KEGG   Candidatus Profftella armatura DC: SSDC_01845
Entry
SSDC_01845        CDS       T02777                                 
Name
(GenBank) tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase
  KO
K03500  16S rRNA (cytosine967-C5)-methyltransferase [EC:2.1.1.176]
Organism
ssdc  Candidatus Profftella armatura DC
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ssdc00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03009 Ribosome biogenesis [BR:ssdc03009]
    SSDC_01845
Enzymes [BR:ssdc01000]
 2. Transferases
  2.1  Transferring one-carbon groups
   2.1.1  Methyltransferases
    2.1.1.176  16S rRNA (cytosine967-C5)-methyltransferase
     SSDC_01845
Ribosome biogenesis [BR:ssdc03009]
 Prokaryotic type
  rRNA modification factors
   16S rRNA modification factors
    SSDC_01845
SSDB
Motif
Pfam: Methyltr_RsmB-F RsmF-B_ferredox Methyltransf_31 NusB Methyltransf_25 FtsJ
Other DBs
NCBI-ProteinID: AGS07053
UniProt: S5RQ79
Position
complement(446155..447558)
AA seq 467 aa
MSQNNNKKNNDSLSFYLYNAAKLIIYVKNGISLKKVFSKILDKNNISEKAKGAIKDITYY
TIRHLRLVEILLNKLIKKPIKISILKGLLFCSLALLIKTENRNIKNENKLKNYYKIYTIV
YQSVNVVQFDSKIAYAKNMINAILREFLRKKGEIFKSKMYNIHESYWNYPIWWINQVKIT
YPNFFQWKNILDVGHKKPPLTLRINQRKTTLISYNKLLKKSGLETTIIGPLAIKLHTPIS
ISKIPKFFNGFCSIQDAAAQLAAPLLDIRSGMYVLDACSAPGGKTCHLLEIADIKLISVD
NNLSRLNMISENLKRLNLKATLILSDISKINLKKLYIDINKKTNNRFRFYKNKYFDRILA
DLPCTGSGVVRRNPDIPWLRRKNDIKKLSKYSCKILNNLWKMLKPGGKLLFVTCSLWFEE
SEEQAIIFSKNHKDSIRLNSPGQLLPTVNKKQDYDGFFYSLFQKRKE
NT seq 1404 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcgcaaaataataataaaaaaaataacgattctttatctttttatttatataatgcc
gcaaaattgataatatatgtaaaaaacggaatatctttaaagaaagttttttcaaaaata
ttagataaaaataatatttctgaaaaagcaaaaggagcaataaaagatattacttattat
actatacgacatcttaggttagttgaaatattattaaacaaattaattaaaaaaccgata
aaaatttcaatattaaaaggattattattttgttctttggctttattaattaaaacagaa
aataggaatataaaaaatgaaaataaattaaaaaattattataaaatatatactatagtt
tatcaatctgttaatgtcgttcaatttgattctaaaatagcttatgcaaaaaatatgatt
aatgcaattttacgagaatttcttcgaaaaaaaggggaaatatttaaatcaaaaatgtat
aatattcatgaaagttattggaattatccgatatggtggataaatcaggttaaaattact
tatcctaatttctttcaatggaagaatattcttgatgttggtcataaaaaaccaccccta
acattacgaattaatcaacgtaaaactactcttatttcttataataaacttttaaaaaaa
tcaggattggaaacaactattattggaccattagctataaaattacataccccgatttct
atttctaaaattcctaaattttttaatggattttgctcaattcaagatgcagccgctcaa
ttagctgcaccattactagatatccgttctggaatgtatgtattggatgcttgttctgcg
ccggggggtaaaacttgtcatttattagaaattgcagatattaaactaatttcggttgat
aataacttaagtagattaaatatgatttcagaaaatctaaaacgattaaatttaaaagca
acattaattctttcagatataagtaaaattaatttaaaaaaattatatatagatataaat
aaaaaaaccaataatcgttttagattttataaaaataaatattttgatagaattttagct
gatttaccatgtactggatctggtgttgttagaagaaatccagatataccatggttacga
aggaaaaatgatattaaaaaactttctaaatactcctgtaaaattcttaataatttatgg
aaaatgttaaaacctggtggaaaattattatttgtaacgtgttcattatggtttgaggaa
tcagaagagcaggcaattattttttctaaaaatcataaggattctattagattaaattca
ccaggtcaattgttaccaactgtaaataaaaaacaagattatgacggttttttttattct
ttatttcaaaaaaggaaagaataa

  All links  
Gene (22)   
   RefGene (20)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (6)   
   Pfam (6)   
All databases (29)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system