimulates elongation by RNA
#=GF CC   polymerase II [1].
#=GF SQ   1845
#=GS A0A6P5WX24_DURZI/42-551     AC A0A6P5WX24.1
#=GS A0A1S4AF13_TOBAC/107-203    AC A0A1S4AF13.1
#=GS D7TRJ8_VITVI/42-538         AC D7TRJ8.1
#=GS A0A317XDT5_9EURO/223-695    AC A0A317XDT5.1
#=GS A0A0L0GBH0_9EUKA/83-459     AC A0A0L0GBH0.1
#=GS A0A0E0KBC4_ORYPU/7-281      AC A0A0E0KBC4.1
#=GS A0A6J2TEH1_DROLE/66-184     AC A0A6J2TEH1.1
#=GS H0XIL0_OTOGA/2-473          AC H0XIL0.1
#=GS A0A072P512_9EURO/172-707    AC A0A072P512.1
#=GS A0A154PMN1_DUFNO/1-344      AC A0A154PMN1.1
#=GS A0A3B5XXQ0_WHEAT/43-525     AC A0A3B5XXQ0.1
#=GS A0A1V6R753_9EURO/220-343    AC A0A1V6R753.1
#=GS A0A4X2KP30_VOMUR/2-513      AC A0A4X2KP30.1
#=GS A0A668VAR8_OREAU/18-279     AC A0A668VAR8.1
#=GS A0A673GNU9_9TELE/2-532      AC A0A673GNU9.1
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#=GS A0A6A4M4C9_9ERIC/175-460    AC A0A6A4M4C9.1
#=GS A0A1W4XPW4_AGRPL/1-223      AC A0A1W4XPW4.1
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#=GS T2FA_HUMAN/2-517            AC P35269.2
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#=GS T2FA_HUMAN/2-517            DR PDB; 1I27 A; 449-517;
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#=GS T2FA_HUMAN/2-517            DR PDB; 5IYD S; 5-180;
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#=GS I4YJL0_WALMC/175-491        AC I4YJL0.1
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#=GS A0A446QQE0_TRITD/49-542     AC A0A446QQE0.1
#=GS M0QXD6_HUMAN/1-83           AC M0QXD6.1
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