GenomeNet

Database: Pfam
Entry: TRAP_beta
LinkDB: TRAP_beta
Original site: TRAP_beta 
#=GF ID   TRAP_beta
#=GF AC   PF05753.16
#=GF DE   Translocon-associated protein beta (TRAPB)
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_6857 (release 8.0)
#=GF GA   22.40 22.40;
#=GF TC   22.40 22.40;
#=GF NC   22.30 22.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0159
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11204460
#=GF RT   The Translocon-Associated Protein beta (TRAPbeta) in zebrafish
#=GF RT   embryogenesis. I. Enhanced expression of transcripts in
#=GF RT   notochord and hatching gland precursors. 
#=GF RA   Mangos S, Krawetz R, Kelly GM; 
#=GF RL   Mol Cell Biochem 2000;215:93-101.
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several eukaryotic translocon-associated
#=GF CC   protein beta (TRAPB) or signal sequence receptor beta subunit
#=GF CC   (SSR-beta) proteins. The normal translocation of nascent
#=GF CC   polypeptides into the lumen of the endoplasmic reticulum (ER) is
#=GF CC   thought to be aided in part by a translocon-associated protein
#=GF CC   (TRAP) complex consisting of 4 protein subunits. The association
#=GF CC   of mature proteins with the ER and Golgi, or other intracellular
#=GF CC   locales, such as lysosomes, depends on the initial targeting of
#=GF CC   the nascent polypeptide to the ER membrane. A similar scenario
#=GF CC   must also exist for proteins destined for secretion [1].
#=GF SQ   1077
#=GS A0A2C9W2C3_MANES/12-65      AC A0A2C9W2C3.1
#=GS A0A4D9A0Q6_SALSN/13-190     AC A0A4D9A0Q6.1
#=GS A0A3L6REA1_PANMI/7-187      AC A0A3L6REA1.1
#=GS A0A443SQ94_9ACAR/5-189      AC A0A443SQ94.1
#=GS A0A0D3B123_BRAOL/12-193     AC A0A0D3B123.1
#=GS A0A445CTT9_ARAHY/12-191     AC A0A445CTT9.1
#=GS A0A068YGU1_ECHMU/6-181      AC A0A068YGU1.1
#=GS A0A452GB04_CAPHI/6-184      AC A0A452GB04.1
#=GS A0A5E4N486_9HEMI/10-190     AC A0A5E4N486.1
#=GS A0A3P9CP83_9CICH/4-183      AC A0A3P9CP83.1
#=GS M7B733_CHEMY/2-175          AC M7B733.1
#=GS A0A4P9W8P4_9FUNG/41-193     AC A0A4P9W8P4.1
#=GS G1SV74_RABIT/21-172         AC G1SV74.2
#=GS A0A3M0J2A3_HIRRU/3-93       AC A0A3M0J2A3.1
#=GS H2N5F4_PONAB/3-54           AC H2N5F4.1
#=GS A0A4U5VK97_COLLU/56-235     AC A0A4U5VK97.1
#=GS A0A2U3W4K7_ODORO/4-182      AC A0A2U3W4K7.1
#=GS I1N7Y5_SOYBN/14-137         AC I1N7Y5.1
#=GS A0A2R9BAL8_PANPA/3-70       AC A0A2R9BAL8.1
#=GS A0A6A3C5H0_HIBSY/107-209    AC A0A6A3C5H0.1
#=GS A0A267F4U5_9PLAT/8-187      AC A0A267F4U5.1
#=GS A0A3R7MF42_PENVA/44-224     AC A0A3R7MF42.1
#=GS A0A077ZB85_TRITR/312-492    AC A0A077ZB85.1
#=GS A0A6D2IZC2_9BRAS/12-188     AC A0A6D2IZC2.1
#=GS A0A2U1NJF5_ARTAN/14-195     AC A0A2U1NJF5.1
#=GS A0A1Y1HIS1_KLENI/11-192     AC A0A1Y1HIS1.1
#=GS A0A2I3MI32_PAPAN/3-61       AC A0A2I3MI32.1
#=GS A0A2I3G355_NOMLE/3-70       AC A0A2I3G355.1
#=GS E1Z6E5_CHLVA/15-207         AC E1Z6E5.1
#=GS A0A5F5PJX6_HORSE/4-70       AC A0A5F5PJX6.1
#=GS A0A4W6CXX1_LATCA/1-173      AC A0A4W6CXX1.1
#=GS A0A0D3G283_9ORYZ/8-187      AC A0A0D3G283.1
#=GS A0A0B2V1A4_TOXCA/3-192      AC A0A0B2V1A4.1
#=GS W5P572_SHEEP/6-184          AC W5P572.1
#=GS M0S9Y8_MUSAM/14-161         AC M0S9Y8.1
#=GS G3WJ59_SARHA/22-201         AC G3WJ59.1
#=GS A0A1S3AI82_ERIEU/4-184      AC A0A1S3AI82.1
#=GS A0A6A2WPH1_HIBSY/145-196    AC A0A6A2WPH1.1
#=GS A0A0A6YVZ1_MOUSE/3-73       AC A0A0A6YVZ1.1
#=GS A0A1U8I629_GOSHI/11-193     AC A0A1U8I629.1
#=GS A0A0D2ZPG8_BRAOL/13-192     AC A0A0D2ZPG8.1
#=GS A0A0K0D8R4_ANGCA/4-161      AC A0A0K0D8R4.1
#=GS A0A2R9BCX0_PANPA/22-200     AC A0A2R9BCX0.1
#=GS A0A4S2LH61_OPIFE/6-180      AC A0A4S2LH61.1
#=GS C1MK76_MICPC/4-205          AC C1MK76.1
#=GS M3Y0S3_MUSPF/19-201         AC M3Y0S3.1
#=GS A0A453E0R3_AEGTS/56-210     AC A0A453E0R3.1
#=GS A0A151T973_CAJCA/10-191     AC A0A151T973.1
#=GS A0A093ESM8_TYTAL/1-130      AC A0A093ESM8.1
#=GS A0A210QB62_MIZYE/19-197     AC A0A210QB62.1
#=GS A0A0B1TI32_OESDE/1-145      AC A0A0B1TI32.1
#=GS A0A5D2UCQ9_GOSMU/11-193     AC A0A5D2UCQ9.1
#=GS A0A251Q888_PRUPE/13-194     AC A0A251Q888.1
#=GS A0A0D2T4R0_GOSRA/11-191     AC A0A0D2T4R0.1
#=GS A0A672G732_SALFA/2-182      AC A0A672G732.1
#=GS A0A200QGW4_9MAGN/13-194     AC A0A200QGW4.1
#=GS A0A6A2XEC8_HIBSY/8-187      AC A0A6A2XEC8.1
#=GS A0A671UD18_SPAAU/4-175      AC A0A671UD18.1
#=GS A0A098VR84_9MICR/14-95      AC A0A098VR84.1
#=GS M0CST6_9EURY/33-136         AC M0CST6.1
#=GS A0A0J7NXD8_LASNI/7-187      AC A0A0J7NXD8.1
#=GS A9URW9_MONBE/1-180          AC A9URW9.1
#=GS A0A091RY41_NESNO/1-121      AC A0A091RY41.1
#=GS A0A1U8K0H9_GOSHI/41-220     AC A0A1U8K0H9.1
#=GS A0A0C2MRW1_THEKT/4-179      AC A0A0C2MRW1.1
#=GS S9XDZ9_CAMFR/4-182          AC S9XDZ9.1
#=GS A0A2K5WZM5_MACFA/3-88       AC A0A2K5WZM5.1
#=GS Q4Q6X5_LEIMA/11-205         AC Q4Q6X5.1
#=GS A0A2T7E974_9POAL/8-192      AC A0A2T7E974.1
#=GS A0A6A6NDM9_HEVBR/12-191     AC A0A6A6NDM9.1
#=GS A0A1S3BNZ1_CUCME/12-193     AC A0A1S3BNZ1.1
#=GS A0A1U7SKK8_ALLSI/1-181      AC A0A1U7SKK8.1
#=GS A0A3S2NFB3_CHISP/5-186      AC A0A3S2NFB3.1
#=GS A0A2C9UZH7_MANES/12-193     AC A0A2C9UZH7.1
#=GS A0A0V0VR84_9BILA/82-172     AC A0A0V0VR84.1
#=GS A0A0E0DKS5_9ORYZ/11-191     AC A0A0E0DKS5.1
#=GS A0A0S4JI19_BODSA/8-196      AC A0A0S4JI19.1
#=GS A0A078H6K4_BRANA/10-191     AC A0A078H6K4.1
#=GS A0A6A2ZX46_HIBSY/35-211     AC A0A6A2ZX46.1
#=GS A0A1Q3DHF7_CEPFO/1-81       AC A0A1Q3DHF7.1
#=GS A0A2I3GJE2_NOMLE/1-50       AC A0A2I3GJE2.1
#=GS A0A2U1QJM2_ARTAN/21-77      AC A0A2U1QJM2.1
#=GS A0A5N6Q404_9ASTR/9-142      AC A0A5N6Q404.1
#=GS R5Y046_9FIRM/47-181         AC R5Y046.1
#=GS M4EVX2_BRARP/13-190         AC M4EVX2.1
#=GS I1HC67_BRADI/9-159          AC I1HC67.1
#=GS A0A672UQ59_STRHB/3-181      AC A0A672UQ59.1
#=GS A0A504YAM3_FASGI/15-187     AC A0A504YAM3.1
#=GS A0A016UZ73_9BILA/32-216     AC A0A016UZ73.1
#=GS A0A0A0AVD7_CHAVO/1-130      AC A0A0A0AVD7.1
#=GS A0A2J7RKQ5_9NEOP/7-186      AC A0A2J7RKQ5.1
#=GS A0A397XWD2_BRACM/1-165      AC A0A397XWD2.1
#=GS A0A151II83_9HYME/8-187      AC A0A151II83.1
#=GS A0A0R3TQJ4_RODNA/6-186      AC A0A0R3TQJ4.1
#=GS A0A2G2XIG9_CAPBA/5-136      AC A0A2G2XIG9.1
#=GS A0A484CLZ5_PERFV/38-218     AC A0A484CLZ5.1
#=GS A0A2J6KDZ6_LACSA/13-195     AC A0A2J6KDZ6.1
#=GS A0A6A4K0R4_APOLU/6-186      AC A0A6A4K0R4.1
#=GS A0A176WHL1_MARPO/1-170      AC A0A176WHL1.1
#=GS A0A072UCB1_MEDTR/11-171     AC A0A072UCB1.1
#=GS A0A5A9NL88_9TELE/5-183      AC A0A5A9NL88.1
#=GS A0A3S1BM33_ELYCH/56-95      AC A0A3S1BM33.1
#=GS V5B7D0_TRYCR/8-195          AC V5B7D0.1
#=GS A0A484B1F6_DRONA/9-187      AC A0A484B1F6.1
#=GS A0A091Q3Y7_LEPDC/4-100      AC A0A091Q3Y7.1
#=GS B4MM43_DROWI/9-187          AC B4MM43.1
#=GS A0A654HRH4_9CEST/8-182      AC A0A654HRH4.1
#=GS E3NQ19_CAERE/13-146         AC E3NQ19.1
#=GS A0A226MKH6_CALSU/1-129      AC A0A226MKH6.1
#=GS A0A2H2JKS9_CAEJA/1-98       AC A0A2H2JKS9.1
#=GS A0A6A3C293_HIBSY/38-92      AC A0A6A3C293.1
#=GS A0A0V1CL27_TRIBR/790-878    AC A0A0V1CL27.1
#=GS A0A078F5V5_BRANA/12-193     AC A0A078F5V5.1
#=GS A0A673SQH6_SURSU/4-56       AC A0A673SQH6.1
#=GS A0A093Q170_9PASS/1-130      AC A0A093Q170.1
#=GS A0A0B0MSW2_GOSAR/41-220     AC A0A0B0MSW2.1
#=GS E3MA74_CAERE/5-185          AC E3MA74.1
#=GS A0A0D9WBR5_9ORYZ/11-103     AC A0A0D9WBR5.1
#=GS A0A1U7ZMF6_NELNU/13-194     AC A0A1U7ZMF6.1
#=GS Q4DQQ9_TRYCC/8-195          AC Q4DQQ9.1
#=GS A0A1J6JQW2_NICAT/5-136      AC A0A1J6JQW2.1
#=GS A0A087VJR2_BALRE/1-130      AC A0A087VJR2.1
#=GS A0A1S4C0R5_TOBAC/9-89       AC A0A1S4C0R5.1
#=GS G7WJV6_METH6/150-272        AC G7WJV6.1
#=GS U3JIQ7_FICAL/1-181          AC U3JIQ7.1
#=GS A0A3P8YCG1_ESOLU/23-202     AC A0A3P8YCG1.2
#=GS A0A401RKE5_CHIPU/64-142     AC A0A401RKE5.1
#=GS A0A384CIZ9_URSMA/3-181      AC A0A384CIZ9.1
#=GS A0A667XFZ3_9TELE/3-182      AC A0A667XFZ3.1
#=GS A0A2K1X400_POPTR/43-189     AC A0A2K1X400.1
#=GS A0A2K5LGP3_CERAT/3-61       AC A0A2K5LGP3.1
#=GS A0A2K3N5J0_TRIPR/11-191     AC A0A2K3N5J0.1
#=GS A0A5F8G6T2_MONDO/3-79       AC A0A5F8G6T2.1
#=GS A0A0D2RUR6_GOSRA/3-132      AC A0A0D2RUR6.1
#=GS A0A445DI61_ARAHY/291-412    AC A0A445DI61.1
#=GS A0A5N5K144_9ROSI/75-210     AC A0A5N5K144.1
#=GS A0A1E5W2U4_9POAL/8-189      AC A0A1E5W2U4.1
#=GS A0A4E0QX42_FASHE/1-45       AC A0A4E0QX42.1
#=GS A0A1X6NVA1_PORUM/14-191     AC A0A1X6NVA1.1
#=GS F6V4W6_MONDO/3-181          AC F6V4W6.1
#=GS A0A5C7HD60_9ROSI/12-193     AC A0A5C7HD60.1
#=GS T1H5U7_MEGSC/1-126          AC T1H5U7.1
#=GS M3W5W2_FELCA/4-88           AC M3W5W2.2
#=GS A0A4U6VAD1_SETVI/9-196      AC A0A4U6VAD1.1
#=GS A0A0C1R1X3_9CLOT/266-389    AC A0A0C1R1X3.1
#=GS Q1HR42_AEDAE/9-187          AC Q1HR42.1
#=GS L1JH19_GUITC/8-185          AC L1JH19.1
#=GS A0A0D3EIL2_9ORYZ/4-188      AC A0A0D3EIL2.1
#=GS A0A3M0J7X4_HIRRU/182-362    AC A0A3M0J7X4.1
#=GS A0A1X7VWT8_AMPQE/6-184      AC A0A1X7VWT8.1
#=GS A0A265QB71_9FIRM/143-262    AC A0A265QB71.1
#=GS A0A5F4C579_CANLF/4-88       AC A0A5F4C579.1
#=GS A0A419QGE3_CLOSI/6-180      AC A0A419QGE3.1
#=GS V4N6V6_EUTSA/13-193         AC V4N6V6.1
#=GS A0A3Q3E2Y7_9LABR/9-93       AC A0A3Q3E2Y7.1
#=GS A0A0D9WBR3_9ORYZ/11-221     AC A0A0D9WBR3.1
#=GS A0A0V1A6N8_9BILA/366-454    AC A0A0V1A6N8.1
#=GS E2BC60_HARSA/7-193          AC E2BC60.1
#=GS Q21352_CAEEL/1-181          AC Q21352.1
#=GS A0A2K6SJR9_SAIBB/21-200     AC A0A2K6SJR9.1
#=GS SSRB_CANLF/4-181            AC P23438.1
#=GS A0A368QLT9_SETIT/6-188      AC A0A368QLT9.1
#=GS A0A5J5BHF2_9ASTE/15-195     AC A0A5J5BHF2.1
#=GS A2DG10_TRIVA/13-183         AC A2DG10.1
#=GS A0A0V1CL27_TRIBR/721-793    AC A0A0V1CL27.1
#=GS A0A3Q4HW01_NEOBR/4-183      AC A0A3Q4HW01.1
#=GS G1PF87_MYOLU/17-195         AC G1PF87.1
#=GS A0A067DX13_CITSI/12-160     AC A0A067DX13.1
#=GS A0A1J1IJ13_9DIPT/8-192      AC A0A1J1IJ13.1
#=GS A0A4Y7JI11_PAPSO/11-190     AC A0A4Y7JI11.1
#=GS D3BIF7_POLPP/3-184          AC D3BIF7.1
#=GS A0A151NZB2_ALLMI/144-324    AC A0A151NZB2.1
#=GS A0A1S4ERY6_DIACI/13-192     AC A0A1S4ERY6.1
#=GS A0A0A6YWA8_MOUSE/3-117      AC A0A0A6YWA8.1
#=GS A0A2G5C436_AQUCA/13-174     AC A0A2G5C436.1
#=GS E4XAU5_OIKDI/1-185          AC E4XAU5.1
#=GS W6UM77_ECHGR/18-194         AC W6UM77.1
#=GS A0A084WEB2_ANOSI/8-186      AC A0A084WEB2.1
#=GS M1BSN9_SOLTU/12-190         AC M1BSN9.1
#=GS A0A0G4ISW6_PLABS/4-183      AC A0A0G4ISW6.1
#=GS A0A0T6AUQ0_9SCAR/7-187      AC A0A0T6AUQ0.1
#=GS A0A3S1BM33_ELYCH/91-128     AC A0A3S1BM33.1
#=GS A0A3P8WQP2_CYNSE/19-197     AC A0A3P8WQP2.1
#=GS A0A368FJJ4_ANCCA/2-64       AC A0A368FJJ4.1
#=GS A0A091G5I8_9AVES/1-130      AC A0A091G5I8.1
#=GS A0A2C9W102_MANES/3-116      AC A0A2C9W102.1
#=GS A0A2I0LJ93_COLLI/1-181      AC A0A2I0LJ93.1
#=GS M4CX38_BRARP/12-190         AC M4CX38.1
#=GS A0A0E0MQ95_ORYRU/7-160      AC A0A0E0MQ95.1
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