1. Oxidoreductases

 2. Transferases

 3. Hydrolases

   3.1  Acting on ester bonds

   3.2  Glycosylases

   3.3  Acting on ether bonds

   3.4  Acting on peptide bonds (peptidases)

     3.4.11  Aminopeptidases

     3.4.13  Dipeptidases

     3.4.14  Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases

     3.4.15  Peptidyl-dipeptidases

     3.4.16  Serine-type carboxypeptidases

     3.4.17  Metallocarboxypeptidases

     3.4.18  Cysteine-type carboxypeptidases

     3.4.19  Omega peptidases

     3.4.21  Serine endopeptidases

     3.4.22  Cysteine endopeptidases

       3.4.22.1  cathepsin B

       3.4.22.2  papain

       3.4.22.3  ficain

       3.4.22.6  chymopapain

       3.4.22.7  asclepain

       3.4.22.8  clostripain

       3.4.22.10  streptopain

       3.4.22.14  actinidain

       3.4.22.15  cathepsin L

       3.4.22.16  cathepsin H

       3.4.22.24  cathepsin T

       3.4.22.25  glycyl endopeptidase

       3.4.22.26  cancer procoagulant

       3.4.22.27  cathepsin S

       3.4.22.28  picornain 3C

       3.4.22.29  picornain 2A

       3.4.22.30  caricain

       3.4.22.31  ananain

       3.4.22.32  stem bromelain

       3.4.22.33  fruit bromelain

       3.4.22.34  legumain

       3.4.22.35  histolysain

       3.4.22.36  caspase-1

       3.4.22.37  gingipain R

       3.4.22.38  cathepsin K

       3.4.22.39  adenain

       3.4.22.40  bleomycin hydrolase

       3.4.22.41  cathepsin F

       3.4.22.42  cathepsin O

       3.4.22.43  cathepsin V

       3.4.22.44  nuclear-inclusion-a endopeptidase

       3.4.22.45  helper-component proteinase

       3.4.22.46  L-peptidase

       3.4.22.47  gingipain K

       3.4.22.48  staphopain

       3.4.22.49  separase

       3.4.22.50  V-cath endopeptidase

       3.4.22.51  cruzipain

       3.4.22.52  calpain-1

       3.4.22.53  calpain-2

       3.4.22.54  calpain-3

       3.4.22.55  caspase-2

       3.4.22.56  caspase-3

       3.4.22.57  caspase-4

       3.4.22.58  caspase-5

       3.4.22.59  caspase-6

       3.4.22.60  caspase-7

       3.4.22.61  caspase-8

       3.4.22.62  caspase-9

       3.4.22.63  caspase-10

       3.4.22.64  caspase-11

       3.4.22.65  peptidase 1 (mite)

       3.4.22.66  calicivirin

       3.4.22.67  zingipain

       3.4.22.68  Ulp1 peptidase

       3.4.22.69  SARS coronavirus main proteinase

       3.4.22.70  sortase A

       3.4.22.71  sortase B

     3.4.23  Aspartic endopeptidases

     3.4.24  Metalloendopeptidases

     3.4.25  Threonine endopeptidases

     3.4.26  Glutamic endopeptidases

   3.5  Acting on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds

   3.6  Acting on acid anhydrides

   3.7  Acting on carbon-carbon bonds

   3.8  Acting on halide bonds

   3.9  Acting on phosphorus-nitrogen bonds

   3.10  Acting on sulfur-nitrogen bonds

   3.11  Acting on carbon-phosphorus bonds

   3.12  Acting on sulfur-sulfur bonds

   3.13  Acting on carbon-sulfur bonds

 4. Lyases

 5. Isomerases

 6. Ligases

 7. Translocases