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Database: Pfam
Entry: Tsr1_G-like
LinkDB: Tsr1_G-like
Original site: Tsr1_G-like 
#=GF ID   Tsr1_G-like
#=GF AC   PF22298.3
#=GF DE   Tsr1, G-like domain
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF AU   Chuguransky S;0000-0002-0520-0736
#=GF SE   ECOD:EF25451
#=GF GA   27.00 27.00;
#=GF TC   27.00 27.00;
#=GF NC   26.90 26.90;
#=GF BM   hmmbuild  HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -E 1000 --cpu 8 -Z 90746521 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0023
#=GF RC   Paper describing PDB structure 5iw7
#=GF RN   [1]
#=GF RM   27250689
#=GF RT   Pre-40S ribosome biogenesis factor Tsr1 is an inactive
#=GF RT   structural mimic of translational GTPases.
#=GF RA   McCaughan UM, Jayachandran U, Shchepachev V, Chen ZA, Rappsilber
#=GF RA   J, Tollervey D, Cook AG;
#=GF RL   Nat Commun. 2016;7:11789.
#=GF RC   Paper describing PDB structure 5jpq
#=GF RN   [2]
#=GF RM   27419870
#=GF RT   Architecture of the 90S Pre-ribosome: A Structural View on the
#=GF RT   Birth of the Eukaryotic Ribosome.
#=GF RA   Kornprobst M, Turk M, Kellner N, Cheng J, Flemming D, Kos-Braun
#=GF RA   I, Kos M, Thoms M, Berninghausen O, Beckmann R, Hurt E;
#=GF RL   Cell. 2016;166:380-393.
#=GF RC   Paper describing PDB structure 5wwn
#=GF RN   [3]
#=GF RM   28244370
#=GF RT   Molecular architecture of the 90S small subunit pre-ribosome.
#=GF RA   Sun Q, Zhu X, Qi J, An W, Lan P, Tan D, Chen R, Wang B, Zheng S,
#=GF RA   Zhang C, Chen X, Zhang W, Chen J, Dong MQ, Ye K;
#=GF RL   Elife. 2017; [Epub ahead of print]
#=GF RC   Paper describing PDB structure 6eml
#=GF RN   [4]
#=GF RM   29155690
#=GF RT   Cryo-EM structure of a late pre-40S ribosomal subunit from
#=GF RT   Saccharomyces cerevisiae.
#=GF RA   Heuer A, Thomson E, Schmidt C, Berninghausen O, Becker T, Hurt
#=GF RA   E, Beckmann R;
#=GF RL   Elife. 2017; [Epub ahead of print]
#=GF RC   Paper describing PDB structure 6g18
#=GF RN   [5]
#=GF RM   29875412
#=GF RT   Visualizing late states of human 40S ribosomal subunit
#=GF RT   maturation.
#=GF RA   Ameismeier M, Cheng J, Berninghausen O, Beckmann R;
#=GF RL   Nature. 2018;558:249-253.
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This entry represents the G-like (guanine nucleotide-binding
#=GF CC   domain) domain, found in Tsr1, a protein required for normal
#=GF CC   export of the pre-40S particles from the nucleus to the
#=GF CC   cytoplasm during 40S ribosomal subunit synthesis [1-5]. This
#=GF CC   domain adopts a GTPase-like fold, but lacks a P-loop and is not
#=GF CC   predicted to bind GTP.
#=GF SQ   3118
#=GS A0A8H5GQF9_9AGAR/78-214     AC A0A8H5GQF9.1
#=GS A7TQ66_VANPO/82-245         AC A7TQ66.1
#=GS A0A0D0DPN0_9AGAM/76-213     AC A0A0D0DPN0.1
#=GS A0A314L776_NICAT/80-232     AC A0A314L776.1
#=GS A0A8J2S750_9STRA/92-215     AC A0A8J2S750.1
#=GS A0A8S1HMR2_9PELO/84-237     AC A0A8S1HMR2.1
#=GS A0A452SK61_URSAM/94-249     AC A0A452SK61.1
#=GS A0A7J7KRH6_BUGNE/94-247     AC A0A7J7KRH6.1
#=GS A0A182E6X8_ONCOC/135-275    AC A0A182E6X8.1
#=GS Q0CYI8_ASPTN/90-243         AC Q0CYI8.1
#=GS A0A4U5UZU1_COLLU/90-248     AC A0A4U5UZU1.1
#=GS A0A9P7XWG7_9FUNG/87-237     AC A0A9P7XWG7.1
#=GS A0A420H7A3_9PEZI/88-241     AC A0A420H7A3.1
#=GS A0A182YFY5_ANOST/87-246     AC A0A182YFY5.1
#=GS A0A132AJB5_SARSC/78-238     AC A0A132AJB5.1
#=GS A0A8H7XFC1_9HELO/88-241     AC A0A8H7XFC1.1
#=GS A0AAE0HJR3_9PEZI/90-242     AC A0AAE0HJR3.1
#=GS A0A6I9WJ49_9HYME/89-248     AC A0A6I9WJ49.1
#=GS A0AAD9H1P4_9STRA/94-254     AC A0AAD9H1P4.1
#=GS A0A7J8GJ44_ROUAE/7-116      AC A0A7J8GJ44.1
#=GS A0A8K0SQV3_9HYPO/89-241     AC A0A8K0SQV3.1
#=GS G8YMV8_PICSO/85-244         AC G8YMV8.1
#=GS A0AAY4EV12_9TELE/90-245     AC A0AAY4EV12.1
#=GS A0A0D3CPL1_BRAOL/80-234     AC A0A0D3CPL1.1
#=GS A0A4Z0A7H9_9AGAM/22-175     AC A0A4Z0A7H9.1
#=GS A0A094IRI2_9PEZI/88-241     AC A0A094IRI2.1
#=GS A0A6G0X9U2_9STRA/87-244     AC A0A6G0X9U2.1
#=GS A0A2A9NTE1_9AGAR/76-212     AC A0A2A9NTE1.1
#=GS A0A8T9C3Q8_9HELO/125-278    AC A0A8T9C3Q8.1
#=GS A0A017SLU0_ASPRC/85-239     AC A0A017SLU0.1
#=GS A0A7L1F391_SYLBO/84-238     AC A0A7L1F391.1
#=GS A0AA38RW39_9PEZI/90-242     AC A0AA38RW39.1
#=GS A0A6A4JKW2_APOLU/86-238     AC A0A6A4JKW2.1
#=GS A0A2Y9Q1J8_DELLE/83-238     AC A0A2Y9Q1J8.1
#=GS A0A674D5V5_SALTR/90-244     AC A0A674D5V5.1
#=GS A0A067MSX1_BOTB1/87-243     AC A0A067MSX1.1
#=GS A0A7K7ZXN1_9PASE/83-237     AC A0A7K7ZXN1.1
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#=GS A0A8S1M3Y4_PARPR/72-240     AC A0A8S1M3Y4.1
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#=GS E2AJH9_CAMFO/176-337        AC E2AJH9.1
#=GS A0A8C7GYM2_ONCKI/87-191     AC A0A8C7GYM2.1
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#=GS A0A0V1BGE1_TRISP/85-210     AC A0A0V1BGE1.1
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