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Database: Pfam
Entry: TrwB_AAD_bind
LinkDB: TrwB_AAD_bind
Original site: TrwB_AAD_bind 
#=GF ID   TrwB_AAD_bind
#=GF AC   PF10412.11
#=GF DE   Type IV secretion-system coupling protein DNA-binding domain
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Gene3D, pdb_1e9r
#=GF GA   20.50 20.50;
#=GF TC   20.50 20.50;
#=GF NC   20.40 20.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0023
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11214325
#=GF RT   The bacterial conjugation protein TrwB resembles ring helicases
#=GF RT   and F1-ATPase. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, Perez-Luque R, Gonzalez A, Cabezon
#=GF RA   E, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   Nature. 2001;409:637-641.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11748238
#=GF RT   Conjugative plasmid protein TrwB, an integral membrane type IV
#=GF RT   secretion system coupling protein. Detailed structural features
#=GF RT   and mapping of the active site cleft. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2002;277:7556-7566.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019476;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   The plasmid conjugative coupling protein TrwB forms hexamers
#=GF CC   from six structurally very similar protomers [1]. This hexamer
#=GF CC   contains a central channel running from the cytosolic pole (made
#=GF CC   up by the AADs) to the membrane pole ending at the transmembrane
#=GF CC   pore shaped by 12 transmembrane helices, rendering an overall
#=GF CC   mushroom-like structure. The TrwB_AAD (all-alpha domain) domain
#=GF CC   appears to be the DNA-binding domain of the structure. TrwB, a
#=GF CC   basic integral inner-membrane nucleoside-triphosphate-binding
#=GF CC   protein, is the structural prototype for the type IV secretion
#=GF CC   system coupling proteins, a family of proteins essential for
#=GF CC   macromolecular transport between cells and export [2].
#=GF SQ   1506
#=GS A0A4Y3TX31_9PROT/127-298    AC A0A4Y3TX31.1
#=GS A0A1I3QC76_9RHOB/432-483    AC A0A1I3QC76.1
#=GS A3VJ90_9RHOB/422-506        AC A3VJ90.1
#=GS A0A2A2HGD8_9GAMM/80-245     AC A0A2A2HGD8.1
#=GS A0A2W7F7W7_9BURK/36-426     AC A0A2W7F7W7.1
#=GS E8V514_TERSS/216-584        AC E8V514.1
#=GS A4XE63_NOVAD/225-611        AC A4XE63.1
#=GS A0A3A9BPS8_9BACT/120-516    AC A0A3A9BPS8.1
#=GS A0A0C1MVL0_9RICK/127-213    AC A0A0C1MVL0.1
#=GS A0A3M8QCQ0_9GAMM/153-533    AC A0A3M8QCQ0.1
#=GS A0A1T4YTS7_9BACT/79-497     AC A0A1T4YTS7.1
#=GS A0A327KUZ9_9RHIZ/237-322    AC A0A327KUZ9.1
#=GS A0A1H5CBV8_9ACTN/342-510    AC A0A1H5CBV8.1
#=GS A0A127CRI2_9RHIZ/123-517    AC A0A127CRI2.1
#=GS A0A437J312_9SPHN/224-610    AC A0A437J312.1
#=GS A0A1C7G414_9FIRM/118-505    AC A0A1C7G414.1
#=GS A0A562TTD0_9SPHI/26-354     AC A0A562TTD0.1
#=GS B4WW43_SYNS7/1-244          AC B4WW43.1
#=GS A0A0P7AB29_9SPHN/197-583    AC A0A0P7AB29.1
#=GS F9ZL90_ACICS/129-531        AC F9ZL90.1
#=GS A0A239MPR9_9BACT/204-577    AC A0A239MPR9.1
#=GS A0A225N3D8_9BURK/117-518    AC A0A225N3D8.1
#=GS A0A1L4D4S7_9PROT/203-596    AC A0A1L4D4S7.1
#=GS A0A1J0WNP3_9RHOB/437-521    AC A0A1J0WNP3.1
#=GS A0A1C2HRE1_9RHOB/437-521    AC A0A1C2HRE1.1
#=GS A0A5S5DIC9_9SPHI/199-591    AC A0A5S5DIC9.1
#=GS Q1RJG0_RICBR/179-559        AC Q1RJG0.1
#=GS J2DEY8_KLEPN/171-561        AC J2DEY8.1
#=GS U9VN73_9CYAN/32-276         AC U9VN73.1
#=GS A0A218QUV6_9CYAN/124-519    AC A0A218QUV6.1
#=GS A0A3P0XAS6_9BACT/214-584    AC A0A3P0XAS6.1
#=GS A0A062U6E9_9RHOB/66-458     AC A0A062U6E9.1
#=GS A0A031J2U6_9SPHN/167-561    AC A0A031J2U6.1
#=GS W1S0I1_9SPHN/224-610        AC W1S0I1.1
#=GS A0A4V1L501_9BACT/220-593    AC A0A4V1L501.1
#=GS A0A2R8BZZ1_9RHOB/437-521    AC A0A2R8BZZ1.1
#=GS A0A2P6FAL9_9MOLU/124-186    AC A0A2P6FAL9.1
#=GS A0A5P8WAI1_9NOSO/110-503    AC A0A5P8WAI1.1
#=GS A0A073J7M0_9RHOB/437-521    AC A0A073J7M0.1
#=GS D6CK82_XANAP/111-494        AC D6CK82.1
#=GS A0A062XQV1_9BACT/533-655    AC A0A062XQV1.1
#=GS A0A239E6U2_9FLAO/21-351     AC A0A239E6U2.1
#=GS E0UMN3_GLOV7/196-514        AC E0UMN3.1
#=GS A0A4Q7YD81_9BACT/240-615    AC A0A4Q7YD81.1
#=GS A0A2A3MXF7_9SPHN/197-583    AC A0A2A3MXF7.1
#=GS A5CEI1_ORITB/62-288         AC A5CEI1.1
#=GS R4Z6J0_9ACTN/320-404        AC R4Z6J0.1
#=GS A0A2S7WFW5_9FLAO/1-317      AC A0A2S7WFW5.1
#=GS J9ZBJ1_LEPFM/145-552        AC J9ZBJ1.1
#=GS A5CC23_ORITB/180-562        AC A5CC23.1
#=GS A0A6I4V7F8_9SPHN/21-354     AC A0A6I4V7F8.1
#=GS A0A1A6C6T0_9GAMM/16-395     AC A0A1A6C6T0.1
#=GS A0A0F0LXH1_9MICO/295-636    AC A0A0F0LXH1.1
#=GS U9VXF5_9CYAN/159-527        AC U9VXF5.1
#=GS A0A0S4LCE4_9BACT/164-546    AC A0A0S4LCE4.1
#=GS A0A0F5PBL1_9SPHN/224-610    AC A0A0F5PBL1.1
#=GS Q8YKT5_NOSS1/716-827        AC Q8YKT5.1
#=GS A0A2W2H8X4_9ACTN/392-469    AC A0A2W2H8X4.1
#=GS A4A4G6_9GAMM/178-322        AC A4A4G6.2
#=GS A0A367S3D9_9NOSO/138-512    AC A0A367S3D9.1
#=GS A0A2A3MTW0_9SPHN/225-611    AC A0A2A3MTW0.1
#=GS A0A2R4MIV4_9RHIZ/183-568    AC A0A2R4MIV4.1
#=GS A0A2K8UI29_9GAMM/143-328    AC A0A2K8UI29.1
#=GS A0A4R4M463_9ACTN/393-555    AC A0A4R4M463.1
#=GS A0A437N4B1_9SPHN/225-615    AC A0A437N4B1.1
#=GS A0A410GDQ8_9BURK/117-518    AC A0A410GDQ8.1
#=GS A0A0K8MDY6_9PROT/4-258      AC A0A0K8MDY6.1
#=GS R6WC71_9FIRM/40-192         AC R6WC71.1
#=GS W1DLY7_KLEPN/123-295        AC W1DLY7.1
#=GS A0A3S0J9V5_9BACT/123-512    AC A0A3S0J9V5.1
#=GS I0ILY2_LEPFC/14-411         AC I0ILY2.1
#=GS K9SQ87_9CYAN/146-538        AC K9SQ87.1
#=GS A0A5C4W9P4_9ACTN/348-434    AC A0A5C4W9P4.1
#=GS A0A432MLJ0_9BACT/264-678    AC A0A432MLJ0.1
#=GS A0A0A3YMC1_9GAMM/171-563    AC A0A0A3YMC1.1
#=GS A0A098GBG9_9GAMM/176-569    AC A0A098GBG9.1
#=GS A0A238DSB5_9BURK/88-476     AC A0A238DSB5.1
#=GS A0A1Y0GD07_9PROT/71-462     AC A0A1Y0GD07.1
#=GS K9V0I8_9CYAN/121-512        AC K9V0I8.1
#=GS A0A4R6V674_9ACTN/230-307    AC A0A4R6V674.1
#=GS A0A270BGY2_9SPHN/172-554    AC A0A270BGY2.1
#=GS A0A646KR55_STRJU/65-222     AC A0A646KR55.1
#=GS A0A5P8WJH9_9NOSO/109-502    AC A0A5P8WJH9.1
#=GS D8JCS4_HALJB/31-378         AC D8JCS4.1
#=GS A0A418NTL9_9SPHN/170-562    AC A0A418NTL9.1
#=GS A0A1B1ZJ25_9PSEU/385-472    AC A0A1B1ZJ25.1
#=GS A0A2A2S9W9_9SPHI/192-587    AC A0A2A2S9W9.1
#=GS A0A5B8URQ2_9SPHI/386-536    AC A0A5B8URQ2.1
#=GS A0A1E1EYS9_9SPHN/172-554    AC A0A1E1EYS9.1
#=GS D8J9Y4_HALJB/67-147         AC D8J9Y4.1
#=GS A0A2T4V109_9DELT/632-693    AC A0A2T4V109.1
#=GS A0A0W0R697_9GAMM/116-281    AC A0A0W0R697.1
#=GS A0A3A9EUT7_9FIRM/293-629    AC A0A3A9EUT7.1
#=GS A0A0C1NCN8_9CYAN/226-326    AC A0A0C1NCN8.1
#=GS U2ZXJ1_9SPHN/172-554        AC U2ZXJ1.1
#=GS A0A0A8WN99_9DELT/27-397     AC A0A0A8WN99.1
#=GS A0A3R9Y1D5_9SPHN/434-484    AC A0A3R9Y1D5.1
#=GS F8L2X3_SIMNZ/192-577        AC F8L2X3.1
#=GS Q5HXP8_GLUOX/123-313        AC Q5HXP8.1
#=GS R5XWY7_9FIRM/43-443         AC R5XWY7.1
#=GS A0A0D1P8T2_BRAEL/153-518    AC A0A0D1P8T2.1
#=GS A0A238YE10_HALVU/33-406     AC A0A238YE10.1
#=GS A0A1M5HPE9_9BACT/20-320     AC A0A1M5HPE9.1
#=GS A0A1Z4RSG7_9CHRO/117-494    AC A0A1Z4RSG7.1
#=GS V7Q0P3_9BACT/496-566        AC V7Q0P3.1
#=GS A0A5B8YLQ4_9FLAO/94-463     AC A0A5B8YLQ4.1
#=GS A0A1Y3XKJ1_9FIRM/71-478     AC A0A1Y3XKJ1.1
#=GS A0A1H1NTT8_9BACT/116-271    AC A0A1H1NTT8.1
#=GS A0A077FNN7_9RICK/183-560    AC A0A077FNN7.1
#=GS A0A098G750_9GAMM/172-344    AC A0A098G750.1
#=GS A0A091FIJ3_9DELT/19-347     AC A0A091FIJ3.1
#=GS Q1GN15_RUEST/436-521        AC Q1GN15.1
#=GS A0A4Q5VAA3_9GAMM/164-213    AC A0A4Q5VAA3.1
#=GS A5V2N2_SPHWW/189-575        AC A5V2N2.1
#=GS A0A1G8F049_9VIBR/151-527    AC A0A1G8F049.1
#=GS A0A0C4WT72_9GAMM/151-200    AC A0A0C4WT72.1
#=GS A0A286ERI2_9ACTN/383-721    AC A0A286ERI2.1
#=GS A0A2I8DS05_9BURK/308-574    AC A0A2I8DS05.1
#=GS D4H0C4_HALVD/423-495        AC D4H0C4.1
#=GS A6L6L3_BACV8/100-465        AC A6L6L3.1
#=GS A0A1I5CSI6_9FLAO/98-470     AC A0A1I5CSI6.1
#=GS A0A1H3FSM7_9RHOB/432-482    AC A0A1H3FSM7.1
#=GS A0A031LL54_9CREN/278-345    AC A0A031LL54.1
#=GS A0A1B4V7Z3_9GAMM/150-311    AC A0A1B4V7Z3.1
#=GS A0A5S5DWD1_9FLAO/133-417    AC A0A5S5DWD1.1
#=GS A0A563DCS0_9BACT/50-397     AC A0A563DCS0.1
#=GS A0A4R1KYV4_9BACT/215-585    AC A0A4R1KYV4.1
#=GS E8X7X0_GRATM/214-587        AC E8X7X0.1
#=GS B4VV16_9CYAN/137-541        AC B4VV16.1
#=GS A0A0W0XSR1_9GAMM/172-565    AC A0A0W0XSR1.1
#=GS A0A1G7Y2H2_9RHIZ/20-240     AC A0A1G7Y2H2.1
#=GS A0A1Y4KAC0_9ACTN/35-379     AC A0A1Y4KAC0.1
#=GS A0A4Q3DGJ8_9RICK/199-595    AC A0A4Q3DGJ8.1
#=GS A0A543CHK7_9ACTN/404-467    AC A0A543CHK7.1
#=GS A0A0B1ZGZ7_9SPHN/172-554    AC A0A0B1ZGZ7.1
#=GS Q094W2_STIAD/667-725        AC Q094W2.1
#=GS G2PQ89_MURRD/189-484        AC G2PQ89.1
#=GS A0A147EFJ9_9SPHN/171-563    AC A0A147EFJ9.1
#=GS A0A0M3T9P1_9SPHN/139-525    AC A0A0M3T9P1.1
#=GS A0A1G4U2R4_9SPHN/224-610    AC A0A1G4U2R4.1
#=GS K7AD23_9ALTE/146-376        AC K7AD23.1
#=GS A0A1C2FXV1_9GAMM/77-453     AC A0A1C2FXV1.1
#=GS A0A4Q1KMT1_9SPHN/172-554    AC A0A4Q1KMT1.1
#=GS J2H0K7_9SPHN/169-570        AC J2H0K7.1
#=GS F4GW04_PUSST/113-496        AC F4GW04.1
#=GS A0A328EBZ9_9BACT/367-692    AC A0A328EBZ9.1
#=GS A0A3D9ET11_9FLAO/191-484    AC A0A3D9ET11.1
#=GS A0A5A7UDC6_CUCME/1-178      AC A0A5A7UDC6.1
#=GS A0A563EHP8_9PSEU/442-642    AC A0A563EHP8.1
#=GS A0A3N0AX39_9ACTN/99-474     AC A0A3N0AX39.1
#=GS A0A1R4H0Y1_9GAMM/12-72      AC A0A1R4H0Y1.1
#=GS I3ZJD2_TERRK/208-581        AC I3ZJD2.1
#=GS A0A0M9E7E4_9DELT/12-398     AC A0A0M9E7E4.1
#=GS A0A372G8X2_9ACTN/446-591    AC A0A372G8X2.1
#=GS Q2NDJ4_ERYLH/197-583        AC Q2NDJ4.1
#=GS K0IN77_NITGG/51-390         AC K0IN77.1
#=GS A0A081PDN5_9SPHI/192-586    AC A0A081PDN5.1
#=GS A0A1Z4JS75_LEPBY/155-540    AC A0A1Z4JS75.1
#=GS A0A1X2C355_9MYCO/305-641    AC A0A1X2C355.1
#=GS A0A0W0ZAE4_9GAMM/117-284    AC A0A0W0ZAE4.1
#=GS Q3HKI7_RHOS4/184-568        AC Q3HKI7.1
#=GS A0A410JX64_9BACT/159-543    AC A0A410JX64.1
#=GS C8S1Y9_9RHOB/430-507        AC C8S1Y9.1
#=GS A0A494W4R8_9SPHN/172-554    AC A0A494W4R8.1
#=GS A0A0F5MQW4_9RICK/168-553    AC A0A0F5MQW4.1
#=GS A0A218ZRU3_9EURY/118-377    AC A0A218ZRU3.1
#=GS A0A6H5JNC6_9PHAE/1-385      AC A0A6H5JNC6.1
#=GS A0A078KYH4_9GAMM/168-557    AC A0A078KYH4.1
#=GS A0A6I7M1B1_9BACT/21-170     AC A0A6I7M1B1.1
#=GS A0A160KUH1_9MICO/289-434    AC A0A160KUH1.1
#=GS A0A1H1XUL6_9ACTN/406-500    AC A0A1H1XUL6.1
#=GS N2IVD9_9PSED/152-322        AC N2IVD9.1
#=GS A0A1G9LR38_9ACTN/368-443    AC A0A1G9LR38.1
#=GS A0A5K8A683_9DELT/1-299      AC A0A5K8A683.1
#=GS K9UPY3_CHAP6/385-566        AC K9UPY3.1
#=GS A0A178IET8_9BACT/432-640    AC A0A178IET8.1
#=GS A0A6I5YQ96_9SPHN/170-551    AC A0A6I5YQ96.1
#=GS F4GMN4_PUSST/117-518        AC F4GMN4.1
#=GS A0A0W1AKL2_9GAMM/117-282    AC A0A0W1AKL2.1
#=GS A0A2A8IE96_9BACI/192-272    AC A0A2A8IE96.1
#=GS A0A4R2LDF3_9FIRM/61-439     AC A0A4R2LDF3.1
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